EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000017166 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 753 bases
Position: chrCCOE01000322.1:244251-245003
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000022056	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-18	1	4
ENSACIP00000022056	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-18	2	4
ENSACIP00000022056	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-18	3	4
ENSACIP00000022056	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-18	4	4
ENSACIP00000022056	zf-met	PF12874.7	4.6e-09	1	3
ENSACIP00000022056	zf-met	PF12874.7	4.6e-09	2	3
ENSACIP00000022056	zf-met	PF12874.7	4.6e-09	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000022643	-	753	-	ENSACIP00000022056	250 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000017166	-	92	41.566	ENSACIG00000004626	-	85	41.566
ENSACIG00000017166	-	77	40.952	ENSACIG00000013604	-	95	40.952
ENSACIG00000017166	-	55	36.111	ENSACIG00000018641	snai2	52	36.111
ENSACIG00000017166	-	65	40.426	ENSACIG00000018022	-	59	40.426
ENSACIG00000017166	-	86	32.143	ENSACIG00000007464	-	66	34.518
ENSACIG00000017166	-	62	34.043	ENSACIG00000001767	zbtb41	65	34.043
ENSACIG00000017166	-	96	40.690	ENSACIG00000009717	-	85	40.690
ENSACIG00000017166	-	64	46.575	ENSACIG00000018440	-	94	46.575
ENSACIG00000017166	-	78	36.478	ENSACIG00000019710	-	80	36.478
ENSACIG00000017166	-	66	41.228	ENSACIG00000017892	-	68	41.228
ENSACIG00000017166	-	82	35.821	ENSACIG00000007882	-	83	35.606
ENSACIG00000017166	-	67	42.466	ENSACIG00000002944	-	51	41.558
ENSACIG00000017166	-	94	39.640	ENSACIG00000011541	-	72	39.640
ENSACIG00000017166	-	56	56.962	ENSACIG00000017653	-	89	56.962
ENSACIG00000017166	-	88	37.500	ENSACIG00000003720	-	74	37.500
ENSACIG00000017166	-	59	38.889	ENSACIG00000010739	-	61	38.889
ENSACIG00000017166	-	84	32.143	ENSACIG00000022625	-	96	36.000
ENSACIG00000017166	-	58	41.481	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	66	41.481
ENSACIG00000017166	-	58	41.176	ENSACIG00000002180	-	94	41.176
ENSACIG00000017166	-	93	41.007	ENSACIG00000004666	-	97	40.580
ENSACIG00000017166	-	84	33.184	ENSACIG00000006755	-	84	33.184
ENSACIG00000017166	-	72	41.304	ENSACIG00000021378	gfi1aa	50	42.029
ENSACIG00000017166	-	60	36.774	ENSACIG00000000406	prdm5	68	36.774
ENSACIG00000017166	-	63	37.405	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	87	37.121
ENSACIG00000017166	-	56	43.636	ENSACIG00000008886	znf1164	77	43.636
ENSACIG00000017166	-	78	33.862	ENSACIG00000019804	-	71	33.862
ENSACIG00000017166	-	89	46.067	ENSACIG00000015835	-	67	45.205
ENSACIG00000017166	-	88	39.286	ENSACIG00000016944	-	92	39.286
ENSACIG00000017166	-	76	38.194	ENSACIG00000022738	-	95	38.255
ENSACIG00000017166	-	59	50.000	ENSACIG00000019102	-	51	47.191
ENSACIG00000017166	-	87	39.744	ENSACIG00000016133	-	59	39.744
ENSACIG00000017166	-	88	38.667	ENSACIG00000022293	-	93	39.130
ENSACIG00000017166	-	90	39.815	ENSACIG00000024444	-	73	39.815
ENSACIG00000017166	-	90	44.286	ENSACIG00000006806	-	63	44.286
ENSACIG00000017166	-	95	38.776	ENSACIG00000003515	-	92	38.158
ENSACIG00000017166	-	66	34.000	ENSACIG00000015411	-	75	34.000
ENSACIG00000017166	-	89	47.253	ENSACIG00000000311	-	70	47.253
ENSACIG00000017166	-	75	37.879	ENSACIG00000023313	-	86	37.879
ENSACIG00000017166	-	65	44.944	ENSACIG00000006377	-	51	44.944
ENSACIG00000017166	-	94	39.333	ENSACIG00000010966	-	56	39.333
ENSACIG00000017166	-	91	40.845	ENSACIG00000017647	-	89	41.549
ENSACIG00000017166	-	60	42.105	ENSACIG00000007034	-	74	42.105
ENSACIG00000017166	-	61	41.844	ENSACIG00000023212	-	72	42.029
