EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000020234 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1623 bases
Position: chrCCOE01000375.1:167253-168875
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000026105	MMR_HSR1	PF01926.23	6.2e-10	1	1

Transcripts

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ENSACIT00000026792	-	849	-	ENSACIP00000026105	282 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000020234	-	70	44.554	ENSACIG00000019149	-	61	45.050
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ENSACIG00000020234	-	70	43.216	ENSACIG00000012714	-	66	43.216
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ENSACIG00000020234	-	72	45.455	ENSACIG00000016635	-	79	45.455
ENSACIG00000020234	-	71	42.365	ENSACIG00000007191	-	57	42.365
ENSACIG00000020234	-	72	49.275	ENSACIG00000023381	-	81	49.275
ENSACIG00000020234	-	71	36.967	ENSACIG00000005587	-	73	36.967
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ENSACIG00000020234	-	73	35.648	ENSACIG00000012061	-	79	32.714
ENSACIG00000020234	-	72	44.444	ENSACIG00000022355	-	71	44.444
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ENSACIG00000020234	-	72	45.320	ENSACIG00000008001	-	88	45.320
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ENSACIG00000020234	-	71	47.525	ENSACIG00000014690	-	78	47.525
ENSACIG00000020234	-	56	44.172	ENSACIG00000012761	-	71	44.172
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ENSACIG00000020234	-	76	42.009	ENSACIG00000006478	-	81	42.009
ENSACIG00000020234	-	72	44.118	ENSACIG00000007466	-	62	44.118
ENSACIG00000020234	-	70	48.485	ENSACIG00000004040	-	78	48.485
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ENSACIG00000020234	-	71	46.535	ENSACIG00000014745	-	91	46.535
ENSACIG00000020234	-	72	46.078	ENSACIG00000016888	-	67	46.078
ENSACIG00000020234	-	66	44.444	ENSACIG00000007178	-	66	44.444
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ENSACIG00000020234	-	71	52.736	ENSACIG00000020225	-	69	52.709
ENSACIG00000020234	-	73	43.750	ENSACIG00000016502	-	89	43.750
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ENSACIG00000020234	-	61	33.702	ENSACIG00000014737	-	84	33.702
ENSACIG00000020234	-	64	32.787	ENSACIG00000014670	-	71	32.787
ENSACIG00000020234	-	70	47.475	ENSACIG00000000893	-	80	47.475
ENSACIG00000020234	-	66	43.617	ENSACIG00000015088	-	75	43.617
ENSACIG00000020234	-	72	45.366	ENSACIG00000022362	-	73	45.366
ENSACIG00000020234	-	72	49.261	ENSACIG00000022366	-	73	49.261
ENSACIG00000020234	-	72	45.146	ENSACIG00000014703	-	85	45.146
ENSACIG00000020234	-	68	45.833	ENSACIG00000007158	-	60	45.833

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000020234	-	72	48.780	ENSAPOG00000007322	-	82	46.444	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020234	-	75	42.453	ENSAPOG00000014759	-	71	42.453	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020234	-	72	43.750	ENSAPOG00000008344	zgc:113625	73	43.750	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020234	-	71	46.535	ENSAPOG00000012716	-	68	46.535	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020234	-	71	52.941	ENSAPOG00000007333	-	59	52.913	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020234	-	71	47.500	ENSAPOG00000006488	-	78	47.500	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020234	-	72	48.039	ENSAPOG00000008063	-	65	48.039	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020234	-	70	47.449	ENSAPOG00000011509	-	67	47.449	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020234	-	72	47.525	ENSAPOG00000006169	-	56	47.525	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020234	-	70	43.842	ENSAPOG00000014243	-	83	43.842	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020234	-	69	51.531	ENSAPOG00000022240	-	57	51.531	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020234	-	72	46.569	ENSAPOG00000021159	-	66	46.569	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020234	-	71	41.872	ENSAPOG00000001315	-	62	41.872	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020234	-	68	43.750	ENSAPOG00000001262	-	92	43.750	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020234	-	75	38.389	ENSAPOG00000001268	-	52	38.389	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020234	-	71	45.226	ENSAPOG00000020897	-	76	45.226	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSACIG00000020234	-	72	38.835	ENSAOCG00000011794	-	62	38.835	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020234	-	71	47.500	ENSAOCG00000023255	-	71	47.500	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020234	-	75	47.393	ENSAOCG00000014702	-	70	47.393	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020234	-	72	43.350	ENSAOCG00000001993	-	86	41.518	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020234	-	72	45.545	ENSAOCG00000008525	-	59	45.545	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020234	-	71	48.000	ENSAOCG00000008522	-	66	48.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020234	-	75	42.453	ENSAOCG00000021905	-	64	42.453	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020234	-	50	60.993	ENSAOCG00000011143	-	81	60.993	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020234	-	72	45.545	ENSAOCG00000023240	-	75	45.545	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020234	-	72	48.293	ENSAOCG00000011167	-	80	45.041	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020234	-	72	38.835	ENSAPEG00000000770	-	62	38.835	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000020234	-	73	46.154	ENSATEG00000017198	-	81	42.678	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000020234	-	73	46.117	ENSACLG00000001976	-	72	46.117	Astatotilapia_calliptera
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