EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000019631 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rab11bb
Alias: zgc:92772
Full Name: RAB11B%2C member RAS oncogene family%2C b
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5123 bases
Position: chrCCOE01000292.1:536454-541576
Accession: ZDB-GENE-040718-293
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000025336	MMR_HSR1	PF01926.23	2.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000026001	-	576	-	ENSACIP00000025336	191 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000019631	rab11bb	74	52.113	ENSACIG00000019049	rab1ab	90	51.880
ENSACIG00000019631	rab11bb	70	38.406	ENSACIG00000006558	-	68	38.406
ENSACIG00000019631	rab11bb	83	35.625	ENSACIG00000004859	rab34b	64	35.625
ENSACIG00000019631	rab11bb	69	33.803	ENSACIG00000018406	rasl11a	56	33.803
ENSACIG00000019631	rab11bb	67	37.500	ENSACIG00000014605	rab6a	62	37.500
ENSACIG00000019631	rab11bb	72	41.429	ENSACIG00000021855	rab33ba	58	41.429
ENSACIG00000019631	rab11bb	71	30.147	ENSACIG00000015128	si:ch73-116o1.2	71	32.432
ENSACIG00000019631	rab11bb	63	37.190	ENSACIG00000020496	rab23	68	36.429
ENSACIG00000019631	rab11bb	70	38.406	ENSACIG00000022381	-	66	38.406
ENSACIG00000019631	rab11bb	70	48.872	ENSACIG00000010896	rab5c	62	48.872
ENSACIG00000019631	rab11bb	83	40.625	ENSACIG00000021459	zgc:101559	68	40.625
ENSACIG00000019631	rab11bb	99	73.272	ENSACIG00000017403	rab11al	99	73.272
ENSACIG00000019631	rab11bb	60	37.391	ENSACIG00000000670	rabl2	51	37.391
ENSACIG00000019631	rab11bb	84	48.125	ENSACIG00000003157	-	85	48.125
ENSACIG00000019631	rab11bb	70	36.090	ENSACIG00000010914	RAB41	63	36.090
ENSACIG00000019631	rab11bb	73	42.857	ENSACIG00000009306	RAB15	66	42.857
ENSACIG00000019631	rab11bb	70	47.368	ENSACIG00000019251	rab5aa	63	47.368
ENSACIG00000019631	rab11bb	75	97.917	ENSACIG00000024374	rab11ba	59	97.917
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	85.780	ENSACIG00000024376	-	100	85.780
ENSACIG00000019631	rab11bb	74	30.137	ENSACIG00000009139	dnajc27	54	30.137
ENSACIG00000019631	rab11bb	94	42.929	ENSACIG00000014625	-	97	42.929
ENSACIG00000019631	rab11bb	71	45.652	ENSACIG00000003102	rab42a	63	45.652
ENSACIG00000019631	rab11bb	65	34.921	ENSACIG00000000699	hrasb	72	36.232
ENSACIG00000019631	rab11bb	67	35.938	ENSACIG00000007154	rab6ba	60	35.938
ENSACIG00000019631	rab11bb	70	39.130	ENSACIG00000022208	-	66	39.130
ENSACIG00000019631	rab11bb	60	30.252	ENSACIG00000000312	arl4cb	60	30.252
ENSACIG00000019631	rab11bb	80	45.455	ENSACIG00000000154	RAB39B	70	45.455
ENSACIG00000019631	rab11bb	92	32.979	ENSACIG00000017824	rras	95	32.979
ENSACIG00000019631	rab11bb	69	46.970	ENSACIG00000006949	RAB17	58	46.970
ENSACIG00000019631	rab11bb	70	45.113	ENSACIG00000014012	rab22a	68	45.113
ENSACIG00000019631	rab11bb	74	52.817	ENSACIG00000009006	zgc:171927	66	52.817
ENSACIG00000019631	rab11bb	80	42.484	ENSACIG00000020616	rab12	61	42.484
ENSACIG00000019631	rab11bb	67	35.938	ENSACIG00000014094	rab6bb	63	35.938
ENSACIG00000019631	rab11bb	70	38.406	ENSACIG00000013630	RAB7A	66	38.406
ENSACIG00000019631	rab11bb	61	41.880	ENSACIG00000009617	rab18a	52	41.880
ENSACIG00000019631	rab11bb	90	38.547	ENSACIG00000013119	-	81	38.547
ENSACIG00000019631	rab11bb	72	48.921	ENSACIG00000023837	-	65	48.921
ENSACIG00000019631	rab11bb	88	67.456	ENSACIG00000017414	rab25b	81	67.456
ENSACIG00000019631	rab11bb	84	38.650	ENSACIG00000022520	rab33a	71	38.650
ENSACIG00000019631	rab11bb	70	38.406	ENSACIG00000018043	rab9a	68	38.406
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	77.064	ENSACIG00000003092	rab11a	100	77.064
ENSACIG00000019631	rab11bb	72	49.275	ENSACIG00000008584	rab13	66	49.275
ENSACIG00000019631	rab11bb	75	77.778	ENSACIG00000019803	rab25a	67	77.778
ENSACIG00000019631	rab11bb	65	36.154	ENSACIG00000011024	si:dkey-13a21.4	63	36.154
ENSACIG00000019631	rab11bb	72	39.716	ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	64	39.716
ENSACIG00000019631	rab11bb	61	39.316	ENSACIG00000008620	rab34a	52	39.316
ENSACIG00000019631	rab11bb	62	47.059	ENSACIG00000023222	-	55	47.059
ENSACIG00000019631	rab11bb	72	48.201	ENSACIG00000008102	rab18b	67	48.201
ENSACIG00000019631	rab11bb	73	46.429	ENSACIG00000010619	rab15	66	46.429
ENSACIG00000019631	rab11bb	71	41.429	ENSACIG00000007739	rab9b	68	41.429

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	87.156	ENSAPOG00000023455	rab11bb	100	87.156	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	85.780	ENSAOCG00000018849	-	100	85.780	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	87.156	ENSAOCG00000018239	rab11bb	100	87.156	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	87.156	ENSAPEG00000016590	rab11bb	100	87.156	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	86.239	ENSATEG00000023725	-	100	86.239	Anabas_testudineus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	87.156	ENSATEG00000017696	rab11bb	100	87.156	Anabas_testudineus