ENSACIG00000017166	-	79	36.054	ENSACIG00000022330	-	84	36.054
ENSACIG00000017166	-	58	44.167	ENSACIG00000006228	-	59	44.167
ENSACIG00000017166	-	92	51.250	ENSACIG00000006172	-	90	51.250
ENSACIG00000017166	-	60	44.898	ENSACIG00000016180	znf341	50	44.898
ENSACIG00000017166	-	66	38.931	ENSACIG00000000286	-	70	38.931
ENSACIG00000017166	-	97	48.718	ENSACIG00000014123	znf236	56	48.718
ENSACIG00000017166	-	60	35.417	ENSACIG00000012263	znf319b	77	35.417
ENSACIG00000017166	-	63	38.571	ENSACIG00000017644	-	91	38.571
ENSACIG00000017166	-	91	38.393	ENSACIG00000009780	-	58	38.667
ENSACIG00000017166	-	88	41.060	ENSACIG00000008448	-	84	41.060
ENSACIG00000017166	-	93	41.772	ENSACIG00000020982	znf710b	53	33.929
ENSACIG00000017166	-	76	46.341	ENSACIG00000007096	-	72	46.341
ENSACIG00000017166	-	93	38.849	ENSACIG00000004041	-	97	38.849
ENSACIG00000017166	-	84	30.702	ENSACIG00000004641	-	66	30.702
ENSACIG00000017166	-	59	44.262	ENSACIG00000012084	-	92	44.262
ENSACIG00000017166	-	84	38.194	ENSACIG00000018404	-	75	38.843
ENSACIG00000017166	-	61	44.444	ENSACIG00000010637	-	50	44.444
ENSACIG00000017166	-	57	41.304	ENSACIG00000002190	gfi1b	53	42.029
ENSACIG00000017166	-	62	44.156	ENSACIG00000012636	ZNF319	61	44.156
ENSACIG00000017166	-	79	33.500	ENSACIG00000009755	-	86	33.500
ENSACIG00000017166	-	94	46.250	ENSACIG00000015429	-	77	54.795
ENSACIG00000017166	-	69	43.750	ENSACIG00000021986	-	90	43.750
ENSACIG00000017166	-	60	49.231	ENSACIG00000006826	-	54	49.231
ENSACIG00000017166	-	93	41.837	ENSACIG00000019791	-	97	36.129
ENSACIG00000017166	-	64	41.353	ENSACIG00000013149	-	75	41.353
ENSACIG00000017166	-	62	34.965	ENSACIG00000009128	-	82	34.965
ENSACIG00000017166	-	88	41.573	ENSACIG00000011153	-	69	39.865
ENSACIG00000017166	-	54	35.780	ENSACIG00000011516	-	72	35.780
ENSACIG00000017166	-	65	46.154	ENSACIG00000019534	-	83	46.154
ENSACIG00000017166	-	74	39.130	ENSACIG00000023794	-	58	39.130
ENSACIG00000017166	-	90	36.111	ENSACIG00000016182	-	90	36.296
ENSACIG00000017166	-	83	50.575	ENSACIG00000017050	-	98	50.575
ENSACIG00000017166	-	90	36.232	ENSACIG00000023049	znf646	95	37.662
ENSACIG00000017166	-	66	35.593	ENSACIG00000004745	-	90	40.678
ENSACIG00000017166	-	69	36.986	ENSACIG00000013163	-	77	37.363
ENSACIG00000017166	-	59	43.089	ENSACIG00000019447	-	67	43.089
ENSACIG00000017166	-	93	37.584	ENSACIG00000023162	-	54	37.584
ENSACIG00000017166	-	61	42.424	ENSACIG00000019815	-	82	42.424
ENSACIG00000017166	-	60	41.333	ENSACIG00000013470	-	55	41.333
ENSACIG00000017166	-	81	38.333	ENSACIG00000013750	-	70	38.333
ENSACIG00000017166	-	65	41.573	ENSACIG00000017683	-	78	37.500
ENSACIG00000017166	-	62	33.113	ENSACIG00000001369	-	80	33.113
ENSACIG00000017166	-	60	43.878	ENSACIG00000016117	-	82	43.878
ENSACIG00000017166	-	92	48.718	ENSACIG00000010647	-	97	48.718
ENSACIG00000017166	-	91	37.821	ENSACIG00000011515	-	79	37.821
ENSACIG00000017166	-	64	46.667	ENSACIG00000003556	-	65	46.667
ENSACIG00000017166	-	86	39.286	ENSACIG00000003754	-	81	39.286
ENSACIG00000017166	-	69	42.446	ENSACIG00000022658	-	95	42.446

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000017166	-	51	39.450	ENSAOCG00000018579	-	74	39.450	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000017166	-	53	48.649	ENSAPEG00000007889	-	61	48.649	Amphiprion_percula
ENSACIG00000017166	-	53	47.674	ENSAPEG00000019755	-	83	31.325	Amphiprion_percula
ENSACIG00000017166	-	55	32.432	ENSCING00000005713	-	69	32.432	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000017166	-	76	34.532	ENSCING00000004861	zf(c2h2)-12	65	34.532	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000017166	-	65	32.432	ENSCSAVG00000006729	-	80	33.784	Ciona_savignyi
