EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000019862 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: prpf6
Alias: c20orf14|fc12b02|wu:fa05f07|wu:fc12b02|zgc:65913
Full Name: PRP6 pre-mRNA processing factor 6 homolog (S. cerevisiae)
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10509 bases
Position: chrCCOE01001023.1:85188-95696
Accession: ZDB-GENE-030131-2575
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000025667	PRP1_N	PF06424.12	2e-57	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000026338	-	2910	-	ENSACIP00000025667	969 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.455	ENSG00000101161	PRPF6	100	92.030	Homo_sapiens
ENSACIG00000019862	prpf6	100	98.349	ENSAPOG00000010395	prpf6	100	98.349	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.038	ENSAMEG00000001916	PRPF6	99	91.614	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000019862	prpf6	100	98.452	ENSAOCG00000012988	prpf6	100	98.452	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000019862	prpf6	96	91.828	ENSAPEG00000008301	prpf6	100	92.043	Amphiprion_percula
ENSACIG00000019862	prpf6	100	98.349	ENSATEG00000005581	prpf6	100	98.349	Anabas_testudineus
ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.880	ENSACAG00000006464	PRPF6	95	92.455	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.455	ENSANAG00000012661	PRPF6	100	92.933	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000019862	prpf6	100	98.968	ENSACLG00000025875	prpf6	100	98.968	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000019862	prpf6	97	94.703	ENSAMXG00000001929	prpf6	100	92.930	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.986	ENSBTAG00000011656	PRPF6	100	92.561	Bos_taurus
ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.455	ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	92.030	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000019862	prpf6	96	93.092	ENSCAFG00000013165	PRPF6	100	92.667	Canis_familiaris
ENSACIG00000019862	prpf6	96	93.092	ENSCAFG00020002050	PRPF6	100	92.667	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.986	ENSCHIG00000018187	PRPF6	100	92.561	Capra_hircus
ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.880	ENSTSYG00000007814	PRPF6	100	92.455	Carlito_syrichta
ENSACIG00000019862	prpf6	93	92.039	ENSCAPG00000015077	PRPF6	100	91.167	Cavia_aperea
ENSACIG00000019862	prpf6	96	93.305	ENSCPOG00000007518	PRPF6	100	92.880	Cavia_porcellus
ENSACIG00000019862	prpf6	96	89.373	ENSCCAG00000024564	PRPF6	100	88.948	Cebus_capucinus
ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.561	ENSCATG00000037473	PRPF6	100	92.136	Cercocebus_atys
ENSACIG00000019862	prpf6	96	89.586	ENSCLAG00000003854	PRPF6	100	89.160	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000019862	prpf6	96	87.856	ENSCSAG00000016742	PRPF6	100	87.434	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000019862	prpf6	81	77.886	ENSCHOG00000003315	-	98	77.686	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000019862	prpf6	98	91.779	ENSCPBG00000013964	PRPF6	96	92.872	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000019862	prpf6	96	72.939	ENSCING00000008817	-	99	72.516	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.349	ENSCANG00000038230	PRPF6	100	91.923	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000019862	prpf6	96	93.305	ENSCGRG00001022666	Prpf6	100	92.880	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.688	ENSCSEG00000018561	prpf6	100	92.688	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000019862	prpf6	100	96.801	ENSCVAG00000010550	prpf6	100	96.801	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000019862	prpf6	100	93.340	ENSDARG00000091367	prpf6	100	94.915	Danio_rerio
ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.455	ENSDNOG00000040544	PRPF6	100	92.136	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000019862	prpf6	87	92.640	ENSDORG00000005406	Prpf6	100	92.640	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000019862	prpf6	96	71.505	FBgn0036828	CG6841	99	71.613	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000019862	prpf6	83	91.813	ENSETEG00000004447	PRPF6	85	91.813	Echinops_telfairi
