EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000017644 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6545 bases
Position: chrCCOE01000325.1:238114-244658
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000022665	zf-C2H2	PF00096.26	2.9e-56	1	9
ENSACIP00000022665	zf-C2H2	PF00096.26	2.9e-56	2	9
ENSACIP00000022665	zf-C2H2	PF00096.26	2.9e-56	3	9
ENSACIP00000022665	zf-C2H2	PF00096.26	2.9e-56	4	9
ENSACIP00000022665	zf-C2H2	PF00096.26	2.9e-56	5	9
ENSACIP00000022665	zf-C2H2	PF00096.26	2.9e-56	6	9
ENSACIP00000022665	zf-C2H2	PF00096.26	2.9e-56	7	9
ENSACIP00000022665	zf-C2H2	PF00096.26	2.9e-56	8	9
ENSACIP00000022665	zf-C2H2	PF00096.26	2.9e-56	9	9
ENSACIP00000022665	zf-met	PF12874.7	2.9e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000023267	-	1416	-	ENSACIP00000022665	471 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000017644's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000017644's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000017644	-	81	43.200	ENSACIG00000004641	-	54	43.200
ENSACIG00000017644	-	90	43.750	ENSACIG00000016944	-	87	43.750
ENSACIG00000017644	-	88	45.455	ENSACIG00000017013	-	56	45.455
ENSACIG00000017644	-	85	43.478	ENSACIG00000006228	-	66	43.478
ENSACIG00000017644	-	89	44.211	ENSACIG00000000286	-	71	44.211
ENSACIG00000017644	-	87	34.667	ENSACIG00000011516	-	85	33.684
ENSACIG00000017644	-	83	43.575	ENSACIG00000003720	-	63	43.575
ENSACIG00000017644	-	82	34.694	ENSACIG00000019804	-	83	34.694
ENSACIG00000017644	-	86	43.529	ENSACIG00000011515	-	67	43.529
ENSACIG00000017644	-	85	38.532	ENSACIG00000007192	zbtb7b	57	38.532
ENSACIG00000017644	-	91	50.279	ENSACIG00000019534	-	88	50.279
ENSACIG00000017644	-	88	42.967	ENSACIG00000022293	-	97	42.967
ENSACIG00000017644	-	85	44.516	ENSACIG00000007096	-	86	44.516
ENSACIG00000017644	-	86	41.748	ENSACIG00000011318	snai1a	52	41.748
ENSACIG00000017644	-	87	48.837	ENSACIG00000011153	-	82	43.841
ENSACIG00000017644	-	84	66.949	ENSACIG00000017653	-	93	66.949
ENSACIG00000017644	-	87	40.120	ENSACIG00000002190	gfi1b	64	40.120
ENSACIG00000017644	-	86	40.441	ENSACIG00000018641	snai2	61	40.441
ENSACIG00000017644	-	83	40.260	ENSACIG00000013613	scrt1b	56	40.260
ENSACIG00000017644	-	83	34.597	ENSACIG00000006377	-	67	34.597
ENSACIG00000017644	-	87	41.593	ENSACIG00000006826	-	59	41.593
ENSACIG00000017644	-	88	42.553	ENSACIG00000015835	-	89	42.553
ENSACIG00000017644	-	90	44.841	ENSACIG00000003556	-	69	44.841
ENSACIG00000017644	-	85	36.471	ENSACIG00000015411	-	84	36.471
ENSACIG00000017644	-	83	40.602	ENSACIG00000004626	-	85	40.602
ENSACIG00000017644	-	94	46.154	ENSACIG00000006172	-	97	44.079
ENSACIG00000017644	-	86	31.034	ENSACIG00000016180	znf341	51	31.034
ENSACIG00000017644	-	89	43.014	ENSACIG00000004041	-	94	43.014
ENSACIG00000017644	-	80	37.681	ENSACIG00000013946	-	59	35.802
ENSACIG00000017644	-	83	33.010	ENSACIG00000002944	-	83	33.010
ENSACIG00000017644	-	89	42.616	ENSACIG00000019447	-	72	42.616
ENSACIG00000017644	-	88	44.809	ENSACIG00000009780	-	71	44.809
ENSACIG00000017644	-	88	37.374	ENSACIG00000009128	-	93	37.374
ENSACIG00000017644	-	85	40.000	ENSACIG00000024444	-	91	40.000
