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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000017754 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 26556 bases
Position: chrCCOE01001043.1:2301764-2328319
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000023073	RRM_1	PF00076.22	2.8e-33	1	2
ENSACIP00000023073	RRM_1	PF00076.22	2.8e-33	2	2
ENSACIP00000023050	RRM_1	PF00076.22	2.6e-28	1	2
ENSACIP00000023050	RRM_1	PF00076.22	2.6e-28	2	2
ENSACIP00000023038	RRM_1	PF00076.22	2.8e-28	1	2
ENSACIP00000023038	RRM_1	PF00076.22	2.8e-28	2	2
ENSACIP00000023080	RRM_1	PF00076.22	6e-26	1	2
ENSACIP00000023080	RRM_1	PF00076.22	6e-26	2	2
ENSACIP00000023095	RRM_1	PF00076.22	4.3e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000023690	-	615	-	ENSACIP00000023080	204 (aa)	-	-
ENSACIT00000023660	-	1257	-	ENSACIP00000023050	418 (aa)	-	-
ENSACIT00000023647	-	1281	-	ENSACIP00000023038	426 (aa)	-	-
ENSACIT00000023705	-	849	-	ENSACIP00000023095	282 (aa)	-	-
ENSACIT00000023683	-	1194	-	ENSACIP00000023073	397 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000017754	-	67	42.424	ENSACIG00000012946	hnrnpa1b	79	37.021
ENSACIG00000017754	-	67	36.364	ENSACIG00000021815	-	90	39.130
ENSACIG00000017754	-	64	49.618	ENSACIG00000008353	hnrnpd	73	45.783
ENSACIG00000017754	-	67	40.152	ENSACIG00000020389	HNRNPA1P48	95	35.632
ENSACIG00000017754	-	61	40.800	ENSACIG00000003327	tardbpl	73	36.364
ENSACIG00000017754	-	64	33.333	ENSACIG00000021834	HNRNPA0	91	34.259
ENSACIG00000017754	-	64	32.394	ENSACIG00000021116	rbm39b	59	32.394
ENSACIG00000017754	-	87	43.796	ENSACIG00000012959	-	90	37.885
ENSACIG00000017754	-	67	45.255	ENSACIG00000017341	hnrnpaba	78	45.333
ENSACIG00000017754	-	73	68.919	ENSACIG00000009475	msi2a	93	57.609

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000017754	-	78	82.675	ENSG00000135097	MSI1	99	87.931	Homo_sapiens
ENSACIG00000017754	-	78	91.640	ENSAPOG00000003191	MSI1	87	94.059	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000017754	-	72	93.069	ENSAPOG00000023458	-	94	82.927	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000017754	-	72	88.462	ENSAMEG00000013302	MSI1	96	74.785	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000017754	-	79	84.494	ENSAOCG00000009031	-	94	84.494	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000017754	-	72	97.525	ENSAOCG00000003804	MSI1	93	87.462	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000017754	-	72	93.069	ENSAPEG00000006857	-	79	82.927	Amphiprion_percula
ENSACIG00000017754	-	72	97.525	ENSAPEG00000003245	MSI1	93	87.462	Amphiprion_percula
ENSACIG00000017754	-	84	88.293	ENSATEG00000023779	-	93	87.009	Anabas_testudineus
ENSACIG00000017754	-	78	90.203	ENSATEG00000017059	MSI1	93	88.341	Anabas_testudineus
ENSACIG00000017754	-	78	83.232	ENSACAG00000002762	MSI1	91	83.232	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000017754	-	64	86.154	ENSANAG00000027901	-	88	82.264	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000017754	-	78	82.675	ENSANAG00000027151	MSI1	91	82.675	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000017754	-	72	93.069	ENSACLG00000000117	-	96	87.789	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000017754	-	89	85.319	ENSACLG00000011230	MSI1	96	85.319	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000017754	-	78	88.177	ENSAMXG00000038960	msi1	71	90.493	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000017754	-	78	87.702	ENSBTAG00000009800	MSI1	96	87.702	Bos_taurus
ENSACIG00000017754	-	79	87.540	ENSCJAG00000008578	MSI1	91	82.675	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000017754	-	88	75.072	ENSCAFG00000010283	MSI1	91	82.371	Canis_familiaris
ENSACIG00000017754	-	78	82.215	ENSCAFG00020020585	MSI1	96	82.215	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000017754	-	78	81.928	ENSCHIG00000024304	MSI1	95	81.928	Capra_hircus