ENSACIG00000019862	prpf6	96	86.667	ENSEBUG00000008835	prpf6	100	86.243	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000019862	prpf6	97	92.518	ENSEASG00005023115	PRPF6	100	92.561	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000019862	prpf6	96	88.735	ENSECAG00000013983	PRPF6	100	88.310	Equus_caballus
ENSACIG00000019862	prpf6	86	95.833	ENSEEUG00000000180	PRPF6	81	95.833	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000019862	prpf6	97	95.122	ENSELUG00000001945	prpf6	94	95.122	Esox_lucius
ENSACIG00000019862	prpf6	96	93.092	ENSFCAG00000001183	PRPF6	100	92.667	Felis_catus
ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.910	ENSFALG00000010326	-	98	92.593	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000019862	prpf6	99	85.036	ENSFALG00000006046	-	97	86.915	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000019862	prpf6	96	91.817	ENSFDAG00000006451	PRPF6	100	91.392	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000019862	prpf6	100	97.523	ENSFHEG00000000560	prpf6	100	97.523	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000019862	prpf6	97	94.168	ENSGMOG00000015622	prpf6	99	93.637	Gadus_morhua
ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.986	ENSGALG00000006001	PRPF6	100	92.667	Gallus_gallus
ENSACIG00000019862	prpf6	100	92.982	ENSGAFG00000021109	prpf6	100	92.982	Gambusia_affinis
ENSACIG00000019862	prpf6	97	95.869	ENSGACG00000002576	prpf6	100	95.869	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000019862	prpf6	98	91.875	ENSGAGG00000008653	PRPF6	96	92.979	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.455	ENSGGOG00000016876	PRPF6	100	92.030	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000019862	prpf6	100	98.968	ENSHBUG00000004496	prpf6	100	98.968	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000019862	prpf6	96	93.199	ENSHGLG00000009222	PRPF6	100	92.774	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000019862	prpf6	93	93.130	ENSHGLG00100016600	PRPF6	100	92.694	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000019862	prpf6	100	96.078	ENSHCOG00000011513	prpf6	100	96.078	Hippocampus_comes
ENSACIG00000019862	prpf6	100	93.224	ENSIPUG00000004912	prpf6	100	93.224	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000019862	prpf6	96	90.764	ENSSTOG00000002922	PRPF6	100	89.915	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000019862	prpf6	96	93.305	ENSJJAG00000000836	Prpf6	100	92.880	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000019862	prpf6	100	97.730	ENSKMAG00000017800	prpf6	100	97.730	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000019862	prpf6	100	96.698	ENSLBEG00000012582	prpf6	100	96.698	Labrus_bergylta
ENSACIG00000019862	prpf6	98	92.812	ENSLOCG00000004827	prpf6	96	92.447	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.561	ENSLAFG00000005272	PRPF6	100	92.136	Loxodonta_africana
ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.349	ENSMFAG00000037542	PRPF6	100	91.923	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000019862	prpf6	96	86.093	ENSMMUG00000015558	PRPF6	95	94.296	Macaca_mulatta
ENSACIG00000019862	prpf6	96	79.873	ENSMNEG00000045555	PRPF6	100	79.449	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000019862	prpf6	100	97.730	ENSMAMG00000010718	prpf6	100	97.730	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000019862	prpf6	97	98.721	ENSMZEG00005015261	-	100	98.721	Maylandia_zebra
ENSACIG00000019862	prpf6	90	98.743	ENSMZEG00005026539	prpf6	100	98.743	Maylandia_zebra
ENSACIG00000019862	prpf6	93	93.130	ENSMGAG00000006634	PRPF6	100	92.803	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000019862	prpf6	96	93.305	ENSMAUG00000013969	Prpf6	100	92.880	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000019862	prpf6	84	92.092	ENSMICG00000017793	PRPF6	98	92.109	Microcebus_murinus
