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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSACIG00000018050 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: nom1
Alias: si:ch211-266o5.1
Full Name: nucleolar protein with MIF4G domain 1
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9716 bases
Position: chrCCOE01000449.1:107813-117528
Accession: ZDB-GENE-060503-321
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000023304	MA3	PF02847.17	1.1e-22	1	1
ENSACIP00000023304	MIF4G	PF02854.19	9e-19	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000023917	-	2334	-	ENSACIP00000023304	777 (aa)	-	-

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Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000018050	nom1	69	68.624	ENSG00000146909	NOM1	83	70.577	Homo_sapiens
ENSACIG00000018050	nom1	97	92.557	ENSAPOG00000012073	nom1	87	92.557	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018050	nom1	77	67.273	ENSAMEG00000001412	NOM1	81	67.188	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000018050	nom1	98	91.603	ENSAOCG00000006229	nom1	88	91.603	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018050	nom1	98	75.445	ENSAPEG00000015994	nom1	88	91.603	Amphiprion_percula
ENSACIG00000018050	nom1	98	77.667	ENSATEG00000005405	nom1	64	89.122	Anabas_testudineus
ENSACIG00000018050	nom1	77	59.690	ENSAPLG00000006585	NOM1	80	67.238	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000018050	nom1	73	62.906	ENSACAG00000011192	NOM1	70	67.490	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000018050	nom1	67	93.511	ENSACLG00000000033	nom1	89	94.635	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000018050	nom1	94	75.279	ENSAMXG00000041486	nom1	83	76.471	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000018050	nom1	97	54.227	ENSCJAG00000004336	NOM1	83	69.349	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000018050	nom1	97	52.549	ENSCAFG00020005121	NOM1	68	67.562	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000018050	nom1	79	57.206	ENSCHIG00000020102	NOM1	71	66.219	Capra_hircus
ENSACIG00000018050	nom1	96	57.393	ENSTSYG00000000227	NOM1	62	69.038	Carlito_syrichta
ENSACIG00000018050	nom1	67	69.981	ENSCAPG00000016273	NOM1	99	69.981	Cavia_aperea
ENSACIG00000018050	nom1	97	52.747	ENSCPOG00000025538	NOM1	60	65.458	Cavia_porcellus
ENSACIG00000018050	nom1	88	70.476	ENSCCAG00000014944	NOM1	99	69.209	Cebus_capucinus
ENSACIG00000018050	nom1	85	57.580	ENSCLAG00000000267	NOM1	72	68.008	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000018050	nom1	80	61.963	ENSCPBG00000018215	NOM1	60	69.392	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000018050	nom1	67	69.157	ENSCANG00000041984	NOM1	89	69.157	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000018050	nom1	71	66.182	ENSCGRG00001020293	Nom1	73	68.208	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000018050	nom1	67	68.208	ENSCGRG00000005405	Nom1	97	68.208	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000018050	nom1	93	70.703	ENSCSEG00000000932	nom1	96	69.554	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000018050	nom1	98	71.966	ENSCVAG00000007562	nom1	98	71.602	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000018050	nom1	98	77.714	ENSDARG00000060027	nom1	100	77.413	Danio_rerio
ENSACIG00000018050	nom1	68	57.383	ENSDORG00000015682	Nom1	76	58.429	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000018050	nom1	63	39.208	FBgn0035336	CG9004	59	39.208	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000018050	nom1	56	52.164	ENSEBUG00000010077	nom1	96	52.164	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000018050	nom1	76	68.073	ENSEASG00005001489	NOM1	70	70.115	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000018050	nom1	76	67.766	ENSECAG00000007596	NOM1	77	69.923	Equus_caballus
ENSACIG00000018050	nom1	99	66.276	ENSELUG00000006266	nom1	91	82.252	Esox_lucius
ENSACIG00000018050	nom1	80	58.394	ENSFCAG00000006467	NOM1	71	67.173	Felis_catus
