EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000018022 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 882 bases
Position: chrCCOE01000350.1:43156-44037
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000023198	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-29	1	5
ENSACIP00000023198	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-29	2	5
ENSACIP00000023198	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-29	3	5
ENSACIP00000023198	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-29	4	5
ENSACIP00000023198	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-29	5	5
ENSACIP00000023198	zf-met	PF12874.7	2.1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000023809	-	882	-	ENSACIP00000023198	293 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000018022	-	53	44.371	ENSACIG00000019804	-	82	44.371
ENSACIG00000018022	-	57	42.593	ENSACIG00000009128	-	79	48.000
ENSACIG00000018022	-	78	53.750	ENSACIG00000022625	-	97	53.750
ENSACIG00000018022	-	84	55.319	ENSACIG00000016182	-	99	55.319
ENSACIG00000018022	-	52	48.175	ENSACIG00000004626	-	76	48.175
ENSACIG00000018022	-	99	54.861	ENSACIG00000003556	-	92	54.861
ENSACIG00000018022	-	50	55.102	ENSACIG00000012084	-	97	55.102
ENSACIG00000018022	-	99	58.442	ENSACIG00000003754	-	86	58.442
ENSACIG00000018022	-	83	49.645	ENSACIG00000023212	-	93	49.645
ENSACIG00000018022	-	51	49.123	ENSACIG00000006228	-	59	49.123
ENSACIG00000018022	-	51	48.551	ENSACIG00000013163	-	81	48.551
ENSACIG00000018022	-	59	49.020	ENSACIG00000016180	znf341	50	49.020
ENSACIG00000018022	-	91	58.519	ENSACIG00000004041	-	97	58.519
ENSACIG00000018022	-	52	34.286	ENSACIG00000002944	-	78	34.286
ENSACIG00000018022	-	66	40.496	ENSACIG00000015411	-	81	41.727
ENSACIG00000018022	-	51	55.357	ENSACIG00000022738	-	91	47.934
ENSACIG00000018022	-	99	43.986	ENSACIG00000000286	-	90	63.265
ENSACIG00000018022	-	75	57.851	ENSACIG00000016932	-	74	57.851
ENSACIG00000018022	-	89	36.296	ENSACIG00000007464	-	83	36.296
ENSACIG00000018022	-	53	49.057	ENSACIG00000017653	-	96	49.057
ENSACIG00000018022	-	84	51.064	ENSACIG00000010647	-	99	51.773
ENSACIG00000018022	-	89	42.727	ENSACIG00000017683	-	76	43.802
ENSACIG00000018022	-	79	50.000	ENSACIG00000022658	-	95	53.731
ENSACIG00000018022	-	56	45.238	ENSACIG00000023313	-	88	45.238
ENSACIG00000018022	-	96	46.512	ENSACIG00000022645	-	80	45.847
ENSACIG00000018022	-	51	36.364	ENSACIG00000011516	-	78	36.508
ENSACIG00000018022	-	99	65.714	ENSACIG00000017050	-	96	70.940
ENSACIG00000018022	-	91	51.111	ENSACIG00000024444	-	87	51.111
ENSACIG00000018022	-	54	48.936	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	85	48.936
ENSACIG00000018022	-	72	40.777	ENSACIG00000009717	-	87	48.611
ENSACIG00000018022	-	58	47.500	ENSACIG00000012636	ZNF319	82	47.500
ENSACIG00000018022	-	77	65.368	ENSACIG00000008448	-	95	65.368
ENSACIG00000018022	-	78	53.901	ENSACIG00000019102	-	64	55.224
ENSACIG00000018022	-	62	37.857	ENSACIG00000012263	znf319b	66	37.857
ENSACIG00000018022	-	57	43.066	ENSACIG00000000406	prdm5	79	43.066
ENSACIG00000018022	-	53	53.901	ENSACIG00000018440	-	97	53.901
ENSACIG00000018022	-	79	58.156	ENSACIG00000010966	-	69	58.865
ENSACIG00000018022	-	99	48.718	ENSACIG00000019710	-	96	52.555
ENSACIG00000018022	-	94	60.563	ENSACIG00000004666	-	98	61.481
ENSACIG00000018022	-	88	51.111	ENSACIG00000013604	-	98	56.250
ENSACIG00000018022	-	53	43.750	ENSACIG00000021986	-	95	41.667
ENSACIG00000018022	-	59	55.970	ENSACIG00000019791	-	92	57.143
