EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000018649 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srsf4
Alias: sfrs4|wu:fb37e02|wu:fj35e06|zgc:152957|zgc:55809
Full Name: serine/arginine-rich splicing factor 4
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5905 bases
Position: chrCCOE01000354.1:54432-60336
Accession: ZDB-GENE-030131-591
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000024223	RRM_1	PF00076.22	1.7e-31	1	2
ENSACIP00000024223	RRM_1	PF00076.22	1.7e-31	2	2
ENSACIP00000024166	RRM_1	PF00076.22	4.1e-31	1	2
ENSACIP00000024166	RRM_1	PF00076.22	4.1e-31	2	2
ENSACIP00000024261	RRM_1	PF00076.22	1e-29	1	2
ENSACIP00000024261	RRM_1	PF00076.22	1e-29	2	2
ENSACIP00000024185	RRM_1	PF00076.22	5.3e-22	1	1
ENSACIP00000024075	RRM_1	PF00076.22	1.8e-19	1	1
ENSACIP00000024267	RRM_1	PF00076.22	5e-19	1	1
ENSACIP00000024277	RRM_1	PF00076.22	6.3e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000024803	-	1059	-	ENSACIP00000024166	352 (aa)	-	-
ENSACIT00000024712	-	459	-	ENSACIP00000024075	152 (aa)	-	-
ENSACIT00000024823	-	834	-	ENSACIP00000024185	277 (aa)	-	-
ENSACIT00000024908	-	399	-	ENSACIP00000024267	132 (aa)	-	-
ENSACIT00000024863	-	783	-	ENSACIP00000024223	260 (aa)	-	-
ENSACIT00000024918	-	360	-	ENSACIP00000024277	119 (aa)	-	-
ENSACIT00000024902	-	1050	-	ENSACIP00000024261	350 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000018649	srsf4	88	71.545	ENSACIG00000023658	-	78	56.574
ENSACIG00000018649	srsf4	57	34.211	ENSACIG00000021116	rbm39b	65	34.211
ENSACIG00000018649	srsf4	52	36.508	ENSACIG00000001335	-	53	36.508
ENSACIG00000018649	srsf4	89	44.262	ENSACIG00000015765	srsf9	70	45.251
ENSACIG00000018649	srsf4	89	45.528	ENSACIG00000008091	srsf1a	70	46.988
ENSACIG00000018649	srsf4	89	63.846	ENSACIG00000011892	srsf5a	94	61.538
ENSACIG00000018649	srsf4	99	51.786	ENSACIG00000010742	srsf5b	94	56.031
ENSACIG00000018649	srsf4	90	74.797	ENSACIG00000020091	-	95	68.504
ENSACIG00000018649	srsf4	89	49.593	ENSACIG00000002623	-	90	46.821
ENSACIG00000018649	srsf4	62	47.436	ENSACIG00000009890	srsf7b	61	45.570
ENSACIG00000018649	srsf4	66	41.975	ENSACIG00000016419	-	51	41.026

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000018649	srsf4	90	85.950	ENSG00000116350	SRSF4	53	87.500	Homo_sapiens
ENSACIG00000018649	srsf4	90	94.118	ENSAPOG00000020244	srsf4	64	94.203	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018649	srsf4	90	75.000	ENSAPOG00000023399	-	60	74.719	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018649	srsf4	90	92.437	ENSAOCG00000005997	srsf4	92	92.500	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018649	srsf4	73	76.628	ENSAPEG00000020826	srsf4	71	75.676	Amphiprion_percula
ENSACIG00000018649	srsf4	69	98.780	ENSAPEG00000020870	-	64	98.780	Amphiprion_percula
ENSACIG00000018649	srsf4	88	91.129	ENSATEG00000005680	srsf4	89	77.903	Anabas_testudineus
ENSACIG00000018649	srsf4	90	73.016	ENSACLG00000021269	-	51	76.374	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000018649	srsf4	100	95.817	ENSACLG00000003395	srsf4	99	95.817	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000018649	srsf4	90	86.777	ENSAMXG00000034811	srsf4	75	89.474	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000018649	srsf4	89	52.083	WBGene00004698	rsp-1	99	49.315	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000018649	srsf4	90	85.950	ENSCHIG00000022096	SRSF4	63	70.428	Capra_hircus
ENSACIG00000018649	srsf4	89	58.394	ENSCING00000020631	-	80	56.923	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000018649	srsf4	89	57.343	ENSCING00000012370	-	68	60.606	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000018649	srsf4	81	64.179	ENSCING00000024718	-	56	56.477	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000018649	srsf4	89	54.962	ENSCING00000011362	-	65	56.216	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000018649	srsf4	89	64.228	ENSCSAVG00000002581	-	70	63.536	Ciona_savignyi
ENSACIG00000018649	srsf4	93	84.800	ENSCSEG00000010058	srsf4	76	91.803	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000018649	srsf4	78	64.224	ENSCVAG00000004342	srsf4	75	66.359	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000018649	srsf4	90	83.065	ENSDARG00000105293	srsf4	72	90.789	Danio_rerio
ENSACIG00000018649	srsf4	89	62.016	FBgn0004587	B52	95	60.938	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000018649	srsf4	92	60.317	ENSEBUG00000001681	srsf4	67	60.894	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000018649	srsf4	75	59.596	ENSEBUG00000003129	srsf4	69	62.987	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000018649	srsf4	90	73.643	ENSELUG00000017551	srsf4	93	75.385	Esox_lucius
ENSACIG00000018649	srsf4	90	85.950	ENSFCAG00000027821	SRSF4	52	72.374	Felis_catus
