EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000017647 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 176549 bases
Position: chrCCOE01000350.1:2963-179511
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000022737	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-73	1	13
ENSACIP00000022737	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-73	2	13
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ENSACIP00000022737	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-73	9	13
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ENSACIP00000022737	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-73	13	13
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ENSACIP00000022899	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-60	1	10
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ENSACIP00000022899	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-60	4	10
ENSACIP00000022899	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-60	5	10
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ENSACIP00000022899	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-60	9	10
ENSACIP00000022899	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-60	10	10
ENSACIP00000023161	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-59	1	12
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ENSACIP00000023161	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-59	12	12
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ENSACIP00000023042	zf-C2H2	PF00096.26	1.8e-27	1	5
ENSACIP00000023042	zf-C2H2	PF00096.26	1.8e-27	2	5
ENSACIP00000023042	zf-C2H2	PF00096.26	1.8e-27	3	5
ENSACIP00000023042	zf-C2H2	PF00096.26	1.8e-27	4	5
ENSACIP00000023042	zf-C2H2	PF00096.26	1.8e-27	5	5
ENSACIP00000023087	zf-C2H2	PF00096.26	2.9e-23	1	4
ENSACIP00000023087	zf-C2H2	PF00096.26	2.9e-23	2	4
ENSACIP00000023087	zf-C2H2	PF00096.26	2.9e-23	3	4
ENSACIP00000023087	zf-C2H2	PF00096.26	2.9e-23	4	4
ENSACIP00000022737	zf-met	PF12874.7	2.3e-25	1	3
ENSACIP00000022737	zf-met	PF12874.7	2.3e-25	2	3
ENSACIP00000022737	zf-met	PF12874.7	2.3e-25	3	3
ENSACIP00000023161	zf-met	PF12874.7	1.2e-22	1	3
ENSACIP00000023161	zf-met	PF12874.7	1.2e-22	2	3
ENSACIP00000023161	zf-met	PF12874.7	1.2e-22	3	3
ENSACIP00000023103	zf-met	PF12874.7	4.6e-21	1	2
ENSACIP00000023103	zf-met	PF12874.7	4.6e-21	2	2
ENSACIP00000022947	zf-met	PF12874.7	2.2e-19	1	3
ENSACIP00000022947	zf-met	PF12874.7	2.2e-19	2	3
ENSACIP00000022947	zf-met	PF12874.7	2.2e-19	3	3
ENSACIP00000022899	zf-met	PF12874.7	2.3e-19	1	3
ENSACIP00000022899	zf-met	PF12874.7	2.3e-19	2	3
ENSACIP00000022899	zf-met	PF12874.7	2.3e-19	3	3
ENSACIP00000022821	zf-met	PF12874.7	1.6e-18	1	3
ENSACIP00000022821	zf-met	PF12874.7	1.6e-18	2	3
ENSACIP00000022821	zf-met	PF12874.7	1.6e-18	3	3
ENSACIP00000022877	zf-met	PF12874.7	2.5e-16	1	2
ENSACIP00000022877	zf-met	PF12874.7	2.5e-16	2	2
ENSACIP00000023042	zf-met	PF12874.7	5.7e-15	1	2
ENSACIP00000023042	zf-met	PF12874.7	5.7e-15	2	2
ENSACIP00000023087	zf-met	PF12874.7	3.9e-11	1	2
ENSACIP00000023087	zf-met	PF12874.7	3.9e-11	2	2
ENSACIP00000023134	zf-met	PF12874.7	4.3e-11	1	2
