EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000019022 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: fb76c12|fb93h11|fb98e07|nanos-related gene|nos2|wu:fb76c12|wu:fb93h11|wu:fb98e07|wu:fq21a10
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 711 bases
Position: chrCCOE01001392.1:942566-943276
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000024497	zf-nanos	PF05741.13	1.2e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000025143	-	711	-	ENSACIP00000024497	236 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000019022	-	96	68.996	ENSACIG00000004805	-	100	68.996

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000019022	-	78	30.348	ENSAPOG00000009762	nanos3	85	30.348	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019022	-	100	96.186	ENSAPOG00000004421	-	100	96.186	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019022	-	96	67.391	ENSAPOG00000005093	-	100	67.391	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019022	-	100	97.458	ENSAOCG00000012346	-	100	97.458	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019022	-	78	32.178	ENSAOCG00000009870	nanos3	89	32.178	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019022	-	98	66.809	ENSAOCG00000020120	-	97	66.809	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019022	-	98	66.809	ENSAPEG00000005585	-	97	66.809	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019022	-	100	97.458	ENSAPEG00000019024	-	100	97.458	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019022	-	78	32.178	ENSAPEG00000013733	nanos3	89	32.178	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019022	-	96	97.345	ENSATEG00000006118	-	100	97.345	Anabas_testudineus
ENSACIG00000019022	-	96	68.559	ENSATEG00000018856	-	95	68.559	Anabas_testudineus
ENSACIG00000019022	-	96	69.130	ENSACLG00000014135	-	97	69.130	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019022	-	94	79.372	ENSACLG00000013474	-	99	79.372	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019022	-	92	64.055	ENSAMXG00000043091	nanos1	98	64.055	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000019022	-	92	64.977	ENSAMXG00000030027	NANOS1	98	64.977	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000019022	-	84	37.963	ENSBTAG00000052883	NANOS1	84	38.117	Bos_taurus
ENSACIG00000019022	-	50	45.763	ENSCAFG00000024541	NANOS2	83	45.763	Canis_familiaris
ENSACIG00000019022	-	50	45.763	ENSCAFG00020001772	NANOS2	83	45.763	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000019022	-	50	44.361	ENSCHIG00000004298	NANOS1	86	34.100	Capra_hircus
ENSACIG00000019022	-	50	43.796	ENSCPOG00000038609	NANOS1	87	34.310	Cavia_porcellus
ENSACIG00000019022	-	50	44.361	ENSCATG00000000994	NANOS1	88	34.601	Cercocebus_atys
ENSACIG00000019022	-	84	37.674	ENSCLAG00000005574	NANOS1	98	36.515	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000019022	-	89	34.783	ENSCGRG00001007664	Nanos1	87	36.170	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000019022	-	98	63.291	ENSCSEG00000012772	-	99	63.291	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000019022	-	94	91.928	ENSCSEG00000004547	-	95	91.928	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000019022	-	96	89.823	ENSCVAG00000013105	-	100	89.823	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000019022	-	95	54.667	ENSCVAG00000019077	-	97	59.471	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000019022	-	96	81.897	ENSDARG00000109337	nanos1	100	81.897	Danio_rerio
ENSACIG00000019022	-	84	33.473	ENSDNOG00000048482	NANOS1	83	34.553	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000019022	-	84	37.788	ENSEASG00005014466	NANOS1	82	38.288	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000019022	-	84	37.674	ENSECAG00000003656	NANOS1	82	38.605	Equus_caballus
ENSACIG00000019022	-	96	87.225	ENSELUG00000022032	nanos1	100	87.225	Esox_lucius
ENSACIG00000019022	-	84	37.004	ENSFCAG00000040429	-	80	37.179	Felis_catus
ENSACIG00000019022	-	100	89.407	ENSFHEG00000020713	-	100	89.407	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000019022	-	93	65.198	ENSFHEG00000005548	-	96	66.079	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000019022	-	88	37.557	ENSGALG00000027980	NANOS1	86	38.117	Gallus_gallus
ENSACIG00000019022	-	78	31.088	ENSGAFG00000010617	nanos3	83	31.551	Gambusia_affinis