ENSACIG00000018050	nom1	79	59.172	ENSFALG00000006904	NOM1	99	59.249	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000018050	nom1	97	54.289	ENSFDAG00000016241	NOM1	61	68.911	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000018050	nom1	98	72.594	ENSFHEG00000015974	nom1	88	85.305	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000018050	nom1	71	71.942	ENSGMOG00000005129	nom1	67	75.287	Gadus_morhua
ENSACIG00000018050	nom1	78	59.784	ENSGALG00000006437	NOM1	61	66.730	Gallus_gallus
ENSACIG00000018050	nom1	98	73.562	ENSGAFG00000003211	nom1	98	73.374	Gambusia_affinis
ENSACIG00000018050	nom1	75	69.582	ENSGAGG00000014347	NOM1	73	69.582	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000018050	nom1	69	67.706	ENSGGOG00000010920	NOM1	56	69.615	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000018050	nom1	67	93.321	ENSHBUG00000014616	nom1	89	94.421	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000018050	nom1	97	54.374	ENSHGLG00000007392	NOM1	90	69.349	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000018050	nom1	86	69.745	ENSHGLG00100014407	NOM1	90	69.349	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000018050	nom1	97	58.971	ENSIPUG00000013980	nom1	98	59.590	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000018050	nom1	70	67.091	ENSSTOG00000031736	NOM1	91	69.540	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000018050	nom1	63	70.431	ENSJJAG00000011716	Nom1	98	70.431	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000018050	nom1	94	87.619	ENSLBEG00000009252	nom1	95	79.626	Labrus_bergylta
ENSACIG00000018050	nom1	70	69.384	ENSLACG00000011777	NOM1	97	56.951	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000018050	nom1	97	63.926	ENSLOCG00000012452	nom1	87	74.081	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000018050	nom1	97	50.123	ENSLAFG00000007119	NOM1	63	62.452	Loxodonta_africana
ENSACIG00000018050	nom1	70	62.909	ENSMMUG00000039033	NOM1	82	65.326	Macaca_mulatta
ENSACIG00000018050	nom1	67	69.349	ENSMLEG00000037062	NOM1	98	69.349	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000018050	nom1	98	83.243	ENSMAMG00000004118	nom1	86	86.616	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000018050	nom1	67	93.321	ENSMZEG00005000384	nom1	89	93.321	Maylandia_zebra
ENSACIG00000018050	nom1	82	58.686	ENSMGAG00000005051	NOM1	76	67.048	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000018050	nom1	97	54.645	ENSMAUG00000017988	Nom1	83	68.593	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000018050	nom1	71	66.545	ENSMOCG00000015962	Nom1	76	68.462	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000018050	nom1	99	71.275	ENSMMOG00000004419	nom1	64	80.556	Mola_mola
ENSACIG00000018050	nom1	77	68.909	ENSMODG00000005177	NOM1	69	71.923	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000018050	nom1	92	73.902	ENSMALG00000008800	nom1	86	88.842	Monopterus_albus
ENSACIG00000018050	nom1	99	53.382	MGP_CAROLIEiJ_G0027043	Nom1	83	67.437	Mus_caroli
ENSACIG00000018050	nom1	99	53.174	ENSMUSG00000001569	Nom1	83	67.630	Mus_musculus
ENSACIG00000018050	nom1	99	53.166	MGP_SPRETEiJ_G0028039	Nom1	83	67.630	Mus_spretus
ENSACIG00000018050	nom1	79	55.982	ENSMPUG00000009745	NOM1	84	64.912	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000018050	nom1	74	64.533	ENSMLUG00000009129	NOM1	86	68.714	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000018050	nom1	100	80.930	ENSNBRG00000016429	nom1	94	93.130	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000018050	nom1	70	66.182	ENSNLEG00000000238	NOM1	82	68.391	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000018050	nom1	67	59.113	ENSMEUG00000001108	NOM1	63	77.551	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000018050	nom1	81	57.143	ENSOPRG00000014676	NOM1	60	60.000	Ochotona_princeps
ENSACIG00000018050	nom1	79	58.815	ENSODEG00000009399	NOM1	84	67.050	Octodon_degus
ENSACIG00000018050	nom1	92	93.702	ENSONIG00000005958	nom1	89	93.702	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000018050	nom1	60	69.330	ENSOANG00000006139	-	97	69.330	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000018050	nom1	95	48.609	ENSOCUG00000021448	-	91	51.709	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000018050	nom1	97	55.610	ENSOCUG00000004071	-	61	70.192	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000018050	nom1	100	70.972	ENSORLG00000010541	nom1	98	72.034	Oryzias_latipes
