EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSACIG00000020024 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: fubp1
Alias: wu:fa92h11|wu:fb24h11|wu:fc26f06|zgc:66046
Full Name: far upstream element (FUSE) binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12302 bases
Position: chrCCOE01000784.1:164481-176782
Accession: ZDB-GENE-040426-2159
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000025872	KH_1	PF00013.29	5.9e-61	1	4
ENSACIP00000025872	KH_1	PF00013.29	5.9e-61	2	4
ENSACIP00000025872	KH_1	PF00013.29	5.9e-61	3	4
ENSACIP00000025872	KH_1	PF00013.29	5.9e-61	4	4
ENSACIP00000025872	KH_2	PF07650.17	6.2e-20	1	1
ENSACIP00000025872	DUF1897	PF09005.10	1e-11	1	2
ENSACIP00000025872	DUF1897	PF09005.10	1e-11	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000026552	-	1866	-	ENSACIP00000025872	621 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000020024	fubp1	83	49.432	ENSACIG00000005212	-	72	56.103
ENSACIG00000020024	fubp1	97	43.457	ENSACIG00000019595	fubp3	74	51.515
ENSACIG00000020024	fubp1	97	53.374	ENSACIG00000009298	khsrp	99	52.827

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000020024	fubp1	69	73.684	ENSG00000162613	FUBP1	100	69.325	Homo_sapiens
ENSACIG00000020024	fubp1	99	92.722	ENSAPOG00000014845	fubp1	98	92.722	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020024	fubp1	69	70.711	ENSAMEG00000007372	FUBP1	100	67.359	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000020024	fubp1	100	88.031	ENSAPEG00000012232	fubp1	100	88.031	Amphiprion_percula
ENSACIG00000020024	fubp1	99	90.865	ENSATEG00000018619	fubp1	100	89.185	Anabas_testudineus
ENSACIG00000020024	fubp1	64	75.181	ENSAPLG00000005965	FUBP1	100	70.279	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000020024	fubp1	69	69.831	ENSACAG00000006310	FUBP1	96	63.610	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000020024	fubp1	99	90.363	ENSACLG00000006708	fubp1	100	88.960	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000020024	fubp1	86	84.962	ENSAMXG00000005525	fubp1	99	83.647	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000020024	fubp1	69	73.904	ENSCJAG00000007062	FUBP1	100	69.432	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000020024	fubp1	69	73.904	ENSCAFG00000020361	FUBP1	100	69.479	Canis_familiaris
ENSACIG00000020024	fubp1	60	79.532	ENSTSYG00000000148	FUBP1	100	69.771	Carlito_syrichta
ENSACIG00000020024	fubp1	56	80.000	ENSCAPG00000011052	-	65	80.000	Cavia_aperea
ENSACIG00000020024	fubp1	69	73.904	ENSCPOG00000002757	FUBP1	98	70.946	Cavia_porcellus
ENSACIG00000020024	fubp1	69	59.942	ENSCCAG00000036537	FUBP1	100	60.519	Cebus_capucinus
ENSACIG00000020024	fubp1	69	73.684	ENSCATG00000042126	FUBP1	100	69.325	Cercocebus_atys
ENSACIG00000020024	fubp1	69	75.737	ENSCLAG00000005621	FUBP1	100	72.152	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000020024	fubp1	69	73.684	ENSCSAG00000001402	FUBP1	100	69.325	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000020024	fubp1	69	73.684	ENSCHOG00000008177	FUBP1	98	69.585	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000020024	fubp1	69	74.723	ENSCGRG00001007103	Fubp1	100	69.692	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000020024	fubp1	64	75.000	ENSCGRG00000003372	Fubp1	100	69.431	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000020024	fubp1	100	88.226	ENSCSEG00000021412	fubp1	100	87.520	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000020024	fubp1	99	84.756	ENSCVAG00000014487	fubp1	93	89.455	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000020024	fubp1	100	76.344	ENSDARG00000029248	fubp1	100	80.031	Danio_rerio
ENSACIG00000020024	fubp1	82	58.537	ENSDNOG00000034565	-	84	52.577	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000020024	fubp1	69	74.330	ENSDORG00000016534	Fubp1	98	70.140	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000020024	fubp1	74	74.128	ENSETEG00000000948	-	58	74.419	Echinops_telfairi