ENSACIG00000019022	-	93	57.273	ENSGAFG00000017593	NANOS1	99	58.636	Gambusia_affinis
ENSACIG00000019022	-	100	89.831	ENSGAFG00000017699	-	100	89.831	Gambusia_affinis
ENSACIG00000019022	-	96	69.130	ENSHBUG00000010726	-	97	69.130	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000019022	-	94	79.821	ENSHBUG00000019798	-	99	79.821	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000019022	-	89	35.714	ENSHGLG00000010622	NANOS1	89	35.317	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000019022	-	96	49.145	ENSHCOG00000011423	-	99	49.787	Hippocampus_comes
ENSACIG00000019022	-	96	71.491	ENSHCOG00000010326	NANOS1	100	71.491	Hippocampus_comes
ENSACIG00000019022	-	99	67.611	ENSIPUG00000020252	nanos1	99	68.826	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000019022	-	100	91.525	ENSKMAG00000008477	-	100	91.525	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000019022	-	92	56.481	ENSLBEG00000027516	-	98	58.525	Labrus_bergylta
ENSACIG00000019022	-	78	35.071	ENSLBEG00000004936	nanos3	84	35.071	Labrus_bergylta
ENSACIG00000019022	-	93	96.818	ENSLBEG00000016559	-	96	96.818	Labrus_bergylta
ENSACIG00000019022	-	96	79.736	ENSLACG00000005166	nanos1	100	79.736	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000019022	-	95	37.395	ENSLACG00000015195	NANOS1	99	37.395	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000019022	-	89	35.981	ENSLOCG00000018243	NANOS1	88	35.981	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000019022	-	96	84.141	ENSLOCG00000018172	nanos1	100	84.141	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000019022	-	79	30.108	ENSMFAG00000040009	NANOS3	67	30.108	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000019022	-	79	30.108	ENSMMUG00000008316	NANOS3	67	30.108	Macaca_mulatta
ENSACIG00000019022	-	50	44.361	ENSMMUG00000048654	NANOS1	75	68.254	Macaca_mulatta
ENSACIG00000019022	-	50	44.361	ENSMNEG00000022527	NANOS1	88	34.601	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000019022	-	79	30.108	ENSMNEG00000028898	NANOS3	67	30.108	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000019022	-	96	66.812	ENSMAMG00000000110	-	96	66.812	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000019022	-	92	80.734	ENSMAMG00000015477	-	99	80.734	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000019022	-	78	32.039	ENSMAMG00000011660	nanos3	85	32.039	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000019022	-	96	69.130	ENSMZEG00005014293	-	100	69.130	Maylandia_zebra
ENSACIG00000019022	-	94	79.821	ENSMZEG00005002722	-	99	79.821	Maylandia_zebra
ENSACIG00000019022	-	89	34.156	ENSMAUG00000021200	Nanos1	88	35.565	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000019022	-	89	34.583	ENSMOCG00000007708	Nanos1	91	35.081	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000019022	-	91	77.674	ENSMMOG00000003796	-	95	77.674	Mola_mola
ENSACIG00000019022	-	100	95.763	ENSMALG00000015460	-	100	95.763	Monopterus_albus
ENSACIG00000019022	-	100	65.272	ENSMALG00000002316	-	100	65.272	Monopterus_albus
ENSACIG00000019022	-	89	34.335	MGP_CAROLIEiJ_G0023120	Nanos1	89	35.102	Mus_caroli
ENSACIG00000019022	-	89	33.197	ENSMUSG00000072437	Nanos1	89	35.391	Mus_musculus
ENSACIG00000019022	-	89	34.034	MGP_PahariEiJ_G0014608	Nanos1	89	35.950	Mus_pahari
ENSACIG00000019022	-	89	34.310	MGP_SPRETEiJ_G0024041	Nanos1	89	34.959	Mus_spretus
ENSACIG00000019022	-	97	35.193	ENSNGAG00000023539	Nanos1	93	35.193	Nannospalax_galili
ENSACIG00000019022	-	96	68.696	ENSNBRG00000024149	-	97	68.696	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000019022	-	94	79.372	ENSNBRG00000014018	-	99	79.372	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000019022	-	89	34.632	ENSODEG00000017556	NANOS1	95	36.015	Octodon_degus
ENSACIG00000019022	-	96	98.230	ENSONIG00000020951	-	100	98.230	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000019022	-	96	69.130	ENSONIG00000021034	-	100	69.130	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000019022	-	93	52.703	ENSORLG00000027849	nanos1a	98	52.703	Oryzias_latipes
