EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000019050 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3790 bases
Position: chrCCOE01000148.1:1226163-1229952
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000024528	MMR_HSR1	PF01926.23	2.3e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000025173	-	540	-	ENSACIP00000024528	179 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000019050	-	87	47.436	ENSACIG00000023231	arl11	89	47.436
ENSACIG00000019050	-	87	50.943	ENSACIG00000003228	arl5a	91	50.943
ENSACIG00000019050	-	88	32.335	ENSACIG00000017582	arl13b	69	32.335
ENSACIG00000019050	-	94	34.118	ENSACIG00000008614	arl8ba	91	34.118
ENSACIG00000019050	-	94	34.706	ENSACIG00000009595	arl8bb	91	34.706
ENSACIG00000019050	-	87	47.239	ENSACIG00000000949	-	81	47.239
ENSACIG00000019050	-	92	41.667	ENSACIG00000000945	-	92	41.667
ENSACIG00000019050	-	100	65.556	ENSACIG00000014610	zgc:110286	100	65.556
ENSACIG00000019050	-	96	32.240	ENSACIG00000024513	-	90	32.240
ENSACIG00000019050	-	89	42.945	ENSACIG00000022050	ARL6	69	42.945
ENSACIG00000019050	-	97	46.552	ENSACIG00000008975	arl5c	97	46.552
ENSACIG00000019050	-	87	43.827	ENSACIG00000013359	arl4d	81	43.827
ENSACIG00000019050	-	98	43.646	ENSACIG00000016407	arl3l2	97	43.646
ENSACIG00000019050	-	88	43.373	ENSACIG00000018839	-	82	43.373
ENSACIG00000019050	-	93	48.503	ENSACIG00000000612	arl2	90	48.503
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSACIG00000022896	arf3b	99	88.889
ENSACIG00000019050	-	96	35.484	ENSACIG00000009740	arfrp1	91	35.484
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSACIG00000016782	-	98	90.116
ENSACIG00000019050	-	84	46.154	ENSACIG00000013244	arl14	76	46.154
ENSACIG00000019050	-	97	44.828	ENSACIG00000016662	arl8	97	44.828
ENSACIG00000019050	-	99	80.899	ENSACIG00000000467	-	99	80.899
ENSACIG00000019050	-	94	31.765	ENSACIG00000000868	arl8a	91	31.765
ENSACIG00000019050	-	96	46.629	ENSACIG00000000312	arl4cb	91	46.629
ENSACIG00000019050	-	99	90.503	ENSACIG00000012192	-	99	90.503
ENSACIG00000019050	-	100	82.778	ENSACIG00000005843	arf5	100	82.778
ENSACIG00000019050	-	93	56.287	ENSACIG00000007953	arl1	94	56.287
ENSACIG00000019050	-	88	47.273	ENSACIG00000024420	-	84	47.273
ENSACIG00000019050	-	96	46.154	ENSACIG00000009110	arl4aa	91	46.154
ENSACIG00000019050	-	89	47.170	ENSACIG00000019225	-	91	47.170
ENSACIG00000019050	-	100	90.000	ENSACIG00000012912	arf2b	81	90.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSG00000134287	ARF3	100	91.176	Homo_sapiens
ENSACIG00000019050	-	100	90.556	ENSG00000143761	ARF1	99	90.556	Homo_sapiens
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSAPOG00000014921	-	99	89.143	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019050	-	97	90.857	ENSAPOG00000015419	arf3b	100	90.857	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019050	-	100	93.296	ENSAPOG00000014968	-	100	93.296	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019050	-	99	89.944	ENSAPOG00000023828	arf2a	99	89.944	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019050	-	100	90.000	ENSAPOG00000021053	-	99	90.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSAMEG00000007042	-	99	88.889	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000019050	-	100	90.556	ENSAMEG00000016301	ARF1	99	90.556	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000019050	-	100	89.444	ENSAMEG00000004184	-	99	89.444	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSAOCG00000013349	-	99	88.889	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSAOCG00000001809	arf2b	99	88.889	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019050	-	99	88.827	ENSAOCG00000007571	arf3b	97	88.827	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSAPEG00000003390	arf2b	99	88.889	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSAPEG00000016302	arf3b	99	88.889	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSAPEG00000002821	-	99	88.889	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSATEG00000022222	-	99	88.889	Anabas_testudineus
ENSACIG00000019050	-	100	90.000	ENSATEG00000009653	arf2b	99	90.000	Anabas_testudineus
ENSACIG00000019050	-	99	96.067	ENSATEG00000005611	-	99	96.067	Anabas_testudineus
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSATEG00000001951	arf3b	99	88.889	Anabas_testudineus