ENSACIG00000020024	fubp1	64	75.926	ENSEBUG00000016143	fubp1	56	49.626	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000020024	fubp1	69	82.770	ENSEEUG00000001287	FUBP1	85	69.450	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000020024	fubp1	100	78.106	ENSELUG00000007990	fubp1	100	79.658	Esox_lucius
ENSACIG00000020024	fubp1	69	74.393	ENSFALG00000005768	FUBP1	97	70.015	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000020024	fubp1	69	73.904	ENSFDAG00000014210	FUBP1	100	70.270	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000020024	fubp1	100	86.342	ENSFHEG00000005230	fubp1	100	87.284	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000020024	fubp1	100	83.043	ENSGMOG00000003370	fubp1	100	82.726	Gadus_morhua
ENSACIG00000020024	fubp1	69	75.551	ENSGALG00000008939	FUBP1	100	71.385	Gallus_gallus
ENSACIG00000020024	fubp1	100	87.422	ENSGAFG00000020972	fubp1	100	88.354	Gambusia_affinis
ENSACIG00000020024	fubp1	100	86.512	ENSGACG00000016563	fubp1	100	87.597	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000020024	fubp1	100	89.160	ENSHBUG00000009835	fubp1	99	95.644	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000020024	fubp1	69	73.904	ENSHGLG00000008415	-	100	72.152	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000020024	fubp1	71	69.481	ENSHGLG00000002808	-	100	62.423	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000020024	fubp1	71	70.130	ENSHGLG00100001414	-	100	62.423	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000020024	fubp1	69	73.904	ENSHGLG00100003417	-	100	69.160	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000020024	fubp1	100	85.362	ENSHCOG00000000910	fubp1	100	86.769	Hippocampus_comes
ENSACIG00000020024	fubp1	100	79.563	ENSIPUG00000009896	fubp1	100	80.187	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000020024	fubp1	69	74.439	ENSSTOG00000014312	FUBP1	100	69.479	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000020024	fubp1	69	74.099	ENSJJAG00000020069	Fubp1	100	70.270	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000020024	fubp1	100	91.401	ENSKMAG00000018897	fubp1	100	91.879	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000020024	fubp1	99	85.522	ENSLBEG00000012700	fubp1	97	86.119	Labrus_bergylta
ENSACIG00000020024	fubp1	97	74.586	ENSLOCG00000003745	fubp1	99	75.110	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000020024	fubp1	69	71.097	ENSLAFG00000003273	FUBP1	99	71.275	Loxodonta_africana
ENSACIG00000020024	fubp1	69	73.684	ENSMFAG00000031825	FUBP1	100	69.278	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000020024	fubp1	69	74.215	ENSMMUG00000002899	FUBP1	100	69.325	Macaca_mulatta
ENSACIG00000020024	fubp1	69	73.684	ENSMNEG00000045212	FUBP1	100	69.325	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000020024	fubp1	99	86.687	ENSMAMG00000007489	fubp1	99	88.048	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000020024	fubp1	100	96.000	ENSMZEG00005024298	fubp1	100	96.000	Maylandia_zebra
ENSACIG00000020024	fubp1	64	76.442	ENSMGAG00000009424	FUBP1	100	71.569	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000020024	fubp1	69	73.904	ENSMAUG00000016428	Fubp1	98	70.946	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000020024	fubp1	69	74.558	ENSMOCG00000014751	Fubp1	100	70.644	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000020024	fubp1	87	93.601	ENSMMOG00000019463	fubp1	99	93.601	Mola_mola
ENSACIG00000020024	fubp1	66	68.610	ENSMODG00000020804	FUBP1	100	64.241	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000020024	fubp1	100	90.895	ENSMALG00000015173	fubp1	100	91.534	Monopterus_albus
ENSACIG00000020024	fubp1	69	74.501	MGP_CAROLIEiJ_G0025740	Fubp1	99	71.619	Mus_caroli
ENSACIG00000020024	fubp1	69	74.279	ENSMUSG00000028034	Fubp1	99	71.429	Mus_musculus
ENSACIG00000020024	fubp1	69	74.336	MGP_PahariEiJ_G0027191	Fubp1	99	71.483	Mus_pahari
ENSACIG00000020024	fubp1	69	74.501	MGP_SPRETEiJ_G0026693	Fubp1	99	71.619	Mus_spretus
ENSACIG00000020024	fubp1	69	70.564	ENSMLUG00000014802	FUBP1	100	66.913	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000020024	fubp1	69	72.109	ENSNGAG00000014302	Fubp1	98	70.270	Nannospalax_galili
