EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000020244 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3784 bases
Position: chrCCOE01000375.1:180512-184295
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000026114	MMR_HSR1	PF01926.23	2e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000026801	-	708	-	ENSACIP00000026114	235 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000020244	-	67	44.586	ENSACIG00000000976	-	78	44.586
ENSACIG00000020244	-	84	44.221	ENSACIG00000012707	-	75	44.221
ENSACIG00000020244	-	99	44.958	ENSACIG00000016635	-	89	44.958
ENSACIG00000020244	-	77	37.363	ENSACIG00000014670	-	70	37.363
ENSACIG00000020244	-	85	32.195	ENSACIG00000007725	-	74	32.195
ENSACIG00000020244	-	90	39.720	ENSACIG00000016313	-	67	39.720
ENSACIG00000020244	-	87	37.864	ENSACIG00000016502	-	88	37.864
ENSACIG00000020244	-	75	36.066	ENSACIG00000014737	-	84	36.066
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ENSACIG00000020244	-	80	43.085	ENSACIG00000015088	-	74	43.085
ENSACIG00000020244	-	88	44.019	ENSACIG00000014680	-	90	44.019
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ENSACIG00000020244	-	90	45.833	ENSACIG00000012648	-	72	45.833
ENSACIG00000020244	-	63	38.065	ENSACIG00000014730	zgc:172131	78	38.065
ENSACIG00000020244	-	69	45.062	ENSACIG00000000631	-	72	37.915
ENSACIG00000020244	-	89	49.057	ENSACIG00000001455	-	77	49.057
ENSACIG00000020244	-	85	59.500	ENSACIG00000020225	-	72	58.491
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ENSACIG00000020244	-	90	45.327	ENSACIG00000022222	-	67	45.327
ENSACIG00000020244	-	74	35.326	ENSACIG00000003050	-	77	35.326
ENSACIG00000020244	-	88	43.541	ENSACIG00000014655	-	78	43.541
ENSACIG00000020244	-	99	40.650	ENSACIG00000001070	-	88	40.650
ENSACIG00000020244	-	85	45.813	ENSACIG00000019524	-	84	45.813
ENSACIG00000020244	-	84	36.538	ENSACIG00000012061	-	61	36.538
ENSACIG00000020244	-	92	42.202	ENSACIG00000006503	-	64	43.478
ENSACIG00000020244	-	52	43.089	ENSACIG00000001465	-	74	43.089
ENSACIG00000020244	-	90	41.270	ENSACIG00000000893	-	79	46.970
ENSACIG00000020244	-	89	37.727	ENSACIG00000005587	-	76	37.727
ENSACIG00000020244	-	80	33.846	ENSACIG00000009811	-	79	33.846
ENSACIG00000020244	-	89	42.381	ENSACIG00000012718	-	88	42.381
ENSACIG00000020244	-	90	44.344	ENSACIG00000012714	-	73	44.344
ENSACIG00000020244	-	86	46.829	ENSACIG00000014662	-	83	46.829
ENSACIG00000020244	-	94	45.495	ENSACIG00000023381	-	86	45.495
ENSACIG00000020244	-	84	44.776	ENSACIG00000014703	-	82	44.776
ENSACIG00000020244	-	90	48.585	ENSACIG00000004040	-	83	48.585
ENSACIG00000020244	-	70	42.604	ENSACIG00000012204	-	72	42.604
ENSACIG00000020244	-	90	41.589	ENSACIG00000007191	-	60	41.589
ENSACIG00000020244	-	90	43.662	ENSACIG00000004245	-	74	43.662
ENSACIG00000020244	-	87	51.208	ENSACIG00000002263	-	74	51.208
ENSACIG00000020244	-	89	35.111	ENSACIG00000005573	-	89	35.111
ENSACIG00000020244	-	75	37.222	ENSACIG00000019509	-	81	37.222
ENSACIG00000020244	-	87	48.544	ENSACIG00000022370	-	73	48.544
ENSACIG00000020244	-	87	49.515	ENSACIG00000022377	-	74	49.515
ENSACIG00000020244	-	66	42.767	ENSACIG00000022374	-	81	42.767
ENSACIG00000020244	-	87	42.995	ENSACIG00000007494	-	67	43.961
ENSACIG00000020244	-	85	71.500	ENSACIG00000020234	-	70	71.500
ENSACIG00000020244	-	86	43.902	ENSACIG00000014646	zgc:113625	79	43.902
ENSACIG00000020244	-	90	43.256	ENSACIG00000006484	-	65	43.256
ENSACIG00000020244	-	97	42.798	ENSACIG00000016888	-	79	42.798
ENSACIG00000020244	-	87	45.854	ENSACIG00000008001	-	88	45.854
ENSACIG00000020244	-	78	45.699	ENSACIG00000007178	-	64	45.699
ENSACIG00000020244	-	83	30.244	ENSACIG00000003906	-	65	30.244
ENSACIG00000020244	-	88	44.286	ENSACIG00000007466	-	63	44.286
ENSACIG00000020244	-	84	43.284	ENSACIG00000006478	-	74	43.284
ENSACIG00000020244	-	79	35.749	ENSACIG00000009149	-	69	35.749
ENSACIG00000020244	-	86	45.854	ENSACIG00000003582	-	65	45.854
ENSACIG00000020244	-	87	44.878	ENSACIG00000014690	-	78	44.878
ENSACIG00000020244	-	86	43.902	ENSACIG00000014716	-	81	43.902
ENSACIG00000020244	-	93	43.049	ENSACIG00000005780	-	67	43.049
ENSACIG00000020244	-	77	44.565	ENSACIG00000005223	-	70	44.565
ENSACIG00000020244	-	90	47.465	ENSACIG00000022355	-	74	47.465
ENSACIG00000020244	-	77	43.169	ENSACIG00000001596	-	71	43.169
