EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000018887 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8929 bases
Position: chrCCOE01001439.1:8308-17236
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000024345	zf-CCHC	PF00098.23	6.1e-08	1	1
ENSACIP00000024349	zf-CCHC	PF00098.23	6.2e-05	1	1
ENSACIP00000024349	PAP_assoc	PF03828.19	1.6e-12	1	1
ENSACIP00000024345	PAP_assoc	PF03828.19	3e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000024988	-	2295	-	ENSACIP00000024345	764 (aa)	-	-
ENSACIT00000024992	-	1104	-	ENSACIP00000024349	367 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000018887's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000018887's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000018887	-	84	50.827	ENSG00000134744	TUT4	57	66.578	Homo_sapiens
ENSACIG00000018887	-	63	71.064	ENSAPOG00000018983	-	69	71.064	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018887	-	97	47.700	ENSAMEG00000009340	TUT4	63	47.361	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000018887	-	96	76.126	ENSATEG00000022516	-	98	76.808	Anabas_testudineus
ENSACIG00000018887	-	61	65.268	ENSATEG00000003823	TUT4	56	66.129	Anabas_testudineus
ENSACIG00000018887	-	59	67.933	ENSAPLG00000006345	TUT4	51	67.933	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000018887	-	84	51.796	ENSACAG00000008282	TUT4	52	57.500	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000018887	-	55	60.880	ENSANAG00000013486	TUT4	57	66.223	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000018887	-	70	68.171	ENSACLG00000023312	TUT4	54	68.171	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000018887	-	63	61.905	ENSAMXG00000007030	TUT4	62	53.364	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000018887	-	84	51.048	ENSBTAG00000002721	TUT4	64	47.354	Bos_taurus
ENSACIG00000018887	-	84	51.667	ENSCJAG00000021588	TUT4	55	57.714	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000018887	-	97	46.693	ENSCAFG00000003734	TUT4	53	57.605	Canis_familiaris
ENSACIG00000018887	-	64	61.957	ENSCAFG00020010923	-	55	72.239	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000018887	-	84	51.064	ENSCHIG00000023944	TUT4	64	47.222	Capra_hircus
ENSACIG00000018887	-	84	50.673	ENSTSYG00000009885	TUT4	63	46.392	Carlito_syrichta
ENSACIG00000018887	-	84	46.847	ENSCAPG00000005680	TUT4	57	53.435	Cavia_aperea
ENSACIG00000018887	-	63	62.182	ENSCPOG00000005086	TUT4	54	57.634	Cavia_porcellus
ENSACIG00000018887	-	80	79.412	ENSCCAG00000025142	-	88	62.248	Cebus_capucinus
ENSACIG00000018887	-	84	51.662	ENSCCAG00000036903	TUT4	58	64.122	Cebus_capucinus
ENSACIG00000018887	-	84	50.519	ENSCATG00000024618	TUT4	55	58.077	Cercocebus_atys
ENSACIG00000018887	-	84	50.368	ENSCLAG00000005255	TUT4	54	57.252	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000018887	-	63	62.182	ENSCSAG00000001277	TUT4	52	58.077	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000018887	-	83	73.288	ENSCHOG00000010995	TUT4	61	60.156	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000018887	-	91	48.396	ENSCPBG00000014796	TUT4	55	64.811	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000018887	-	63	62.182	ENSCANG00000036212	TUT4	57	66.578	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000018887	-	75	66.511	ENSCGRG00001020315	-	52	58.015	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000018887	-	84	50.531	ENSCGRG00000017571	Tut4	52	58.015	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000018887	-	63	61.905	ENSCVAG00000012659	TUT4	59	59.684	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000018887	-	84	50.446	ENSDNOG00000013920	TUT4	52	58.077	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000018887	-	84	50.822	ENSDORG00000027891	Tut4	52	58.397	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000018887	-	90	49.062	ENSETEG00000016298	TUT4	50	51.445	Echinops_telfairi
ENSACIG00000018887	-	62	52.788	ENSEBUG00000009834	TUT4	69	56.948	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000018887	-	84	51.497	ENSECAG00000021261	TUT4	52	57.224	Equus_caballus
