EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000018952 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4075 bases
Position: chrCCOE01001047.1:53121-57195
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000024402	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-20	1	3
ENSACIP00000024402	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-20	2	3
ENSACIP00000024402	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-20	3	3
ENSACIP00000024402	zf-met	PF12874.7	3e-06	1	2
ENSACIP00000024402	zf-met	PF12874.7	3e-06	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000025045	-	795	-	ENSACIP00000024402	264 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000018952	-	80	48.276	ENSACIG00000011541	-	93	48.276
ENSACIG00000018952	-	64	45.763	ENSACIG00000004626	-	85	45.763
ENSACIG00000018952	-	80	38.947	ENSACIG00000008886	znf1164	89	38.947
ENSACIG00000018952	-	54	43.662	ENSACIG00000018404	-	85	43.662
ENSACIG00000018952	-	84	49.138	ENSACIG00000017647	-	97	52.586
ENSACIG00000018952	-	50	57.812	ENSACIG00000022658	-	92	57.812
ENSACIG00000018952	-	50	44.928	ENSACIG00000009755	-	71	44.928
ENSACIG00000018952	-	66	45.588	ENSACIG00000019534	-	91	45.588
ENSACIG00000018952	-	65	42.593	ENSACIG00000007096	-	95	43.966
ENSACIG00000018952	-	50	41.237	ENSACIG00000007034	-	80	41.237
ENSACIG00000018952	-	72	30.198	ENSACIG00000006826	-	82	30.198
ENSACIG00000018952	-	80	54.310	ENSACIG00000003556	-	80	54.310
ENSACIG00000018952	-	80	50.239	ENSACIG00000018059	-	74	51.196
ENSACIG00000018952	-	52	46.479	ENSACIG00000007855	-	97	46.479
ENSACIG00000018952	-	54	48.718	ENSACIG00000022330	-	86	48.718
ENSACIG00000018952	-	74	49.565	ENSACIG00000016944	-	98	49.565
ENSACIG00000018952	-	59	37.168	ENSACIG00000016133	-	72	37.168
ENSACIG00000018952	-	80	47.619	ENSACIG00000022625	-	99	48.980
ENSACIG00000018952	-	52	44.248	ENSACIG00000021986	-	91	44.248
ENSACIG00000018952	-	51	34.188	ENSACIG00000011516	-	79	34.188
ENSACIG00000018952	-	81	48.276	ENSACIG00000006806	-	79	48.276
ENSACIG00000018952	-	66	40.517	ENSACIG00000004641	-	67	40.517
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ENSACIG00000018952	-	67	43.651	ENSACIG00000007464	-	63	43.651
ENSACIG00000018952	-	56	41.667	ENSACIG00000001860	-	52	41.667
ENSACIG00000018952	-	80	60.476	ENSACIG00000024444	-	81	60.476
ENSACIG00000018952	-	53	52.941	ENSACIG00000022293	-	97	53.846
ENSACIG00000018952	-	62	42.500	ENSACIG00000022738	-	97	45.205
ENSACIG00000018952	-	66	49.138	ENSACIG00000006755	-	85	49.138
ENSACIG00000018952	-	95	53.759	ENSACIG00000017013	-	73	53.759
ENSACIG00000018952	-	81	40.517	ENSACIG00000013750	-	91	40.517
ENSACIG00000018952	-	53	38.938	ENSACIG00000012636	ZNF319	77	38.938
ENSACIG00000018952	-	64	39.344	ENSACIG00000014282	znf526	58	34.167
ENSACIG00000018952	-	80	57.759	ENSACIG00000016182	-	92	55.172
ENSACIG00000018952	-	72	52.586	ENSACIG00000003754	-	93	52.586
ENSACIG00000018952	-	79	39.167	ENSACIG00000015835	-	80	39.167
ENSACIG00000018952	-	64	39.655	ENSACIG00000013149	-	83	39.655
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ENSACIG00000018952	-	80	53.448	ENSACIG00000019102	-	59	53.448
ENSACIG00000018952	-	61	41.593	ENSACIG00000017683	-	76	39.560
ENSACIG00000018952	-	50	32.432	ENSACIG00000013613	scrt1b	52	32.432
ENSACIG00000018952	-	53	33.962	ENSACIG00000018641	snai2	51	33.962
ENSACIG00000018952	-	80	45.972	ENSACIG00000018022	-	67	45.498
ENSACIG00000018952	-	81	49.327	ENSACIG00000023162	-	61	49.327
ENSACIG00000018952	-	81	59.535	ENSACIG00000011153	-	87	59.535
ENSACIG00000018952	-	61	53.333	ENSACIG00000018440	-	94	53.333
ENSACIG00000018952	-	80	54.237	ENSACIG00000019710	-	84	54.237
ENSACIG00000018952	-	55	39.024	ENSACIG00000023049	znf646	97	35.593
ENSACIG00000018952	-	81	57.025	ENSACIG00000019791	-	95	54.310
ENSACIG00000018952	-	84	54.310	ENSACIG00000010966	-	69	54.310
ENSACIG00000018952	-	53	43.269	ENSACIG00000017653	-	99	43.269
ENSACIG00000018952	-	74	33.898	ENSACIG00000001296	-	61	33.898
ENSACIG00000018952	-	80	53.097	ENSACIG00000004666	-	96	53.097
ENSACIG00000018952	-	80	45.299	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	95	45.299
ENSACIG00000018952	-	81	51.240	ENSACIG00000004745	-	95	55.172
ENSACIG00000018952	-	54	41.600	ENSACIG00000000406	prdm5	86	44.348
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ENSACIG00000018952	-	51	58.333	ENSACIG00000019804	-	76	58.333
ENSACIG00000018952	-	61	46.667	ENSACIG00000015429	-	75	46.667
ENSACIG00000018952	-	80	47.926	ENSACIG00000022645	-	57	47.926
ENSACIG00000018952	-	80	50.000	ENSACIG00000013470	-	92	50.000
ENSACIG00000018952	-	62	49.580	ENSACIG00000010637	-	53	49.580
ENSACIG00000018952	-	66	37.037	ENSACIG00000009443	-	58	37.037
ENSACIG00000018952	-	55	43.956	ENSACIG00000003515	-	98	45.361
ENSACIG00000018952	-	80	46.552	ENSACIG00000010647	-	98	60.526
ENSACIG00000018952	-	80	47.414	ENSACIG00000011515	-	95	47.414
ENSACIG00000018952	-	81	52.586	ENSACIG00000013604	-	98	57.664
ENSACIG00000018952	-	58	48.305	ENSACIG00000023794	-	61	48.305
ENSACIG00000018952	-	76	37.273	ENSACIG00000009717	-	87	48.718
ENSACIG00000018952	-	71	56.000	ENSACIG00000000311	-	80	56.000
ENSACIG00000018952	-	80	52.586	ENSACIG00000008448	-	94	52.586