ENSACIG00000018050	nom1	92	72.436	ENSORLG00020010789	nom1	99	71.669	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000018050	nom1	68	85.932	ENSORLG00015010475	nom1	99	71.669	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000018050	nom1	99	87.214	ENSOMEG00000004219	nom1	87	87.214	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000018050	nom1	67	69.540	ENSOGAG00000001124	NOM1	85	69.808	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000018050	nom1	79	56.701	ENSOARG00000007261	NOM1	82	66.219	Ovis_aries
ENSACIG00000018050	nom1	69	68.257	ENSPPAG00000041374	NOM1	83	70.192	Pan_paniscus
ENSACIG00000018050	nom1	80	58.224	ENSPTIG00000013532	NOM1	80	67.241	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000018050	nom1	69	68.257	ENSPTRG00000019917	NOM1	83	70.192	Pan_troglodytes
ENSACIG00000018050	nom1	97	55.394	ENSPANG00000007605	NOM1	82	69.808	Papio_anubis
ENSACIG00000018050	nom1	100	60.165	ENSPKIG00000005825	nom1	63	72.190	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000018050	nom1	69	68.460	ENSPSIG00000017848	NOM1	87	69.772	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000018050	nom1	98	73.168	ENSPMGG00000002577	nom1	91	86.260	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000018050	nom1	97	55.569	ENSPEMG00000024180	Nom1	84	69.364	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000018050	nom1	94	68.991	ENSPCIG00000027941	NOM1	68	68.692	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000018050	nom1	99	87.238	ENSPFOG00000015771	nom1	88	87.238	Poecilia_formosa
ENSACIG00000018050	nom1	67	87.214	ENSPLAG00000007856	nom1	64	87.214	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000018050	nom1	100	72.170	ENSPMEG00000014155	nom1	88	87.023	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000018050	nom1	98	73.684	ENSPREG00000008850	nom1	98	72.705	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000018050	nom1	97	51.946	ENSPPYG00000018222	NOM1	82	64.038	Pongo_abelii
ENSACIG00000018050	nom1	80	63.023	ENSPCAG00000000440	NOM1	74	63.023	Procavia_capensis
ENSACIG00000018050	nom1	67	67.810	ENSPCOG00000015222	NOM1	98	67.810	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000018050	nom1	79	59.199	ENSPVAG00000014760	NOM1	60	66.731	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000018050	nom1	67	92.557	ENSPNYG00000006975	nom1	95	92.176	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000018050	nom1	99	74.773	ENSPNAG00000011085	nom1	84	77.040	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000018050	nom1	97	52.840	ENSRNOG00000048969	AABR07059041.1	87	64.355	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000018050	nom1	97	55.030	ENSRBIG00000037042	NOM1	83	69.615	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000018050	nom1	97	54.788	ENSRROG00000037293	NOM1	83	69.231	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000018050	nom1	53	63.592	ENSSHAG00000002835	-	99	63.592	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000018050	nom1	79	62.239	ENSSHAG00000017998	-	99	58.468	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000018050	nom1	63	73.511	ENSSFOG00015003196	nom1	100	73.511	Scleropages_formosus
ENSACIG00000018050	nom1	100	73.939	ENSSMAG00000011047	nom1	87	88.359	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000018050	nom1	97	90.076	ENSSDUG00000006834	nom1	89	90.076	Seriola_dumerili
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ENSACIG00000018050	nom1	81	50.424	ENSSPUG00000002556	NOM1	90	68.868	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000018050	nom1	98	91.794	ENSSPAG00000000953	nom1	86	91.794	Stegastes_partitus
ENSACIG00000018050	nom1	86	56.708	ENSTGUG00000000702	-	83	68.631	Taeniopygia_guttata
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ENSACIG00000018050	nom1	77	67.273	ENSUAMG00000025450	NOM1	83	66.987	Ursus_americanus
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