ENSACIG00000020244	-	74	42.529	ENSACIG00000008666	-	83	42.529
ENSACIG00000020244	-	90	42.130	ENSACIG00000002950	-	60	42.667
ENSACIG00000020244	-	85	45.813	ENSACIG00000014745	-	90	45.813
ENSACIG00000020244	-	94	44.595	ENSACIG00000022362	-	78	44.595
ENSACIG00000020244	-	92	49.309	ENSACIG00000022366	-	77	49.309
ENSACIG00000020244	-	81	45.833	ENSACIG00000007158	-	66	43.925

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000020244	-	83	55.670	ENSAPOG00000022240	-	56	56.186	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020244	-	93	48.416	ENSAPOG00000012716	-	73	48.416	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020244	-	87	44.878	ENSAPOG00000020897	-	80	44.340	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020244	-	85	46.078	ENSAPOG00000014243	-	83	46.078	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020244	-	87	46.948	ENSAPOG00000011509	-	79	46.121	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020244	-	86	45.631	ENSAPOG00000008344	zgc:113625	72	45.631	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020244	-	88	46.512	ENSAPOG00000006169	-	65	45.726	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020244	-	97	41.410	ENSAPOG00000001268	-	56	41.410	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020244	-	77	48.889	ENSAPOG00000001262	-	86	48.889	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020244	-	51	75.833	ENSAPOG00000007361	-	68	75.833	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020244	-	85	58.500	ENSAPOG00000007333	-	62	57.075	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020244	-	89	44.286	ENSAPOG00000014759	-	69	44.286	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020244	-	88	46.512	ENSAPOG00000006488	-	90	45.726	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020244	-	93	45.701	ENSAPOG00000008063	-	70	45.701	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020244	-	93	43.891	ENSAPOG00000021159	-	71	43.891	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020244	-	85	48.500	ENSAPOG00000007322	-	69	48.500	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020244	-	87	38.350	ENSAPOG00000001315	-	63	38.350	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSACIG00000020244	-	85	59.000	ENSAOCG00000011155	-	62	57.547	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020244	-	87	51.707	ENSAOCG00000014702	-	67	51.707	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020244	-	82	49.223	ENSAOCG00000001993	-	80	47.642	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020244	-	90	47.642	ENSAOCG00000023240	-	78	47.642	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020244	-	89	36.190	ENSAOCG00000011794	-	61	36.190	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020244	-	87	47.549	ENSAOCG00000008522	-	67	47.549	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020244	-	90	47.170	ENSAOCG00000008525	-	61	47.170	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020244	-	89	44.286	ENSAOCG00000021905	-	63	44.286	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020244	-	85	72.000	ENSAOCG00000012651	-	89	69.668	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020244	-	85	48.000	ENSAOCG00000011167	-	66	48.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020244	-	91	43.318	ENSAPEG00000022382	-	71	43.318	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000020244	-	65	57.895	ENSAPEG00000003102	-	78	57.895	Amphiprion_percula
ENSACIG00000020244	-	87	51.707	ENSAPEG00000016533	-	68	51.707	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000020244	-	92	44.934	ENSATEG00000013008	-	77	44.934	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000020244	-	93	43.243	ENSATEG00000014085	-	74	43.694	Anabas_testudineus
ENSACIG00000020244	-	84	46.701	ENSATEG00000020431	zgc:113625	77	46.701	Anabas_testudineus
ENSACIG00000020244	-	90	49.528	ENSATEG00000019003	-	80	49.528	Anabas_testudineus
ENSACIG00000020244	-	84	71.574	ENSATEG00000017202	-	57	71.226	Anabas_testudineus
ENSACIG00000020244	-	85	58.000	ENSATEG00000017193	-	61	56.604	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000020244	-	90	48.585	ENSATEG00000014013	si:ch211-113e8.5	79	48.585	Anabas_testudineus
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