EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000017892 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2782 bases
Position: chrCCOE01000389.1:1381863-1384644
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000023020	zf-C2H2	PF00096.26	6.4e-22	1	5
ENSACIP00000023020	zf-C2H2	PF00096.26	6.4e-22	2	5
ENSACIP00000023020	zf-C2H2	PF00096.26	6.4e-22	3	5
ENSACIP00000023020	zf-C2H2	PF00096.26	6.4e-22	4	5
ENSACIP00000023020	zf-C2H2	PF00096.26	6.4e-22	5	5
ENSACIP00000023020	zf-met	PF12874.7	1.5e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000023629	-	780	-	ENSACIP00000023020	259 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000017892	-	73	40.411	ENSACIG00000013508	ZNF384	52	40.411
ENSACIG00000017892	-	74	43.307	ENSACIG00000006755	-	75	43.307
ENSACIG00000017892	-	76	42.857	ENSACIG00000019710	-	73	42.857
ENSACIG00000017892	-	68	41.228	ENSACIG00000017166	-	66	41.228
ENSACIG00000017892	-	92	38.235	ENSACIG00000021986	-	90	38.235
ENSACIG00000017892	-	76	41.624	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	95	41.624
ENSACIG00000017892	-	91	44.355	ENSACIG00000004666	-	99	45.270
ENSACIG00000017892	-	77	39.891	ENSACIG00000023794	-	56	39.891
ENSACIG00000017892	-	81	42.647	ENSACIG00000007882	-	74	42.647
ENSACIG00000017892	-	85	35.514	ENSACIG00000009128	-	79	35.514
ENSACIG00000017892	-	79	44.330	ENSACIG00000004745	-	93	44.330
ENSACIG00000017892	-	97	43.889	ENSACIG00000013604	-	99	43.889
ENSACIG00000017892	-	85	41.414	ENSACIG00000009717	-	88	41.414
ENSACIG00000017892	-	86	39.070	ENSACIG00000013163	-	76	39.070
ENSACIG00000017892	-	76	39.286	ENSACIG00000017644	-	83	39.286
ENSACIG00000017892	-	75	45.763	ENSACIG00000016133	-	59	45.763
ENSACIG00000017892	-	89	36.087	ENSACIG00000009755	-	87	36.087
ENSACIG00000017892	-	78	36.434	ENSACIG00000007855	-	95	36.434
ENSACIG00000017892	-	85	46.970	ENSACIG00000004041	-	94	45.370
ENSACIG00000017892	-	86	41.837	ENSACIG00000015429	-	82	40.881
ENSACIG00000017892	-	87	36.190	ENSACIG00000020938	zbtb47b	69	36.190
ENSACIG00000017892	-	73	36.702	ENSACIG00000007000	-	54	36.702
ENSACIG00000017892	-	68	33.636	ENSACIG00000012604	scrt2	53	33.636
ENSACIG00000017892	-	85	35.979	ENSACIG00000018404	-	73	35.979
ENSACIG00000017892	-	98	44.444	ENSACIG00000022293	-	93	44.444
ENSACIG00000017892	-	89	44.068	ENSACIG00000016182	-	85	45.556
ENSACIG00000017892	-	76	40.171	ENSACIG00000017653	-	94	40.171
ENSACIG00000017892	-	83	40.152	ENSACIG00000015411	-	73	40.769
ENSACIG00000017892	-	83	38.947	ENSACIG00000019815	-	81	45.038
ENSACIG00000017892	-	75	39.437	ENSACIG00000012263	znf319b	92	39.437
ENSACIG00000017892	-	87	46.597	ENSACIG00000019791	-	92	47.802
ENSACIG00000017892	-	94	34.959	ENSACIG00000001767	zbtb41	67	34.959
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ENSACIG00000017892	-	82	39.227	ENSACIG00000000406	prdm5	75	39.227
ENSACIG00000017892	-	98	38.144	ENSACIG00000003515	-	90	42.188
ENSACIG00000017892	-	70	44.444	ENSACIG00000003720	-	60	44.444
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ENSACIG00000017892	-	76	44.681	ENSACIG00000010637	-	52	44.681
ENSACIG00000017892	-	82	37.853	ENSACIG00000016117	-	81	37.853
ENSACIG00000017892	-	81	44.304	ENSACIG00000017013	-	53	44.304
ENSACIG00000017892	-	80	42.029	ENSACIG00000003754	-	84	42.029
ENSACIG00000017892	-	74	46.980	ENSACIG00000022658	-	93	45.026
ENSACIG00000017892	-	75	38.255	ENSACIG00000019804	-	82	38.255
ENSACIG00000017892	-	70	35.976	ENSACIG00000019534	-	78	35.976
ENSACIG00000017892	-	86	43.617	ENSACIG00000023212	-	77	43.617