ENSACIG00000017754	-	78	81.847	ENSTSYG00000033949	MSI1	91	81.847	Carlito_syrichta
ENSACIG00000017754	-	78	81.923	ENSCAPG00000003919	MSI1	74	81.923	Cavia_aperea
ENSACIG00000017754	-	78	82.675	ENSCPOG00000012361	MSI1	96	82.675	Cavia_porcellus
ENSACIG00000017754	-	78	82.675	ENSCCAG00000035567	MSI1	91	82.675	Cebus_capucinus
ENSACIG00000017754	-	78	84.953	ENSCATG00000030019	MSI1	94	84.953	Cercocebus_atys
ENSACIG00000017754	-	78	82.675	ENSCLAG00000011329	MSI1	96	82.675	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000017754	-	64	90.000	ENSCSAG00000002265	MSI1	88	81.496	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000017754	-	79	87.220	ENSCPBG00000011349	MSI1	88	90.210	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017754	-	78	81.905	ENSCANG00000040651	MSI1	96	81.905	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000017754	-	78	82.675	ENSCGRG00001018883	Msi1	95	81.138	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000017754	-	78	81.962	ENSCGRG00000002191	Msi1	69	81.962	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000017754	-	78	88.673	ENSCSEG00000008352	-	95	85.714	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000017754	-	76	94.419	ENSCSEG00000005834	-	94	94.419	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000017754	-	78	85.390	ENSCSEG00000011032	MSI1	96	88.380	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000017754	-	74	75.342	ENSCVAG00000017463	-	89	75.342	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000017754	-	64	67.857	ENSCVAG00000017430	zgc:110796	78	67.857	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000017754	-	78	90.615	ENSCVAG00000009100	MSI1	90	90.615	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000017754	-	72	90.196	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	89	87.850	Danio_rerio
ENSACIG00000017754	-	54	92.857	ENSDARG00000041299	zgc:110796	74	92.857	Danio_rerio
ENSACIG00000017754	-	78	87.119	ENSDARG00000010710	msi1	95	90.813	Danio_rerio
ENSACIG00000017754	-	78	75.873	ENSDNOG00000005713	MSI1	92	75.472	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000017754	-	78	81.308	ENSDORG00000005610	Msi1	96	77.811	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000017754	-	78	78.095	ENSETEG00000004756	MSI1	96	78.095	Echinops_telfairi
ENSACIG00000017754	-	78	87.742	ENSEASG00005004736	MSI1	94	87.742	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000017754	-	79	87.025	ENSECAG00000017526	MSI1	91	82.675	Equus_caballus
ENSACIG00000017754	-	85	79.718	ENSELUG00000023219	MSI1	88	82.188	Esox_lucius
ENSACIG00000017754	-	78	84.112	ENSELUG00000023280	-	96	86.869	Esox_lucius
ENSACIG00000017754	-	79	87.540	ENSFCAG00000011007	MSI1	91	82.675	Felis_catus
ENSACIG00000017754	-	78	82.828	ENSFALG00000007574	MSI1	96	85.366	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000017754	-	78	81.587	ENSFDAG00000019586	MSI1	96	81.587	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000017754	-	72	94.059	ENSFHEG00000022446	MSI1	94	83.537	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000017754	-	72	97.525	ENSFHEG00000003560	-	92	97.895	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000017754	-	72	89.655	ENSGMOG00000001006	MSI1	86	87.333	Gadus_morhua
ENSACIG00000017754	-	72	91.304	ENSGMOG00000017838	-	94	75.301	Gadus_morhua
ENSACIG00000017754	-	78	82.625	ENSGALG00000007227	MSI1	94	80.994	Gallus_gallus
ENSACIG00000017754	-	75	73.333	ENSGAFG00000005860	-	85	76.923	Gambusia_affinis
ENSACIG00000017754	-	72	96.059	ENSGAFG00000021522	MSI1	90	92.667	Gambusia_affinis
