EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000017719 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: si:dkey-98f17.5
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9614 bases
Position: chrCCOE01000938.1:669593-679206
Accession: ZDB-GENE-060526-354
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000022783	MMR_HSR1	PF01926.23	1.1e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000023387	-	1347	-	ENSACIP00000022783	448 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	57.871	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	57.871

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	93.973	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	93.973	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	94.420	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	94.420	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Amphiprion_percula
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	94.420	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	94.420	Amphiprion_percula
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Anabas_testudineus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Anabas_testudineus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	99	58.036	ENSACAG00000028632	-	99	58.575	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	94.866	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	94.866	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	59.292	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	59.292	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	59.692	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	59.692	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	81.737	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	81.737	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	79	62.360	ENSCING00000020807	-	94	62.360	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	98	56.364	ENSCSAVG00000009987	-	98	56.591	Ciona_savignyi
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	57.556	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	58.278	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	89.732	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	87.264	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	90.179	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	90.179	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	75.000	Danio_rerio
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	98	84.091	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	84.091	Danio_rerio
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	79	55.932	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	95	55.932	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	99	81.390	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	81.390	Esox_lucius
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	58.980	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	58.980	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	89	55.362	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	55.362	Gadus_morhua
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Gambusia_affinis
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	90.848	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	90.848	Gambusia_affinis
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	85	63.613	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	61.596	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	58	94.574	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.574	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	59.513	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	59.513	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	95.312	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	95.312	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	99	86.036	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	86.036	Hippocampus_comes
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Hippocampus_comes
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	96	59.584	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	59.584	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	78.174	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	78.174	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	84	58.201	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	83	58.201	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	59.333	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Labrus_bergylta
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	99	69.144	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.144	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	99	61.798	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	62.022	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	62.138	ENSLACG00000004899	-	99	62.138	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	99	75.839	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.839	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	91.518	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	91.518	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	96	60.508	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	60.508	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	59.071	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	59.071	Maylandia_zebra
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	95.089	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	95.089	Maylandia_zebra
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	57.206	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	57.206	Mola_mola
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	98	89.749	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	89.749	Monopterus_albus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Monopterus_albus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	94.866	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	94.866	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	96	60.046	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	60.046	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	58.850	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	58.850	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	96.429	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	96.429	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Oryzias_latipes
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	86.607	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	86.607	Oryzias_latipes
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	89.732	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	89.732	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	89.955	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	89.955	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	78.174	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	78.174	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	58.575	ENSPKIG00000023918	-	98	58.575	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	87.723	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	87.723	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	59.735	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	59.735	Periophthalmus_magnuspinnatus
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