EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000019049 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rab1ab
Alias: fb53a02|rab1a|si:zc101n13.3|wu:fb53a02
Full Name: RAB1A%2C member RAS oncogene family b
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6657 bases
Position: chrCCOE01000371.1:208644-215300
Accession: ZDB-GENE-030616-564
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000025060	MMR_HSR1	PF01926.23	1e-05	1	1
ENSACIP00000025111	MMR_HSR1	PF01926.23	1.7e-05	1	1
ENSACIP00000024917	MMR_HSR1	PF01926.23	1.8e-05	1	1
ENSACIP00000025033	MMR_HSR1	PF01926.23	1.9e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000025686	-	630	-	ENSACIP00000025033	209 (aa)	-	-
ENSACIT00000025568	-	624	-	ENSACIP00000024917	207 (aa)	-	-
ENSACIT00000025769	-	447	-	ENSACIP00000025111	148 (aa)	-	-
ENSACIT00000025694	-	534	-	ENSACIP00000025041	177 (aa)	-	-
ENSACIT00000025713	-	615	-	ENSACIP00000025060	204 (aa)	-	-
ENSACIT00000025574	-	528	-	ENSACIP00000024923	175 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000019049	rab1ab	93	44.604	ENSACIG00000003102	rab42a	79	43.605
ENSACIG00000019049	rab1ab	98	44.221	ENSACIG00000019251	rab5aa	91	45.128
ENSACIG00000019049	rab1ab	79	30.081	ENSACIG00000016782	-	68	30.081
ENSACIG00000019049	rab1ab	87	37.594	ENSACIG00000007739	rab9b	82	39.521
ENSACIG00000019049	rab1ab	78	31.933	ENSACIG00000018839	-	59	31.405
ENSACIG00000019049	rab1ab	79	30.081	ENSACIG00000022896	arf3b	62	30.081
ENSACIG00000019049	rab1ab	93	30.070	ENSACIG00000009139	dnajc27	52	30.070
ENSACIG00000019049	rab1ab	85	51.587	ENSACIG00000009306	RAB15	77	48.765
ENSACIG00000019049	rab1ab	79	33.333	ENSACIG00000009110	arl4aa	59	33.333
ENSACIG00000019049	rab1ab	80	31.667	ENSACIG00000008614	arl8ba	62	31.667
ENSACIG00000019049	rab1ab	90	51.880	ENSACIG00000019631	rab11bb	74	52.113
ENSACIG00000019049	rab1ab	98	35.323	ENSACIG00000013119	-	87	35.610
ENSACIG00000019049	rab1ab	85	65.079	ENSACIG00000003157	-	82	62.893
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	45.455	ENSACIG00000017403	rab11al	98	45.972
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	50.000	ENSACIG00000008584	rab13	97	50.000
ENSACIG00000019049	rab1ab	79	45.763	ENSACIG00000008620	rab34a	65	39.865
ENSACIG00000019049	rab1ab	91	31.183	ENSACIG00000020496	rab23	98	31.343
ENSACIG00000019049	rab1ab	80	33.613	ENSACIG00000000868	arl8a	61	33.898
ENSACIG00000019049	rab1ab	89	39.286	ENSACIG00000022208	-	95	37.755
ENSACIG00000019049	rab1ab	88	40.000	ENSACIG00000014094	rab6bb	75	41.176
ENSACIG00000019049	rab1ab	88	32.105	ENSACIG00000018406	rasl11a	72	32.258
ENSACIG00000019049	rab1ab	78	31.356	ENSACIG00000000949	-	66	30.597
ENSACIG00000019049	rab1ab	98	39.698	ENSACIG00000014012	rab22a	97	40.513
ENSACIG00000019049	rab1ab	79	35.833	ENSACIG00000013359	arl4d	60	35.246
ENSACIG00000019049	rab1ab	98	38.693	ENSACIG00000014605	rab6a	93	38.693
ENSACIG00000019049	rab1ab	57	30.400	ENSACIG00000010764	rasl10a	64	31.008
ENSACIG00000019049	rab1ab	89	48.120	ENSACIG00000000154	RAB39B	90	43.229
ENSACIG00000019049	rab1ab	97	35.468	ENSACIG00000006949	RAB17	86	35.678
ENSACIG00000019049	rab1ab	82	35.119	ENSACIG00000017824	rras	83	35.976
ENSACIG00000019049	rab1ab	94	38.298	ENSACIG00000007154	rab6ba	76	40.994
ENSACIG00000019049	rab1ab	98	38.000	ENSACIG00000009617	rab18a	94	38.776
ENSACIG00000019049	rab1ab	89	87.121	ENSACIG00000009006	zgc:171927	82	81.006
ENSACIG00000019049	rab1ab	78	31.356	ENSACIG00000000312	arl4cb	68	31.579
ENSACIG00000019049	rab1ab	81	36.527	ENSACIG00000000100	kras	53	38.650
ENSACIG00000019049	rab1ab	78	32.773	ENSACIG00000000612	arl2	61	32.231
ENSACIG00000019049	rab1ab	86	34.254	ENSACIG00000000699	hrasb	93	36.723
ENSACIG00000019049	rab1ab	97	45.729	ENSACIG00000008102	rab18b	93	46.667
ENSACIG00000019049	rab1ab	80	41.071	ENSACIG00000022381	-	81	39.286
ENSACIG00000019049	rab1ab	98	37.313	ENSACIG00000023222	-	84	38.071
ENSACIG00000019049	rab1ab	81	39.516	ENSACIG00000018043	rab9a	79	39.623
ENSACIG00000019049	rab1ab	81	37.903	ENSACIG00000006558	-	82	37.576
ENSACIG00000019049	rab1ab	80	41.071	ENSACIG00000013630	RAB7A	81	39.286
ENSACIG00000019049	rab1ab	82	31.792	ENSACIG00000009071	rheb	94	31.792
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	90.099	ENSACIG00000014625	-	100	90.244
