EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000017574 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3716 bases
Position: chrCCOE01000275.1:22273-25988
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000022600	SRA1	PF07304.11	1.1e-64	1	1
ENSACIP00000022607	SRA1	PF07304.11	9.7e-60	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000023202	-	783	-	ENSACIP00000022600	260 (aa)	-	-
ENSACIT00000023209	-	714	-	ENSACIP00000022607	237 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000017574's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000017574's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000017574	-	87	47.907	ENSG00000213523	SRA1	84	47.964	Homo_sapiens
ENSACIG00000017574	-	87	49.083	ENSAMEG00000011005	SRA1	84	47.489	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000017574	-	99	75.194	ENSAOCG00000019366	-	100	75.194	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000017574	-	99	75.194	ENSAPEG00000004211	-	100	75.194	Amphiprion_percula
ENSACIG00000017574	-	94	62.338	ENSATEG00000013578	-	96	72.851	Anabas_testudineus
ENSACIG00000017574	-	89	44.796	ENSACAG00000013148	SRA1	89	45.205	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000017574	-	87	47.907	ENSANAG00000020391	SRA1	84	47.511	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000017574	-	99	76.429	ENSACLG00000002061	-	100	77.224	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000017574	-	97	47.036	ENSAMXG00000032750	sra1	95	48.560	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000017574	-	87	47.887	ENSBTAG00000001449	SRA1	89	46.119	Bos_taurus
ENSACIG00000017574	-	87	47.418	ENSCJAG00000016613	SRA1	84	46.154	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000017574	-	87	49.533	ENSCAFG00000005819	SRA1	84	46.637	Canis_familiaris
ENSACIG00000017574	-	87	49.533	ENSCAFG00020001924	SRA1	84	46.637	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000017574	-	82	48.259	ENSCHIG00000013652	SRA1	73	44.700	Capra_hircus
ENSACIG00000017574	-	87	48.165	ENSTSYG00000032938	SRA1	85	46.083	Carlito_syrichta
ENSACIG00000017574	-	86	46.667	ENSCPOG00000020210	SRA1	84	46.330	Cavia_porcellus
ENSACIG00000017574	-	87	48.598	ENSCCAG00000029225	SRA1	84	47.768	Cebus_capucinus
ENSACIG00000017574	-	87	46.977	ENSCATG00000044295	SRA1	85	47.059	Cercocebus_atys
ENSACIG00000017574	-	85	46.860	ENSCLAG00000003359	SRA1	84	47.706	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000017574	-	87	46.977	ENSCSAG00000012824	SRA1	85	47.059	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000017574	-	86	45.455	ENSCPBG00000007590	SRA1	88	48.826	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017574	-	80	32.161	ENSCING00000014906	-	96	31.000	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000017574	-	87	46.262	ENSCANG00000036375	SRA1	85	45.946	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000017574	-	94	45.833	ENSCGRG00001005557	-	88	42.917	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000017574	-	94	45.833	ENSCGRG00000007079	-	93	42.917	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000017574	-	88	66.364	ENSCSEG00000020723	-	98	65.258	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000017574	-	100	64.419	ENSCVAG00000019294	-	100	65.299	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000017574	-	88	54.839	ENSDARG00000053619	sra1	96	52.558	Danio_rerio
ENSACIG00000017574	-	87	46.047	ENSDNOG00000045277	SRA1	81	44.978	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000017574	-	84	34.653	ENSEBUG00000006644	sra1	96	33.796	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000017574	-	86	45.909	ENSEASG00005017485	SRA1	81	47.032	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000017574	-	86	45.909	ENSECAG00000014366	SRA1	84	47.032	Equus_caballus
ENSACIG00000017574	-	87	59.641	ENSELUG00000004809	sra1	91	60.090	Esox_lucius
ENSACIG00000017574	-	87	49.296	ENSFCAG00000035180	SRA1	85	49.065	Felis_catus
ENSACIG00000017574	-	84	48.039	ENSFALG00000009306	SRA1	83	48.815	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000017574	-	86	48.571	ENSFDAG00000001810	SRA1	84	45.622	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000017574	-	92	72.646	ENSFHEG00000003267	-	100	66.031	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000017574	-	87	55.046	ENSGMOG00000012361	-	99	53.744	Gadus_morhua