ENSACIG00000017166	-	74	32.000	ENSCSAVG00000005896	-	74	32.000	Ciona_savignyi
ENSACIG00000017166	-	54	42.857	ENSCSAVG00000003895	-	99	42.857	Ciona_savignyi
ENSACIG00000017166	-	74	45.902	ENSCSAVG00000009574	-	99	45.902	Ciona_savignyi
ENSACIG00000017166	-	74	32.432	ENSCSEG00000005491	-	57	32.432	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000017166	-	74	37.589	ENSCVAG00000016098	-	80	37.589	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000017166	-	87	41.935	ENSCVAG00000002295	-	73	41.935	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000017166	-	66	38.202	ENSCVAG00000019574	-	81	38.202	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000017166	-	61	34.783	FBgn0037722	CG8319	58	33.333	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000017166	-	64	39.161	FBgn0033934	CG17385	64	39.161	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000017166	-	60	33.083	FBgn0030012	CG18262	59	33.083	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000017166	-	58	41.176	ENSEBUG00000015522	-	63	41.176	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000017166	-	61	42.029	ENSEBUG00000000735	-	98	42.029	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000017166	-	68	41.304	ENSEBUG00000008392	-	75	41.304	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000017166	-	74	41.912	ENSEBUG00000004841	-	79	41.912	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000017166	-	81	34.211	ENSELUG00000020794	-	64	34.228	Esox_lucius
ENSACIG00000017166	-	91	44.944	ENSFHEG00000013644	-	77	44.944	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000017166	-	91	36.986	ENSFHEG00000020889	-	83	36.986	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000017166	-	62	41.026	ENSGACG00000018415	-	99	40.541	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000017166	-	89	48.101	ENSHCOG00000014881	-	64	48.101	Hippocampus_comes
ENSACIG00000017166	-	92	31.098	ENSHCOG00000008181	-	75	30.488	Hippocampus_comes
ENSACIG00000017166	-	77	41.071	ENSHCOG00000014887	-	53	41.071	Hippocampus_comes
ENSACIG00000017166	-	64	34.965	ENSKMAG00000007658	-	87	34.965	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000017166	-	64	31.897	ENSKMAG00000012909	-	60	31.897	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000017166	-	80	37.255	ENSLBEG00000026573	-	75	36.275	Labrus_bergylta
ENSACIG00000017166	-	59	40.000	ENSONIG00000003471	-	97	40.000	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000017166	-	90	43.860	ENSONIG00000016416	-	96	43.860	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000017166	-	64	36.296	ENSONIG00000003224	-	92	36.296	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000017166	-	60	36.538	ENSONIG00000009894	-	61	36.538	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000017166	-	96	39.130	ENSONIG00000007812	-	99	40.708	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000017166	-	66	50.943	ENSORLG00015018254	-	89	50.943	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000017166	-	80	37.662	ENSOMEG00000017673	-	74	37.662	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000017166	-	92	44.000	ENSPMGG00000000218	-	68	43.636	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSACIG00000017166	-	62	43.478	ENSPMGG00000000458	-	88	44.828	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSACIG00000017166	-	60	39.062	ENSTNIG00000008154	-	71	39.062	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000017166	-	52	40.517	ENSXCOG00000005697	-	82	40.517	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000017166	-	61	41.429	ENSXMAG00000022242	-	74	41.429	Xiphophorus_maculatus