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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000020091 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6011 bases
Position: chrCCOE01000390.1:9270-15280
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000026092	RRM_1	PF00076.22	1.6e-31	1	2
ENSACIP00000026092	RRM_1	PF00076.22	1.6e-31	2	2
ENSACIP00000026058	RRM_1	PF00076.22	2e-31	1	2
ENSACIP00000026058	RRM_1	PF00076.22	2e-31	2	2
ENSACIP00000026101	RRM_1	PF00076.22	7.9e-19	1	1
ENSACIP00000026108	RRM_1	PF00076.22	6.6e-17	1	1
ENSACIP00000026058	RRM_3	PF08777.11	1.7e-07	1	1
ENSACIP00000026092	RRM_3	PF08777.11	1.8e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000026788	-	402	-	ENSACIP00000026101	133 (aa)	-	-
ENSACIT00000026779	-	906	-	ENSACIP00000026092	301 (aa)	-	-
ENSACIT00000026745	-	978	-	ENSACIP00000026058	325 (aa)	-	-
ENSACIT00000026795	-	312	-	ENSACIP00000026108	103 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000020091	-	59	35.484	ENSACIG00000001335	-	52	35.484
ENSACIG00000020091	-	71	42.105	ENSACIG00000016419	-	67	39.252
ENSACIG00000020091	-	92	40.404	ENSACIG00000009890	srsf7b	73	40.404
ENSACIG00000020091	-	95	68.504	ENSACIG00000018649	srsf4	90	74.797
ENSACIG00000020091	-	66	30.263	ENSACIG00000016116	cirbpa	56	33.673
ENSACIG00000020091	-	94	36.154	ENSACIG00000015765	srsf9	80	40.265
ENSACIG00000020091	-	94	62.016	ENSACIG00000011892	srsf5a	94	62.879
ENSACIG00000020091	-	94	62.500	ENSACIG00000010742	srsf5b	98	53.311
ENSACIG00000020091	-	94	38.168	ENSACIG00000008091	srsf1a	94	39.316
ENSACIG00000020091	-	94	37.405	ENSACIG00000002623	-	85	44.379
ENSACIG00000020091	-	93	82.258	ENSACIG00000023658	-	66	79.724
ENSACIG00000020091	-	75	43.750	ENSACIG00000004885	srsf7a	52	43.750

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	ENSG00000124193	SRSF6	97	60.290	Homo_sapiens
ENSACIG00000020091	-	95	80.303	ENSAPOG00000016635	-	84	81.618	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020091	-	95	60.156	ENSAMEG00000003710	SRSF6	76	57.895	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000020091	-	74	93.421	ENSAOCG00000019438	-	77	86.364	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020091	-	95	91.339	ENSAOCG00000004309	-	100	86.769	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020091	-	95	90.076	ENSAPEG00000020746	-	100	77.199	Amphiprion_percula
ENSACIG00000020091	-	95	83.721	ENSAPEG00000013086	-	68	74.790	Amphiprion_percula
ENSACIG00000020091	-	95	90.551	ENSATEG00000007255	-	95	77.955	Anabas_testudineus
ENSACIG00000020091	-	68	72.826	ENSAPLG00000014472	SRSF6	92	61.168	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000020091	-	95	78.740	ENSACAG00000002061	SRSF6	71	74.297	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	ENSANAG00000024080	SRSF6	94	62.462	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000020091	-	82	97.619	ENSACLG00000024373	-	91	97.674	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000020091	-	95	80.916	ENSAMXG00000003101	-	60	77.778	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000020091	-	95	80.000	ENSAMXG00000042692	-	96	82.222	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000020091	-	95	81.102	ENSBTAG00000008527	SRSF6	63	88.235	Bos_taurus
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	ENSCJAG00000048403	SRSF6	80	77.130	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000020091	-	95	81.102	ENSCAFG00000009289	SRSF6	63	88.235	Canis_familiaris
ENSACIG00000020091	-	95	81.102	ENSCAFG00020013559	SRSF6	63	88.235	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000020091	-	95	81.102	ENSCHIG00000015890	-	63	88.235	Capra_hircus
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	ENSCHIG00000009148	-	76	71.103	Capra_hircus
ENSACIG00000020091	-	95	50.394	ENSTSYG00000026476	SRSF6	100	50.872	Carlito_syrichta
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	ENSCPOG00000011761	SRSF6	63	87.059	Cavia_porcellus
ENSACIG00000020091	-	95	68.462	ENSCCAG00000018540	-	97	57.912	Cebus_capucinus
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	ENSCCAG00000026018	-	94	62.462	Cebus_capucinus