ENSACIG00000018887	-	67	66.430	ENSELUG00000024167	TUT4	53	63.656	Esox_lucius
ENSACIG00000018887	-	97	46.797	ENSFCAG00000003246	TUT4	64	46.958	Felis_catus
ENSACIG00000018887	-	84	49.410	ENSFDAG00000016676	TUT4	51	57.500	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000018887	-	63	66.427	ENSGMOG00000001281	TUT4	64	65.493	Gadus_morhua
ENSACIG00000018887	-	91	48.663	ENSGALG00000010629	TUT4	55	57.308	Gallus_gallus
ENSACIG00000018887	-	62	66.508	ENSGACG00000005282	-	62	66.508	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000018887	-	91	47.965	ENSGAGG00000020531	TUT4	55	61.024	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000018887	-	66	60.993	ENSHBUG00000008564	-	50	65.282	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000018887	-	63	67.062	ENSHGLG00000000804	TUT4	54	57.500	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000018887	-	63	67.062	ENSHGLG00100002051	TUT4	54	57.500	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000018887	-	90	47.709	ENSHCOG00000009746	-	50	69.697	Hippocampus_comes
ENSACIG00000018887	-	60	57.778	ENSIPUG00000002120	-	89	57.778	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000018887	-	62	65.148	ENSIPUG00000002638	zcchc11	55	65.148	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000018887	-	84	50.075	ENSSTOG00000015611	TUT4	52	57.034	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000018887	-	60	66.667	ENSLACG00000010748	TUT4	50	58.974	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000018887	-	66	65.022	ENSLOCG00000006248	TUT4	60	65.022	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000018887	-	84	51.294	ENSLAFG00000003763	TUT4	72	46.623	Loxodonta_africana
ENSACIG00000018887	-	84	50.667	ENSMFAG00000011842	TUT4	53	57.605	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000018887	-	84	50.667	ENSMMUG00000017023	TUT4	57	66.578	Macaca_mulatta
ENSACIG00000018887	-	84	50.667	ENSMNEG00000009839	TUT4	50	57.605	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000018887	-	84	50.825	ENSMLEG00000036158	TUT4	55	66.578	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000018887	-	66	64.365	ENSMAMG00000014890	TUT4	56	64.365	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000018887	-	70	68.171	ENSMZEG00005017227	TUT4	53	68.171	Maylandia_zebra
ENSACIG00000018887	-	91	48.930	ENSMGAG00000011185	TUT4	58	57.500	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000018887	-	84	51.360	ENSMICG00000015853	TUT4	51	58.238	Microcebus_murinus
ENSACIG00000018887	-	78	33.784	ENSMOCG00000012851	Tut4	51	55.200	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000018887	-	98	72.510	ENSMMOG00000017546	-	94	73.174	Mola_mola
ENSACIG00000018887	-	63	62.656	ENSMMOG00000016870	-	52	72.393	Mola_mola
ENSACIG00000018887	-	84	50.983	ENSMODG00000000618	TUT4	72	46.701	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000018887	-	84	50.000	MGP_CAROLIEiJ_G0026268	Tut4	53	57.795	Mus_caroli
ENSACIG00000018887	-	84	50.989	ENSMUSG00000034610	Tut4	53	57.795	Mus_musculus
ENSACIG00000018887	-	84	50.760	MGP_PahariEiJ_G0028601	Tut4	52	57.795	Mus_pahari
ENSACIG00000018887	-	75	66.511	MGP_SPRETEiJ_G0027237	Tut4	53	57.795	Mus_spretus
ENSACIG00000018887	-	97	46.899	ENSMPUG00000006880	TUT4	72	47.098	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000018887	-	84	51.067	ENSMLUG00000001067	TUT4	60	57.824	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000018887	-	78	34.072	ENSNGAG00000011508	Tut4	51	56.000	Nannospalax_galili
ENSACIG00000018887	-	63	62.271	ENSNBRG00000005683	-	51	73.620	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000018887	-	84	50.830	ENSNLEG00000017998	TUT4	58	63.480	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000018887	-	84	47.460	ENSMEUG00000003865	TUT4	62	42.985	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000018887	-	84	50.149	ENSODEG00000007328	TUT4	52	56.979	Octodon_degus
ENSACIG00000018887	-	70	68.171	ENSONIG00000019455	TUT4	62	67.217	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000018887	-	84	48.811	ENSOANG00000012864	TUT4	57	53.860	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000018887	-	85	50.671	ENSOCUG00000002390	TUT4	55	57.089	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000018887	-	64	60.145	ENSORLG00000013135	-	52	71.472	Oryzias_latipes