ENSACIP00000023134	zf-met	PF12874.7	4.3e-11	2	2
ENSACIP00000023177	zf-met	PF12874.7	2.4e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000023556	-	1191	-	ENSACIP00000022947	396 (aa)	-	-
ENSACIT00000023427	-	1221	-	ENSACIP00000022821	406 (aa)	-	-
ENSACIT00000023340	-	1428	-	ENSACIP00000022737	475 (aa)	-	-
ENSACIT00000023651	-	834	-	ENSACIP00000023042	277 (aa)	-	-
ENSACIT00000023507	-	1197	-	ENSACIP00000022899	398 (aa)	-	-
ENSACIT00000023788	-	1254	-	ENSACIP00000023177	417 (aa)	-	-
ENSACIT00000023772	-	1512	-	ENSACIP00000023161	503 (aa)	-	-
ENSACIT00000023745	-	786	-	ENSACIP00000023134	261 (aa)	-	-
ENSACIT00000023484	-	1260	-	ENSACIP00000022877	419 (aa)	-	-
ENSACIT00000023697	-	1218	-	ENSACIP00000023087	405 (aa)	-	-
ENSACIT00000023714	-	1110	-	ENSACIP00000023103	369 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000017647	-	88	43.066	ENSACIG00000002180	-	98	41.860
ENSACIG00000017647	-	89	32.576	ENSACIG00000002944	-	95	36.364
ENSACIG00000017647	-	97	56.688	ENSACIG00000022645	-	95	54.348
ENSACIG00000017647	-	93	43.671	ENSACIG00000013163	-	94	44.944
ENSACIG00000017647	-	99	52.023	ENSACIG00000009755	-	85	52.532
ENSACIG00000017647	-	89	47.899	ENSACIG00000007855	-	95	51.316
ENSACIG00000017647	-	97	49.664	ENSACIG00000007464	-	79	49.664
ENSACIG00000017647	-	92	45.625	ENSACIG00000021378	gfi1aa	68	46.358
ENSACIG00000017647	-	86	42.326	ENSACIG00000009180	znf652	52	39.640
ENSACIG00000017647	-	96	32.716	ENSACIG00000003694	znf131	50	35.664
ENSACIG00000017647	-	97	46.316	ENSACIG00000010637	-	91	47.556
ENSACIG00000017647	-	99	56.274	ENSACIG00000003556	-	96	57.895
ENSACIG00000017647	-	94	40.602	ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	91	40.602
ENSACIG00000017647	-	97	51.568	ENSACIG00000004745	-	96	55.725
ENSACIG00000017647	-	96	63.370	ENSACIG00000008448	-	91	64.122
ENSACIG00000017647	-	94	38.971	ENSACIG00000018641	snai2	82	38.971
ENSACIG00000017647	-	99	52.778	ENSACIG00000024444	-	90	46.801
ENSACIG00000017647	-	82	39.604	ENSACIG00000009443	-	73	40.594
ENSACIG00000017647	-	84	54.545	ENSACIG00000014282	znf526	90	34.241
ENSACIG00000017647	-	99	49.261	ENSACIG00000006806	-	83	52.941
ENSACIG00000017647	-	97	42.857	ENSACIG00000014123	znf236	66	53.488
ENSACIG00000017647	-	99	48.128	ENSACIG00000007882	-	94	48.128
ENSACIG00000017647	-	95	51.389	ENSACIG00000022293	-	96	55.556
ENSACIG00000017647	-	91	51.592	ENSACIG00000007096	-	96	52.532
ENSACIG00000017647	-	84	56.250	ENSACIG00000010660	-	96	56.250
ENSACIG00000017647	-	94	42.795	ENSACIG00000013508	ZNF384	51	44.079
ENSACIG00000017647	-	98	42.152	ENSACIG00000023313	-	90	47.500
ENSACIG00000017647	-	90	33.173	ENSACIG00000004096	PRDM15	50	34.348
ENSACIG00000017647	-	87	50.735	ENSACIG00000019804	-	99	43.333
ENSACIG00000017647	-	94	50.000	ENSACIG00000023212	-	95	47.514
ENSACIG00000017647	-	96	49.861	ENSACIG00000013604	-	99	57.241
ENSACIG00000017647	-	87	39.394	ENSACIG00000001296	-	51	38.961
ENSACIG00000017647	-	89	51.351	ENSACIG00000007034	-	91	48.780
ENSACIG00000017647	-	93	42.143	ENSACIG00000008611	-	92	39.759
ENSACIG00000017647	-	89	41.549	ENSACIG00000017166	-	91	40.845
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