ENSACIG00000017644	-	96	38.393	ENSACIG00000018404	-	77	38.393
ENSACIG00000017644	-	90	48.000	ENSACIG00000022738	-	97	44.970
ENSACIG00000017644	-	90	59.184	ENSACIG00000008886	znf1164	97	59.184
ENSACIG00000017644	-	89	45.404	ENSACIG00000011541	-	68	45.404
ENSACIG00000017644	-	90	39.130	ENSACIG00000016133	-	67	39.130
ENSACIG00000017644	-	87	41.429	ENSACIG00000010966	-	55	41.429
ENSACIG00000017644	-	87	43.793	ENSACIG00000013470	-	64	43.793
ENSACIG00000017644	-	87	50.000	ENSACIG00000016182	-	83	50.000
ENSACIG00000017644	-	82	37.692	ENSACIG00000012604	scrt2	58	37.692
ENSACIG00000017644	-	94	43.316	ENSACIG00000007882	-	93	43.316
ENSACIG00000017644	-	84	68.531	ENSACIG00000001369	-	83	68.531
ENSACIG00000017644	-	91	31.538	ENSACIG00000023049	znf646	99	34.294
ENSACIG00000017644	-	89	39.203	ENSACIG00000013163	-	80	39.203
ENSACIG00000017644	-	86	41.522	ENSACIG00000018440	-	97	41.558
ENSACIG00000017644	-	98	44.211	ENSACIG00000004666	-	99	47.059
ENSACIG00000017644	-	82	45.614	ENSACIG00000010660	-	92	45.614
ENSACIG00000017644	-	83	37.818	ENSACIG00000017683	-	80	37.662
ENSACIG00000017644	-	91	38.571	ENSACIG00000017166	-	63	38.571
ENSACIG00000017644	-	88	44.186	ENSACIG00000006755	-	75	44.186
ENSACIG00000017644	-	82	42.029	ENSACIG00000002180	-	99	42.029
ENSACIG00000017644	-	85	44.444	ENSACIG00000010637	-	53	47.266
ENSACIG00000017644	-	85	46.597	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	82	46.597
ENSACIG00000017644	-	91	47.742	ENSACIG00000022658	-	95	43.874
ENSACIG00000017644	-	97	43.432	ENSACIG00000017050	-	100	43.529
ENSACIG00000017644	-	87	51.282	ENSACIG00000021986	-	97	48.800
ENSACIG00000017644	-	86	41.429	ENSACIG00000022330	-	85	41.429
ENSACIG00000017644	-	88	30.000	ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	88	30.469
ENSACIG00000017644	-	85	43.243	ENSACIG00000009755	-	87	43.243
ENSACIG00000017644	-	90	45.361	ENSACIG00000003754	-	83	45.361
ENSACIG00000017644	-	91	34.405	ENSACIG00000016117	-	87	34.727
ENSACIG00000017644	-	93	44.595	ENSACIG00000008448	-	70	44.595
ENSACIG00000017644	-	91	39.706	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	99	39.706
ENSACIG00000017644	-	87	35.756	ENSACIG00000012263	znf319b	90	36.424
ENSACIG00000017644	-	89	47.619	ENSACIG00000017647	-	92	47.619
ENSACIG00000017644	-	91	41.860	ENSACIG00000010739	-	86	41.860
ENSACIG00000017644	-	85	35.262	ENSACIG00000012636	ZNF319	87	35.262
ENSACIG00000017644	-	89	35.135	ENSACIG00000001767	zbtb41	63	35.135
ENSACIG00000017644	-	90	43.310	ENSACIG00000010647	-	98	44.615
ENSACIG00000017644	-	91	39.024	ENSACIG00000009717	-	95	39.833
ENSACIG00000017644	-	86	41.463	ENSACIG00000019710	-	76	41.463
ENSACIG00000017644	-	86	45.178	ENSACIG00000006806	-	63	45.178
ENSACIG00000017644	-	86	37.466	ENSACIG00000013149	-	84	37.086
ENSACIG00000017644	-	93	43.304	ENSACIG00000004745	-	90	41.618
ENSACIG00000017644	-	87	39.881	ENSACIG00000016354	gfi1ab	51	39.881
ENSACIG00000017644	-	85	42.529	ENSACIG00000019815	-	89	42.529
ENSACIG00000017644	-	86	43.023	ENSACIG00000023162	-	72	43.023
ENSACIG00000017644	-	92	41.525	ENSACIG00000003515	-	93	42.920
ENSACIG00000017644	-	88	36.631	ENSACIG00000000406	prdm5	70	36.631