ENSACIG00000018887	-	64	59.783	ENSORLG00020002631	-	53	71.166	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000018887	-	63	60.806	ENSORLG00015001219	-	52	71.779	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000018887	-	63	55.311	ENSOMEG00000015574	-	50	66.871	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000018887	-	84	52.042	ENSOGAG00000005425	TUT4	64	47.500	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000018887	-	84	51.142	ENSOARG00000005494	TUT4	63	47.299	Ovis_aries
ENSACIG00000018887	-	63	62.182	ENSPPAG00000037653	TUT4	55	67.385	Pan_paniscus
ENSACIG00000018887	-	97	46.563	ENSPPRG00000020521	TUT4	63	46.658	Panthera_pardus
ENSACIG00000018887	-	97	46.563	ENSPTIG00000010511	TUT4	63	46.658	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000018887	-	63	62.182	ENSPTRG00000000740	TUT4	55	67.385	Pan_troglodytes
ENSACIG00000018887	-	84	49.552	ENSPANG00000005042	TUT4	53	56.322	Papio_anubis
ENSACIG00000018887	-	91	48.663	ENSPSIG00000016704	TUT4	54	66.745	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000018887	-	63	65.517	ENSPMGG00000015621	-	56	53.251	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000018887	-	78	31.452	ENSPEMG00000023722	Tut4	51	53.435	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000018887	-	84	52.155	ENSPCIG00000022380	TUT4	70	46.753	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000018887	-	61	67.574	ENSPFOG00000002439	TUT4	61	57.341	Poecilia_formosa
ENSACIG00000018887	-	63	60.440	ENSPMEG00000006996	-	50	72.086	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000018887	-	64	61.957	ENSPPYG00000001347	TUT4	52	57.500	Pongo_abelii
ENSACIG00000018887	-	71	67.828	ENSPCOG00000007824	TUT4	53	57.806	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000018887	-	63	61.679	ENSPVAG00000009804	TUT4	53	43.767	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000018887	-	70	68.171	ENSPNYG00000023175	TUT4	53	68.171	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000018887	-	84	47.676	ENSRBIG00000027989	TUT4	51	54.231	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000018887	-	84	50.977	ENSRROG00000034868	TUT4	55	67.385	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000018887	-	90	63.343	ENSSBOG00000020099	-	98	56.235	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000018887	-	84	51.560	ENSSBOG00000013661	TUT4	53	57.634	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000018887	-	84	52.193	ENSSHAG00000006231	TUT4	65	54.452	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000018887	-	84	52.932	ENSSFOG00015013524	zcchc11	66	51.149	Scleropages_formosus
ENSACIG00000018887	-	59	66.746	ENSSMAG00000016072	TUT4	56	62.581	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000018887	-	65	59.712	ENSSLDG00000016071	TUT4	61	52.234	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000018887	-	92	48.031	ENSSPUG00000013287	TUT4	56	53.831	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000018887	-	84	51.128	ENSSSCG00000003859	TUT4	54	57.692	Sus_scrofa
ENSACIG00000018887	-	90	55.389	ENSTRUG00000024719	-	78	50.000	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000018887	-	64	49.345	ENSTNIG00000002785	-	90	49.345	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000018887	-	84	50.915	ENSTTRG00000016142	TUT4	63	46.825	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000018887	-	97	47.632	ENSUAMG00000000759	TUT4	90	46.658	Ursus_americanus
ENSACIG00000018887	-	97	47.396	ENSUMAG00000022669	TUT4	72	46.527	Ursus_maritimus
ENSACIG00000018887	-	97	47.500	ENSVVUG00000002703	TUT4	79	58.824	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000018887	-	84	50.000	ENSXETG00000008061	tut4	59	66.033	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000018887	-	63	60.440	ENSXCOG00000007204	-	50	72.086	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000018887	-	63	60.806	ENSXMAG00000000751	-	50	72.393	Xiphophorus_maculatus