EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000018097 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: celf4
Alias: zgc:92761
Full Name: CUGBP%2C Elav-like family member 4
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 87469 bases
Position: chrCCOE01001043.1:2683813-2771281
Accession: ZDB-GENE-040718-300
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000023312	RRM_1	PF00076.22	2.9e-42	1	3
ENSACIP00000023312	RRM_1	PF00076.22	2.9e-42	2	3
ENSACIP00000023312	RRM_1	PF00076.22	2.9e-42	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000023925	-	1311	-	ENSACIP00000023312	436 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000018097's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000018097's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000018097	celf4	55	80.952	ENSACIG00000004318	-	100	50.230
ENSACIG00000018097	celf4	51	78.571	ENSACIG00000023843	celf1	98	57.216
ENSACIG00000018097	celf4	90	60.870	ENSACIG00000007698	celf3b	100	59.825
ENSACIG00000018097	celf4	97	70.208	ENSACIG00000003650	si:dkey-205h23.2	98	69.977
ENSACIG00000018097	celf4	75	70.796	ENSACIG00000015357	celf5a	70	70.796
ENSACIG00000018097	celf4	90	59.477	ENSACIG00000010932	celf3a	100	58.297

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000018097	celf4	100	82.405	ENSG00000101489	CELF4	100	94.030	Homo_sapiens
ENSACIG00000018097	celf4	100	80.571	ENSAPOG00000002964	celf4	100	80.571	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018097	celf4	87	78.465	ENSAMEG00000017059	CELF4	94	77.830	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000018097	celf4	100	94.796	ENSAOCG00000020590	celf4	100	94.796	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018097	celf4	58	65.019	ENSAOCG00000019919	-	80	65.019	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018097	celf4	100	94.796	ENSAPEG00000002940	celf4	99	94.796	Amphiprion_percula
ENSACIG00000018097	celf4	100	94.344	ENSATEG00000023731	celf4	100	94.344	Anabas_testudineus
ENSACIG00000018097	celf4	68	68.435	ENSAPLG00000007830	-	100	68.170	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000018097	celf4	100	82.405	ENSANAG00000029499	CELF4	99	82.628	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000018097	celf4	100	92.273	ENSACLG00000011828	celf4	99	92.273	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000018097	celf4	100	89.773	ENSAMXG00000007935	celf4	99	89.773	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000018097	celf4	100	81.920	ENSBTAG00000004940	CELF4	99	82.405	Bos_taurus
ENSACIG00000018097	celf4	100	80.349	ENSCJAG00000021135	CELF4	99	80.568	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000018097	celf4	100	77.602	ENSCHIG00000007169	CELF4	99	77.568	Capra_hircus
ENSACIG00000018097	celf4	88	83.742	ENSTSYG00000000816	CELF4	84	84.049	Carlito_syrichta
ENSACIG00000018097	celf4	100	68.119	ENSCPOG00000035956	CELF4	99	68.317	Cavia_porcellus
ENSACIG00000018097	celf4	100	82.405	ENSCCAG00000028373	CELF4	99	82.628	Cebus_capucinus
ENSACIG00000018097	celf4	100	82.405	ENSCATG00000045293	CELF4	99	82.628	Cercocebus_atys
ENSACIG00000018097	celf4	100	72.673	ENSCLAG00000008344	CELF4	99	72.871	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000018097	celf4	88	72.191	ENSCSAG00000017933	CELF4	100	72.472	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000018097	celf4	91	75.964	ENSCPBG00000005237	CELF4	96	76.558	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000018097	celf4	100	82.405	ENSCANG00000036735	CELF4	99	82.628	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000018097	celf4	73	63.061	ENSCGRG00001018085	Celf4	89	63.325	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000018097	celf4	100	90.596	ENSCSEG00000007074	celf4	99	90.138	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000018097	celf4	100	92.793	ENSCVAG00000017617	celf4	99	93.243	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000018097	celf4	100	76.190	ENSDARG00000070045	celf4	100	86.957	Danio_rerio
ENSACIG00000018097	celf4	88	70.380	ENSDNOG00000032492	CELF4	99	70.652	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000018097	celf4	100	72.673	ENSDORG00000007169	Celf4	99	72.871	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000018097	celf4	92	80.576	ENSETEG00000007432	-	71	79.137	Echinops_telfairi
ENSACIG00000018097	celf4	100	82.405	ENSEASG00005016534	CELF4	99	82.628	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000018097	celf4	100	75.720	ENSECAG00000008810	CELF4	99	75.926	Equus_caballus
