EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000020062 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpl17
Alias: fa91a06|wu:fa91a06|wu:fa99c06|zgc:65996
Full Name: ribosomal protein L17
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7009 bases
Position: chrCCOE01000717.1:239763-246771
Accession: ZDB-GENE-030131-8585
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000025970	Ribosomal_L22	PF00237.19	8.2e-42	1	1
ENSACIP00000025947	Ribosomal_L22	PF00237.19	2e-41	1	1
ENSACIP00000025958	Ribosomal_L22	PF00237.19	6.1e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000026630	-	435	-	ENSACIP00000025947	145 (aa)	-	-
ENSACIT00000026640	-	444	-	ENSACIP00000025958	147 (aa)	-	-
ENSACIT00000026652	-	567	-	ENSACIP00000025970	188 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000020062	rpl17	98	94.406	ENSG00000215472	RPL17-C18orf32	90	85.455	Homo_sapiens
ENSACIG00000020062	rpl17	98	94.406	ENSG00000265681	RPL17	100	94.203	Homo_sapiens
ENSACIG00000020062	rpl17	98	97.902	ENSAPOG00000018953	rpl17	90	88.485	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020062	rpl17	98	79.720	ENSAMEG00000018893	-	90	72.727	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000020062	rpl17	99	94.483	ENSAMEG00000009498	RPL17	88	85.455	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000020062	rpl17	98	66.434	ENSAMEG00000009513	-	78	66.434	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000020062	rpl17	98	65.035	ENSAMEG00000004612	-	80	63.158	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000020062	rpl17	100	68.707	ENSAMEG00000005035	-	86	66.265	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000020062	rpl17	72	79.048	ENSAMEG00000010993	-	87	79.528	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000020062	rpl17	98	97.902	ENSAOCG00000014751	rpl17	70	94.839	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020062	rpl17	99	97.931	ENSAPEG00000024012	rpl17	90	88.485	Amphiprion_percula
ENSACIG00000020062	rpl17	98	97.203	ENSATEG00000023387	rpl17	90	87.879	Anabas_testudineus
ENSACIG00000020062	rpl17	99	94.444	ENSAPLG00000008451	-	88	86.061	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000020062	rpl17	98	88.811	ENSANAG00000008692	-	82	87.333	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000020062	rpl17	98	82.517	ENSANAG00000028566	-	89	76.364	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000020062	rpl17	98	90.210	ENSANAG00000019389	-	90	81.818	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000020062	rpl17	98	74.126	ENSANAG00000032131	-	88	67.879	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000020062	rpl17	98	82.517	ENSANAG00000020029	-	87	75.152	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000020062	rpl17	98	94.406	ENSANAG00000038237	RPL17	87	91.447	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000020062	rpl17	98	80.420	ENSANAG00000026004	-	89	73.939	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000020062	rpl17	98	99.301	ENSACLG00000009583	rpl17	75	95.745	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000020062	rpl17	99	95.139	ENSAMXG00000001082	rpl17	77	92.754	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000020062	rpl17	98	95.105	ENSBTAG00000022902	-	96	86.061	Bos_taurus
ENSACIG00000020062	rpl17	70	77.228	ENSBTAG00000032382	-	86	76.033	Bos_taurus
ENSACIG00000020062	rpl17	98	91.608	ENSBTAG00000024839	-	90	83.030	Bos_taurus
ENSACIG00000020062	rpl17	92	78.358	ENSBTAG00000000425	-	86	77.922	Bos_taurus
ENSACIG00000020062	rpl17	98	88.112	ENSBTAG00000030199	-	87	78.788	Bos_taurus
ENSACIG00000020062	rpl17	92	82.090	ENSBTAG00000025764	-	85	80.921	Bos_taurus
ENSACIG00000020062	rpl17	98	68.531	ENSBTAG00000053051	-	56	69.595	Bos_taurus
ENSACIG00000020062	rpl17	98	90.909	ENSBTAG00000034973	-	90	82.424	Bos_taurus
ENSACIG00000020062	rpl17	99	90.972	ENSBTAG00000030941	-	90	81.212	Bos_taurus
ENSACIG00000020062	rpl17	90	85.385	ENSBTAG00000030490	-	89	81.410	Bos_taurus
ENSACIG00000020062	rpl17	98	89.510	ENSBTAG00000027015	-	86	81.212	Bos_taurus
