EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000019102 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4624 bases
Position: chrCCOE01000243.1:532951-537574
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000024610	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-29	1	6
ENSACIP00000024610	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-29	2	6
ENSACIP00000024610	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-29	3	6
ENSACIP00000024610	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-29	4	6
ENSACIP00000024610	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-29	5	6
ENSACIP00000024610	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-29	6	6
ENSACIP00000024610	zf-met	PF12874.7	2.9e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000025256	-	1686	-	ENSACIP00000024610	561 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000019102	-	53	45.989	ENSACIG00000007882	-	83	45.989
ENSACIG00000019102	-	60	50.162	ENSACIG00000024444	-	83	50.162
ENSACIG00000019102	-	63	40.741	ENSACIG00000001369	-	78	40.741
ENSACIG00000019102	-	60	49.282	ENSACIG00000018059	-	79	49.282
ENSACIG00000019102	-	55	52.535	ENSACIG00000012084	-	95	52.535
ENSACIG00000019102	-	60	50.000	ENSACIG00000011515	-	97	50.000
ENSACIG00000019102	-	60	45.161	ENSACIG00000015835	-	83	45.161
ENSACIG00000019102	-	51	41.216	ENSACIG00000008886	znf1164	82	41.216
ENSACIG00000019102	-	50	55.102	ENSACIG00000009780	-	93	55.102
ENSACIG00000019102	-	56	55.602	ENSACIG00000022293	-	96	55.602
ENSACIG00000019102	-	54	63.793	ENSACIG00000016932	-	73	63.793
ENSACIG00000019102	-	55	45.178	ENSACIG00000010739	-	79	45.178
ENSACIG00000019102	-	64	50.160	ENSACIG00000008448	-	96	50.160
ENSACIG00000019102	-	53	38.060	ENSACIG00000018641	snai2	75	38.060
ENSACIG00000019102	-	55	41.667	ENSACIG00000000406	prdm5	86	41.667
ENSACIG00000019102	-	68	60.759	ENSACIG00000017050	-	99	60.759
ENSACIG00000019102	-	53	51.316	ENSACIG00000004641	-	62	51.316
ENSACIG00000019102	-	53	42.534	ENSACIG00000016117	-	84	42.291
ENSACIG00000019102	-	59	39.252	ENSACIG00000006826	-	90	39.252
ENSACIG00000019102	-	53	58.454	ENSACIG00000000286	-	93	53.383
ENSACIG00000019102	-	60	44.538	ENSACIG00000011153	-	96	48.889
ENSACIG00000019102	-	53	54.237	ENSACIG00000013958	-	57	54.237
ENSACIG00000019102	-	52	34.591	ENSACIG00000020982	znf710b	50	33.906
ENSACIG00000019102	-	61	51.462	ENSACIG00000006755	-	90	51.462
ENSACIG00000019102	-	57	49.811	ENSACIG00000019791	-	97	50.781
ENSACIG00000019102	-	54	37.600	ENSACIG00000023049	znf646	99	37.553
ENSACIG00000019102	-	56	57.143	ENSACIG00000003556	-	85	57.143
ENSACIG00000019102	-	68	64.783	ENSACIG00000004666	-	99	59.890
ENSACIG00000019102	-	59	50.204	ENSACIG00000023212	-	85	50.204
ENSACIG00000019102	-	55	40.000	ENSACIG00000023313	-	94	40.000
ENSACIG00000019102	-	64	43.377	ENSACIG00000023162	-	81	43.377
ENSACIG00000019102	-	60	54.185	ENSACIG00000004745	-	96	48.592
ENSACIG00000019102	-	74	38.333	ENSACIG00000017683	-	78	41.489
ENSACIG00000019102	-	50	54.018	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	95	54.018
ENSACIG00000019102	-	61	53.778	ENSACIG00000011541	-	95	53.778
ENSACIG00000019102	-	64	55.224	ENSACIG00000018022	-	78	53.901
ENSACIG00000019102	-	59	48.810	ENSACIG00000001860	-	82	48.810
ENSACIG00000019102	-	63	44.444	ENSACIG00000013750	-	94	38.603
ENSACIG00000019102	-	60	64.035	ENSACIG00000004041	-	99	64.035
ENSACIG00000019102	-	60	49.811	ENSACIG00000019710	-	89	54.464
ENSACIG00000019102	-	50	40.476	ENSACIG00000017892	-	91	40.476
ENSACIG00000019102	-	51	47.191	ENSACIG00000017166	-	59	50.000
ENSACIG00000019102	-	54	48.889	ENSACIG00000023794	-	80	48.889
