EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000019815 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1089 bases
Position: chrCCOE01000372.1:38706-39794
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000025567	zf-C2H2	PF00096.26	7.7e-44	1	6
ENSACIP00000025567	zf-C2H2	PF00096.26	7.7e-44	2	6
ENSACIP00000025567	zf-C2H2	PF00096.26	7.7e-44	3	6
ENSACIP00000025567	zf-C2H2	PF00096.26	7.7e-44	4	6
ENSACIP00000025567	zf-C2H2	PF00096.26	7.7e-44	5	6
ENSACIP00000025567	zf-C2H2	PF00096.26	7.7e-44	6	6
ENSACIP00000025567	zf-met	PF12874.7	1.1e-18	1	4
ENSACIP00000025567	zf-met	PF12874.7	1.1e-18	2	4
ENSACIP00000025567	zf-met	PF12874.7	1.1e-18	3	4
ENSACIP00000025567	zf-met	PF12874.7	1.1e-18	4	4

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000026236	-	927	-	ENSACIP00000025567	308 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000019815	-	99	48.425	ENSACIG00000011541	-	76	48.425
ENSACIG00000019815	-	82	46.000	ENSACIG00000008448	-	69	44.715
ENSACIG00000019815	-	95	49.776	ENSACIG00000004666	-	98	50.400
ENSACIG00000019815	-	81	50.746	ENSACIG00000010660	-	92	50.746
ENSACIG00000019815	-	88	38.384	ENSACIG00000010739	-	84	38.384
ENSACIG00000019815	-	91	48.031	ENSACIG00000009717	-	90	48.031
ENSACIG00000019815	-	82	52.778	ENSACIG00000011153	-	71	52.778
ENSACIG00000019815	-	83	36.607	ENSACIG00000001369	-	81	36.607
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ENSACIG00000019815	-	83	42.194	ENSACIG00000018404	-	76	42.194
ENSACIG00000019815	-	82	51.938	ENSACIG00000000311	-	59	51.938
ENSACIG00000019815	-	94	31.429	ENSACIG00000014282	znf526	75	39.189
ENSACIG00000019815	-	89	42.529	ENSACIG00000017644	-	85	42.529
ENSACIG00000019815	-	90	35.417	ENSACIG00000002944	-	86	35.417
ENSACIG00000019815	-	82	39.091	ENSACIG00000008886	znf1164	93	39.091
ENSACIG00000019815	-	87	47.159	ENSACIG00000009755	-	75	44.595
ENSACIG00000019815	-	87	47.778	ENSACIG00000016117	-	83	47.778
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ENSACIG00000019815	-	82	48.193	ENSACIG00000006377	-	74	48.193
ENSACIG00000019815	-	82	43.284	ENSACIG00000023794	-	76	43.284
ENSACIG00000019815	-	89	46.939	ENSACIG00000004626	-	92	46.502
ENSACIG00000019815	-	82	47.737	ENSACIG00000019447	-	66	47.737
ENSACIG00000019815	-	82	46.667	ENSACIG00000016180	znf341	51	46.667
ENSACIG00000019815	-	96	40.484	ENSACIG00000004745	-	93	42.529
ENSACIG00000019815	-	89	45.249	ENSACIG00000012084	-	100	45.249
ENSACIG00000019815	-	95	46.392	ENSACIG00000009780	-	82	48.214
ENSACIG00000019815	-	85	44.444	ENSACIG00000013946	-	56	44.444
ENSACIG00000019815	-	82	45.390	ENSACIG00000013163	-	78	45.390
ENSACIG00000019815	-	83	32.800	ENSACIG00000009443	-	56	32.800
ENSACIG00000019815	-	92	44.094	ENSACIG00000013604	-	97	44.488
ENSACIG00000019815	-	81	47.170	ENSACIG00000011516	-	81	47.170
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ENSACIG00000019815	-	81	34.921	ENSACIG00000016133	-	53	34.921
ENSACIG00000019815	-	82	38.983	ENSACIG00000001767	zbtb41	62	37.308
ENSACIG00000019815	-	90	40.426	ENSACIG00000002180	-	96	40.426
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ENSACIG00000019815	-	99	48.413	ENSACIG00000004641	-	63	48.413
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ENSACIG00000019815	-	82	46.479	ENSACIG00000017653	-	96	46.479
ENSACIG00000019815	-	99	47.863	ENSACIG00000007464	-	66	47.863
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ENSACIG00000019815	-	98	48.230	ENSACIG00000017050	-	96	54.545
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ENSACIG00000019815	-	82	40.000	ENSACIG00000016354	gfi1ab	51	39.286
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ENSACIG00000019815	-	99	43.830	ENSACIG00000019791	-	91	46.930
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ENSACIG00000019815	-	92	49.206	ENSACIG00000004041	-	95	49.603
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ENSACIG00000019815	-	93	45.087	ENSACIG00000022658	-	91	45.211
ENSACIG00000019815	-	82	59.398	ENSACIG00000000286	-	70	59.398
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ENSACIG00000019815	-	84	47.600	ENSACIG00000013470	-	67	46.094
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ENSACIG00000019815	-	100	47.009	ENSACIG00000006755	-	92	47.191
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ENSACIG00000019815	-	93	45.745	ENSACIG00000016944	-	92	46.637
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ENSACIG00000019815	-	87	44.922	ENSACIG00000019710	-	74	45.059
ENSACIG00000019815	-	97	47.917	ENSACIG00000019804	-	85	47.917
ENSACIG00000019815	-	82	40.404	ENSACIG00000007000	-	69	35.685
ENSACIG00000019815	-	93	44.444	ENSACIG00000024444	-	72	44.444
ENSACIG00000019815	-	87	39.394	ENSACIG00000020938	zbtb47b	67	39.394
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ENSACIG00000019815	-	82	49.231	ENSACIG00000007034	-	83	49.231
ENSACIG00000019815	-	92	40.336	ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	74	40.336
ENSACIG00000019815	-	82	48.598	ENSACIG00000006228	-	69	48.598
ENSACIG00000019815	-	90	49.123	ENSACIG00000022738	-	98	47.541
ENSACIG00000019815	-	90	37.273	ENSACIG00000012263	znf319b	92	37.273
ENSACIG00000019815	-	85	33.077	ENSACIG00000016779	patz1	50	30.292
ENSACIG00000019815	-	90	49.315	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	86	46.863
ENSACIG00000019815	-	96	57.018	ENSACIG00000006806	-	73	57.018
ENSACIG00000019815	-	91	46.809	ENSACIG00000007855	-	90	46.809
ENSACIG00000019815	-	83	41.667	ENSACIG00000013613	scrt1b	55	41.667
ENSACIG00000019815	-	98	49.213	ENSACIG00000023212	-	83	49.213
ENSACIG00000019815	-	93	35.565	ENSACIG00000009128	-	83	33.962
ENSACIG00000019815	-	88	33.585	ENSACIG00000012636	ZNF319	95	36.508
ENSACIG00000019815	-	93	44.000	ENSACIG00000016182	-	92	43.350