ENSACIG00000020062	rpl17	97	68.310	WBGene00004429	rpl-17	81	64.474	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000020062	rpl17	98	94.406	ENSCJAG00000041339	-	90	85.455	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000020062	rpl17	98	88.811	ENSCJAG00000012969	-	85	88.079	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000020062	rpl17	98	94.406	ENSCJAG00000004779	RPL17	96	85.455	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000020062	rpl17	98	93.706	ENSCJAG00000043620	-	90	84.848	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000020062	rpl17	97	72.340	ENSCAFG00000003489	-	90	70.000	Canis_familiaris
ENSACIG00000020062	rpl17	98	93.007	ENSCAFG00000008273	-	90	84.242	Canis_familiaris
ENSACIG00000020062	rpl17	99	72.028	ENSCAFG00000016420	-	98	70.455	Canis_familiaris
ENSACIG00000020062	rpl17	98	85.315	ENSCAFG00000030361	-	82	84.000	Canis_familiaris
ENSACIG00000020062	rpl17	98	93.007	ENSCAFG00000007572	-	82	91.333	Canis_familiaris
ENSACIG00000020062	rpl17	99	89.655	ENSCAFG00000003241	-	80	87.097	Canis_familiaris
ENSACIG00000020062	rpl17	96	70.000	ENSCAFG00000001059	-	93	66.265	Canis_familiaris
ENSACIG00000020062	rpl17	98	92.308	ENSCAFG00000028960	-	90	83.636	Canis_familiaris
ENSACIG00000020062	rpl17	72	64.151	ENSCAFG00000008592	-	100	64.151	Canis_familiaris
ENSACIG00000020062	rpl17	98	90.210	ENSCAFG00000009852	-	90	82.424	Canis_familiaris
ENSACIG00000020062	rpl17	98	62.937	ENSCAFG00000014751	-	89	57.927	Canis_familiaris
ENSACIG00000020062	rpl17	98	86.014	ENSCAFG00000008290	-	90	78.182	Canis_familiaris
ENSACIG00000020062	rpl17	98	94.406	ENSCAFG00000019044	RPL17	90	85.455	Canis_familiaris
ENSACIG00000020062	rpl17	88	94.488	ENSCAFG00020008186	-	88	91.946	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000020062	rpl17	98	93.007	ENSCAFG00020002362	-	90	83.636	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000020062	rpl17	90	92.308	ENSCAFG00020009916	-	89	87.975	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000020062	rpl17	98	88.811	ENSCAFG00020020767	-	90	81.212	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000020062	rpl17	72	90.476	ENSCAFG00020011340	-	88	90.476	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000020062	rpl17	88	89.062	ENSCAFG00020026995	-	89	85.806	Canis_lupus_dingo
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ENSACIG00000020062	rpl17	98	94.406	ENSCAFG00020026471	RPL17-C18orf32	78	91.447	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000020062	rpl17	98	92.308	ENSCAFG00020003786	-	90	83.636	Canis_lupus_dingo
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ENSACIG00000020062	rpl17	64	84.946	ENSCHIG00000018629	-	75	76.147	Capra_hircus
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ENSACIG00000020062	rpl17	61	78.070	ENSTSYG00000027387	-	85	78.070	Carlito_syrichta
ENSACIG00000020062	rpl17	97	89.437	ENSTSYG00000036299	-	89	81.212	Carlito_syrichta
ENSACIG00000020062	rpl17	98	80.420	ENSTSYG00000026297	-	95	74.545	Carlito_syrichta
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ENSACIG00000020062	rpl17	98	94.406	ENSTSYG00000007402	RPL17	90	85.455	Carlito_syrichta
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ENSACIG00000020062	rpl17	70	94.059	ENSCAPG00000000001	-	84	91.057	Cavia_aperea
ENSACIG00000020062	rpl17	98	54.545	ENSCAPG00000009609	-	88	52.795	Cavia_aperea
ENSACIG00000020062	rpl17	91	68.182	ENSCPOG00000034555	-	86	67.320	Cavia_porcellus
ENSACIG00000020062	rpl17	98	95.105	ENSCPOG00000019337	-	90	86.061	Cavia_porcellus
ENSACIG00000020062	rpl17	70	94.059	ENSCPOG00000023476	-	84	91.057	Cavia_porcellus
ENSACIG00000020062	rpl17	96	69.286	ENSCPOG00000037176	-	82	65.789	Cavia_porcellus
ENSACIG00000020062	rpl17	98	92.308	ENSCCAG00000020468	-	90	84.848	Cebus_capucinus
ENSACIG00000020062	rpl17	90	90.076	ENSCCAG00000026040	-	77	90.076	Cebus_capucinus
ENSACIG00000020062	rpl17	98	94.406	ENSCCAG00000024026	RPL17	87	91.447	Cebus_capucinus
ENSACIG00000020062	rpl17	98	86.713	ENSCCAG00000032514	-	70	83.553	Cebus_capucinus
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ENSACIG00000020062	rpl17	98	87.413	ENSCATG00000040284	-	89	80.606	Cercocebus_atys
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ENSACIG00000020062	rpl17	98	99.301	ENSONIG00000012509	rpl17	100	88.043	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000020062	rpl17	98	95.105	ENSOANG00000002910	-	90	86.061	Ornithorhynchus_anatinus
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ENSACIG00000020062	rpl17	98	93.706	ENSOCUG00000024676	-	90	84.848	Oryctolagus_cuniculus
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