EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000020225 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3970 bases
Position: chrCCOE01000375.1:160288-164257
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000026095	MMR_HSR1	PF01926.23	3.8e-08	1	1

Transcripts

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ENSACIT00000026782	-	867	-	ENSACIP00000026095	288 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000020225	-	75	45.701	ENSACIG00000023381	-	80	46.117
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ENSACIG00000020225	-	65	31.443	ENSACIG00000009811	-	81	31.443
ENSACIG00000020225	-	71	49.275	ENSACIG00000000893	-	81	49.751
ENSACIG00000020225	-	55	45.783	ENSACIG00000012204	-	70	45.783
ENSACIG00000020225	-	69	44.976	ENSACIG00000014662	-	83	44.976
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ENSACIG00000020225	-	72	43.662	ENSACIG00000014655	-	76	44.390
ENSACIG00000020225	-	70	36.364	ENSACIG00000005573	-	88	36.364
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ENSACIG00000020225	-	73	46.262	ENSACIG00000008001	-	86	48.241
ENSACIG00000020225	-	59	35.795	ENSACIG00000003050	-	76	35.795
ENSACIG00000020225	-	56	47.879	ENSACIG00000000631	-	57	47.879
ENSACIG00000020225	-	81	47.479	ENSACIG00000002263	-	73	48.276
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ENSACIG00000020225	-	69	47.059	ENSACIG00000019524	-	85	47.059
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ENSACIG00000020225	-	72	45.714	ENSACIG00000014690	-	77	46.535
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ENSACIG00000020225	-	65	44.041	ENSACIG00000001596	-	76	44.041
ENSACIG00000020225	-	60	35.519	ENSACIG00000014737	-	84	35.519
ENSACIG00000020225	-	72	58.491	ENSACIG00000020244	-	85	59.500
ENSACIG00000020225	-	66	47.150	ENSACIG00000007158	-	60	47.739
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ENSACIG00000020225	-	68	33.171	ENSACIG00000007725	-	74	33.171
ENSACIG00000020225	-	79	44.672	ENSACIG00000022355	-	69	49.010
ENSACIG00000020225	-	84	43.426	ENSACIG00000004040	-	78	48.241
ENSACIG00000020225	-	68	46.040	ENSACIG00000014703	-	83	46.040
ENSACIG00000020225	-	63	36.364	ENSACIG00000014670	-	72	36.364
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ENSACIG00000020225	-	68	45.320	ENSACIG00000014745	-	91	45.320
ENSACIG00000020225	-	75	38.326	ENSACIG00000012159	-	50	40.933
ENSACIG00000020225	-	86	43.426	ENSACIG00000001070	-	73	46.569

Orthologs

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ENSACIG00000020225	-	72	50.718	ENSAPOG00000007322	-	69	52.239	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020225	-	78	46.725	ENSAPOG00000012716	-	67	48.259	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020225	-	71	49.038	ENSAPOG00000006488	-	78	48.259	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020225	-	67	76.684	ENSAPOG00000022240	-	57	76.684	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020225	-	70	42.718	ENSAPOG00000020897	-	76	43.284	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020225	-	80	36.863	ENSAPOG00000001315	-	62	39.024	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020225	-	70	48.039	ENSAPOG00000011509	-	67	47.208	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020225	-	77	91.480	ENSAPOG00000007333	-	67	91.556	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSACIG00000020225	-	71	43.662	ENSAPOG00000014243	-	81	45.500	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020225	-	73	45.946	ENSAPOG00000014759	-	67	47.264	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020225	-	63	47.826	ENSAPOG00000001262	-	88	47.826	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020225	-	71	49.038	ENSAPOG00000006169	-	56	48.259	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020225	-	72	44.700	ENSAPOG00000008344	zgc:113625	71	46.569	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020225	-	83	43.621	ENSAPOG00000008063	-	65	46.305	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020225	-	72	49.761	ENSAOCG00000011167	-	67	51.244	Amphiprion_ocellaris
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ENSACIG00000020225	-	74	45.982	ENSAOCG00000021905	-	61	47.291	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020225	-	68	57.214	ENSAOCG00000012651	-	84	57.214	Amphiprion_ocellaris
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ENSACIG00000020225	-	78	43.750	ENSAOCG00000001993	-	76	47.739	Amphiprion_ocellaris
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ENSACIG00000020225	-	78	43.038	ENSAOCG00000008522	-	71	45.370	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020225	-	77	45.259	ENSAOCG00000008525	-	61	46.411	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020225	-	80	36.111	ENSAOCG00000011794	-	60	40.099	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020225	-	78	44.298	ENSAOCG00000023240	-	74	46.766	Amphiprion_ocellaris
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ENSACIG00000020225	-	75	47.297	ENSATEG00000019003	-	76	48.259	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000020225	-	89	41.091	ENSATEG00000013008	-	69	47.783	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000020225	-	78	45.148	ENSATEG00000014028	-	74	47.904	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000020225	-	67	40.609	ENSATEG00000016536	-	59	40.609	Anabas_testudineus
ENSACIG00000020225	-	82	44.958	ENSATEG00000014013	si:ch211-113e8.5	75	49.749	Anabas_testudineus
ENSACIG00000020225	-	68	55.276	ENSATEG00000017202	-	54	56.436	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000020225	-	69	43.842	ENSACLG00000023760	-	83	44.221	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000020225	-	65	48.187	ENSACLG00000003401	-	79	48.187	Astatotilapia_calliptera
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