ENSACIG00000020024	fubp1	100	89.120	ENSNBRG00000015099	fubp1	100	89.120	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000020024	fubp1	69	71.460	ENSNLEG00000009772	FUBP1	100	67.747	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000020024	fubp1	68	59.821	ENSOPRG00000001175	FUBP1	98	58.552	Ochotona_princeps
ENSACIG00000020024	fubp1	99	51.975	ENSODEG00000003657	-	99	50.555	Octodon_degus
ENSACIG00000020024	fubp1	69	73.904	ENSODEG00000002600	-	100	70.270	Octodon_degus
ENSACIG00000020024	fubp1	99	89.812	ENSONIG00000018381	fubp1	99	89.812	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000020024	fubp1	56	80.170	ENSOANG00000009777	FUBP1	99	66.954	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000020024	fubp1	99	85.144	ENSORLG00000003540	fubp1	99	84.444	Oryzias_latipes
ENSACIG00000020024	fubp1	100	84.043	ENSORLG00020005908	fubp1	99	83.625	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000020024	fubp1	100	86.050	ENSORLG00015008779	fubp1	100	86.185	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000020024	fubp1	100	89.120	ENSOMEG00000021943	fubp1	100	89.120	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000020024	fubp1	69	70.208	ENSOGAG00000014233	FUBP1	100	66.962	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000020024	fubp1	69	73.846	ENSOARG00000013259	FUBP1	100	67.111	Ovis_aries
ENSACIG00000020024	fubp1	69	73.904	ENSPPRG00000000413	FUBP1	100	69.479	Panthera_pardus
ENSACIG00000020024	fubp1	69	73.904	ENSPTIG00000019450	FUBP1	100	69.479	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000020024	fubp1	65	74.171	ENSPSIG00000012965	FUBP1	100	69.094	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000020024	fubp1	99	81.141	ENSPMGG00000009060	fubp1	99	79.873	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000020024	fubp1	69	74.945	ENSPEMG00000021802	Fubp1	100	70.270	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000020024	fubp1	62	55.217	ENSPMAG00000001644	-	93	54.585	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000020024	fubp1	100	87.082	ENSPFOG00000000238	fubp1	100	83.333	Poecilia_formosa
ENSACIG00000020024	fubp1	100	85.827	ENSPLAG00000021170	fubp1	100	85.604	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000020024	fubp1	99	90.224	ENSPMEG00000004747	fubp1	99	90.224	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000020024	fubp1	99	86.772	ENSPREG00000017911	fubp1	99	92.683	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000020024	fubp1	71	73.176	ENSPPYG00000001219	-	68	76.159	Pongo_abelii
ENSACIG00000020024	fubp1	69	73.846	ENSPCAG00000012617	FUBP1	98	69.385	Procavia_capensis
ENSACIG00000020024	fubp1	69	74.222	ENSPCOG00000024974	FUBP1	100	69.479	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000020024	fubp1	69	69.079	ENSPVAG00000014637	FUBP1	98	65.899	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000020024	fubp1	100	90.394	ENSPNYG00000004552	fubp1	100	90.394	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000020024	fubp1	100	79.514	ENSPNAG00000016207	fubp1	100	81.818	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000020024	fubp1	69	74.444	ENSRNOG00000043370	Fubp1	100	69.646	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000020024	fubp1	69	73.684	ENSRBIG00000042950	FUBP1	100	69.325	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000020024	fubp1	69	73.684	ENSRROG00000043534	FUBP1	100	69.325	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000020024	fubp1	69	73.904	ENSSBOG00000027299	FUBP1	98	72.015	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000020024	fubp1	64	72.922	ENSSHAG00000005367	FUBP1	99	71.949	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000020024	fubp1	99	78.855	ENSSFOG00015010213	fubp1	99	78.462	Scleropages_formosus
ENSACIG00000020024	fubp1	100	84.172	ENSSMAG00000012029	fubp1	98	84.172	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000020024	fubp1	100	89.474	ENSSDUG00000007383	fubp1	100	88.801	Seriola_dumerili
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