EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000018727 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 21701 bases
Position: chrCCOE01000243.1:405525-427225
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000024414	dsrm	PF00035.26	7.5e-19	1	2
ENSACIP00000024414	dsrm	PF00035.26	7.5e-19	2	2
ENSACIP00000024530	dsrm	PF00035.26	1e-18	1	2
ENSACIP00000024530	dsrm	PF00035.26	1e-18	2	2
ENSACIP00000024350	dsrm	PF00035.26	1.1e-18	1	2
ENSACIP00000024350	dsrm	PF00035.26	1.1e-18	2	2
ENSACIP00000024496	dsrm	PF00035.26	1.1e-18	1	2
ENSACIP00000024496	dsrm	PF00035.26	1.1e-18	2	2
ENSACIP00000024538	dsrm	PF00035.26	1.1e-18	1	2
ENSACIP00000024538	dsrm	PF00035.26	1.1e-18	2	2
ENSACIP00000024459	dsrm	PF00035.26	1.2e-18	1	2
ENSACIP00000024459	dsrm	PF00035.26	1.2e-18	2	2
ENSACIP00000024232	dsrm	PF00035.26	1.2e-18	1	2
ENSACIP00000024232	dsrm	PF00035.26	1.2e-18	2	2
ENSACIP00000024466	dsrm	PF00035.26	1.2e-18	1	2
ENSACIP00000024466	dsrm	PF00035.26	1.2e-18	2	2
ENSACIP00000024530	A_deamin	PF02137.18	1.2e-99	1	1
ENSACIP00000024496	A_deamin	PF02137.18	1.4e-99	1	1
ENSACIP00000024538	A_deamin	PF02137.18	7.7e-99	1	1
ENSACIP00000024232	A_deamin	PF02137.18	7.7e-99	1	1
ENSACIP00000024459	A_deamin	PF02137.18	7.6e-97	1	1
ENSACIP00000024466	A_deamin	PF02137.18	2.1e-96	1	1
ENSACIP00000024414	A_deamin	PF02137.18	1.4e-95	1	1
ENSACIP00000024350	A_deamin	PF02137.18	2.1e-93	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000025183	-	2136	-	ENSACIP00000024538	711 (aa)	-	-
ENSACIT00000024993	-	2040	-	ENSACIP00000024350	679 (aa)	-	-
ENSACIT00000025111	-	2166	-	ENSACIP00000024466	721 (aa)	-	-
ENSACIT00000025057	-	2163	-	ENSACIP00000024414	720 (aa)	-	-
ENSACIT00000025175	-	1986	-	ENSACIP00000024530	661 (aa)	-	-
ENSACIT00000025104	-	2106	-	ENSACIP00000024459	701 (aa)	-	-
ENSACIT00000024872	-	2121	-	ENSACIP00000024232	706 (aa)	-	-
ENSACIT00000025141	-	2100	-	ENSACIP00000024496	699 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000018727	-	97	41.730	ENSACIG00000024297	-	97	41.730
ENSACIG00000018727	-	63	31.390	ENSACIG00000019144	adad1	63	33.151
ENSACIG00000018727	-	98	41.892	ENSACIG00000004927	adarb1b	99	41.152
ENSACIG00000018727	-	90	56.271	ENSACIG00000003609	adarb2	89	55.799

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000018727	-	98	48.120	ENSG00000185736	ADARB2	95	46.986	Homo_sapiens
ENSACIG00000018727	-	71	54.898	ENSAPOG00000000330	adarb2	86	52.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018727	-	97	69.138	ENSAPOG00000007476	-	100	65.035	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018727	-	98	45.909	ENSAMEG00000001942	ADARB2	98	45.152	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000018727	-	98	69.080	ENSAOCG00000005591	-	99	68.421	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018727	-	98	54.476	ENSAOCG00000009758	adarb2	90	53.438	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018727	-	69	77.519	ENSAPEG00000003048	-	63	77.519	Amphiprion_percula
ENSACIG00000018727	-	98	54.325	ENSAPEG00000006268	adarb2	90	53.295	Amphiprion_percula
ENSACIG00000018727	-	98	52.941	ENSATEG00000022366	adarb2	96	51.391	Anabas_testudineus
ENSACIG00000018727	-	98	77.017	ENSATEG00000012728	-	99	76.833	Anabas_testudineus
ENSACIG00000018727	-	98	48.936	ENSAPLG00000012729	ADARB2	99	46.489	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000018727	-	98	48.250	ENSACAG00000003231	ADARB2	89	46.067	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000018727	-	97	48.006	ENSANAG00000033136	ADARB2	97	44.737	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000018727	-	98	54.917	ENSACLG00000012724	adarb2	96	51.195	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000018727	-	90	87.664	ENSACLG00000026322	-	90	89.308	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000018727	-	98	48.722	ENSAMXG00000040561	adarb2	99	46.196	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000018727	-	98	46.667	ENSBTAG00000014194	ADARB2	94	45.312	Bos_taurus