ENSACIG00000019631	rab11bb	94	84.951	ENSAPLG00000011046	-	94	84.951	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	85.780	ENSACLG00000005446	-	100	85.780	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	87.156	ENSACLG00000007076	rab11bb	100	87.156	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	84.404	ENSAMXG00000037623	-	100	84.404	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	86.239	ENSAMXG00000042655	rab11bb	100	86.239	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	83.945	ENSBTAG00000002475	RAB11B	100	83.945	Bos_taurus
ENSACIG00000019631	rab11bb	95	81.818	ENSCHIG00000022426	-	93	81.818	Capra_hircus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	83.945	ENSCATG00000029188	-	100	83.945	Cercocebus_atys
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	84.862	ENSCPBG00000017056	-	100	84.862	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	85.321	ENSCSEG00000007239	-	100	85.321	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	87.156	ENSCSEG00000012149	rab11bb	100	87.156	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	83.028	ENSCVAG00000019751	-	100	83.028	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	84.862	ENSCVAG00000019718	-	100	84.862	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	87.156	ENSCVAG00000017021	-	100	87.156	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	85.780	ENSDARG00000090086	rab11bb	100	85.780	Danio_rerio
ENSACIG00000019631	rab11bb	99	82.028	ENSETEG00000000905	-	99	82.028	Echinops_telfairi
ENSACIG00000019631	rab11bb	98	81.860	ENSEASG00005003708	-	99	81.860	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000019631	rab11bb	98	81.860	ENSECAG00000000716	RAB11B	99	81.860	Equus_caballus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	83.486	ENSELUG00000000916	-	92	99.219	Esox_lucius
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	85.780	ENSELUG00000021148	rab11bb	100	85.780	Esox_lucius
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	84.404	ENSELUG00000020948	-	98	100.000	Esox_lucius
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	84.862	ENSFALG00000011828	-	100	84.862	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	98.429	ENSFHEG00000022676	-	100	98.429	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	87.156	ENSFHEG00000018353	rab11bb	100	87.156	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000019631	rab11bb	99	82.870	ENSGMOG00000009668	-	99	82.870	Gadus_morhua
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	87.615	ENSGMOG00000009211	rab11bb	100	87.615	Gadus_morhua
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	84.862	ENSGALG00000000613	RAB11B	100	84.862	Gallus_gallus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	87.156	ENSGAFG00000007102	rab11bb	100	87.156	Gambusia_affinis
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	86.697	ENSGACG00000015479	rab11bb	100	86.697	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	83.028	ENSGACG00000013297	-	99	83.028	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	83.945	ENSGGOG00000014516	RAB11B	100	83.945	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	85.780	ENSHBUG00000009947	-	100	85.780	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	87.156	ENSHBUG00000014777	rab11bb	100	87.156	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	83.486	ENSHCOG00000000954	-	100	83.486	Hippocampus_comes
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	86.697	ENSHCOG00000002423	rab11bb	100	86.697	Hippocampus_comes
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	81.651	ENSHCOG00000000985	-	100	81.651	Hippocampus_comes
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	84.404	ENSIPUG00000025100	rab11b	100	84.404	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	86.239	ENSIPUG00000019927	rab11bb	100	86.239	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	85.780	ENSKMAG00000006170	-	100	85.780	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	87.156	ENSKMAG00000009033	rab11bb	100	87.156	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	77.523	ENSLBEG00000005981	-	100	77.523	Labrus_bergylta
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	87.156	ENSLBEG00000015248	rab11bb	100	87.156	Labrus_bergylta