ENSACIG00000017644	-	89	35.938	ENSACIG00000007000	-	58	35.938
ENSACIG00000017644	-	87	38.902	ENSACIG00000023212	-	82	40.458
ENSACIG00000017644	-	87	43.353	ENSACIG00000012084	-	98	40.639
ENSACIG00000017644	-	98	41.292	ENSACIG00000013604	-	99	41.292
ENSACIG00000017644	-	83	42.857	ENSACIG00000007855	-	89	42.857
ENSACIG00000017644	-	86	45.556	ENSACIG00000000311	-	61	45.556
ENSACIG00000017644	-	89	46.875	ENSACIG00000023313	-	95	46.875
ENSACIG00000017644	-	86	39.634	ENSACIG00000020938	zbtb47b	74	39.634
ENSACIG00000017644	-	89	43.636	ENSACIG00000004231	sall1a	51	39.474
ENSACIG00000017644	-	92	43.844	ENSACIG00000019791	-	96	39.093
ENSACIG00000017644	-	89	39.631	ENSACIG00000023794	-	77	39.631
ENSACIG00000017644	-	85	43.137	ENSACIG00000007464	-	55	43.137
ENSACIG00000017644	-	85	47.761	ENSACIG00000007034	-	72	47.761
ENSACIG00000017644	-	86	45.890	ENSACIG00000015429	-	85	45.890
ENSACIG00000017644	-	96	43.554	ENSACIG00000022625	-	96	45.255
ENSACIG00000017644	-	93	40.449	ENSACIG00000014123	znf236	71	40.449
ENSACIG00000017644	-	90	38.000	ENSACIG00000009443	-	60	38.000
ENSACIG00000017644	-	88	39.062	ENSACIG00000014282	znf526	88	39.062
ENSACIG00000017644	-	83	39.286	ENSACIG00000017892	-	76	39.286
ENSACIG00000017644	-	85	38.158	ENSACIG00000008611	-	60	38.158

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000017644	-	86	51.071	ENSACLG00000003546	-	63	51.071	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000017644	-	87	56.174	ENSACLG00000000473	-	88	56.174	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000017644	-	95	56.286	ENSACLG00000000487	-	95	56.286	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000017644	-	97	51.579	ENSACLG00000002844	-	88	51.579	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000017644	-	93	53.741	ENSACLG00000022497	-	99	53.741	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000017644	-	85	51.240	ENSHBUG00000006250	-	95	51.240	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000017644	-	92	53.616	ENSMZEG00005020759	-	99	53.616	Maylandia_zebra
ENSACIG00000017644	-	87	54.420	ENSMZEG00005012727	-	69	54.420	Maylandia_zebra
ENSACIG00000017644	-	87	59.531	ENSMZEG00005021801	-	85	59.531	Maylandia_zebra
ENSACIG00000017644	-	96	56.071	ENSMZEG00005020852	-	58	56.071	Maylandia_zebra
ENSACIG00000017644	-	90	55.942	ENSNBRG00000001608	-	100	55.942	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000017644	-	93	48.214	ENSNBRG00000009815	-	92	49.649	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000017644	-	95	58.475	ENSNBRG00000002542	-	98	58.475	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000017644	-	86	54.870	ENSONIG00000007886	-	99	54.870	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000017644	-	93	59.259	ENSPNYG00000005777	-	97	59.259	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000017644	-	90	52.212	ENSPNYG00000021571	-	88	52.212	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000017644	-	95	60.232	ENSPNYG00000023916	-	92	60.232	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000017644	-	95	49.157	ENSPNYG00000023637	-	81	47.893	Pundamilia_nyererei