EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000020400 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: twistnb
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7741 bases
Position: chrCCOE01000707.1:127364-135104
Accession: ZDB-GENE-041007-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000026325	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	7.4e-09	1	1
ENSACIP00000026330	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	1.1e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000027022	-	1164	-	ENSACIP00000026330	387 (aa)	-	-
ENSACIT00000027017	-	1122	-	ENSACIP00000026325	373 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000020400	twistnb	80	43.226	ENSG00000105849	TWISTNB	86	40.823	Homo_sapiens
ENSACIG00000020400	twistnb	98	71.277	ENSAPOG00000011796	twistnb	98	71.809	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020400	twistnb	97	71.117	ENSAOCG00000024200	twistnb	98	72.606	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020400	twistnb	97	71.662	ENSAPEG00000016750	twistnb	98	73.138	Amphiprion_percula
ENSACIG00000020400	twistnb	95	69.252	ENSATEG00000017956	twistnb	98	69.947	Anabas_testudineus
ENSACIG00000020400	twistnb	96	76.667	ENSACLG00000022280	twistnb	91	78.049	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000020400	twistnb	54	56.716	ENSAMXG00000035868	twistnb	76	52.800	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000020400	twistnb	80	45.277	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	92	44.512	Bos_taurus
ENSACIG00000020400	twistnb	80	45.307	ENSTSYG00000001471	TWISTNB	93	41.888	Carlito_syrichta
ENSACIG00000020400	twistnb	53	54.000	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	59	54.000	Cavia_porcellus
ENSACIG00000020400	twistnb	80	43.548	ENSCATG00000035621	TWISTNB	86	40.823	Cercocebus_atys
ENSACIG00000020400	twistnb	80	43.548	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	86	40.823	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000020400	twistnb	89	41.124	ENSCPBG00000000367	TWISTNB	98	41.349	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000020400	twistnb	94	59.290	ENSCVAG00000014324	twistnb	99	57.812	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000020400	twistnb	94	41.117	ENSDARG00000024416	twistnb	97	41.013	Danio_rerio
ENSACIG00000020400	twistnb	80	43.226	ENSDORG00000007795	Twistnb	91	41.066	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000020400	twistnb	50	55.319	ENSEASG00005021702	TWISTNB	53	55.319	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000020400	twistnb	50	55.319	ENSECAG00000014563	TWISTNB	91	43.750	Equus_caballus
ENSACIG00000020400	twistnb	98	52.533	ENSELUG00000000098	TWISTNB	99	51.724	Esox_lucius
ENSACIG00000020400	twistnb	50	54.787	ENSFCAG00000025987	TWISTNB	89	42.994	Felis_catus
ENSACIG00000020400	twistnb	81	40.000	ENSFALG00000009761	TWISTNB	99	40.000	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000020400	twistnb	97	60.218	ENSFHEG00000013318	twistnb	99	60.267	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000020400	twistnb	86	39.877	ENSGALG00000010863	TWISTNB	80	38.244	Gallus_gallus
ENSACIG00000020400	twistnb	95	60.163	ENSGAFG00000018309	twistnb	99	59.200	Gambusia_affinis
ENSACIG00000020400	twistnb	68	67.589	ENSGACG00000006425	twistnb	92	67.589	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000020400	twistnb	80	42.903	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	86	40.823	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000020400	twistnb	96	76.111	ENSHBUG00000020155	twistnb	91	77.507	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000020400	twistnb	88	44.713	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	93	42.773	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000020400	twistnb	80	45.667	ENSHGLG00100005410	TWISTNB	93	42.773	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000020400	twistnb	96	52.099	ENSHCOG00000010590	twistnb	99	55.610	Hippocampus_comes
ENSACIG00000020400	twistnb	98	46.950	ENSIPUG00000004117	twistnb	99	47.632	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000020400	twistnb	50	54.787	ENSSTOG00000022702	TWISTNB	90	39.766	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000020400	twistnb	98	61.749	ENSKMAG00000001591	twistnb	97	63.271	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000020400	twistnb	96	67.308	ENSLBEG00000024225	twistnb	98	68.617	Labrus_bergylta
ENSACIG00000020400	twistnb	98	43.817	ENSLACG00000010508	TWISTNB	99	42.318	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000020400	twistnb	50	55.851	ENSLAFG00000008755	TWISTNB	56	55.851	Loxodonta_africana