ENSACIG00000017892	-	72	48.800	ENSACIG00000023162	-	50	48.800
ENSACIG00000017892	-	75	47.200	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	82	39.175
ENSACIG00000017892	-	85	46.111	ENSACIG00000008448	-	73	46.111
ENSACIG00000017892	-	80	40.659	ENSACIG00000023313	-	90	40.659
ENSACIG00000017892	-	61	50.725	ENSACIG00000010660	-	96	50.725
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ENSACIG00000017892	-	77	41.530	ENSACIG00000009780	-	73	41.530
ENSACIG00000017892	-	73	45.699	ENSACIG00000019447	-	69	45.699
ENSACIG00000017892	-	82	40.690	ENSACIG00000014282	znf526	65	40.690
ENSACIG00000017892	-	80	39.196	ENSACIG00000022625	-	84	37.391
ENSACIG00000017892	-	91	40.476	ENSACIG00000019102	-	50	40.476
ENSACIG00000017892	-	83	43.333	ENSACIG00000022738	-	97	41.398
ENSACIG00000017892	-	85	42.564	ENSACIG00000013470	-	64	42.564
ENSACIG00000017892	-	94	44.792	ENSACIG00000014123	znf236	56	44.792
ENSACIG00000017892	-	74	45.000	ENSACIG00000015835	-	68	48.889
ENSACIG00000017892	-	71	36.022	ENSACIG00000014233	znf407	53	36.022
ENSACIG00000017892	-	84	46.875	ENSACIG00000018440	-	96	46.875
ENSACIG00000017892	-	69	41.053	ENSACIG00000013946	-	55	41.053
ENSACIG00000017892	-	73	40.113	ENSACIG00000022330	-	88	40.113
ENSACIG00000017892	-	83	43.407	ENSACIG00000000311	-	57	43.407
ENSACIG00000017892	-	98	45.205	ENSACIG00000017050	-	97	45.263
ENSACIG00000017892	-	78	45.946	ENSACIG00000006806	-	61	45.946
ENSACIG00000017892	-	76	39.726	ENSACIG00000013149	-	81	39.726
ENSACIG00000017892	-	56	31.250	ENSACIG00000009443	-	62	32.143
ENSACIG00000017892	-	83	44.000	ENSACIG00000004626	-	78	44.000
ENSACIG00000017892	-	74	50.000	ENSACIG00000016944	-	77	50.000
ENSACIG00000017892	-	91	42.130	ENSACIG00000010647	-	97	44.615
ENSACIG00000017892	-	81	35.115	ENSACIG00000018641	snai2	52	35.115
ENSACIG00000017892	-	70	39.429	ENSACIG00000017683	-	76	37.584
ENSACIG00000017892	-	86	43.946	ENSACIG00000003556	-	69	43.946
ENSACIG00000017892	-	75	41.237	ENSACIG00000024444	-	65	43.085
ENSACIG00000017892	-	72	35.366	ENSACIG00000001369	-	82	35.366
ENSACIG00000017892	-	83	37.500	ENSACIG00000006377	-	62	37.500
ENSACIG00000017892	-	77	43.966	ENSACIG00000006228	-	75	43.966
ENSACIG00000017892	-	75	45.570	ENSACIG00000012084	-	98	45.570
ENSACIG00000017892	-	72	35.714	ENSACIG00000011516	-	77	33.166
ENSACIG00000017892	-	90	41.322	ENSACIG00000011515	-	73	41.322
ENSACIG00000017892	-	78	46.721	ENSACIG00000022645	-	66	46.721
ENSACIG00000017892	-	87	36.842	ENSACIG00000008886	znf1164	90	36.842
ENSACIG00000017892	-	83	35.673	ENSACIG00000012636	ZNF319	84	35.673
ENSACIG00000017892	-	72	32.520	ENSACIG00000013613	scrt1b	54	32.520
ENSACIG00000017892	-	77	37.811	ENSACIG00000013750	-	62	37.811
ENSACIG00000017892	-	70	42.000	ENSACIG00000007096	-	69	42.000
ENSACIG00000017892	-	81	40.476	ENSACIG00000010739	-	81	40.476
ENSACIG00000017892	-	83	48.800	ENSACIG00000011153	-	70	50.000
ENSACIG00000017892	-	70	44.444	ENSACIG00000007034	-	78	44.444
ENSACIG00000017892	-	73	43.094	ENSACIG00000011541	-	67	43.094
ENSACIG00000017892	-	85	44.545	ENSACIG00000000286	-	71	44.545
ENSACIG00000017892	-	70	43.363	ENSACIG00000018059	-	51	43.363
ENSACIG00000017892	-	85	33.333	ENSACIG00000023049	znf646	96	32.237
ENSACIG00000017892	-	92	42.353	ENSACIG00000017647	-	89	44.737
ENSACIG00000017892	-	73	42.276	ENSACIG00000004641	-	56	42.276
ENSACIG00000017892	-	74	44.681	ENSACIG00000018022	-	56	44.681

