EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000018305 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: esf1
Alias: fe06g12|im:7138472|wu:fe06g12|zgc:66241
Full Name: ESF1%2C nucleolar pre-rRNA processing protein%2C homolog (S. cerevisiae)
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17633 bases
Position: chrCCOE01000148.1:277827-295459
Accession: ZDB-GENE-030131-4917
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000023601	NUC153	PF08159.12	9.4e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000024219	-	2139	-	ENSACIP00000023601	712 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000018305	esf1	91	70.513	ENSG00000089048	ESF1	76	70.667	Homo_sapiens
ENSACIG00000018305	esf1	72	74.858	ENSAPOG00000003004	esf1	100	74.858	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018305	esf1	90	72.222	ENSAMEG00000008830	ESF1	76	72.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000018305	esf1	100	75.505	ENSAOCG00000006033	esf1	100	80.196	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018305	esf1	100	74.021	ENSAPEG00000022385	esf1	100	73.499	Amphiprion_percula
ENSACIG00000018305	esf1	100	70.896	ENSATEG00000016321	esf1	100	68.262	Anabas_testudineus
ENSACIG00000018305	esf1	99	62.172	ENSAPLG00000012113	ESF1	77	69.333	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000018305	esf1	92	70.513	ENSACAG00000000963	ESF1	76	70.667	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000018305	esf1	93	67.416	ENSANAG00000036778	ESF1	76	72.000	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000018305	esf1	100	80.000	ENSACLG00000002972	esf1	100	78.667	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000018305	esf1	80	67.714	ENSAMXG00000001172	esf1	99	63.950	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000018305	esf1	90	69.444	ENSBTAG00000007130	ESF1	75	69.333	Bos_taurus
ENSACIG00000018305	esf1	92	67.416	ENSCJAG00000004640	ESF1	77	72.000	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000018305	esf1	90	70.833	ENSCAFG00000005587	ESF1	76	70.667	Canis_familiaris
ENSACIG00000018305	esf1	90	70.833	ENSCAFG00020027530	ESF1	76	70.667	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000018305	esf1	95	70.833	ENSCHIG00000021188	ESF1	78	70.667	Capra_hircus
ENSACIG00000018305	esf1	95	72.222	ENSTSYG00000009956	ESF1	76	72.000	Carlito_syrichta
ENSACIG00000018305	esf1	99	52.441	ENSCAPG00000010333	-	99	52.514	Cavia_aperea
ENSACIG00000018305	esf1	65	70.833	ENSCAPG00000010466	-	54	70.667	Cavia_aperea
ENSACIG00000018305	esf1	95	69.444	ENSCPOG00000014027	-	77	69.333	Cavia_porcellus
ENSACIG00000018305	esf1	92	67.416	ENSCCAG00000024521	ESF1	76	72.000	Cebus_capucinus
ENSACIG00000018305	esf1	90	72.222	ENSCATG00000042792	ESF1	76	72.000	Cercocebus_atys
ENSACIG00000018305	esf1	95	72.222	ENSCLAG00000013266	-	77	72.000	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000018305	esf1	90	72.222	ENSCSAG00000011777	ESF1	76	72.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000018305	esf1	91	37.838	ENSCING00000020446	-	73	40.625	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000018305	esf1	91	40.030	ENSCSAVG00000009015	-	92	42.585	Ciona_savignyi
ENSACIG00000018305	esf1	90	72.222	ENSCANG00000030674	ESF1	75	72.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000018305	esf1	90	69.444	ENSCGRG00001018257	Esf1	77	69.333	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000018305	esf1	80	72.990	ENSCSEG00000001159	esf1	54	70.629	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000018305	esf1	99	73.554	ENSCVAG00000007894	esf1	99	72.727	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000018305	esf1	80	66.781	ENSDARG00000008740	esf1	99	62.846	Danio_rerio