ENSACIG00000020400	twistnb	80	43.226	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	86	40.506	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000020400	twistnb	80	43.226	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	86	40.506	Macaca_mulatta
ENSACIG00000020400	twistnb	80	43.042	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	86	40.317	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000020400	twistnb	80	43.548	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	86	40.823	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000020400	twistnb	96	76.667	ENSMZEG00005007561	twistnb	91	78.049	Maylandia_zebra
ENSACIG00000020400	twistnb	80	45.847	ENSMOCG00000003458	Twistnb	95	41.796	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000020400	twistnb	100	58.750	ENSMMOG00000020085	twistnb	100	60.000	Mola_mola
ENSACIG00000020400	twistnb	100	61.364	ENSMALG00000016407	twistnb	98	61.697	Monopterus_albus
ENSACIG00000020400	twistnb	84	41.212	MGP_CAROLIEiJ_G0017692	Twistnb	94	41.298	Mus_caroli
ENSACIG00000020400	twistnb	53	54.545	ENSMUSG00000020561	Twistnb	71	49.573	Mus_musculus
ENSACIG00000020400	twistnb	50	54.787	MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	60	53.030	Mus_pahari
ENSACIG00000020400	twistnb	84	43.505	MGP_SPRETEiJ_G0018534	Twistnb	94	41.056	Mus_spretus
ENSACIG00000020400	twistnb	50	55.851	ENSMPUG00000013948	TWISTNB	53	55.851	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000020400	twistnb	96	75.487	ENSNBRG00000008652	twistnb	97	77.174	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000020400	twistnb	80	43.042	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	93	39.169	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000020400	twistnb	80	42.071	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	98	39.886	Ochotona_princeps
ENSACIG00000020400	twistnb	97	64.384	ENSORLG00000004005	twistnb	88	64.865	Oryzias_latipes
ENSACIG00000020400	twistnb	97	66.027	ENSORLG00020002579	twistnb	98	64.324	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000020400	twistnb	97	64.835	ENSORLG00015013403	twistnb	87	64.595	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000020400	twistnb	80	43.226	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	87	40.379	Pan_paniscus
ENSACIG00000020400	twistnb	82	43.607	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	88	43.631	Panthera_pardus
ENSACIG00000020400	twistnb	76	44.251	ENSPTIG00000021539	TWISTNB	92	44.257	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000020400	twistnb	80	43.226	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	86	40.823	Pan_troglodytes
ENSACIG00000020400	twistnb	80	43.548	ENSPANG00000015736	TWISTNB	86	40.823	Papio_anubis
ENSACIG00000020400	twistnb	58	57.674	ENSPKIG00000025635	twistnb	91	48.214	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000020400	twistnb	95	63.361	ENSPMGG00000019023	twistnb	94	61.326	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000020400	twistnb	79	42.321	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	51	52.941	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000020400	twistnb	96	76.667	ENSPNYG00000002674	twistnb	97	77.778	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000020400	twistnb	94	46.197	ENSPNAG00000011956	twistnb	95	46.197	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000020400	twistnb	50	56.915	ENSRNOG00000010750	Twistnb	93	45.312	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000020400	twistnb	50	57.447	ENSSFOG00015012788	twistnb	59	57.447	Scleropages_formosus
ENSACIG00000020400	twistnb	98	66.125	ENSSMAG00000012792	twistnb	98	65.684	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000020400	twistnb	100	67.085	ENSSDUG00000007038	twistnb	98	71.088	Seriola_dumerili
ENSACIG00000020400	twistnb	82	38.264	ENSSPUG00000007595	TWISTNB	72	45.089	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000020400	twistnb	100	62.755	ENSSPAG00000005871	twistnb	98	69.149	Stegastes_partitus
ENSACIG00000020400	twistnb	50	54.011	ENSSSCG00000025298	TWISTNB	90	40.964	Sus_scrofa
ENSACIG00000020400	twistnb	87	61.162	ENSTNIG00000017778	twistnb	96	59.091	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000020400	twistnb	50	55.319	ENSUAMG00000017593	TWISTNB	56	55.319	Ursus_americanus
ENSACIG00000020400	twistnb	50	54.787	ENSUMAG00000022203	TWISTNB	56	54.787	Ursus_maritimus
ENSACIG00000020400	twistnb	95	61.408	ENSXCOG00000020199	twistnb	99	59.401	Xiphophorus_couchianus