EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000019827 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: sar1ab
Alias: fd13d02|sar1a|wu:fd13d02|zgc:110650
Full Name: secretion associated%2C Ras related GTPase 1Ab
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3516 bases
Position: chrCCOE01000564.1:897372-900887
Accession: ZDB-GENE-050417-437
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000025797	MMR_HSR1	PF01926.23	7.9e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000026474	-	597	-	ENSACIP00000025797	198 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000019827's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000019827's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000019827	sar1ab	52	32.692	ENSACIG00000009595	arl8bb	66	32.692
ENSACIG00000019827	sar1ab	64	35.156	ENSACIG00000000868	arl8a	68	35.156
ENSACIG00000019827	sar1ab	94	30.108	ENSACIG00000016407	arl3l2	94	30.108
ENSACIG00000019827	sar1ab	64	33.333	ENSACIG00000000949	-	66	33.333
ENSACIG00000019827	sar1ab	88	31.285	ENSACIG00000000945	-	91	31.285
ENSACIG00000019827	sar1ab	86	32.386	ENSACIG00000013359	arl4d	82	32.386
ENSACIG00000019827	sar1ab	72	35.664	ENSACIG00000000612	arl2	78	35.664
ENSACIG00000019827	sar1ab	61	33.058	ENSACIG00000016782	-	73	33.058
ENSACIG00000019827	sar1ab	63	30.159	ENSACIG00000008614	arl8ba	79	30.159
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	80.808	ENSACIG00000013634	sar1b	100	80.808
ENSACIG00000019827	sar1ab	73	32.886	ENSACIG00000000312	arl4cb	75	32.886
ENSACIG00000019827	sar1ab	67	33.083	ENSACIG00000012192	-	74	33.083
ENSACIG00000019827	sar1ab	68	33.333	ENSACIG00000013244	arl14	67	33.333
ENSACIG00000019827	sar1ab	64	32.283	ENSACIG00000007953	arl1	71	32.283
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	78.283	ENSACIG00000024513	-	100	78.283
ENSACIG00000019827	sar1ab	58	35.537	ENSACIG00000024420	-	62	35.537
ENSACIG00000019827	sar1ab	87	31.429	ENSACIG00000000467	-	89	31.429
ENSACIG00000019827	sar1ab	78	30.968	ENSACIG00000012912	arf2b	67	30.968
ENSACIG00000019827	sar1ab	88	32.000	ENSACIG00000014610	zgc:110286	91	32.000
ENSACIG00000019827	sar1ab	86	32.065	ENSACIG00000018839	-	82	32.065
ENSACIG00000019827	sar1ab	86	33.333	ENSACIG00000019225	-	91	33.333

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	93.939	ENSAOCG00000022062	sar1ab	100	93.939	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	93.939	ENSAPEG00000011525	sar1ab	100	93.939	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	92.929	ENSATEG00000003466	sar1ab	100	92.929	Anabas_testudineus
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	96.465	ENSACLG00000013053	sar1ab	100	96.465	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	89.394	ENSCSEG00000004825	sar1ab	100	89.394	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	76.768	ENSCVAG00000006500	-	100	76.768	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	92.929	ENSCVAG00000015162	sar1ab	100	92.929	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	86.869	ENSDARG00000033320	sar1ab	100	86.869	Danio_rerio
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	89.899	ENSELUG00000024279	sar1ab	100	89.899	Esox_lucius
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	81.313	ENSELUG00000013652	sar1a	100	81.313	Esox_lucius
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	91.414	ENSFHEG00000021773	sar1ab	100	91.414	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	78.283	ENSFHEG00000012352	-	100	78.283	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	88.384	ENSGMOG00000012588	sar1ab	100	88.384	Gadus_morhua
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	93.434	ENSGAFG00000009702	sar1ab	100	93.434	Gambusia_affinis
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	78.283	ENSGAFG00000004846	-	98	80.342	Gambusia_affinis
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	89.899	ENSGACG00000008616	sar1ab	100	89.899	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	96.465	ENSHBUG00000021221	sar1ab	100	96.465	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	90.404	ENSHCOG00000002845	sar1ab	80	90.404	Hippocampus_comes
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	92.929	ENSKMAG00000018006	sar1ab	100	92.929	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	92.424	ENSLBEG00000001114	sar1ab	100	92.424	Labrus_bergylta
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	91.919	ENSMAMG00000021314	sar1ab	100	91.919	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	96.465	ENSMZEG00005027606	sar1ab	100	96.465	Maylandia_zebra
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	91.414	ENSMMOG00000010360	sar1ab	100	91.414	Mola_mola
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	90.909	ENSMALG00000005831	sar1ab	100	90.909	Monopterus_albus
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	96.970	ENSNBRG00000018772	sar1ab	100	96.970	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	97.980	ENSONIG00000018509	sar1ab	100	97.980	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	80.303	ENSORLG00000009132	-	90	80.303	Oryzias_latipes
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	91.414	ENSORLG00000006779	sar1ab	67	91.414	Oryzias_latipes
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	80.303	ENSORLG00020007024	-	90	80.303	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	90.909	ENSORLG00020005458	sar1ab	100	90.909	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	91.414	ENSORLG00015010542	sar1ab	100	91.414	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	79.798	ENSORLG00015006223	-	94	83.929	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	93.434	ENSOMEG00000004948	sar1ab	100	93.434	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	79.798	ENSOMEG00000012020	-	100	79.798	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	83.333	ENSPKIG00000007615	sar1ab	100	83.333	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	91.414	ENSPMGG00000013330	sar1ab	100	91.414	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	94.444	ENSPFOG00000023432	sar1ab	100	94.444	Poecilia_formosa
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	94.444	ENSPLAG00000023705	sar1ab	100	94.444	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	77.778	ENSPMEG00000001717	-	100	77.778	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	94.444	ENSPMEG00000000559	sar1ab	100	94.444	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	94.444	ENSPREG00000016098	sar1ab	100	94.444	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	96.970	ENSPNYG00000011603	sar1ab	100	96.970	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	87.879	ENSPNAG00000008007	sar1ab	100	87.879	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	85.354	ENSSFOG00015014010	sar1a	100	85.354	Scleropages_formosus
ENSACIG00000019827	sar1ab	72	76.923	ENSSMAG00000020758	sar1ab	95	76.923	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	91.919	ENSSDUG00000010773	sar1ab	100	91.919	Seriola_dumerili
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	91.919	ENSSLDG00000025558	sar1ab	100	91.919	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	94.949	ENSSPAG00000009194	sar1ab	100	94.949	Stegastes_partitus
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	91.919	ENSTRUG00000007269	sar1ab	100	91.919	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	92.929	ENSTNIG00000008635	sar1ab	100	92.929	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	78.788	ENSXMAG00000026223	SAR1A	100	78.788	Xiphophorus_maculatus
ENSACIG00000019827	sar1ab	100	93.939	ENSXMAG00000003130	sar1ab	100	93.939	Xiphophorus_maculatus