ENSACIG00000018727	-	98	44.394	ENSCJAG00000008412	ADARB2	98	43.629	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000018727	-	64	47.146	ENSCAFG00000005516	-	95	47.146	Canis_familiaris
ENSACIG00000018727	-	98	47.424	ENSCAFG00020004349	ADARB2	98	45.315	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000018727	-	98	45.745	ENSCHIG00000002677	ADARB2	94	45.442	Capra_hircus
ENSACIG00000018727	-	98	47.706	ENSCAPG00000009111	ADARB2	96	46.027	Cavia_aperea
ENSACIG00000018727	-	98	47.859	ENSCPOG00000013893	ADARB2	94	45.607	Cavia_porcellus
ENSACIG00000018727	-	66	47.454	ENSCCAG00000023030	ADARB2	93	47.454	Cebus_capucinus
ENSACIG00000018727	-	98	48.485	ENSCATG00000033324	ADARB2	99	47.448	Cercocebus_atys
ENSACIG00000018727	-	98	47.859	ENSCLAG00000004143	ADARB2	99	45.148	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000018727	-	98	48.710	ENSCSAG00000014037	ADARB2	99	47.652	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000018727	-	67	41.189	ENSCHOG00000003620	-	53	52.752	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000018727	-	98	48.097	ENSCPBG00000017055	ADARB2	99	47.708	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000018727	-	97	48.554	ENSCANG00000041148	ADARB2	99	46.768	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000018727	-	98	48.777	ENSCGRG00001012519	Adarb2	92	48.212	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000018727	-	98	48.777	ENSCGRG00000007814	Adarb2	92	48.212	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000018727	-	98	54.669	ENSCSEG00000012042	adarb2	95	52.570	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000018727	-	96	60.863	ENSCVAG00000009369	-	98	59.613	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000018727	-	98	53.614	ENSCVAG00000000566	adarb2	92	52.273	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000018727	-	98	51.051	ENSDARG00000071823	adarb2	96	49.302	Danio_rerio
ENSACIG00000018727	-	98	47.859	ENSDNOG00000000111	ADARB2	97	45.710	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000018727	-	98	47.806	ENSDORG00000005710	Adarb2	97	46.286	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000018727	-	93	46.628	ENSETEG00000017498	ADARB2	94	47.104	Echinops_telfairi
ENSACIG00000018727	-	98	48.485	ENSEASG00005019093	ADARB2	99	46.547	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000018727	-	98	48.788	ENSECAG00000014587	ADARB2	99	46.823	Equus_caballus
ENSACIG00000018727	-	97	52.198	ENSELUG00000008478	ADARB2	95	49.054	Esox_lucius
ENSACIG00000018727	-	98	52.161	ENSELUG00000003379	adarb2	98	48.806	Esox_lucius
ENSACIG00000018727	-	98	46.667	ENSFCAG00000003296	ADARB2	95	45.152	Felis_catus
ENSACIG00000018727	-	98	49.240	ENSFALG00000006993	ADARB2	99	47.885	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000018727	-	98	48.471	ENSFDAG00000012339	ADARB2	96	45.710	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000018727	-	96	62.000	ENSFHEG00000004579	-	97	59.970	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000018727	-	75	58.678	ENSGMOG00000017835	adarb2	67	55.779	Gadus_morhua
ENSACIG00000018727	-	76	51.976	ENSGMOG00000016035	-	75	52.918	Gadus_morhua
ENSACIG00000018727	-	98	49.088	ENSGALG00000006797	ADARB2	99	49.145	Gallus_gallus
ENSACIG00000018727	-	97	61.035	ENSGAFG00000018614	-	99	61.002	Gambusia_affinis
ENSACIG00000018727	-	97	44.397	ENSGAFG00000002060	adarb2	99	49.198	Gambusia_affinis
ENSACIG00000018727	-	98	52.932	ENSGACG00000001798	adarb2	99	49.531	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000018727	-	97	62.822	ENSGACG00000017477	-	94	62.341	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000018727	-	97	48.402	ENSGGOG00000003165	ADARB2	97	46.986	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000018727	-	99	87.145	ENSHBUG00000007365	-	92	87.429	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000018727	-	98	54.697	ENSHBUG00000001752	adarb2	99	51.001	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000018727	-	99	41.128	ENSHGLG00000014550	ADARB2	94	46.805	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000018727	-	98	48.318	ENSHGLG00100011502	ADARB2	92	47.776	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000018727	-	98	52.338	ENSHCOG00000020344	adarb2	92	52.237	Hippocampus_comes