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000017892	-	83	44.737	ENSAPOG00000019138	-	56	44.737	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000017892	-	74	38.220	ENSAOCG00000014769	-	53	38.220	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000017892	-	83	44.118	ENSAOCG00000016897	-	66	44.118	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000017892	-	78	35.484	ENSAOCG00000001325	-	66	35.484	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000017892	-	82	35.238	ENSAOCG00000006744	-	78	35.238	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000017892	-	83	44.118	ENSAPEG00000001556	-	63	44.118	Amphiprion_percula
ENSACIG00000017892	-	73	43.972	ENSAPEG00000010013	-	54	35.047	Amphiprion_percula
ENSACIG00000017892	-	92	44.538	ENSATEG00000018931	-	88	41.781	Anabas_testudineus
ENSACIG00000017892	-	58	44.211	ENSACLG00000011658	-	78	42.353	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000017892	-	59	44.595	ENSACLG00000019154	-	75	44.595	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000017892	-	83	41.732	ENSAMXG00000029518	-	72	41.732	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000017892	-	75	36.508	ENSCING00000002128	zf(c2h2)-35	72	36.508	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000017892	-	76	51.190	ENSCSEG00000015593	-	77	51.190	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000017892	-	83	45.333	ENSCSEG00000010453	-	67	45.333	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000017892	-	69	43.478	ENSCSEG00000010264	-	68	43.478	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000017892	-	79	37.500	ENSCVAG00000020141	-	70	37.500	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000017892	-	81	46.875	ENSCVAG00000012682	-	73	46.875	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000017892	-	73	44.068	ENSCVAG00000006653	-	61	44.068	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000017892	-	73	40.397	ENSCVAG00000015616	-	75	38.889	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000017892	-	98	46.218	ENSCVAG00000003250	-	70	46.218	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000017892	-	75	44.000	ENSCVAG00000006484	-	57	44.000	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000017892	-	75	38.835	ENSEBUG00000007931	-	72	37.949	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000017892	-	80	39.572	ENSEBUG00000002290	-	53	39.572	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000017892	-	78	42.775	ENSELUG00000001909	-	82	33.735	Esox_lucius
ENSACIG00000017892	-	78	44.172	ENSELUG00000020882	-	50	44.172	Esox_lucius
ENSACIG00000017892	-	85	52.941	ENSELUG00000024007	-	61	52.941	Esox_lucius
ENSACIG00000017892	-	82	36.697	ENSGAFG00000007528	-	60	36.697	Gambusia_affinis
ENSACIG00000017892	-	73	42.069	ENSGAFG00000008204	-	62	42.069	Gambusia_affinis
ENSACIG00000017892	-	78	43.871	ENSGAFG00000001879	-	71	43.871	Gambusia_affinis
ENSACIG00000017892	-	86	40.667	ENSHBUG00000006656	-	56	40.667	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000017892	-	90	45.455	ENSHCOG00000015497	-	73	45.455	Hippocampus_comes
ENSACIG00000017892	-	70	43.956	ENSHCOG00000020670	-	73	43.956	Hippocampus_comes
ENSACIG00000017892	-	98	40.860	ENSHCOG00000013489	-	89	40.860	Hippocampus_comes
ENSACIG00000017892	-	73	43.558	ENSHCOG00000008550	-	54	43.558	Hippocampus_comes
ENSACIG00000017892	-	73	43.558	ENSHCOG00000001873	-	54	43.558	Hippocampus_comes
ENSACIG00000017892	-	78	41.096	ENSIPUG00000013083	-	53	41.096	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000017892	-	85	32.889	ENSKMAG00000007699	-	70	32.889	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000017892	-	85	35.577	ENSKMAG00000014184	-	53	35.577	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000017892	-	89	34.348	ENSLBEG00000011210	-	57	34.348	Labrus_bergylta