ENSACIG00000019102	-	63	50.799	ENSACIG00000006172	-	98	53.070
ENSACIG00000019102	-	55	42.478	ENSACIG00000014123	znf236	64	42.478
ENSACIG00000019102	-	59	48.958	ENSACIG00000009717	-	93	48.958
ENSACIG00000019102	-	61	49.112	ENSACIG00000017013	-	81	49.112
ENSACIG00000019102	-	53	37.500	ENSACIG00000006586	-	72	37.500
ENSACIG00000019102	-	55	48.214	ENSACIG00000019804	-	82	48.214
ENSACIG00000019102	-	60	51.773	ENSACIG00000022645	-	70	51.773
ENSACIG00000019102	-	52	36.889	ENSACIG00000013508	ZNF384	58	36.889
ENSACIG00000019102	-	53	47.312	ENSACIG00000022330	-	82	47.312
ENSACIG00000019102	-	60	48.961	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	97	50.588
ENSACIG00000019102	-	50	33.333	ENSACIG00000011516	-	85	33.333
ENSACIG00000019102	-	54	52.632	ENSACIG00000019447	-	72	52.632
ENSACIG00000019102	-	62	47.674	ENSACIG00000003720	-	100	47.674
ENSACIG00000019102	-	63	53.731	ENSACIG00000010647	-	99	54.198
ENSACIG00000019102	-	51	40.000	ENSACIG00000014282	znf526	84	38.679
ENSACIG00000019102	-	51	39.322	ENSACIG00000003515	-	98	39.322
ENSACIG00000019102	-	59	47.490	ENSACIG00000004626	-	95	47.490
ENSACIG00000019102	-	64	54.167	ENSACIG00000016182	-	94	54.167
ENSACIG00000019102	-	67	53.913	ENSACIG00000013470	-	96	51.095
ENSACIG00000019102	-	71	47.556	ENSACIG00000022738	-	99	49.618
ENSACIG00000019102	-	64	56.250	ENSACIG00000017647	-	94	61.441
ENSACIG00000019102	-	64	53.846	ENSACIG00000010966	-	69	57.143
ENSACIG00000019102	-	60	53.378	ENSACIG00000007464	-	80	50.000
ENSACIG00000019102	-	50	42.857	ENSACIG00000009128	-	83	42.857
ENSACIG00000019102	-	59	53.448	ENSACIG00000018952	-	80	53.448
ENSACIG00000019102	-	55	55.357	ENSACIG00000000311	-	81	55.357
ENSACIG00000019102	-	64	53.589	ENSACIG00000013604	-	99	53.589
ENSACIG00000019102	-	55	62.687	ENSACIG00000003754	-	91	62.687
ENSACIG00000019102	-	55	43.465	ENSACIG00000006806	-	80	43.465
ENSACIG00000019102	-	51	53.409	ENSACIG00000009755	-	81	53.409
ENSACIG00000019102	-	64	50.299	ENSACIG00000022625	-	96	51.266
ENSACIG00000019102	-	56	45.000	ENSACIG00000019815	-	98	45.000
ENSACIG00000019102	-	60	37.126	ENSACIG00000016133	-	77	37.126

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000019102	-	52	56.818	ENSAPOG00000004878	-	83	56.818	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019102	-	60	52.518	ENSAPOG00000024332	-	89	48.254	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019102	-	58	39.940	ENSAPOG00000023479	-	86	39.940	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019102	-	63	43.750	ENSAPOG00000014714	-	98	45.714	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019102	-	60	49.112	ENSAPOG00000018127	-	72	58.730	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019102	-	51	52.514	ENSAPOG00000020343	-	77	52.514	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019102	-	60	53.750	ENSAPOG00000007528	-	64	53.750	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019102	-	56	60.526	ENSAPOG00000022086	-	98	61.600	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019102	-	51	63.187	ENSAPOG00000013212	-	100	63.187	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019102	-	54	56.818	ENSAPOG00000005681	-	90	56.818	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019102	-	64	44.068	ENSAPOG00000005986	-	97	53.968	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019102	-	60	55.828	ENSAPOG00000000503	-	99	49.102	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019102	-	66	48.534	ENSAPOG00000008053	-	73	48.534	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019102	-	60	60.417	ENSAPOG00000014378	-	60	60.417	