ENSACIG00000018097	celf4	87	61.787	ENSEEUG00000003763	CELF4	90	62.035	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000018097	celf4	100	82.183	ENSFCAG00000045234	CELF4	99	82.405	Felis_catus
ENSACIG00000018097	celf4	88	72.191	ENSFALG00000009188	CELF4	98	72.753	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000018097	celf4	100	67.525	ENSFDAG00000010287	CELF4	99	67.723	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000018097	celf4	100	78.390	ENSFHEG00000003431	celf4	99	78.814	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000018097	celf4	86	92.683	ENSGMOG00000011747	-	75	92.683	Gadus_morhua
ENSACIG00000018097	celf4	100	62.167	ENSGMOG00000008703	celf4	100	63.019	Gadus_morhua
ENSACIG00000018097	celf4	100	79.619	ENSGAFG00000021515	celf4	99	79.362	Gambusia_affinis
ENSACIG00000018097	celf4	100	75.142	ENSGACG00000008752	celf4	100	75.332	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000018097	celf4	59	73.720	ENSGAGG00000023014	-	98	74.403	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000018097	celf4	88	59.544	ENSGAGG00000017672	-	99	52.494	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000018097	celf4	100	82.405	ENSGGOG00000013920	CELF4	99	82.628	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000018097	celf4	100	92.273	ENSHBUG00000021618	celf4	99	92.273	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000018097	celf4	100	75.670	ENSHGLG00000003130	CELF4	99	75.876	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000018097	celf4	100	72.277	ENSHGLG00100006394	CELF4	99	72.475	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000018097	celf4	100	91.403	ENSHCOG00000012195	celf4	99	91.403	Hippocampus_comes
ENSACIG00000018097	celf4	100	82.390	ENSIPUG00000010810	celf4	96	79.773	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000018097	celf4	100	72.673	ENSJJAG00000016892	Celf4	99	72.871	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000018097	celf4	100	85.398	ENSKMAG00000019602	celf4	99	85.619	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000018097	celf4	100	93.665	ENSLBEG00000000940	celf4	99	93.665	Labrus_bergylta
ENSACIG00000018097	celf4	92	59.305	ENSLOCG00000004792	celf4	99	60.050	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000018097	celf4	100	72.619	ENSLAFG00000021352	CELF4	99	72.817	Loxodonta_africana
ENSACIG00000018097	celf4	100	82.405	ENSMFAG00000042983	CELF4	99	82.628	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000018097	celf4	100	76.082	ENSMMUG00000006866	CELF4	99	75.464	Macaca_mulatta
ENSACIG00000018097	celf4	100	82.405	ENSMNEG00000033449	CELF4	99	82.628	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000018097	celf4	91	74.693	ENSMLEG00000028543	CELF4	88	74.939	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000018097	celf4	100	94.344	ENSMAMG00000018573	celf4	99	94.344	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000018097	celf4	100	92.273	ENSMZEG00005026879	celf4	99	92.273	Maylandia_zebra
ENSACIG00000018097	celf4	59	63.433	ENSMGAG00000017029	CELF4	90	63.258	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000018097	celf4	100	80.349	ENSMICG00000006984	CELF4	99	80.568	Microcebus_murinus
ENSACIG00000018097	celf4	100	72.673	ENSMOCG00000011985	Celf4	99	72.871	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000018097	celf4	100	93.213	ENSMMOG00000012281	celf4	100	93.213	Mola_mola
ENSACIG00000018097	celf4	63	72.100	ENSMODG00000000306	CELF4	84	72.414	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000018097	celf4	100	86.066	ENSMALG00000001696	celf4	100	86.066	Monopterus_albus
ENSACIG00000018097	celf4	100	75.670	MGP_CAROLIEiJ_G0022058	Celf4	100	77.729	Mus_caroli
ENSACIG00000018097	celf4	100	79.869	ENSMUSG00000024268	Celf4	99	80.088	Mus_musculus
ENSACIG00000018097	celf4	100	75.670	MGP_PahariEiJ_G0018792	Celf4	100	77.729	Mus_pahari
ENSACIG00000018097	celf4	100	75.670	MGP_SPRETEiJ_G0022969	Celf4	100	77.681	Mus_spretus
ENSACIG00000018097	celf4	76	92.857	ENSMPUG00000001027	CELF4	100	58.005	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000018097	celf4	88	72.922	ENSMLUG00000001755	CELF4	100	73.190	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000018097	celf4	100	72.673	ENSNGAG00000000761	Celf4	99	72.871	Nannospalax_galili
ENSACIG00000018097	celf4	100	92.273	ENSNBRG00000018194	celf4	99	92.273	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000018097	celf4	72	74.227	ENSMEUG00000007202	-	83	74.914	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000018097	celf4	78	90.476	ENSOPRG00000014415	CELF4	99	66.392	Ochotona_princeps
ENSACIG00000018097	celf4	100	72.673	ENSODEG00000018464	CELF4	99	72.871	Octodon_degus
