EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000019524 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 823 bases
Position: chrCCOE01001289.1:89183-90005
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000025201	MMR_HSR1	PF01926.23	1.4e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000025861	-	717	-	ENSACIP00000025201	238 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000019524	-	83	48.990	ENSACIG00000000893	-	80	48.990
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ENSACIG00000019524	-	84	47.317	ENSACIG00000006478	-	76	47.317
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ENSACIG00000019524	-	84	45.813	ENSACIG00000020244	-	85	45.813
ENSACIG00000019524	-	85	47.059	ENSACIG00000012707	-	78	47.059
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ENSACIG00000019524	-	66	45.000	ENSACIG00000022374	-	82	45.000
ENSACIG00000019524	-	84	47.739	ENSACIG00000022377	-	73	47.739
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ENSACIG00000019524	-	69	38.415	ENSACIG00000001465	-	96	38.415
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ENSACIG00000019524	-	89	44.131	ENSACIG00000008001	-	92	44.131
ENSACIG00000019524	-	80	41.885	ENSACIG00000001596	-	75	41.885
ENSACIG00000019524	-	82	46.154	ENSACIG00000004040	-	77	46.154
ENSACIG00000019524	-	85	47.059	ENSACIG00000020225	-	69	47.059
ENSACIG00000019524	-	95	55.274	ENSACIG00000014655	-	89	55.274
ENSACIG00000019524	-	83	42.929	ENSACIG00000012714	-	66	42.929
ENSACIG00000019524	-	86	45.411	ENSACIG00000006484	-	63	45.411
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ENSACIG00000019524	-	84	46.500	ENSACIG00000001070	-	72	46.500
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ENSACIG00000019524	-	67	43.396	ENSACIG00000000976	-	79	43.396
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ENSACIG00000019524	-	86	44.444	ENSACIG00000003582	-	67	44.231
ENSACIG00000019524	-	74	36.517	ENSACIG00000003050	-	79	36.517
ENSACIG00000019524	-	85	49.029	ENSACIG00000016635	-	77	49.261
ENSACIG00000019524	-	78	48.187	ENSACIG00000005223	-	73	48.187
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ENSACIG00000019524	-	73	42.614	ENSACIG00000000631	-	61	42.614
ENSACIG00000019524	-	77	35.638	ENSACIG00000009811	-	78	35.638
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ENSACIG00000019524	-	78	47.872	ENSACIG00000012204	-	79	47.872
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ENSACIG00000019524	-	84	54.500	ENSACIG00000014634	zgc:113625	81	54.229
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Orthologs

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ENSACIG00000019524	-	85	48.780	ENSAPOG00000008063	-	66	48.780	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019524	-	82	46.667	ENSAPOG00000011509	-	67	46.667	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019524	-	84	47.291	ENSAPOG00000021159	-	66	47.291	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019524	-	85	47.059	ENSAPOG00000007333	-	59	47.059	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019524	-	84	47.739	ENSAPOG00000006488	-	77	47.739	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019524	-	51	50.407	ENSAPOG00000007361	-	69	50.407	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019524	-	87	46.154	ENSAPOG00000006169	-	58	46.154	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019524	-	83	39.394	ENSAPOG00000001315	-	61	39.394	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSACIG00000019524	-	79	47.594	ENSAPOG00000001262	-	90	47.594	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019524	-	97	53.498	ENSAPOG00000008344	zgc:113625	86	53.498	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019524	-	82	44.444	ENSAPOG00000022240	-	57	44.444	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019524	-	83	42.424	ENSAPOG00000020897	-	75	42.424	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019524	-	85	48.529	ENSAPOG00000007322	-	70	48.529	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019524	-	84	48.768	ENSAPOG00000012716	-	68	48.768	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSACIG00000019524	-	83	48.731	ENSAOCG00000001993	-	79	47.805	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019524	-	93	45.045	ENSAOCG00000023255	-	75	45.045	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019524	-	85	47.549	ENSAOCG00000011167	-	68	47.549	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019524	-	85	47.059	ENSAOCG00000011155	-	59	47.059	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019524	-	83	38.384	ENSAOCG00000011794	-	59	38.384	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019524	-	84	48.500	ENSAOCG00000008525	-	58	48.500	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019524	-	87	45.631	ENSAOCG00000008522	-	68	45.631	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019524	-	84	48.500	ENSAOCG00000021905	-	60	48.500	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019524	-	84	42.786	ENSAPEG00000003884	-	64	42.786	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000019524	-	85	46.569	ENSAPEG00000012184	-	59	46.569	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000019524	-	87	67.150	ENSATEG00000020431	zgc:113625	82	67.150	Anabas_testudineus
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