ENSACIG00000018305	esf1	90	69.444	ENSDNOG00000019409	ESF1	75	69.333	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000018305	esf1	90	72.222	ENSDORG00000016313	Esf1	77	72.000	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000018305	esf1	97	40.570	FBgn0024364	CG11417	94	39.153	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000018305	esf1	95	69.231	ENSEBUG00000015161	esf1	77	72.727	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000018305	esf1	90	70.833	ENSEASG00005001777	ESF1	76	70.667	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000018305	esf1	90	70.833	ENSECAG00000019188	ESF1	76	70.667	Equus_caballus
ENSACIG00000018305	esf1	80	41.754	ENSEEUG00000015837	-	78	50.862	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000018305	esf1	91	78.750	ENSELUG00000000408	esf1	84	78.667	Esox_lucius
ENSACIG00000018305	esf1	90	71.831	ENSFCAG00000000919	ESF1	76	72.000	Felis_catus
ENSACIG00000018305	esf1	89	73.913	ENSFALG00000010914	ESF1	75	70.667	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000018305	esf1	96	72.222	ENSFDAG00000014777	ESF1	78	72.000	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000018305	esf1	71	77.476	ENSFHEG00000014984	esf1	99	76.505	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000018305	esf1	91	67.857	ENSGALG00000034768	ESF1	77	70.667	Gallus_gallus
ENSACIG00000018305	esf1	99	68.675	ENSGAFG00000000540	esf1	99	69.262	Gambusia_affinis
ENSACIG00000018305	esf1	90	70.833	ENSGGOG00000006692	ESF1	76	70.667	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000018305	esf1	100	80.053	ENSHBUG00000001890	esf1	100	78.457	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000018305	esf1	90	70.833	ENSHGLG00000011505	ESF1	78	70.667	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000018305	esf1	90	70.833	ENSHGLG00100015045	ESF1	78	70.667	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000018305	esf1	79	65.753	ENSIPUG00000006507	esf1	77	66.500	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000018305	esf1	95	72.222	ENSSTOG00000009846	ESF1	76	72.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000018305	esf1	90	72.222	ENSJJAG00000012570	Esf1	75	72.000	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000018305	esf1	92	70.588	ENSLACG00000016439	ESF1	76	75.342	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000018305	esf1	95	66.897	ENSLOCG00000015979	esf1	85	77.333	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000018305	esf1	97	68.056	ENSLAFG00000005479	ESF1	81	68.000	Loxodonta_africana
ENSACIG00000018305	esf1	90	72.222	ENSMFAG00000036841	ESF1	76	72.000	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000018305	esf1	90	72.222	ENSMNEG00000044042	ESF1	76	72.000	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000018305	esf1	90	70.833	ENSMLEG00000037121	ESF1	76	70.667	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000018305	esf1	100	76.291	ENSMAMG00000018648	esf1	100	78.599	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000018305	esf1	72	80.117	ENSMZEG00005013912	esf1	100	78.752	Maylandia_zebra
ENSACIG00000018305	esf1	96	67.857	ENSMGAG00000004291	ESF1	77	70.667	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000018305	esf1	90	70.833	ENSMAUG00000015975	Esf1	77	70.667	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000018305	esf1	90	72.222	ENSMICG00000010711	ESF1	74	72.000	Microcebus_murinus
ENSACIG00000018305	esf1	90	70.833	ENSMOCG00000005902	Esf1	78	70.667	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000018305	esf1	71	75.954	ENSMMOG00000018693	esf1	99	75.382	Mola_mola
ENSACIG00000018305	esf1	91	70.513	ENSMODG00000005066	ESF1	79	70.667	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000018305	esf1	91	70.968	ENSMALG00000007338	esf1	71	71.767	Monopterus_albus
ENSACIG00000018305	esf1	90	70.833	MGP_CAROLIEiJ_G0024365	Esf1	76	70.667	Mus_caroli
ENSACIG00000018305	esf1	90	72.222	ENSMUSG00000045624	Esf1	76	72.000	Mus_musculus
ENSACIG00000018305	esf1	90	70.833	MGP_PahariEiJ_G0025810	Esf1	76	70.667	Mus_pahari
ENSACIG00000018305	esf1	90	72.222	MGP_SPRETEiJ_G0025285	Esf1	76	72.000	Mus_spretus