ENSACIG00000019049	rab1ab	80	47.500	ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	75	43.114
ENSACIG00000019049	rab1ab	96	41.176	ENSACIG00000022520	rab33a	91	41.176
ENSACIG00000019049	rab1ab	79	30.081	ENSACIG00000012912	arf2b	51	30.328
ENSACIG00000019049	rab1ab	78	30.579	ENSACIG00000012192	-	63	30.081
ENSACIG00000019049	rab1ab	81	39.516	ENSACIG00000011024	si:dkey-13a21.4	79	37.654
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	40.865	ENSACIG00000019803	rab25a	98	40.094
ENSACIG00000019049	rab1ab	90	52.632	ENSACIG00000024374	rab11ba	68	51.515
ENSACIG00000019049	rab1ab	90	51.880	ENSACIG00000024376	-	79	50.581
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	47.115	ENSACIG00000003092	rab11a	97	46.411
ENSACIG00000019049	rab1ab	97	38.500	ENSACIG00000010914	RAB41	92	38.500
ENSACIG00000019049	rab1ab	85	33.835	ENSACIG00000014610	zgc:110286	69	33.835
ENSACIG00000019049	rab1ab	80	30.252	ENSACIG00000013244	arl14	57	30.252
ENSACIG00000019049	rab1ab	97	35.961	ENSACIG00000000642	rab36	73	36.139
ENSACIG00000019049	rab1ab	86	33.594	ENSACIG00000015128	si:ch73-116o1.2	67	35.000
ENSACIG00000019049	rab1ab	89	48.120	ENSACIG00000023837	-	77	47.273
ENSACIG00000019049	rab1ab	85	57.143	ENSACIG00000020616	rab12	70	50.000
ENSACIG00000019049	rab1ab	80	38.136	ENSACIG00000000670	rabl2	71	35.758
ENSACIG00000019049	rab1ab	85	55.556	ENSACIG00000010619	rab15	78	49.398
ENSACIG00000019049	rab1ab	88	46.923	ENSACIG00000010896	rab5c	90	44.388
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	43.069	ENSACIG00000017414	rab25b	95	43.939
ENSACIG00000019049	rab1ab	79	30.508	ENSACIG00000016407	arl3l2	61	30.508
ENSACIG00000019049	rab1ab	91	46.324	ENSACIG00000021855	rab33ba	74	44.382
ENSACIG00000019049	rab1ab	91	30.216	ENSACIG00000024420	-	68	30.216
ENSACIG00000019049	rab1ab	78	30.769	ENSACIG00000023231	arl11	64	30.769
ENSACIG00000019049	rab1ab	79	41.525	ENSACIG00000004859	rab34b	71	33.526
ENSACIG00000019049	rab1ab	88	50.000	ENSACIG00000021459	zgc:101559	80	46.448
ENSACIG00000019049	rab1ab	80	31.667	ENSACIG00000009595	arl8bb	62	31.667

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.604	ENSG00000174903	RAB1B	99	91.000	Homo_sapiens
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	90.594	ENSAPOG00000012767	rab1ba	99	92.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	97.030	ENSAPOG00000007746	rab1ab	99	98.500	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.604	ENSAMEG00000017135	RAB1B	99	91.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	97.030	ENSAOCG00000006385	rab1ab	99	98.500	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	90.594	ENSAOCG00000003965	rab1ba	100	92.462	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	90.594	ENSAPEG00000012105	rab1ba	99	92.000	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	97.030	ENSAPEG00000001358	rab1ab	99	98.500	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	91.089	ENSATEG00000015844	-	99	92.537	Anabas_testudineus
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	90.594	ENSATEG00000002479	rab1ba	99	92.000	Anabas_testudineus
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	96.040	ENSATEG00000008052	rab1ab	99	97.500	Anabas_testudineus
ENSACIG00000019049	rab1ab	93	94.891	ENSACAG00000009125	RAB1B	94	98.496	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.604	ENSANAG00000022585	RAB1B	99	91.000	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	90.594	ENSACLG00000013668	rab1ba	99	92.000	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	97.030	ENSACLG00000007644	rab1ab	99	99.497	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	90.686	ENSAMXG00000003547	rab1ba	91	90.686	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	93.069	ENSAMXG00000032564	rab1ab	99	94.500	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000019049	rab1ab	98	89.447	ENSBTAG00000046485	RAB1B	68	89.109	Bos_taurus
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.109	ENSCJAG00000047933	-	99	90.000	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.604	ENSCJAG00000001599	-	99	91.000	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.604	ENSCAFG00000012855	RAB1B	98	91.000	Canis_familiaris
ENSACIG00000019049	rab1ab	100	88.725	ENSCAFG00020015406	-	99	91.000	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.604	ENSCHIG00000015549	RAB1B	99	91.000	Capra_hircus