ENSACIG00000019022	-	96	84.513	ENSORLG00020022492	nanos1b	100	84.513	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000019022	-	93	53.153	ENSORLG00020008713	-	98	53.153	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000019022	-	96	84.581	ENSORLG00015021513	-	100	84.581	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000019022	-	93	52.703	ENSORLG00015000175	-	98	52.703	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000019022	-	93	53.363	ENSOMEG00000008866	NANOS1	98	53.363	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000019022	-	78	31.771	ENSOMEG00000000922	nanos3	83	31.771	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000019022	-	98	85.281	ENSOMEG00000003107	-	99	85.281	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000019022	-	50	46.032	ENSOGAG00000033947	NANOS1	88	35.385	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000019022	-	79	30.108	ENSPANG00000015037	NANOS3	65	30.108	Papio_anubis
ENSACIG00000019022	-	50	44.361	ENSPANG00000000318	NANOS1	88	34.601	Papio_anubis
ENSACIG00000019022	-	93	84.091	ENSPKIG00000000617	nanos1	91	84.091	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000019022	-	97	84.848	ENSPKIG00000019945	nanos1	98	84.848	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000019022	-	100	79.447	ENSPMGG00000008267	-	98	80.237	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000019022	-	89	33.878	ENSPEMG00000019116	Nanos1	89	36.777	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000019022	-	95	34.944	ENSPCIG00000028425	NANOS1	94	35.766	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000019022	-	93	66.520	ENSPFOG00000020008	-	99	66.520	Poecilia_formosa
ENSACIG00000019022	-	100	90.254	ENSPLAG00000005060	-	100	90.254	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000019022	-	98	64.854	ENSPLAG00000022525	-	98	64.854	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000019022	-	78	31.351	ENSPMEG00000014135	nanos3	83	31.351	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000019022	-	100	90.254	ENSPMEG00000000521	-	100	90.254	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000019022	-	93	66.520	ENSPMEG00000015568	-	96	66.520	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000019022	-	93	66.079	ENSPREG00000007213	NANOS1	99	66.814	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000019022	-	100	90.254	ENSPREG00000006901	-	100	90.254	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000019022	-	78	31.795	ENSPREG00000000425	nanos3	83	32.821	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000019022	-	50	43.511	ENSPCOG00000009467	NANOS1	89	32.584	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000019022	-	50	44.697	ENSPVAG00000003146	NANOS1	84	35.178	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000019022	-	96	69.130	ENSPNYG00000018230	-	97	69.130	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000019022	-	94	79.821	ENSPNYG00000001325	-	99	79.821	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000019022	-	98	68.220	ENSPNAG00000004874	nanos1	99	68.880	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000019022	-	89	35.000	ENSRNOG00000025060	Nanos1	89	36.250	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000019022	-	96	72.458	ENSSFOG00015009241	-	97	74.153	Scleropages_formosus
ENSACIG00000019022	-	96	68.996	ENSSDUG00000003196	-	100	68.996	Seriola_dumerili
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ENSACIG00000019022	-	94	68.444	ENSSLDG00000009413	-	96	68.444	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000019022	-	96	35.714	ENSSPUG00000002169	NANOS1	87	35.600	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000019022	-	96	67.686	ENSSPAG00000014569	NANOS1	100	67.686	Stegastes_partitus
ENSACIG00000019022	-	100	97.458	ENSSPAG00000011053	-	100	97.458	Stegastes_partitus
ENSACIG00000019022	-	97	95.197	ENSTRUG00000021804	-	98	95.197	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000019022	-	96	64.317	ENSTRUG00000019839	-	100	64.317	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000019022	-	59	90.909	ENSTNIG00000010543	-	100	90.909	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000019022	-	78	34.197	ENSXCOG00000014426	nanos3	83	34.409	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000019022	-	100	89.407	ENSXCOG00000015035	-	100	89.407	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000019022	-	78	33.161	ENSXMAG00000023751	nanos3	83	34.409	Xiphophorus_maculatus
ENSACIG00000019022	-	100	89.407	ENSXMAG00000024788	-	100	89.407	Xiphophorus_maculatus
ENSACIG00000019022	-	96	66.957	ENSXMAG00000019985	NANOS1	100	66.957	Xiphophorus_maculatus