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	ENSCATG00000030794	SRSF6	95	63.746	Cercocebus_atys
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	ENSCLAG00000010247	SRSF6	63	87.059	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	ENSCSAG00000014022	SRSF6	95	63.746	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000020091	-	95	49.606	ENSCHOG00000000561	SRSF6	54	88.889	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000020091	-	95	77.692	ENSCPBG00000018200	SRSF6	73	73.622	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000020091	-	95	50.394	ENSCANG00000042529	-	64	55.417	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000020091	-	95	79.528	ENSCANG00000037774	-	69	71.074	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	ENSCGRG00001022339	Srsf6	63	87.059	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000020091	-	95	77.953	ENSCSEG00000019778	SRSF6	90	82.927	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000020091	-	95	78.740	ENSCVAG00000001863	SRSF6	95	84.553	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000020091	-	95	81.679	ENSDARG00000016783	srsf6b	92	88.506	Danio_rerio
ENSACIG00000020091	-	95	71.654	ENSDARG00000013729	srsf6a	78	62.162	Danio_rerio
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	ENSDNOG00000008410	SRSF6	97	59.942	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	ENSDORG00000028378	Srsf6	63	87.059	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000020091	-	95	75.397	ENSETEG00000006221	SRSF6	100	61.671	Echinops_telfairi
ENSACIG00000020091	-	95	81.102	ENSEASG00005023429	SRSF6	80	69.455	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000020091	-	95	81.102	ENSECAG00000023932	SRSF6	88	65.789	Equus_caballus
ENSACIG00000020091	-	95	83.846	ENSELUG00000024182	SRSF6	86	89.773	Esox_lucius
ENSACIG00000020091	-	95	82.677	ENSELUG00000013506	SRSF6	95	75.175	Esox_lucius
ENSACIG00000020091	-	95	81.102	ENSFCAG00000032814	SRSF6	76	67.925	Felis_catus
ENSACIG00000020091	-	95	50.394	ENSFDAG00000012191	SRSF6	68	54.510	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000020091	-	95	81.890	ENSFHEG00000023065	srsf6a	74	73.092	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000020091	-	95	70.866	ENSGMOG00000006105	srsf6a	94	56.338	Gadus_morhua
ENSACIG00000020091	-	95	83.465	ENSGMOG00000014458	srsf6a	99	59.511	Gadus_morhua
ENSACIG00000020091	-	95	79.389	ENSGALG00000000990	SRSF6	94	64.438	Gallus_gallus
ENSACIG00000020091	-	92	79.200	ENSGAFG00000019088	-	72	80.800	Gambusia_affinis
ENSACIG00000020091	-	95	81.395	ENSGACG00000006084	srsf6a	100	60.969	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000020091	-	95	77.692	ENSGAGG00000003238	SRSF6	73	73.622	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	ENSGGOG00000009808	SRSF6	97	60.290	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000020091	-	100	87.077	ENSHBUG00000006386	-	100	84.615	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000020091	-	95	59.690	ENSHGLG00000007701	-	56	64.865	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	ENSHGLG00000007348	SRSF6	63	87.059	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000020091	-	95	50.394	ENSHGLG00100005043	SRSF6	68	54.510	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000020091	-	95	76.378	ENSHCOG00000002740	srsf6a	75	72.727	Hippocampus_comes
ENSACIG00000020091	-	95	81.890	ENSIPUG00000004776	-	76	75.664	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000020091	-	88	77.778	ENSIPUG00000016856	SRSF6	61	77.934	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	ENSSTOG00000010866	SRSF6	63	87.059	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000020091	-	95	77.165	ENSKMAG00000011934	srsf6a	71	77.027	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000020091	-	95	81.395	ENSLBEG00000007356	srsf6a	70	74.000	Labrus_bergylta
ENSACIG00000020091	-	95	81.102	ENSLACG00000005466	SRSF6	71	73.770	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	ENSMFAG00000036925	SRSF6	95	63.746	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	ENSMMUG00000006742	SRSF6	95	63.746	Macaca_mulatta