ENSACIG00000017574	-	90	43.162	ENSGALG00000040453	SRA1	88	46.330	Gallus_gallus
ENSACIG00000017574	-	98	66.537	ENSGAFG00000022037	-	69	64.981	Gambusia_affinis
ENSACIG00000017574	-	90	69.124	ENSGACG00000020904	-	88	73.303	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000017574	-	86	45.909	ENSGAGG00000000284	SRA1	88	47.887	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000017574	-	87	47.907	ENSGGOG00000042935	SRA1	84	47.964	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000017574	-	61	83.784	ENSHBUG00000010633	-	81	84.127	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000017574	-	86	47.143	ENSHGLG00000010259	SRA1	84	46.789	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000017574	-	86	47.143	ENSHGLG00100006596	SRA1	84	46.789	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000017574	-	88	61.321	ENSHCOG00000013146	-	92	62.673	Hippocampus_comes
ENSACIG00000017574	-	88	51.786	ENSIPUG00000020481	sra1	94	51.786	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000017574	-	86	45.872	ENSSTOG00000024229	SRA1	84	46.637	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000017574	-	86	47.619	ENSJJAG00000014326	-	85	45.495	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000017574	-	90	73.059	ENSLBEG00000002280	-	92	74.661	Labrus_bergylta
ENSACIG00000017574	-	86	49.772	ENSLACG00000007697	SRA1	90	46.296	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000017574	-	88	54.911	ENSLOCG00000011051	SRA1	91	50.427	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000017574	-	87	46.188	ENSLAFG00000020802	SRA1	84	46.288	Loxodonta_africana
ENSACIG00000017574	-	87	46.977	ENSMFAG00000007347	SRA1	85	47.059	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000017574	-	87	46.977	ENSMMUG00000001706	SRA1	85	47.059	Macaca_mulatta
ENSACIG00000017574	-	87	46.977	ENSMNEG00000029401	SRA1	85	47.059	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000017574	-	87	46.977	ENSMLEG00000036807	SRA1	85	47.059	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000017574	-	99	69.853	ENSMAMG00000012359	-	100	69.853	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000017574	-	99	76.429	ENSMZEG00005025134	-	100	76.429	Maylandia_zebra
ENSACIG00000017574	-	99	76.429	ENSMZEG00005024979	-	100	76.429	Maylandia_zebra
ENSACIG00000017574	-	97	45.565	ENSMAUG00000012789	-	95	42.800	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000017574	-	87	48.585	ENSMICG00000044059	SRA1	85	48.585	Microcebus_murinus
ENSACIG00000017574	-	90	43.673	ENSMOCG00000008156	-	94	43.725	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000017574	-	88	58.079	ENSMMOG00000017400	-	92	59.211	Mola_mola
ENSACIG00000017574	-	99	69.767	ENSMALG00000003857	-	100	69.767	Monopterus_albus
ENSACIG00000017574	-	94	45.763	ENSMUSG00000006050	Sra1	98	43.933	Mus_musculus
ENSACIG00000017574	-	87	47.085	ENSMPUG00000008493	SRA1	84	46.637	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000017574	-	83	47.291	ENSMLUG00000022959	SRA1	86	46.377	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000017574	-	87	46.789	ENSNGAG00000017765	-	90	46.256	Nannospalax_galili
ENSACIG00000017574	-	87	47.907	ENSNLEG00000034424	SRA1	84	47.511	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000017574	-	86	48.815	ENSMEUG00000013640	SRA1	84	47.867	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000017574	-	87	44.811	ENSOPRG00000018381	SRA1	85	45.701	Ochotona_princeps
ENSACIG00000017574	-	85	46.860	ENSODEG00000003997	SRA1	82	45.982	Octodon_degus
ENSACIG00000017574	-	92	76.471	ENSONIG00000017849	-	96	79.583	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000017574	-	86	44.976	ENSOCUG00000021569	SRA1	85	45.205	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000017574	-	93	59.259	ENSORLG00000022839	sra1	97	60.484	Oryzias_latipes
ENSACIG00000017574	-	93	59.259	ENSORLG00020013412	-	97	60.887	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000017574	-	93	58.264	ENSOMEG00000009187	-	99	56.870	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000017574	-	86	46.364	ENSOGAG00000025549	SRA1	85	47.297	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000017574	-	87	48.113	ENSOARG00000018101	SRA1	86	44.737	Ovis_aries