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ENSACIG00000017892	-	95	47.899	ENSLBEG00000001132	-	57	47.899	Labrus_bergylta
ENSACIG00000017892	-	72	36.585	ENSLBEG00000006161	-	70	36.585	Labrus_bergylta
ENSACIG00000017892	-	70	40.491	ENSLBEG00000007106	-	60	40.491	Labrus_bergylta
ENSACIG00000017892	-	97	37.824	ENSLOCG00000004208	-	99	37.824	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000017892	-	98	48.718	ENSMAMG00000017939	-	79	48.718	Mastacembelus_armatus
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ENSACIG00000017892	-	68	45.833	ENSMMOG00000013330	-	55	45.833	Mola_mola
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ENSACIG00000017892	-	83	35.028	ENSONIG00000007967	-	56	35.028	Oreochromis_niloticus
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ENSACIG00000017892	-	80	41.935	ENSORLG00015018099	-	63	41.935	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000017892	-	92	44.737	ENSOMEG00000005578	-	69	44.737	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000017892	-	70	38.012	ENSPMGG00000006928	-	53	38.012	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000017892	-	80	43.878	ENSPMGG00000002661	-	80	40.476	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000017892	-	75	42.478	ENSPMGG00000002659	-	83	42.574	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSACIG00000017892	-	76	39.896	ENSPMGG00000009571	-	73	39.837	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000017892	-	81	42.857	ENSPMGG00000002455	-	84	42.857	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000017892	-	63	45.918	ENSPMAG00000000839	-	93	45.918	Petromyzon_marinus
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ENSACIG00000017892	-	59	40.164	ENSPMAG00000002022	-	95	40.164	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000017892	-	100	41.781	ENSPFOG00000018860	-	98	41.781	Poecilia_formosa
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ENSACIG00000017892	-	69	38.053	ENSPMEG00000005210	-	89	38.053	Poecilia_mexicana
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ENSACIG00000017892	-	75	42.857	ENSPREG00000002603	-	57	42.857	Poecilia_reticulata
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ENSACIG00000017892	-	78	40.777	ENSPNYG00000017888	-	53	43.617	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000017892	-	78	38.065	ENSPNAG00000005946	-	90	38.065	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000017892	-	70	42.105	ENSSFOG00015011531	-	89	41.791	Scleropages_formosus
ENSACIG00000017892	-	83	43.939	ENSSMAG00000004259	-	79	43.939	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000017892	-	80	34.021	ENSSMAG00000008308	-	52	40.323	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000017892	-	87	39.891	ENSSMAG00000013291	-	98	38.500	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000017892	-	73	35.882	ENSSLDG00000014436	-	73	35.882	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000017892	-	58	35.878	ENSSPAG00000005770	-	58	35.878	Stegastes_partitus
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ENSACIG00000017892	-	90	46.667	ENSXETG00000012506	znf91	99	46.667	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000017892	-	71	36.885	ENSXCOG00000003441	-	58	38.286	Xiphophorus_couchianus
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ENSACIG00000017892	-	69	38.053	ENSXMAG00000012936	-	87	38.053	Xiphophorus_maculatus