ENSACIG00000020091	-	95	79.528	ENSMNEG00000038270	-	67	72.574	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000020091	-	95	79.528	ENSMNEG00000027392	-	95	63.444	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000020091	-	82	97.619	ENSMAMG00000023477	-	90	97.619	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000020091	-	95	83.721	ENSMAMG00000017161	srsf6a	71	77.600	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000020091	-	100	88.923	ENSMZEG00005008032	-	100	88.000	Maylandia_zebra
ENSACIG00000020091	-	95	77.165	ENSMZEG00005020658	-	75	73.451	Maylandia_zebra
ENSACIG00000020091	-	81	87.059	ENSMAUG00000019086	-	63	87.059	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	ENSMICG00000008537	SRSF6	63	87.059	Microcebus_murinus
ENSACIG00000020091	-	74	92.105	ENSMMOG00000015241	-	82	85.227	Mola_mola
ENSACIG00000020091	-	95	78.906	ENSMODG00000003107	SRSF6	91	66.026	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000020091	-	95	73.228	ENSMALG00000003702	srsf6a	61	65.587	Monopterus_albus
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	MGP_CAROLIEiJ_G0024606	Srsf6	63	87.059	Mus_caroli
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	ENSMUSG00000016921	Srsf6	63	87.059	Mus_musculus
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	MGP_PahariEiJ_G0026050	Srsf6	96	63.746	Mus_pahari
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	MGP_SPRETEiJ_G0025528	Srsf6	63	87.059	Mus_spretus
ENSACIG00000020091	-	95	81.102	ENSMPUG00000017692	SRSF6	76	77.578	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000020091	-	95	48.889	ENSMLUG00000016618	SRSF6	92	52.174	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	ENSNGAG00000017560	Srsf6	63	87.059	Nannospalax_galili
ENSACIG00000020091	-	95	91.339	ENSNBRG00000014709	-	100	85.231	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000020091	-	95	82.946	ENSNBRG00000001846	-	77	68.364	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	ENSNLEG00000006524	SRSF6	97	60.290	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000020091	-	95	78.906	ENSMEUG00000014615	SRSF6	72	77.130	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000020091	-	81	87.059	ENSODEG00000016510	-	63	87.059	Octodon_degus
ENSACIG00000020091	-	95	92.126	ENSONIG00000020247	-	100	82.709	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000020091	-	95	83.721	ENSONIG00000001925	-	71	75.197	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000020091	-	95	57.463	ENSOCUG00000009785	-	88	58.088	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000020091	-	93	45.968	ENSOCUG00000023999	-	89	48.444	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000020091	-	95	70.079	ENSORLG00000003530	srsf6a	71	60.606	Oryzias_latipes
ENSACIG00000020091	-	99	75.000	ENSORLG00020017506	srsf6a	90	70.861	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000020091	-	95	69.291	ENSORLG00015009410	srsf6a	57	70.136	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000020091	-	95	67.717	ENSOMEG00000006001	srsf6a	61	63.559	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000020091	-	95	80.315	ENSOGAG00000014468	SRSF6	76	72.031	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000020091	-	95	77.165	ENSOARG00000003117	SRSF6	76	68.702	Ovis_aries
ENSACIG00000020091	-	95	68.504	ENSPPAG00000043131	-	69	68.161	Pan_paniscus
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ENSACIG00000020091	-	95	78.906	ENSSHAG00000012805	SRSF6	74	73.016	Sarcophilus_harrisii
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ENSACIG00000020091	-	95	85.827	ENSSMAG00000017447	-	81	76.779	Scophthalmus_maximus
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ENSACIG00000020091	-	95	80.315	ENSSPUG00000004967	SRSF6	94	63.438	Sphenodon_punctatus
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ENSACIG00000020091	-	95	81.102	ENSUAMG00000003559	SRSF6	63	88.235	Ursus_americanus
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ENSACIG00000020091	-	95	81.890	ENSXMAG00000021849	srsf6a	73	73.171	Xiphophorus_maculatus