EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000017653 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 38142 bases
Position: chrCCOE01000325.1:250208-288349
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000022678	zf-C2H2	PF00096.26	3.7e-35	1	6
ENSACIP00000022678	zf-C2H2	PF00096.26	3.7e-35	2	6
ENSACIP00000022678	zf-C2H2	PF00096.26	3.7e-35	3	6
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ENSACIP00000022678	zf-met	PF12874.7	1.8e-13	1	2
ENSACIP00000022678	zf-met	PF12874.7	1.8e-13	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000023280	-	759	-	ENSACIP00000022678	252 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000017653	-	97	37.443	ENSACIG00000023794	-	55	37.443
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ENSACIG00000017653	-	94	37.069	ENSACIG00000020982	znf710b	50	34.711
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ENSACIG00000017653	-	93	44.330	ENSACIG00000016182	-	83	42.308
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ENSACIG00000017653	-	93	32.143	ENSACIG00000014233	znf407	65	32.143
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ENSACIG00000017653	-	97	43.162	ENSACIG00000017647	-	89	43.644
ENSACIG00000017653	-	95	44.444	ENSACIG00000000311	-	63	44.444
ENSACIG00000017653	-	99	42.045	ENSACIG00000014282	znf526	75	42.045
ENSACIG00000017653	-	93	43.137	ENSACIG00000022658	-	88	43.103
ENSACIG00000017653	-	96	40.948	ENSACIG00000023212	-	80	40.948
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ENSACIG00000017653	-	96	41.453	ENSACIG00000013604	-	96	41.453
ENSACIG00000017653	-	96	36.709	ENSACIG00000023313	-	92	36.709
ENSACIG00000017653	-	96	46.479	ENSACIG00000019815	-	82	46.479
ENSACIG00000017653	-	96	43.590	ENSACIG00000022293	-	97	43.590
ENSACIG00000017653	-	93	45.794	ENSACIG00000017050	-	97	41.379
ENSACIG00000017653	-	96	50.000	ENSACIG00000007034	-	71	50.000
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ENSACIG00000017653	-	97	42.105	ENSACIG00000010660	-	99	42.105
ENSACIG00000017653	-	93	40.343	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	87	40.343
ENSACIG00000017653	-	97	41.365	ENSACIG00000018440	-	99	41.365
ENSACIG00000017653	-	94	43.357	ENSACIG00000012084	-	97	43.357

Orthologs

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ENSACIG00000017653	-	93	58.333	ENSAPOG00000021959	-	53	39.823	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000017653	-	94	39.844	ENSAPOG00000005195	-	65	41.810	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000017653	-	94	40.964	ENSAPOG00000019061	-	73	40.964	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000017653	-	94	45.714	ENSAPOG00000021991	-	77	41.584	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000017653	-	93	44.608	ENSAPOG00000021383	-	62	44.608	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000017653	-	93	41.748	ENSAPOG00000013982	-	70	41.748	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000017653	-	95	34.686	ENSAPOG00000010200	-	57	40.426	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000017653	-	93	43.038	ENSAOCG00000012813	-	73	43.038	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000017653	-	93	40.323	ENSAOCG00000016905	-	76	40.323	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000017653	-	93	41.453	ENSAOCG00000002795	-	64	41.453	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000017653	-	93	44.340	ENSAOCG00000007134	-	77	39.011	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000017653	-	96	43.103	ENSAOCG00000017602	-	67	43.162	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000017653	-	93	44.118	ENSAOCG00000002430	-	73	44.118	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000017653	-	93	44.017	ENSAOCG00000017595	-	61	44.017	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000017653	-	96	44.444	ENSAOCG00000010471	-	67	44.444	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000017653	-	93	44.017	ENSAPEG00000012443	-	61	44.017	Amphiprion_percula
ENSACIG00000017653	-	96	43.103	ENSAPEG00000012470	-	67	43.162	Amphiprion_percula
ENSACIG00000017653	-	93	40.079	ENSAPEG00000001546	-	88	40.079	Amphiprion_percula
ENSACIG00000017653	-	96	43.333	ENSAPEG00000015337	-	97	41.558	Amphiprion_percula
ENSACIG00000017653	-	95	44.118	ENSAPEG00000013044	-	59	44.118	Amphiprion_percula
ENSACIG00000017653	-	96	44.444	ENSAPEG00000013097	-	72	44.444	Amphiprion_percula
ENSACIG00000017653	-	93	39.205	ENSAPEG00000019106	-	53	40.476	Amphiprion_percula
ENSACIG00000017653	-	93	40.341	ENSATEG00000008674	-	50	40.341	Anabas_testudineus
ENSACIG00000017653	-	93	38.298	ENSATEG00000019378	-	59	38.298	Anabas_testudineus
ENSACIG00000017653	-	93	37.154	ENSATEG00000013871	-	52	37.154	Anabas_testudineus
ENSACIG00000017653	-	94	38.235	ENSACLG00000020231	-	93	37.333	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000017653	-	96	45.455	ENSACLG00000013935	-	77	45.455	Astatotilapia_calliptera
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