Orthologs

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ENSACIG00000019815	-	82	47.674	ENSAPOG00000010200	-	56	40.411	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019815	-	85	45.500	ENSAPOG00000013982	-	68	44.538	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019815	-	96	44.269	ENSAPOG00000021991	-	90	44.269	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019815	-	99	45.455	ENSAPOG00000019061	-	82	45.455	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019815	-	97	49.802	ENSAPOG00000021383	-	76	49.802	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019815	-	93	47.210	ENSAPOG00000021959	-	61	42.938	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019815	-	100	48.696	ENSAOCG00000002795	-	80	48.696	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019815	-	99	45.704	ENSAOCG00000012813	-	86	45.704	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019815	-	100	51.515	ENSAOCG00000007134	-	93	51.515	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019815	-	90	50.198	ENSAOCG00000017595	-	70	50.198	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019815	-	90	53.030	ENSAOCG00000016905	-	74	53.030	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019815	-	93	49.565	ENSAOCG00000010471	-	77	49.565	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019815	-	85	46.983	ENSAOCG00000002430	-	77	45.714	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019815	-	97	51.685	ENSAOCG00000017602	-	79	51.685	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019815	-	94	49.565	ENSAPEG00000013097	-	79	49.565	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019815	-	85	51.685	ENSAPEG00000012470	-	79	51.685	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019815	-	96	46.637	ENSAPEG00000015337	-	95	45.669	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019815	-	90	47.987	ENSAPEG00000001546	-	86	47.987	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019815	-	100	49.802	ENSAPEG00000012443	-	80	49.802	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019815	-	89	40.079	ENSAPEG00000019106	-	54	41.445	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019815	-	93	46.983	ENSAPEG00000013044	-	65	45.714	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019815	-	89	40.942	ENSATEG00000013871	-	58	42.586	Anabas_testudineus
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