EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000017561 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8253 bases
Position: chrCCOE01001849.1:34959-43211
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000022589	MMR_HSR1	PF01926.23	9.3e-07	1	1
ENSACIP00000022584	MMR_HSR1	PF01926.23	1.2e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000023191	-	1197	-	ENSACIP00000022589	398 (aa)	-	-
ENSACIT00000023186	-	1401	-	ENSACIP00000022584	466 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000017561	-	98	49.858	ENSACIG00000010992	-	93	49.858
ENSACIG00000017561	-	97	54.805	ENSACIG00000014652	-	98	54.805
ENSACIG00000017561	-	99	59.288	ENSACIG00000008165	-	97	61.290
ENSACIG00000017561	-	98	49.235	ENSACIG00000011491	-	97	49.235
ENSACIG00000017561	-	57	55.556	ENSACIG00000000621	-	87	54.008
ENSACIG00000017561	-	96	55.814	ENSACIG00000023724	-	96	55.814

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000017561	-	96	38.961	ENSG00000124449	IRGC	82	38.961	Homo_sapiens
ENSACIG00000017561	-	97	62.694	ENSAPOG00000008330	irgf3	93	62.694	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000017561	-	76	33.224	ENSAMEG00000001281	-	67	33.333	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000017561	-	95	39.370	ENSAMEG00000019320	-	90	38.760	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000017561	-	96	36.082	ENSAMEG00000004488	-	90	36.317	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000017561	-	95	38.786	ENSAMEG00000018526	-	88	39.370	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000017561	-	95	35.696	ENSAMEG00000018886	-	88	35.696	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000017561	-	88	40.833	ENSAMEG00000004232	IRGC	89	40.833	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000017561	-	96	37.696	ENSAMEG00000018904	-	90	37.984	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000017561	-	59	65.665	ENSAOCG00000012267	-	90	64.634	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000017561	-	97	62.338	ENSAOCG00000016549	-	96	62.338	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000017561	-	97	63.117	ENSAPEG00000002637	-	90	61.443	Amphiprion_percula
ENSACIG00000017561	-	97	59.585	ENSATEG00000011805	-	95	59.585	Anabas_testudineus
ENSACIG00000017561	-	97	59.326	ENSATEG00000011621	-	96	59.326	Anabas_testudineus
ENSACIG00000017561	-	98	59.335	ENSATEG00000011733	-	96	59.845	Anabas_testudineus
ENSACIG00000017561	-	95	57.895	ENSATEG00000011665	-	97	57.403	Anabas_testudineus
ENSACIG00000017561	-	94	41.333	ENSACAG00000027865	-	85	41.333	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000017561	-	95	44.186	ENSACAG00000004461	-	83	45.000	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000017561	-	92	41.734	ENSACAG00000027084	-	82	41.734	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000017561	-	92	32.800	ENSACAG00000022806	-	87	33.422	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000017561	-	95	43.307	ENSACAG00000005249	-	90	43.307	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000017561	-	98	35.264	ENSACAG00000027740	-	88	35.264	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000017561	-	57	58.222	ENSACLG00000017575	-	78	58.929	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000017561	-	76	53.465	ENSACLG00000026694	-	87	57.991	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000017561	-	96	56.658	ENSACLG00000008069	-	91	58.636	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000017561	-	76	49.169	ENSACLG00000017650	-	89	47.447	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000017561	-	91	55.956	ENSACLG00000017785	-	92	55.956	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000017561	-	93	58.713	ENSACLG00000017700	-	98	57.181	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000017561	-	70	54.286	ENSACLG00000017734	-	76	54.480	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000017561	-	56	55.605	ENSACLG00000026716	-	74	56.306	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000017561	-	93	43.935	ENSAMXG00000025551	-	94	43.935	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000017561	-	68	35.521	ENSAMXG00000001283	-	95	34.228	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000017561	-	92	39.237	ENSAMXG00000018938	-	94	39.237	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000017561	-	94	44.156	ENSAMXG00000003370	-	96	44.529	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000017561	-	54	47.196	ENSAMXG00000043797	-	86	48.357	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000017561	-	92	40.811	ENSAMXG00000031909	-	92	41.873	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000017561	-	95	46.615	ENSAMXG00000003336	-	92	46.966	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000017561	-	91	41.160	ENSAMXG00000037767	-	98	41.504	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000017561	-	92	30.894	ENSAMXG00000033649	-	94	30.978	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000017561	-	91	40.548	ENSAMXG00000041276	-	87	41.209	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000017561	-	92	36.290	ENSAMXG00000003353	-	91	36.290	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000017561	-	97	40.155	ENSAMXG00000025169	-	99	40.155	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000017561	-	96	37.795	ENSAMXG00000026039	irge4	94	37.795	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000017561	-	95	47.165	ENSAMXG00000041738	-	96	47.165	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000017561	-	91	34.426	ENSBTAG00000015727	IFI47	84	34.521	Bos_taurus
ENSACIG00000017561	-	96	39.221	ENSBTAG00000013766	IRGC	82	39.221	Bos_taurus