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	84.862	ENSLBEG00000004172	-	100	84.862	Labrus_bergylta
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	84.862	ENSLACG00000016857	-	100	84.862	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	83.945	ENSMFAG00000003654	RAB11B	100	83.945	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	83.945	ENSMLEG00000030601	-	100	83.945	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	84.862	ENSMAMG00000018533	-	100	84.862	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	86.697	ENSMAMG00000006378	rab11bb	100	86.697	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	87.156	ENSMZEG00005003352	rab11bb	100	87.156	Maylandia_zebra
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	85.780	ENSMZEG00005010975	-	100	85.780	Maylandia_zebra
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	83.945	ENSMICG00000034065	-	100	83.945	Microcebus_murinus
ENSACIG00000019631	rab11bb	93	86.341	ENSMMOG00000007917	rab11bb	100	86.341	Mola_mola
ENSACIG00000019631	rab11bb	99	84.332	ENSMMOG00000001238	-	99	84.332	Mola_mola
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	85.780	ENSMMOG00000001250	-	100	85.780	Mola_mola
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	84.862	ENSMODG00000003841	-	100	84.862	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	87.156	ENSMALG00000022187	rab11bb	100	87.156	Monopterus_albus
ENSACIG00000019631	rab11bb	93	83.092	ENSMLUG00000006677	-	100	83.092	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	87.156	ENSNBRG00000000372	rab11bb	100	87.156	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	85.780	ENSNBRG00000023885	-	100	85.780	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	84.862	ENSMEUG00000003686	-	100	84.862	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	87.156	ENSONIG00000010435	rab11bb	100	87.156	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	85.780	ENSONIG00000002544	-	100	85.780	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000019631	rab11bb	60	94.737	ENSOANG00000031567	-	82	94.737	Ornithorhynchus_anatinus
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ENSACIG00000019631	rab11bb	100	86.697	ENSORLG00000013938	rab11bb	100	86.697	Oryzias_latipes
ENSACIG00000019631	rab11bb	99	84.332	ENSORLG00020020844	RAB11B	99	84.332	Oryzias_latipes_hni
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ENSACIG00000019631	rab11bb	100	86.697	ENSORLG00015020173	rab11bb	100	86.697	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000019631	rab11bb	99	84.332	ENSORLG00015016999	RAB11B	99	84.332	Oryzias_latipes_hsok
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ENSACIG00000019631	rab11bb	100	85.780	ENSPKIG00000011703	-	100	85.780	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000019631	rab11bb	97	80.822	ENSPSIG00000010242	-	85	80.822	Pelodiscus_sinensis
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ENSACIG00000019631	rab11bb	97	83.019	ENSPCIG00000020371	-	99	83.019	Phascolarctos_cinereus
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ENSACIG00000019631	rab11bb	100	87.156	ENSPMEG00000012389	rab11bb	100	87.156	Poecilia_mexicana
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ENSACIG00000019631	rab11bb	100	85.780	ENSPNYG00000019611	-	100	85.780	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	83.945	ENSRROG00000037812	-	100	83.945	Rhinopithecus_roxellana
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ENSACIG00000019631	rab11bb	100	84.862	ENSTGUG00000000084	-	100	84.862	Taeniopygia_guttata
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ENSACIG00000019631	rab11bb	100	87.156	ENSTRUG00000022029	rab11bb	100	87.156	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000019631	rab11bb	99	85.648	ENSTNIG00000013182	-	100	85.648	Tetraodon_nigroviridis
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ENSACIG00000019631	rab11bb	100	86.697	ENSTNIG00000011081	rab11bb	100	86.697	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000019631	rab11bb	92	84.236	ENSTNIG00000002003	-	100	84.236	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000019631	rab11bb	93	83.902	ENSUAMG00000006639	-	99	83.902	Ursus_americanus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	84.475	ENSXETG00000025484	rab11b.1	99	84.475	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	87.156	ENSXCOG00000008042	-	100	87.156	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	85.780	ENSXCOG00000009190	-	100	85.780	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000019631	rab11bb	100	85.321	ENSXMAG00000024840	-	100	85.321	Xiphophorus_maculatus
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