ENSACIG00000017754	-	78	84.195	ENSGACG00000008674	-	91	84.195	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000017754	-	78	88.026	ENSGACG00000012679	MSI1	93	85.761	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000017754	-	78	88.026	ENSGAGG00000016037	MSI1	90	88.026	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000017754	-	78	82.060	ENSGGOG00000010328	MSI1	96	82.060	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000017754	-	72	99.505	ENSHBUG00000021921	MSI1	93	88.073	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000017754	-	72	93.069	ENSHBUG00000011841	-	91	85.061	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000017754	-	78	82.371	ENSHGLG00000012782	MSI1	91	82.371	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000017754	-	78	81.587	ENSHGLG00100016848	MSI1	96	81.587	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000017754	-	78	89.527	ENSHCOG00000012067	-	85	93.310	Hippocampus_comes
ENSACIG00000017754	-	78	91.883	ENSHCOG00000012019	MSI1	96	95.423	Hippocampus_comes
ENSACIG00000017754	-	78	86.288	ENSIPUG00000001976	msi1	95	89.583	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000017754	-	78	82.215	ENSSTOG00000009799	MSI1	96	82.215	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000017754	-	78	83.951	ENSJJAG00000010463	Msi1	94	83.951	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000017754	-	64	87.692	ENSJJAG00000010643	-	93	74.516	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000017754	-	72	92.118	ENSKMAG00000011251	MSI1	94	83.129	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000017754	-	78	93.182	ENSKMAG00000019877	-	96	96.831	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000017754	-	78	90.939	ENSLBEG00000008789	MSI1	94	88.673	Labrus_bergylta
ENSACIG00000017754	-	81	95.046	ENSLBEG00000001375	-	88	95.046	Labrus_bergylta
ENSACIG00000017754	-	78	83.792	ENSLACG00000018287	MSI1	96	83.792	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000017754	-	64	75.556	ENSLOCG00000008618	zgc:110796	58	75.556	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000017754	-	72	81.106	ENSLAFG00000009412	MSI1	96	76.712	Loxodonta_africana
ENSACIG00000017754	-	78	82.675	ENSMFAG00000001798	MSI1	96	82.675	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000017754	-	78	82.675	ENSMMUG00000031527	MSI1	93	82.424	Macaca_mulatta
ENSACIG00000017754	-	78	87.742	ENSMNEG00000040034	MSI1	94	87.742	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000017754	-	78	81.905	ENSMLEG00000003921	MSI1	96	81.905	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000017754	-	81	93.789	ENSMAMG00000018426	-	91	97.887	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000017754	-	72	92.079	ENSMAMG00000002279	MSI1	87	87.375	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000017754	-	78	90.291	ENSMZEG00005000340	-	90	90.291	Maylandia_zebra
ENSACIG00000017754	-	72	99.505	ENSMZEG00005026892	MSI1	93	88.073	Maylandia_zebra
ENSACIG00000017754	-	64	93.671	ENSMGAG00000016518	-	100	93.491	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000017754	-	64	90.000	ENSMAUG00000016820	Msi1	99	87.336	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000017754	-	78	83.642	ENSMICG00000033181	MSI1	94	83.642	Microcebus_murinus
ENSACIG00000017754	-	83	80.000	ENSMOCG00000002286	Msi1	91	82.371	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000017754	-	78	93.289	ENSMMOG00000012265	-	92	97.544	Mola_mola
ENSACIG00000017754	-	79	82.911	ENSMMOG00000010492	MSI1	92	85.915	Mola_mola
ENSACIG00000017754	-	57	78.632	ENSMODG00000003189	-	96	57.188	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000017754	-	80	86.462	ENSMALG00000017889	MSI1	91	90.785	Monopterus_albus
ENSACIG00000017754	-	78	93.831	ENSMALG00000001426	-	96	97.535	Monopterus_albus
ENSACIG00000017754	-	78	82.371	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	99	88.722	Mus_caroli
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ENSACIG00000017754	-	78	82.067	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	99	88.346	Mus_pahari
ENSACIG00000017754	-	78	82.371	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	99	88.722	Mus_spretus
ENSACIG00000017754	-	78	82.215	ENSMPUG00000003168	MSI1	96	82.215	Mustela_putorius_furo
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