ENSACIG00000018022	-	55	49.677	ENSACIG00000010637	-	51	51.773
ENSACIG00000018022	-	99	64.835	ENSACIG00000018059	-	97	64.835
ENSACIG00000018022	-	56	44.681	ENSACIG00000017892	-	74	44.681
ENSACIG00000018022	-	64	43.796	ENSACIG00000003515	-	96	43.796
ENSACIG00000018022	-	53	56.391	ENSACIG00000022293	-	93	56.391
ENSACIG00000018022	-	51	49.333	ENSACIG00000006755	-	68	49.333
ENSACIG00000018022	-	51	46.000	ENSACIG00000023049	znf646	99	46.000
ENSACIG00000018022	-	89	48.485	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	99	51.064
ENSACIG00000018022	-	67	34.375	ENSACIG00000013946	-	61	34.375
ENSACIG00000018022	-	71	50.847	ENSACIG00000003720	-	97	52.985
ENSACIG00000018022	-	58	37.273	ENSACIG00000020982	znf710b	50	37.273
ENSACIG00000018022	-	60	45.455	ENSACIG00000009780	-	60	52.941
ENSACIG00000018022	-	98	46.405	ENSACIG00000006172	-	99	55.556
ENSACIG00000018022	-	52	50.746	ENSACIG00000022330	-	88	50.746
ENSACIG00000018022	-	79	43.411	ENSACIG00000015835	-	80	50.000
ENSACIG00000018022	-	84	50.685	ENSACIG00000013470	-	97	50.345
ENSACIG00000018022	-	78	50.000	ENSACIG00000023162	-	80	50.000
ENSACIG00000018022	-	100	59.859	ENSACIG00000017647	-	96	78.947
ENSACIG00000018022	-	79	52.212	ENSACIG00000011153	-	97	52.239
ENSACIG00000018022	-	89	50.355	ENSACIG00000006806	-	84	50.746
ENSACIG00000018022	-	77	47.101	ENSACIG00000013750	-	61	47.101
ENSACIG00000018022	-	82	47.328	ENSACIG00000009180	znf652	54	46.324
ENSACIG00000018022	-	66	51.493	ENSACIG00000019447	-	69	51.493
ENSACIG00000018022	-	53	42.466	ENSACIG00000013149	-	79	42.466
ENSACIG00000018022	-	59	40.426	ENSACIG00000017166	-	65	40.426
ENSACIG00000018022	-	51	51.064	ENSACIG00000015429	-	85	45.669
ENSACIG00000018022	-	86	47.826	ENSACIG00000017013	-	80	48.221
ENSACIG00000018022	-	55	52.632	ENSACIG00000011541	-	67	52.632
ENSACIG00000018022	-	69	60.000	ENSACIG00000000311	-	62	60.000
ENSACIG00000018022	-	97	48.571	ENSACIG00000014123	znf236	56	48.571
ENSACIG00000018022	-	66	38.926	ENSACIG00000001767	zbtb41	63	38.926
ENSACIG00000018022	-	67	45.498	ENSACIG00000018952	-	80	45.972
ENSACIG00000018022	-	77	44.444	ENSACIG00000002190	gfi1b	73	43.704
ENSACIG00000018022	-	94	50.694	ENSACIG00000004745	-	96	54.286
ENSACIG00000018022	-	62	41.401	ENSACIG00000016117	-	86	41.844
ENSACIG00000018022	-	66	60.177	ENSACIG00000016944	-	98	60.177
ENSACIG00000018022	-	64	41.447	ENSACIG00000018404	-	82	42.453
ENSACIG00000018022	-	87	41.892	ENSACIG00000004641	-	52	41.892

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000018022	-	54	52.500	ENSAPOG00000007955	-	56	52.500	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	99	51.748	ENSAPOG00000007528	-	89	51.748	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	96	49.645	ENSAPOG00000005986	-	86	51.493	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	58	55.634	ENSAPOG00000022086	-	98	56.028	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	99	51.852	ENSAPOG00000023479	-	93	51.852	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	97	44.380	ENSAPOG00000008053	-	96	52.083	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	97	53.125	ENSAPOG00000018127	-	89	55.474	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	53	56.349	ENSAPOG00000021690	-	91	56.618	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	53	56.800	ENSAPOG00000005681	-	92	56.800	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	55	53.448	ENSAPOG00000015096	-	99	53.448	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	54	58.182	