ENSACIG00000017561	-	96	39.221	ENSCJAG00000013464	IRGC	82	39.221	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000017561	-	96	37.500	ENSCAFG00000004727	IRGC	97	36.214	Canis_familiaris
ENSACIG00000017561	-	97	35.969	ENSCAFG00000000502	IFGGC1	89	35.969	Canis_familiaris
ENSACIG00000017561	-	96	37.596	ENSCAFG00000012657	-	86	37.984	Canis_familiaris
ENSACIG00000017561	-	71	30.605	ENSCAFG00000028829	-	65	30.714	Canis_familiaris
ENSACIG00000017561	-	96	37.859	ENSCAFG00000000498	-	88	37.887	Canis_familiaris
ENSACIG00000017561	-	71	30.605	ENSCAFG00020002229	-	71	30.714	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000017561	-	82	38.720	ENSCAFG00020013248	IRGC	80	39.450	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000017561	-	96	37.596	ENSCAFG00020002248	-	86	37.984	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000017561	-	96	37.859	ENSCAFG00020002399	-	85	37.887	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000017561	-	97	35.969	ENSCAFG00020002398	-	89	35.969	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000017561	-	60	40.000	ENSCHIG00000013605	-	67	40.167	Capra_hircus
ENSACIG00000017561	-	92	34.959	ENSCHIG00000006767	-	85	34.959	Capra_hircus
ENSACIG00000017561	-	96	39.221	ENSCHIG00000007797	IRGC	82	39.221	Capra_hircus
ENSACIG00000017561	-	76	41.776	ENSCAPG00000016931	-	72	41.914	Cavia_aperea
ENSACIG00000017561	-	96	38.442	ENSCAPG00000012775	IRGC	84	39.589	Cavia_aperea
ENSACIG00000017561	-	62	31.707	ENSCAPG00000016904	-	60	31.746	Cavia_aperea
ENSACIG00000017561	-	95	36.939	ENSCPOG00000036108	-	86	36.939	Cavia_porcellus
ENSACIG00000017561	-	97	34.625	ENSCPOG00000037314	-	89	34.625	Cavia_porcellus
ENSACIG00000017561	-	97	35.917	ENSCPOG00000034856	-	89	35.917	Cavia_porcellus
ENSACIG00000017561	-	96	36.719	ENSCPOG00000023450	-	89	37.076	Cavia_porcellus
ENSACIG00000017561	-	97	35.751	ENSCPOG00000038985	-	89	35.938	Cavia_porcellus
ENSACIG00000017561	-	76	40.789	ENSCPOG00000037129	-	72	40.924	Cavia_porcellus
ENSACIG00000017561	-	95	36.675	ENSCPOG00000039847	-	86	36.675	Cavia_porcellus
ENSACIG00000017561	-	96	38.442	ENSCPOG00000000918	IRGC	84	39.589	Cavia_porcellus
ENSACIG00000017561	-	76	40.789	ENSCPOG00000034918	-	72	40.924	Cavia_porcellus
ENSACIG00000017561	-	76	41.118	ENSCPOG00000037647	-	72	41.254	Cavia_porcellus
ENSACIG00000017561	-	96	38.961	ENSCATG00000016103	IRGC	82	38.961	Cercocebus_atys
ENSACIG00000017561	-	96	39.481	ENSCLAG00000017638	IRGC	83	40.617	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000017561	-	77	40.850	ENSCLAG00000017958	-	73	41.311	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000017561	-	97	35.751	ENSCLAG00000017791	-	87	36.554	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000017561	-	95	36.745	ENSCLAG00000010051	-	85	36.458	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000017561	-	77	39.610	ENSCLAG00000011265	-	78	39.936	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000017561	-	94	37.067	ENSCLAG00000017811	-	87	37.433	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000017561	-	96	38.961	ENSCSAG00000019621	IRGC	82	38.961	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000017561	-	58	43.534	ENSCHOG00000005921	-	91	43.723	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000017561	-	89	40.000	ENSCPBG00000021942	-	91	37.500	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017561	-	95	40.633	ENSCPBG00000021943	-	89	40.633	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017561	-	97	42.010	ENSCPBG00000021938	-	93	41.432	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017561	-	90	40.166	ENSCPBG00000021468	-	83	40.166	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017561	-	98	41.867	ENSCPBG00000021464	-	96	41.867	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017561	-	94	40.945	ENSCPBG00000006686	-	88	40.404	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017561	-	94	40.160	ENSCPBG00000021937	-	88	40.160	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017561	-	94	43.617	ENSCPBG00000021939	-	97	42.755	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017561	-	95	42.298	ENSCPBG00000010054	-	96	42.040	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017561	-	89	40.960	ENSCPBG00000021472	-	90	40.960	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017561	-	95	37.598	ENSCPBG00000021473	-	95	37.696	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017561	-	51	38.537	ENSCPBG00000021470	-	68	39.706	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017561	-	96	35.584	ENSCPBG00000006671	-	97	35.584	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017561	-	96	44.648	ENSCPBG00000022413	-	86	44.648	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017561	-	92	38.965	ENSCPBG00000013089	-	80	38.965	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017561	-	95	39.633	ENSCPBG00000016822	-	91	39.683	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017561	-	96	43.103	ENSCPBG00000016826	-	93	43.902	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017561	-	93	30.481	ENSCPBG00000013137	-	96	30.645	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017561	-	91	42.896	ENSCPBG00000011454	-	92	43.562	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017561	-	95	44.125	ENSCPBG00000017286	-	93	43.367	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017561	-	96	39.687	ENSCPBG00000013135	-	94	40.157	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017561	-	92	42.627	ENSCPBG00000021465	-	86	42.627	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017561	-	90	41.341	ENSCPBG00000021467	-	88	41.370	Chrysemys_picta_bellii
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ENSACIG00000017561	-	96	45.974	ENSCPBG00000002666	-	89	45.974	Chrysemys_picta_bellii
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