ENSACIG00000018727	-	93	46.880	ENSIPUG00000000812	adarb2	94	48.048	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000018727	-	98	49.083	ENSSTOG00000014329	ADARB2	92	48.494	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000018727	-	98	48.318	ENSJJAG00000015849	Adarb2	92	47.496	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000018727	-	98	72.466	ENSKMAG00000000395	-	91	71.879	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000018727	-	98	53.718	ENSLBEG00000028085	adarb2	97	50.348	Labrus_bergylta
ENSACIG00000018727	-	98	74.963	ENSLBEG00000021671	-	99	73.314	Labrus_bergylta
ENSACIG00000018727	-	98	52.036	ENSLOCG00000012249	adarb2	97	48.818	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000018727	-	98	48.930	ENSLAFG00000004361	ADARB2	99	46.273	Loxodonta_africana
ENSACIG00000018727	-	98	48.571	ENSMFAG00000040865	ADARB2	99	47.123	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000018727	-	98	48.571	ENSMMUG00000017120	ADARB2	95	47.123	Macaca_mulatta
ENSACIG00000018727	-	98	48.722	ENSMNEG00000040136	ADARB2	98	47.019	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000018727	-	98	48.571	ENSMLEG00000036075	ADARB2	99	47.123	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000018727	-	97	78.287	ENSMAMG00000013888	-	99	78.311	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000018727	-	90	55.189	ENSMAMG00000015084	adarb2	96	51.836	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000018727	-	99	85.845	ENSMZEG00005006722	-	97	85.239	Maylandia_zebra
ENSACIG00000018727	-	98	54.917	ENSMZEG00005017069	adarb2	94	51.329	Maylandia_zebra
ENSACIG00000018727	-	98	48.784	ENSMGAG00000005556	ADARB2	99	46.639	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000018727	-	98	49.235	ENSMAUG00000010346	Adarb2	99	47.340	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000018727	-	97	41.731	ENSMICG00000047603	ADARB2	93	40.942	Microcebus_murinus
ENSACIG00000018727	-	98	49.088	ENSMOCG00000011797	Adarb2	99	47.332	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000018727	-	98	53.566	ENSMMOG00000005538	adarb2	98	50.201	Mola_mola
ENSACIG00000018727	-	99	72.672	ENSMMOG00000011272	-	98	70.555	Mola_mola
ENSACIG00000018727	-	90	48.926	ENSMODG00000006359	ADARB2	99	49.175	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000018727	-	90	53.257	ENSMALG00000017654	adarb2	93	50.144	Monopterus_albus
ENSACIG00000018727	-	98	78.064	ENSMALG00000012596	-	97	78.468	Monopterus_albus
ENSACIG00000018727	-	98	48.930	MGP_CAROLIEiJ_G0018212	Adarb2	92	48.212	Mus_caroli
ENSACIG00000018727	-	98	48.624	ENSMUSG00000052551	Adarb2	92	48.069	Mus_musculus
ENSACIG00000018727	-	98	48.624	MGP_PahariEiJ_G0019260	Adarb2	92	48.069	Mus_pahari
ENSACIG00000018727	-	98	48.624	MGP_SPRETEiJ_G0019068	Adarb2	99	49.421	Mus_spretus
ENSACIG00000018727	-	98	47.576	ENSMPUG00000016224	ADARB2	99	46.676	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000018727	-	98	46.746	ENSMLUG00000013832	ADARB2	99	45.980	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000018727	-	98	48.471	ENSNGAG00000015119	Adarb2	92	47.776	Nannospalax_galili
ENSACIG00000018727	-	99	79.728	ENSNBRG00000019879	-	99	80.707	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000018727	-	90	55.960	ENSNBRG00000013208	adarb2	93	52.709	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000018727	-	98	48.554	ENSMEUG00000008809	ADARB2	91	47.983	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000018727	-	79	50.000	ENSOPRG00000009309	ADARB2	80	50.000	Ochotona_princeps
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ENSACIG00000018727	-	93	60.413	ENSXMAG00000006770	-	99	57.410	Xiphophorus_maculatus