ENSACIG00000019050	-	100	90.556	ENSACAG00000006923	ARF1	99	90.556	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSACAG00000008240	-	99	88.889	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000019050	-	95	78.824	ENSANAG00000021775	-	77	78.824	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000019050	-	98	92.614	ENSANAG00000036021	-	82	92.614	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSANAG00000025111	-	99	88.889	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000019050	-	96	80.117	ENSANAG00000023642	-	89	79.268	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000019050	-	99	97.191	ENSACLG00000017387	-	99	97.191	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSACLG00000024971	arf3b	99	88.889	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019050	-	100	90.000	ENSACLG00000022124	arf2b	99	90.000	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSACLG00000006072	-	99	88.889	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019050	-	100	89.444	ENSAMXG00000037485	arf2b	99	89.444	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSAMXG00000016434	arf3a	79	88.889	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000019050	-	99	92.179	ENSAMXG00000035742	arf2a	99	92.179	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000019050	-	100	89.444	ENSBTAG00000006785	ARF2	99	89.444	Bos_taurus
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSBTAG00000051755	ARF3	99	88.889	Bos_taurus
ENSACIG00000019050	-	100	90.556	ENSBTAG00000007725	ARF1	99	90.556	Bos_taurus
ENSACIG00000019050	-	100	89.444	WBGene00000182	arf-1.2	99	89.444	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSCJAG00000020800	-	99	88.889	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000019050	-	98	82.955	ENSCJAG00000041786	-	100	82.955	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000019050	-	100	89.444	ENSCAFG00000029422	-	99	89.444	Canis_familiaris
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSCAFG00020013389	-	99	88.889	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000019050	-	100	89.444	ENSCAFG00020026857	-	99	89.444	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000019050	-	100	90.556	ENSCAFG00020005724	ARF1	99	90.556	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSCHIG00000019252	-	99	88.889	Capra_hircus
ENSACIG00000019050	-	100	90.556	ENSCHIG00000010924	ARF1	99	90.556	Capra_hircus
ENSACIG00000019050	-	100	89.444	ENSCHIG00000027099	-	99	89.444	Capra_hircus
ENSACIG00000019050	-	100	90.556	ENSTSYG00000027538	ARF1	99	90.556	Carlito_syrichta
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSTSYG00000011564	-	99	88.889	Carlito_syrichta
ENSACIG00000019050	-	100	90.556	ENSCAPG00000002502	ARF1	99	90.556	Cavia_aperea
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSCPOG00000040787	-	99	88.889	Cavia_porcellus
ENSACIG00000019050	-	100	90.556	ENSCPOG00000039117	ARF1	99	90.556	Cavia_porcellus
ENSACIG00000019050	-	100	90.556	ENSCCAG00000025067	-	82	90.556	Cebus_capucinus
ENSACIG00000019050	-	100	90.556	ENSCCAG00000023374	-	99	90.556	Cebus_capucinus
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSCCAG00000037739	-	99	88.889	Cebus_capucinus
ENSACIG00000019050	-	100	90.556	ENSCATG00000034162	-	99	90.556	Cercocebus_atys
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSCATG00000033929	-	99	88.889	Cercocebus_atys
ENSACIG00000019050	-	100	90.556	ENSCLAG00000000520	ARF1	99	90.556	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSCLAG00000003101	-	99	88.889	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000019050	-	100	87.778	ENSCLAG00000007475	-	99	87.778	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSCSAG00000006224	-	99	88.889	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000019050	-	100	90.556	ENSCSAG00000016460	ARF1	99	90.556	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSCPBG00000019994	-	99	88.889	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000019050	-	100	90.556	ENSCPBG00000001732	ARF1	99	90.556	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000019050	-	100	89.444	ENSCPBG00000018544	-	99	89.444	Chrysemys_picta_bellii
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ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSCANG00000031504	-	99	88.889	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000019050	-	100	90.556	ENSCANG00000035715	-	99	90.556	Colobus_angolensis_palliatus
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ENSACIG00000019050	-	100	90.556	ENSCGRG00001013922	Arf1	99	90.556	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSCGRG00001004437	Arf3	99	88.889	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000019050	-	100	88.889	ENSCGRG00000006593	Arf3	99	88.889	Cricetulus_griseus_crigri
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ENSACIG00000019050	-	99	97.191	ENSCVAG00000018314	-	99	97.191	Cyprinodon_variegatus
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