ENSACIG00000018097	celf4	100	87.010	ENSONIG00000019463	celf4	99	87.010	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000018097	celf4	87	80.964	ENSOCUG00000024790	CELF4	75	80.882	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000018097	celf4	100	93.348	ENSORLG00000008913	celf4	100	93.348	Oryzias_latipes
ENSACIG00000018097	celf4	100	80.769	ENSORLG00020008454	celf4	100	80.769	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000018097	celf4	100	86.985	ENSORLG00015004115	celf4	100	86.768	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000018097	celf4	100	95.455	ENSOMEG00000002391	celf4	100	95.455	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000018097	celf4	83	92.857	ENSOGAG00000010018	CELF4	100	64.706	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000018097	celf4	59	68.790	ENSOARG00000005276	CELF4	100	69.108	Ovis_aries
ENSACIG00000018097	celf4	91	78.624	ENSPPAG00000020644	CELF4	88	78.870	Pan_paniscus
ENSACIG00000018097	celf4	100	82.405	ENSPPRG00000007683	CELF4	99	82.628	Panthera_pardus
ENSACIG00000018097	celf4	100	82.405	ENSPTRG00000009982	CELF4	99	82.628	Pan_troglodytes
ENSACIG00000018097	celf4	100	82.405	ENSPANG00000006365	CELF4	99	82.628	Papio_anubis
ENSACIG00000018097	celf4	100	87.416	ENSPKIG00000017421	celf4	99	87.416	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000018097	celf4	88	72.191	ENSPSIG00000015538	CELF4	98	72.753	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000018097	celf4	100	72.673	ENSPEMG00000019299	Celf4	99	72.871	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000018097	celf4	81	96.078	ENSPLAG00000012151	celf4	88	96.078	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000018097	celf4	100	87.273	ENSPMEG00000015313	celf4	97	87.273	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000018097	celf4	100	93.891	ENSPREG00000021231	celf4	100	94.118	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000018097	celf4	80	79.167	ENSPCAG00000000126	CELF4	74	78.125	Procavia_capensis
ENSACIG00000018097	celf4	100	75.770	ENSPVAG00000009204	CELF4	99	75.975	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000018097	celf4	100	92.273	ENSPNYG00000004131	celf4	99	92.273	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000018097	celf4	100	85.909	ENSPNAG00000006426	celf4	100	85.909	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000018097	celf4	85	74.242	ENSRNOG00000014503	Celf4	100	74.545	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000018097	celf4	100	82.183	ENSRBIG00000035924	CELF4	99	82.405	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000018097	celf4	100	82.405	ENSRROG00000014839	CELF4	99	82.628	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000018097	celf4	100	81.514	ENSSBOG00000030001	CELF4	99	81.737	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000018097	celf4	80	79.699	ENSSHAG00000009193	CELF4	75	81.818	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000018097	celf4	100	81.757	ENSSFOG00015010874	celf4	98	81.982	Scleropages_formosus
ENSACIG00000018097	celf4	100	90.826	ENSSMAG00000009331	celf4	100	90.367	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000018097	celf4	100	77.021	ENSSLDG00000018548	celf4	100	77.021	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000018097	celf4	100	80.213	ENSSPAG00000018307	celf4	100	80.213	Stegastes_partitus
ENSACIG00000018097	celf4	100	80.610	ENSSSCG00000003748	CELF4	99	80.828	Sus_scrofa
ENSACIG00000018097	celf4	88	72.191	ENSTGUG00000001649	CELF4	98	72.753	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000018097	celf4	100	91.629	ENSTRUG00000015481	celf4	100	91.855	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000018097	celf4	99	80.000	ENSTNIG00000010679	celf4	99	80.404	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000018097	celf4	88	86.207	ENSTBEG00000010647	CELF4	87	86.207	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000018097	celf4	100	75.565	ENSTTRG00000016826	CELF4	99	75.770	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000018097	celf4	79	79.252	ENSUAMG00000005506	CELF4	71	79.592	Ursus_americanus
ENSACIG00000018097	celf4	56	82.000	ENSVPAG00000009042	-	70	82.000	Vicugna_pacos
ENSACIG00000018097	celf4	100	77.358	ENSVVUG00000027721	CELF4	99	77.568	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000018097	celf4	88	69.919	ENSXETG00000020486	celf4	98	70.461	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000018097	celf4	88	81.658	ENSXCOG00000017592	celf4	97	79.524	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000018097	celf4	100	85.041	ENSXMAG00000018178	celf4	100	85.041	Xiphophorus_maculatus