ENSAPOG00000013065	-	94	58.182	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	55	54.930	ENSAPOG00000020368	-	99	54.930	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	89	69.231	ENSAPOG00000001725	-	96	56.028	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	91	54.478	ENSAPOG00000022234	-	95	54.331	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	88	46.831	ENSAPOG00000000503	-	96	46.831	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	54	54.348	ENSAPOG00000006282	-	87	54.348	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	99	50.758	ENSAPOG00000024332	-	89	55.556	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	97	56.780	ENSAPOG00000001742	-	78	56.780	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	77	53.333	ENSAPOG00000014714	-	98	53.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	55	53.333	ENSAPOG00000024038	-	92	53.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	97	56.028	ENSAPOG00000013125	-	55	56.028	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	98	53.226	ENSAPOG00000002691	-	82	50.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	86	53.211	ENSAPOG00000020864	-	84	53.211	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	54	53.226	ENSAPOG00000020343	-	85	53.226	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	97	52.482	ENSAPOG00000014378	-	72	52.482	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018022	-	99	51.634	ENSAOCG00000009970	-	99	52.239	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018022	-	99	54.545	ENSAOCG00000016287	-	96	56.028	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018022	-	96	54.167	ENSAOCG00000018543	-	99	54.478	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018022	-	51	52.756	ENSAOCG00000000448	-	94	52.756	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018022	-	65	52.113	ENSAOCG00000016737	-	98	60.909	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018022	-	87	53.968	ENSAOCG00000015586	-	97	52.083	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018022	-	55	48.454	ENSAOCG00000016088	-	79	53.600	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018022	-	84	53.731	ENSAOCG00000011204	-	80	53.731	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018022	-	76	52.778	ENSAOCG00000006793	-	99	52.778	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018022	-	90	54.861	ENSAOCG00000020830	-	98	56.463	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018022	-	99	50.000	ENSAOCG00000014651	-	92	50.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018022	-	97	53.782	ENSAOCG00000018307	-	100	54.412	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018022	-	79	51.502	ENSAOCG00000022375	-	94	51.502	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018022	-	98	54.167	ENSAOCG00000002585	-	94	58.865	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018022	-	95	43.467	ENSAPEG00000005592	-	89	53.191	Amphiprion_percula
ENSACIG00000018022	-	97	49.650	ENSAPEG00000013585	-	90	62.500	Amphiprion_percula
ENSACIG00000018022	-	97	53.472	ENSAPEG00000005462	-	96	53.472	Amphiprion_percula
ENSACIG00000018022	-	79	51.389	ENSAPEG00000009835	-	99	51.389	Amphiprion_percula
ENSACIG00000018022	-	92	52.239	ENSAPEG00000007389	-	96	57.353	Amphiprion_percula
ENSACIG00000018022	-	96	52.985	ENSAPEG00000007141	-	88	52.985	Amphiprion_percula
ENSACIG00000018022	-	52	54.622	ENSAPEG00000014848	-	99	54.622	Amphiprion_percula
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