ENSACIG00000018952	-	74	43.182	ENSACIG00000003720	-	97	43.182
ENSACIG00000018952	-	77	42.202	ENSACIG00000010739	-	95	42.202
ENSACIG00000018952	-	52	39.655	ENSACIG00000023313	-	90	39.655
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ENSACIG00000018952	-	57	44.915	ENSACIG00000016117	-	82	44.915
ENSACIG00000018952	-	81	53.913	ENSACIG00000004041	-	96	53.913
ENSACIG00000018952	-	91	55.909	ENSACIG00000006172	-	98	54.783

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000018952	-	76	55.000	ENSAPOG00000020864	-	76	55.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	59	60.938	ENSAPOG00000013212	-	100	60.938	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	60	50.862	ENSAPOG00000021690	-	96	50.862	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	50	55.814	ENSAPOG00000022964	-	99	55.814	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	59	46.061	ENSAPOG00000020343	-	96	46.552	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	51	49.254	ENSAPOG00000006282	-	84	49.254	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	80	52.174	ENSAPOG00000001742	-	66	52.174	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	80	49.099	ENSAPOG00000023479	-	64	49.099	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	83	46.552	ENSAPOG00000005986	-	95	41.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	63	63.158	ENSAPOG00000020368	-	100	63.158	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	63	52.586	ENSAPOG00000022086	-	97	58.209	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	79	50.000	ENSAPOG00000014714	-	97	50.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	96	48.889	ENSAPOG00000002691	-	76	48.889	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	95	52.893	ENSAPOG00000013125	-	81	52.893	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	80	51.724	ENSAPOG00000008053	-	67	51.724	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	96	52.586	ENSAPOG00000014378	-	58	52.586	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	80	50.000	ENSAPOG00000022234	-	97	48.544	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	79	40.000	ENSAPOG00000000503	-	76	40.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	80	54.464	ENSAPOG00000007528	-	63	54.464	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	80	56.566	ENSAPOG00000024332	-	80	56.566	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	53	54.023	ENSAPOG00000013065	-	97	54.023	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	77	42.593	ENSAPOG00000007955	-	77	49.558	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	80	47.706	ENSAPOG00000018127	-	66	48.276	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	92	41.870	ENSAPOG00000001725	-	95	54.839	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	50	47.414	ENSAPOG00000007983	-	52	47.414	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000018952	-	95	46.154	ENSAOCG00000014651	-	69	46.154	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018952	-	81	52.703	ENSAOCG00000011204	-	69	53.390	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018952	-	73	53.043	ENSAOCG00000018543	-	99	53.043	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018952	-	81	51.648	ENSAOCG00000022375	-	98	51.515	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018952	-	81	54.310	ENSAOCG00000015586	-	97	53.390	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018952	-	81	54.237	ENSAOCG00000018307	-	99	53.719	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018952	-	75	51.724	ENSAOCG00000000448	-	93	51.724	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018952	-	90	52.893	ENSAOCG00000016287	-	85	57.025	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018952	-	64	51.724	ENSAOCG00000024281	-	99	51.724	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018952	-	50	47.414	ENSAOCG00000024767	-	55	47.414	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018952	-	80	57.627	ENSAOCG00000002585	-	84	57.627	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018952	-	50	47.414	ENSAOCG00000013345	-	55	47.414	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018952	-	70	54.386	ENSAOCG00000016737	-	100	54.386	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018952	-	82	48.305	ENSAOCG00000006793	-	99	48.305	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018952	-	51	50.000	ENSAOCG00000016088	-	79	50.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018952	-	84	57.851	ENSAOCG00000020830	-	93	59.829	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000018952	-	56	54.310	ENSAPEG00000010438	-	95	54.310	Amphiprion_percula
ENSACIG00000018952	-	83	47.414	ENSAPEG00000013585	-	94	41.611	Amphiprion_percula
ENSACIG00000018952	-	85	53.097	ENSAPEG00000007389	-	98	53.097	Amphiprion_percula
ENSACIG00000018952	-	80	49.515	ENSAPEG00000015593	-	84	49.515	Amphiprion_percula
ENSACIG00000018952	-	82	49.115	ENSAPEG00000015310	-	73	49.115	Amphiprion_percula
ENSACIG00000018952	-	80	57.627	ENSAPEG00000009381	-	65	57.627	Amphiprion_percula
ENSACIG00000018952	-	81	43.243	ENSAPEG00000009533	-	86	43.243	Amphiprion_percula
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