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019102	-	56	53.165	ENSAPOG00000022234	-	97	53.165	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019102	-	64	57.322	ENSAPOG00000013125	-	83	57.322	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019102	-	61	53.165	ENSAPOG00000001742	-	68	53.165	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019102	-	60	58.659	ENSAPOG00000001725	-	98	54.694	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019102	-	50	57.025	ENSAPOG00000021690	-	92	57.025	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019102	-	60	49.580	ENSAPOG00000007983	-	55	49.580	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019102	-	64	47.345	ENSAPOG00000002691	-	73	47.345	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019102	-	60	46.847	ENSAPOG00000020864	-	77	46.847	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019102	-	62	45.869	ENSAOCG00000009970	-	76	45.869	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019102	-	53	54.582	ENSAOCG00000016737	-	100	54.582	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019102	-	60	52.252	ENSAOCG00000011204	-	69	52.252	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019102	-	63	54.132	ENSAOCG00000018307	-	99	54.132	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019102	-	77	54.772	ENSAOCG00000015586	-	97	54.772	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019102	-	52	52.101	ENSAOCG00000016088	-	82	52.101	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019102	-	63	48.963	ENSAOCG00000013345	-	58	48.963	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019102	-	60	49.367	ENSAOCG00000022375	-	97	50.262	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019102	-	63	48.963	ENSAOCG00000024767	-	58	48.963	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019102	-	59	48.889	ENSAOCG00000006793	-	92	48.889	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019102	-	63	57.485	ENSAOCG00000016287	-	88	56.485	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019102	-	64	62.222	ENSAOCG00000014651	-	77	62.222	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019102	-	64	48.011	ENSAOCG00000002585	-	87	47.619	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019102	-	60	55.340	ENSAOCG00000020830	-	93	54.661	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019102	-	55	53.306	ENSAOCG00000024281	-	98	53.306	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019102	-	52	54.772	ENSAOCG00000018543	-	94	54.772	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019102	-	52	39.932	ENSAPEG00000009533	-	76	39.932	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019102	-	60	53.846	ENSAPEG00000015593	-	94	53.846	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019102	-	60	53.814	ENSAPEG00000005462	-	96	50.000	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019102	-	52	54.065	ENSAPEG00000010438	-	100	55.310	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019102	-	53	52.615	ENSAPEG00000003892	-	76	52.615	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019102	-	84	53.247	ENSAPEG00000009835	-	98	53.247	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019102	-	59	45.578	ENSAPEG00000016536	-	94	45.578	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019102	-	67	54.545	ENSAPEG00000007389	-	98	53.097	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019102	-	67	54.321	ENSAPEG00000020501	-	85	54.321	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019102	-	60	45.860	ENSAPEG00000017116	-	78	45.860	Amphiprion_percula
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