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.604	ENSTSYG00000025638	RAB1B	97	91.500	Carlito_syrichta
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.604	ENSCAPG00000015495	RAB1B	98	91.919	Cavia_aperea
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.604	ENSCPOG00000014868	RAB1B	99	91.000	Cavia_porcellus
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.604	ENSCCAG00000021540	RAB1B	99	91.000	Cebus_capucinus
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.604	ENSCATG00000002342	RAB1B	99	91.000	Cercocebus_atys
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.604	ENSCLAG00000015776	RAB1B	99	91.000	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000019049	rab1ab	89	98.485	ENSCSAG00000014775	-	94	99.259	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.604	ENSCSAG00000008145	RAB1B	92	88.889	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	88.614	ENSCPBG00000022446	RAB1B	99	90.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000019049	rab1ab	89	98.485	ENSCING00000023081	-	98	86.500	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000019049	rab1ab	89	98.485	ENSCSAVG00000009147	-	98	86.500	Ciona_savignyi
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.604	ENSCANG00000042299	RAB1B	99	91.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.604	ENSCGRG00001014956	Rab1b	99	91.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.604	ENSCGRG00000015564	Rab1b	99	91.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.109	ENSCSEG00000018732	rab1ba	99	90.955	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000019049	rab1ab	100	90.196	ENSCSEG00000020977	-	97	92.965	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000019049	rab1ab	100	94.608	ENSCVAG00000022585	-	100	95.122	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.604	ENSCVAG00000022799	-	99	91.000	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	90.594	ENSDARG00000052263	rab1aa	99	92.000	Danio_rerio
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	91.626	ENSDARG00000029663	rab1ab	99	93.035	Danio_rerio
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	90.099	ENSDARG00000058044	rab1ba	100	92.424	Danio_rerio
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ENSACIG00000019049	rab1ab	99	91.089	ENSSLDG00000011757	-	100	92.965	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	96.535	ENSSLDG00000018942	rab1ab	99	98.000	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.109	ENSSPUG00000007945	RAB1B	99	90.500	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000019049	rab1ab	97	94.924	ENSSPAG00000015564	rab1ab	86	96.410	Stegastes_partitus
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	90.594	ENSSPAG00000022676	rab1ba	99	92.000	Stegastes_partitus
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.604	ENSSSCG00000012954	RAB1B	95	96.571	Sus_scrofa
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	96.535	ENSTRUG00000023164	rab1ab	99	98.500	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	90.594	ENSTRUG00000004287	rab1ba	99	92.000	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000019049	rab1ab	89	98.485	ENSTNIG00000004511	-	95	97.386	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000019049	rab1ab	83	90.244	ENSTBEG00000004630	RAB1B	94	90.400	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.604	ENSTTRG00000014408	RAB1B	99	91.000	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.604	ENSUAMG00000021114	RAB1B	99	91.000	Ursus_americanus
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.604	ENSUMAG00000011180	RAB1B	91	89.268	Ursus_maritimus
ENSACIG00000019049	rab1ab	97	91.500	ENSVVUG00000027023	-	91	91.500	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	93.069	ENSXETG00000014011	rab1a	99	94.500	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	95.545	ENSXCOG00000013842	rab1ab	99	97.000	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000019049	rab1ab	89	97.727	ENSXCOG00000010770	-	75	90.476	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	96.040	ENSXMAG00000005757	rab1ab	99	97.500	Xiphophorus_maculatus
ENSACIG00000019049	rab1ab	99	89.109	ENSXMAG00000022299	rab1ba	99	90.500	Xiphophorus_maculatus