EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000019567 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 633 bases
Position: chrCCOE01000292.1:349341-349973
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000025253	RVT_1	PF00078.27	1.9e-19	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000025914	-	570	-	ENSACIP00000025253	189 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000019567	-	63	39.259	ENSACIG00000008842	-	76	37.037
ENSACIG00000019567	-	83	35.981	ENSACIG00000019349	-	88	36.449
ENSACIG00000019567	-	77	32.692	ENSACIG00000010457	-	81	32.692
ENSACIG00000019567	-	55	40.288	ENSACIG00000011711	-	65	40.288

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000019567	-	50	37.313	ENSAPOG00000023528	-	58	39.865	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019567	-	89	37.736	ENSAOCG00000004576	-	55	37.736	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019567	-	72	36.538	ENSAOCG00000022972	-	91	36.538	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019567	-	89	36.620	ENSAPEG00000024502	-	56	36.620	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019567	-	62	34.839	ENSAPEG00000007794	-	75	34.839	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019567	-	78	36.508	ENSATEG00000002253	-	55	36.508	Anabas_testudineus
ENSACIG00000019567	-	83	43.781	ENSATEG00000014313	-	58	43.781	Anabas_testudineus
ENSACIG00000019567	-	91	35.079	ENSACLG00000021037	-	96	35.079	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	95	36.530	ENSACLG00000004232	-	50	36.530	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	95	36.530	ENSACLG00000013944	-	50	36.530	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	90	40.000	ENSACLG00000003937	-	53	40.000	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	90	40.000	ENSACLG00000009983	-	55	41.429	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	95	37.443	ENSACLG00000026769	-	50	37.443	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	88	42.718	ENSACLG00000015732	-	56	42.718	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	95	36.986	ENSACLG00000025525	-	54	36.986	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	72	36.571	ENSACLG00000019046	-	61	39.362	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	92	35.545	ENSACLG00000013213	-	60	35.545	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	95	36.530	ENSACLG00000024184	-	50	36.530	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	95	36.986	ENSACLG00000020601	-	50	36.986	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	95	51.598	ENSACLG00000001865	-	60	51.598	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	91	36.967	ENSACLG00000000437	-	56	36.967	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	95	36.530	ENSACLG00000008572	-	50	36.530	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	95	34.247	ENSACLG00000022277	-	53	34.247	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	87	38.916	ENSACLG00000022966	-	56	38.916	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	91	36.019	ENSACLG00000011151	-	56	36.019	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	69	34.459	ENSACLG00000015652	-	56	34.459	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	95	35.160	ENSACLG00000024587	-	57	35.160	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	91	36.493	ENSACLG00000013183	-	56	36.493	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	87	41.379	ENSACLG00000012076	-	54	41.379	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	90	39.336	ENSACLG00000005126	-	64	39.336	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	95	36.530	ENSACLG00000010080	-	50	36.530	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	94	39.171	ENSACLG00000002725	-	59	39.171	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	95	52.968	ENSACLG00000024568	-	52	52.968	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	95	36.986	ENSACLG00000017093	-	50	36.986	Astatotilapia_calliptera
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ENSACIG00000019567	-	88	36.893	ENSACLG00000015324	-	53	36.893	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	95	35.616	ENSACLG00000020388	-	60	35.616	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	95	36.986	ENSACLG00000027855	-	50	36.986	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	90	41.429	ENSACLG00000005593	-	55	41.429	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	95	36.986	ENSACLG00000025562	-	50	36.986	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	91	36.493	ENSACLG00000008024	-	56	36.493	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	89	36.058	ENSACLG00000000802	-	63	36.058	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019567	-	58	35.417	ENSACLG00000015452	-	79	35.417	Astatotilapia_calliptera
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ENSACIG00000019567	-	96	53.182	ENSACLG00000002680	-	54	53.182	Astatotilapia_calliptera
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ENSACIG00000019567	-	95	36.530	ENSACLG00000000907	-	57	36.530	Astatotilapia_calliptera
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ENSACIG00000019567	-	94	35.484	ENSAMXG00000038658	-	64	35.484	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000019567	-	95	36.036	ENSAMXG00000032194	-	57	36.036	Astyanax_mexicanus
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ENSACIG00000019567	-	91	36.916	ENSAMXG00000029786	-	54	36.916	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000019567	-	78	38.421	ENSAMXG00000038422	-	50	38.421	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000019567	-	95	35.586	ENSAMXG00000025823	-	55	35.586	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000019567	-	95	35.586	ENSAMXG00000041932	-	52	35.586	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000019567	-	99	30.901	ENSAMXG00000042595	-	55	30.901	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000019567	-	91	35.814	ENSAMXG00000034283	-	61	35.814	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000019567	-	74	50.955	ENSCVAG00000013070	-	57	50.955	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000019567	-	55	51.145	ENSCVAG00000018200	-	85	51.145	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000019567	-	88	31.280	ENSELUG00000009527	-	63	31.280	Esox_lucius
ENSACIG00000019567	-	95	39.450	ENSELUG00000018484	-	50	39.450	Esox_lucius
ENSACIG00000019567	-	95	35.023	ENSHBUG00000010554	-	57	35.023	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000019567	-	71	43.103	ENSHBUG00000023310	-	80	43.103	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000019567	-	83	39.106	ENSHBUG00000020518	-	88	39.106	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000019567	-	95	41.743	ENSHBUG00000008975	-	65	41.743	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000019567	-	90	41.429	ENSHBUG00000010402	-	62	41.429	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000019567	-	95	36.364	ENSHBUG00000017512	-	54	36.364	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000019567	-	52	36.975	ENSIPUG00000017061	-	53	36.975	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000019567	-	95	32.420	ENSIPUG00000002934	-	53	32.420	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000019567	-	83	35.567	ENSKMAG00000013085	-	73	35.567	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000019567	-	95	37.443	ENSKMAG00000005036	-	71	37.443	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000019567	-	95	39.726	ENSLBEG00000018075	-	53	39.726	Labrus_bergylta
ENSACIG00000019567	-	95	39.269	ENSLBEG00000019432	-	64	39.269	Labrus_bergylta
ENSACIG00000019567	-	95	39.726	ENSLBEG00000010839	-	53	39.726	Labrus_bergylta
ENSACIG00000019567	-	95	39.726	ENSLBEG00000011919	-	53	39.726	Labrus_bergylta
ENSACIG00000019567	-	95	39.726	ENSLBEG00000010478	-	53	39.726	Labrus_bergylta
ENSACIG00000019567	-	95	39.726	ENSLBEG00000018787	-	60	39.726	Labrus_bergylta
ENSACIG00000019567	-	95	39.726	ENSLBEG00000018979	-	53	39.726	Labrus_bergylta
ENSACIG00000019567	-	95	39.726	ENSLBEG00000017939	-	53	39.726	Labrus_bergylta
ENSACIG00000019567	-	93	36.279	ENSMAMG00000006227	-	68	36.279	Mastacembelus_armatus
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ENSACIG00000019567	-	94	36.574	ENSMAMG00000024196	-	52	36.574	Mastacembelus_armatus
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ENSACIG00000019567	-	94	36.574	ENSMAMG00000024198	-	52	36.574	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000019567	-	50	35.398	ENSMAMG00000019150	-	52	35.398	Mastacembelus_armatus
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