ENSACIG00000019862	prpf6	96	93.199	ENSMOCG00000001701	Prpf6	100	92.774	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000019862	prpf6	96	97.849	ENSMMOG00000020419	prpf6	100	97.849	Mola_mola
ENSACIG00000019862	prpf6	93	93.958	ENSMODG00000017051	PRPF6	99	93.465	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000019862	prpf6	95	98.043	ENSMALG00000000089	prpf6	100	98.043	Monopterus_albus
ENSACIG00000019862	prpf6	96	87.035	MGP_CAROLIEiJ_G0024814	Prpf6	100	86.185	Mus_caroli
ENSACIG00000019862	prpf6	96	93.305	ENSMUSG00000002455	Prpf6	100	92.880	Mus_musculus
ENSACIG00000019862	prpf6	96	93.305	MGP_PahariEiJ_G0026262	Prpf6	100	92.880	Mus_pahari
ENSACIG00000019862	prpf6	96	93.305	MGP_SPRETEiJ_G0025741	Prpf6	100	92.880	Mus_spretus
ENSACIG00000019862	prpf6	87	93.087	ENSMPUG00000008673	PRPF6	99	92.610	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000019862	prpf6	96	93.411	ENSNGAG00000003365	Prpf6	100	92.986	Nannospalax_galili
ENSACIG00000019862	prpf6	100	99.071	ENSNBRG00000015025	prpf6	100	99.071	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.349	ENSNLEG00000010208	PRPF6	100	91.923	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000019862	prpf6	96	84.137	ENSMEUG00000009824	-	90	84.387	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000019862	prpf6	96	87.354	ENSODEG00000004841	PRPF6	100	86.929	Octodon_degus
ENSACIG00000019862	prpf6	100	99.174	ENSONIG00000017406	prpf6	100	99.174	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000019862	prpf6	96	93.199	ENSOANG00000004920	PRPF6	100	92.774	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000019862	prpf6	95	90.987	ENSOCUG00000014151	PRPF6	100	90.558	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000019862	prpf6	100	96.078	ENSORLG00000009592	prpf6	100	96.078	Oryzias_latipes
ENSACIG00000019862	prpf6	100	96.182	ENSORLG00020001458	prpf6	100	96.182	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000019862	prpf6	100	96.182	ENSORLG00015018762	prpf6	100	96.182	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000019862	prpf6	100	96.801	ENSOMEG00000012174	prpf6	100	96.801	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000019862	prpf6	96	86.093	ENSOGAG00000007573	PRPF6	100	85.669	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.561	ENSOARG00000008776	PRPF6	99	92.136	Ovis_aries
ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.455	ENSPPAG00000008686	PRPF6	100	92.030	Pan_paniscus
ENSACIG00000019862	prpf6	96	93.092	ENSPPRG00000008497	PRPF6	100	92.667	Panthera_pardus
ENSACIG00000019862	prpf6	93	93.021	ENSPTIG00000011184	PRPF6	97	92.585	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.455	ENSPTRG00000013765	PRPF6	100	92.030	Pan_troglodytes
ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.136	ENSPANG00000024135	PRPF6	100	91.711	Papio_anubis
ENSACIG00000019862	prpf6	98	93.659	ENSPKIG00000005627	prpf6	99	94.894	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000019862	prpf6	88	93.072	ENSPSIG00000007717	PRPF6	98	93.072	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000019862	prpf6	99	95.041	ENSPMGG00000008925	prpf6	99	94.318	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000019862	prpf6	96	93.305	ENSPEMG00000016036	Prpf6	100	92.880	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000019862	prpf6	97	88.093	ENSPMAG00000006144	prpf6	100	88.093	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000019862	prpf6	96	93.305	ENSPCIG00000017909	PRPF6	100	92.880	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000019862	prpf6	100	96.830	ENSPFOG00000006431	prpf6	99	96.830	Poecilia_formosa
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ENSACIG00000019862	prpf6	91	94.771	ENSPCAG00000006536	PRPF6	88	94.118	Procavia_capensis
ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.455	ENSPCOG00000016881	PRPF6	100	92.030	Propithecus_coquereli
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