ENSACIG00000017574	-	87	47.907	ENSPPAG00000032469	SRA1	84	47.964	Pan_paniscus
ENSACIG00000017574	-	87	49.296	ENSPPRG00000023984	SRA1	85	49.065	Panthera_pardus
ENSACIG00000017574	-	87	49.296	ENSPTIG00000011361	SRA1	85	49.065	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000017574	-	87	47.907	ENSPTRG00000017314	SRA1	84	47.964	Pan_troglodytes
ENSACIG00000017574	-	87	48.837	ENSPANG00000008615	SRA1	85	47.297	Papio_anubis
ENSACIG00000017574	-	88	55.607	ENSPKIG00000019491	sra1	91	56.561	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000017574	-	71	52.273	ENSPMGG00000018172	-	62	60.156	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000017574	-	96	45.763	ENSPEMG00000000489	-	88	42.797	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000017574	-	85	30.455	ENSPMAG00000008631	sra1	93	30.435	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000017574	-	86	47.143	ENSPCIG00000017474	SRA1	79	46.919	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000017574	-	99	61.538	ENSPFOG00000019038	-	96	64.591	Poecilia_formosa
ENSACIG00000017574	-	99	61.923	ENSPLAG00000002438	-	100	64.751	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000017574	-	99	61.923	ENSPMEG00000000520	-	96	64.981	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000017574	-	99	57.491	ENSPREG00000003284	-	100	57.639	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000017574	-	87	47.442	ENSPPYG00000015855	SRA1	84	48.848	Pongo_abelii
ENSACIG00000017574	-	69	38.202	ENSPCAG00000016361	SRA1	92	40.341	Procavia_capensis
ENSACIG00000017574	-	87	48.585	ENSPCOG00000010221	SRA1	84	46.154	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000017574	-	87	48.357	ENSPVAG00000009698	SRA1	85	44.395	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000017574	-	99	76.071	ENSPNYG00000022136	-	100	76.868	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000017574	-	88	51.802	ENSPNAG00000020396	sra1	77	53.275	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000017574	-	94	45.763	ENSRNOG00000018089	Sra1	85	46.296	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000017574	-	87	47.196	ENSRBIG00000035226	SRA1	85	46.847	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000017574	-	87	47.196	ENSRROG00000011630	SRA1	85	46.847	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000017574	-	87	48.585	ENSSBOG00000011756	SRA1	84	47.706	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000017574	-	86	44.712	ENSSHAG00000016297	SRA1	84	46.667	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000017574	-	88	56.481	ENSSFOG00015022155	sra1	91	53.271	Scleropages_formosus
ENSACIG00000017574	-	100	68.679	ENSSMAG00000016237	-	99	70.189	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000017574	-	99	69.349	ENSSDUG00000023303	-	100	70.115	Seriola_dumerili
ENSACIG00000017574	-	100	55.000	ENSSLDG00000007472	SRA1	100	72.222	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000017574	-	87	47.273	ENSSPUG00000015651	SRA1	91	47.248	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000017574	-	99	75.194	ENSSPAG00000011180	-	100	74.806	Stegastes_partitus
ENSACIG00000017574	-	87	48.372	ENSSSCG00000014365	SRA1	71	47.887	Sus_scrofa
ENSACIG00000017574	-	95	59.167	ENSTRUG00000007664	-	93	58.678	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000017574	-	100	62.214	ENSTNIG00000007605	-	99	55.755	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000017574	-	87	46.512	ENSTTRG00000005574	SRA1	85	47.489	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000017574	-	87	47.907	ENSUAMG00000005355	SRA1	89	47.465	Ursus_americanus
ENSACIG00000017574	-	84	46.512	ENSUMAG00000013276	SRA1	72	47.368	Ursus_maritimus
ENSACIG00000017574	-	87	49.533	ENSVVUG00000012374	SRA1	84	46.637	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000017574	-	86	50.472	ENSXETG00000032326	sra1	89	49.767	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000017574	-	99	66.538	ENSXMAG00000006613	-	100	66.538	Xiphophorus_maculatus