ENSACIG00000018649	srsf4	90	94.167	ENSFHEG00000007472	srsf4	88	97.561	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000018649	srsf4	90	86.777	ENSGMOG00000012906	srsf4	57	89.385	Gadus_morhua
ENSACIG00000018649	srsf4	91	95.588	ENSGAFG00000018496	srsf4	66	82.514	Gambusia_affinis
ENSACIG00000018649	srsf4	90	92.623	ENSGACG00000002389	srsf4	56	92.179	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000018649	srsf4	90	85.124	ENSGAGG00000014836	SRSF4	52	72.797	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000018649	srsf4	90	73.016	ENSHBUG00000011326	-	51	76.374	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000018649	srsf4	75	100.000	ENSHBUG00000016897	-	81	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000018649	srsf4	90	87.805	ENSHCOG00000012540	srsf4	68	89.730	Hippocampus_comes
ENSACIG00000018649	srsf4	90	95.588	ENSKMAG00000013631	srsf4	82	80.288	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000018649	srsf4	65	98.701	ENSLBEG00000017163	-	81	97.727	Labrus_bergylta
ENSACIG00000018649	srsf4	90	71.654	ENSLOCG00000001442	-	54	71.859	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000018649	srsf4	90	96.639	ENSMAMG00000004888	srsf4	77	94.118	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000018649	srsf4	100	95.817	ENSMZEG00005026275	srsf4	99	95.817	Maylandia_zebra
ENSACIG00000018649	srsf4	75	100.000	ENSMZEG00005025078	-	80	100.000	Maylandia_zebra
ENSACIG00000018649	srsf4	91	89.905	ENSMMOG00000013653	srsf4	89	88.328	Mola_mola
ENSACIG00000018649	srsf4	90	85.950	ENSMODG00000011052	SRSF4	55	87.079	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000018649	srsf4	67	75.000	ENSMALG00000010062	-	81	76.000	Monopterus_albus
ENSACIG00000018649	srsf4	94	94.118	ENSMALG00000013392	srsf4	88	85.621	Monopterus_albus
ENSACIG00000018649	srsf4	75	100.000	ENSNBRG00000014840	-	83	100.000	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000018649	srsf4	90	66.942	ENSNLEG00000030787	-	62	70.857	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000018649	srsf4	70	98.795	ENSORLG00000028783	-	75	98.795	Oryzias_latipes
ENSACIG00000018649	srsf4	90	96.694	ENSORLG00020016052	srsf4	92	79.600	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000018649	srsf4	90	96.694	ENSORLG00015007566	srsf4	71	93.855	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000018649	srsf4	90	96.694	ENSOMEG00000005541	srsf4	51	95.531	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000018649	srsf4	64	82.895	ENSOARG00000017944	-	67	38.498	Ovis_aries
ENSACIG00000018649	srsf4	63	83.529	ENSOARG00000002451	SRSF4	73	69.196	Ovis_aries
ENSACIG00000018649	srsf4	90	85.950	ENSPPRG00000016248	SRSF4	52	72.374	Panthera_pardus
ENSACIG00000018649	srsf4	93	86.364	ENSPMGG00000013436	srsf4	98	83.969	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000018649	srsf4	90	65.354	ENSPMAG00000009397	srsf4	68	68.132	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000018649	srsf4	91	95.588	ENSPFOG00000001306	srsf4	53	91.099	Poecilia_formosa
ENSACIG00000018649	srsf4	90	95.833	ENSPLAG00000008812	srsf4	81	95.652	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000018649	srsf4	91	95.588	ENSPMEG00000023638	srsf4	81	95.652	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000018649	srsf4	93	95.588	ENSPREG00000009639	srsf4	81	95.652	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000018649	srsf4	90	93.548	ENSPNYG00000003796	srsf4	64	92.818	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000018649	srsf4	98	91.176	ENSPNAG00000023844	srsf4	53	90.230	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000018649	srsf4	67	81.111	ENSSHAG00000012407	SRSF4	51	83.108	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000018649	srsf4	90	91.597	ENSSFOG00015020292	srsf4	82	88.288	Scleropages_formosus
ENSACIG00000018649	srsf4	90	91.339	ENSSMAG00000001707	srsf4	50	92.391	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000018649	srsf4	90	96.639	ENSSDUG00000007387	srsf4	81	75.601	Seriola_dumerili
ENSACIG00000018649	srsf4	90	72.500	ENSSLDG00000009745	srsf4	97	61.567	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000018649	srsf4	70	84.337	ENSSPUG00000019124	-	85	85.526	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000018649	srsf4	91	95.588	ENSSPAG00000014538	srsf4	83	93.277	Stegastes_partitus
ENSACIG00000018649	srsf4	90	94.958	ENSTRUG00000011891	srsf4	85	73.282	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000018649	srsf4	90	68.182	ENSXCOG00000003212	-	55	70.745	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000018649	srsf4	93	95.588	ENSXCOG00000018826	srsf4	89	91.525	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000018649	srsf4	69	97.561	ENSXMAG00000021549	-	69	97.561	Xiphophorus_maculatus