ENSACIG00000018305	esf1	90	72.222	ENSMPUG00000001450	ESF1	76	72.000	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000018305	esf1	90	70.833	ENSMLUG00000013080	ESF1	77	70.667	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000018305	esf1	90	70.833	ENSNLEG00000014563	ESF1	75	70.667	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000018305	esf1	73	57.905	ENSOPRG00000004862	ESF1	99	55.854	Ochotona_princeps
ENSACIG00000018305	esf1	95	69.444	ENSODEG00000006824	ESF1	79	69.333	Octodon_degus
ENSACIG00000018305	esf1	96	94.805	ENSONIG00000006804	esf1	84	94.667	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000018305	esf1	90	72.222	ENSOCUG00000005414	ESF1	77	72.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000018305	esf1	71	70.056	ENSORLG00000018625	esf1	99	69.680	Oryzias_latipes
ENSACIG00000018305	esf1	99	71.739	ENSORLG00015022826	esf1	99	69.742	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000018305	esf1	72	73.485	ENSOMEG00000009311	esf1	100	70.833	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000018305	esf1	90	69.444	ENSOGAG00000016912	ESF1	77	69.333	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000018305	esf1	90	70.833	ENSOARG00000011158	ESF1	73	70.667	Ovis_aries
ENSACIG00000018305	esf1	90	70.833	ENSPPAG00000024379	ESF1	76	70.667	Pan_paniscus
ENSACIG00000018305	esf1	90	71.831	ENSPPRG00000012007	ESF1	75	72.000	Panthera_pardus
ENSACIG00000018305	esf1	90	71.831	ENSPTIG00000020063	ESF1	75	72.000	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000018305	esf1	90	70.833	ENSPTRG00000013258	ESF1	76	70.667	Pan_troglodytes
ENSACIG00000018305	esf1	92	77.011	ENSPKIG00000024448	esf1	81	81.333	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000018305	esf1	99	56.107	ENSPMGG00000016911	esf1	99	54.030	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000018305	esf1	96	76.562	ENSPCIG00000019331	ESF1	78	76.119	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000018305	esf1	99	64.529	ENSPFOG00000010101	esf1	99	64.005	Poecilia_formosa
ENSACIG00000018305	esf1	71	71.206	ENSPLAG00000006452	esf1	99	69.650	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000018305	esf1	99	68.842	ENSPMEG00000000713	esf1	99	69.507	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000018305	esf1	99	66.887	ENSPREG00000004431	esf1	98	67.815	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000018305	esf1	90	70.833	ENSPPYG00000010715	ESF1	76	70.667	Pongo_abelii
ENSACIG00000018305	esf1	59	66.667	ENSPCAG00000006881	ESF1	51	66.667	Procavia_capensis
ENSACIG00000018305	esf1	90	68.056	ENSPVAG00000001295	ESF1	67	67.568	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000018305	esf1	100	80.214	ENSPNYG00000015735	esf1	100	79.144	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000018305	esf1	90	70.833	ENSRNOG00000004777	Esf1	76	70.667	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000018305	esf1	90	72.222	ENSRBIG00000035763	ESF1	76	72.000	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000018305	esf1	90	72.222	ENSRROG00000032022	ESF1	76	72.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000018305	esf1	90	72.222	ENSSBOG00000030387	ESF1	76	72.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000018305	esf1	90	73.611	ENSSHAG00000000449	ESF1	81	73.333	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000018305	esf1	100	77.103	ENSSDUG00000019460	esf1	100	79.150	Seriola_dumerili
ENSACIG00000018305	esf1	95	71.429	ENSSPUG00000012635	ESF1	80	70.667	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000018305	esf1	100	74.517	ENSSPAG00000019077	esf1	100	74.131	Stegastes_partitus
ENSACIG00000018305	esf1	90	72.222	ENSSSCG00000007077	ESF1	75	72.000	Sus_scrofa
ENSACIG00000018305	esf1	94	68.056	ENSTGUG00000002450	ESF1	75	68.000	Taeniopygia_guttata
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ENSACIG00000018305	esf1	79	69.758	ENSVPAG00000005291	ESF1	68	69.333	Vicugna_pacos
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