EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000018059 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1358 bases
Position: chrCCOE01000350.1:272345-273702
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000023246	zf-C2H2	PF00096.26	9.3e-16	1	3
ENSACIP00000023246	zf-C2H2	PF00096.26	9.3e-16	2	3
ENSACIP00000023246	zf-C2H2	PF00096.26	9.3e-16	3	3
ENSACIP00000023246	zf-met	PF12874.7	0.00015	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000023857	-	813	-	ENSACIP00000023246	270 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000018059	-	78	53.636	ENSACIG00000011153	-	97	53.636
ENSACIG00000018059	-	60	42.105	ENSACIG00000016117	-	84	43.011
ENSACIG00000018059	-	57	46.610	ENSACIG00000019447	-	66	48.305
ENSACIG00000018059	-	86	43.333	ENSACIG00000007464	-	82	38.776
ENSACIG00000018059	-	57	42.574	ENSACIG00000015411	-	62	42.574
ENSACIG00000018059	-	84	55.085	ENSACIG00000016182	-	95	55.085
ENSACIG00000018059	-	58	43.902	ENSACIG00000007855	-	93	43.902
ENSACIG00000018059	-	79	50.435	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	99	46.923
ENSACIG00000018059	-	50	44.444	ENSACIG00000019804	-	51	44.444
ENSACIG00000018059	-	76	49.558	ENSACIG00000010647	-	96	53.846
ENSACIG00000018059	-	50	47.692	ENSACIG00000003515	-	88	46.316
ENSACIG00000018059	-	50	39.706	ENSACIG00000023049	znf646	94	39.706
ENSACIG00000018059	-	77	43.254	ENSACIG00000015835	-	83	42.570
ENSACIG00000018059	-	77	50.962	ENSACIG00000022625	-	98	51.304
ENSACIG00000018059	-	76	51.786	ENSACIG00000017013	-	80	49.780
ENSACIG00000018059	-	75	44.762	ENSACIG00000009717	-	93	44.762
ENSACIG00000018059	-	97	64.835	ENSACIG00000018022	-	99	64.835
ENSACIG00000018059	-	67	53.390	ENSACIG00000019791	-	92	53.390
ENSACIG00000018059	-	95	52.500	ENSACIG00000019710	-	95	52.893
ENSACIG00000018059	-	72	40.000	ENSACIG00000004641	-	78	42.222
ENSACIG00000018059	-	79	49.282	ENSACIG00000019102	-	60	49.282
ENSACIG00000018059	-	76	51.695	ENSACIG00000010637	-	51	51.695
ENSACIG00000018059	-	68	57.000	ENSACIG00000000311	-	80	57.000
ENSACIG00000018059	-	83	45.614	ENSACIG00000013149	-	58	45.614
ENSACIG00000018059	-	96	49.587	ENSACIG00000006172	-	100	50.000
ENSACIG00000018059	-	84	48.305	ENSACIG00000013470	-	96	48.305
ENSACIG00000018059	-	77	49.565	ENSACIG00000011515	-	97	49.565
ENSACIG00000018059	-	77	44.395	ENSACIG00000023162	-	78	47.500
ENSACIG00000018059	-	67	46.957	ENSACIG00000022738	-	93	45.370
ENSACIG00000018059	-	57	43.357	ENSACIG00000015429	-	75	51.429
ENSACIG00000018059	-	51	44.444	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	84	44.444
ENSACIG00000018059	-	70	48.246	ENSACIG00000003720	-	62	50.000
ENSACIG00000018059	-	86	50.000	ENSACIG00000006806	-	81	50.000
ENSACIG00000018059	-	91	48.305	ENSACIG00000004745	-	94	48.305
ENSACIG00000018059	-	80	51.163	ENSACIG00000013604	-	99	51.163
ENSACIG00000018059	-	85	47.619	ENSACIG00000022658	-	94	52.586
ENSACIG00000018059	-	51	40.000	ENSACIG00000001369	-	78	40.000
ENSACIG00000018059	-	74	51.196	ENSACIG00000018952	-	80	50.239
ENSACIG00000018059	-	91	44.867	ENSACIG00000022645	-	78	45.247
ENSACIG00000018059	-	71	48.246	ENSACIG00000009780	-	92	48.246
ENSACIG00000018059	-	52	42.623	ENSACIG00000021986	-	91	42.623
ENSACIG00000018059	-	62	34.211	ENSACIG00000011516	-	74	35.088
ENSACIG00000018059	-	51	47.458	ENSACIG00000023212	-	72	47.458
ENSACIG00000018059	-	51	52.174	ENSACIG00000011541	-	66	52.174
ENSACIG00000018059	-	89	49.565	ENSACIG00000024444	-	87	49.565
ENSACIG00000018059	-	67	52.066	ENSACIG00000022293	-	95	53.043
ENSACIG00000018059	-	50	46.087	ENSACIG00000000406	prdm5	54	46.087
ENSACIG00000018059	-	97	53.968	ENSACIG00000003556	-	94	55.652
ENSACIG00000018059	-	95	40.909	ENSACIG00000000286	-	85	45.833
ENSACIG00000018059	-	89	48.235	ENSACIG00000014123	znf236	58	48.235
ENSACIG00000018059	-	97	60.484	ENSACIG00000003754	-	89	36.882
ENSACIG00000018059	-	79	55.844	ENSACIG00000010966	-	69	55.844
ENSACIG00000018059	-	74	60.000	ENSACIG00000016932	-	67	60.000
ENSACIG00000018059	-	51	43.363	ENSACIG00000017892	-	70	43.363
ENSACIG00000018059	-	77	83.173	ENSACIG00000008448	-	95	83.173
ENSACIG00000018059	-	56	52.137	ENSACIG00000012084	-	98	51.938
ENSACIG00000018059	-	95	60.000	ENSACIG00000017050	-	99	75.000
ENSACIG00000018059	-	88	58.261	ENSACIG00000004041	-	97	58.261
ENSACIG00000018059	-	57	52.239	ENSACIG00000018440	-	95	52.239
ENSACIG00000018059	-	64	56.593	ENSACIG00000016944	-	97	56.354
ENSACIG00000018059	-	92	58.475	ENSACIG00000004666	-	98	60.684
ENSACIG00000018059	-	97	54.922	ENSACIG00000017647	-	99	56.757

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000018059	-	56	46.281	ENSCSAVG00000000520	-	83	46.281	Ciona_savignyi
ENSACIG00000018059	-	50	47.727	ENSEBUG00000001698	-	72	47.727	Eptatretus_burgeri