EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000020459 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: htatsf1
Alias: zgc:66252
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4893 bases
Position: chrCCOE01000073.1:183380-188272
Accession: ZDB-GENE-040426-1578
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000026421	RRM_1	PF00076.22	1.1e-16	1	2
ENSACIP00000026421	RRM_1	PF00076.22	1.1e-16	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000027114	-	1353	-	ENSACIP00000026421	450 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000020459's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000020459's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	59.502	ENSG00000102241	HTATSF1	100	56.855	Homo_sapiens
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	84.141	ENSAPOG00000009823	htatsf1	100	84.141	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	82.505	ENSAOCG00000020994	htatsf1	100	82.937	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	83.913	ENSAPEG00000016432	htatsf1	100	83.913	Amphiprion_percula
ENSACIG00000020459	htatsf1	93	83.294	ENSATEG00000008903	htatsf1	93	83.092	Anabas_testudineus
ENSACIG00000020459	htatsf1	92	63.121	ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	63.121	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000020459	htatsf1	77	65.143	ENSACAG00000009346	HTATSF1	98	60.100	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000020459	htatsf1	86	59.948	ENSANAG00000025458	-	50	61.247	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	88.717	ENSACLG00000008096	htatsf1	100	88.717	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000020459	htatsf1	99	68.230	ENSAMXG00000008387	htatsf1	100	68.376	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000020459	htatsf1	92	58.469	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	55	59.059	Bos_taurus
ENSACIG00000020459	htatsf1	77	38.527	WBGene00022025	Y65B4A.1	76	37.360	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	59.594	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	50	64.160	Canis_familiaris
ENSACIG00000020459	htatsf1	80	63.172	ENSCCAG00000025329	-	54	63.496	Cebus_capucinus
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	59.955	ENSCATG00000029963	HTATSF1	53	61.557	Cercocebus_atys
ENSACIG00000020459	htatsf1	90	59.762	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	52	60.145	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	59.955	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	53	61.557	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000020459	htatsf1	99	62.174	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	99	62.121	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000020459	htatsf1	80	59.375	ENSCING00000005914	-	83	46.703	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000020459	htatsf1	88	40.263	ENSCSAVG00000000371	-	97	39.387	Ciona_savignyi
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	59.685	ENSCANG00000028495	HTATSF1	53	61.268	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000020459	htatsf1	91	62.264	ENSCGRG00001021602	Htatsf1	51	62.264	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	81.195	ENSCVAG00000014070	htatsf1	99	79.867	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	68.251	ENSDARG00000056649	htatsf1	100	66.450	Danio_rerio
ENSACIG00000020459	htatsf1	88	42.643	FBgn0037081	barc	65	45.135	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000020459	htatsf1	91	53.596	ENSEBUG00000001534	htatsf1	84	53.349	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	60.092	ENSEASG00005003440	HTATSF1	51	61.722	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	60.092	ENSECAG00000009156	HTATSF1	51	61.722	Equus_caballus
ENSACIG00000020459	htatsf1	99	63.656	ENSELUG00000005486	htatsf1	90	64.378	Esox_lucius
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	59.226	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	50	63.544	Felis_catus
ENSACIG00000020459	htatsf1	99	59.110	ENSFALG00000003728	HTATSF1	88	63.636	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	81.758	ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	80.174	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000020459	htatsf1	81	77.322	ENSGMOG00000016444	htatsf1	100	77.322	Gadus_morhua
ENSACIG00000020459	htatsf1	99	60.954	ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	60.954	Gallus_gallus
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	81.498	ENSGAFG00000003041	htatsf1	98	79.956	Gambusia_affinis
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	79.204	ENSGACG00000020459	htatsf1	100	77.655	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	59.502	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	53	61.085	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	88.717	ENSHBUG00000004392	htatsf1	100	88.717	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000020459	htatsf1	99	69.845	ENSHCOG00000009056	htatsf1	100	70.354	Hippocampus_comes
ENSACIG00000020459	htatsf1	99	64.706	ENSIPUG00000017828	htatsf1	100	66.316	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	60.271	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	63.317	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	85.022	ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	82.819	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	80.130	ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	77.970	Labrus_bergylta
ENSACIG00000020459	htatsf1	99	61.726	ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	61.062	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000020459	htatsf1	99	47.146	ENSLOCG00000015118	htatsf1	99	45.530	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000020459	htatsf1	94	59.954	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	61.266	Loxodonta_africana
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	59.955	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	53	61.557	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	59.955	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	53	61.557	Macaca_mulatta
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	59.955	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	58	61.557	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	59.955	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	53	61.557	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000020459	htatsf1	99	80.889	ENSMAMG00000021225	htatsf1	99	80.000	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	88.938	ENSMZEG00005000485	htatsf1	100	88.938	Maylandia_zebra
ENSACIG00000020459	htatsf1	94	62.413	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	98	62.413	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000020459	htatsf1	82	63.325	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	53	61.737	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	58.824	ENSMICG00000009348	HTATSF1	53	60.377	Microcebus_murinus
ENSACIG00000020459	htatsf1	82	63.467	ENSMOCG00000023007	-	53	61.848	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	80.353	ENSMMOG00000011013	htatsf1	100	79.470	Mola_mola
ENSACIG00000020459	htatsf1	57	58.491	ENSMODG00000000199	-	91	56.557	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000020459	htatsf1	99	62.227	ENSMODG00000014087	-	97	62.009	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	80.837	ENSMALG00000019977	htatsf1	100	79.515	Monopterus_albus
ENSACIG00000020459	htatsf1	82	63.564	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	64.213	Mus_caroli
ENSACIG00000020459	htatsf1	94	57.541	ENSMLUG00000009234	-	54	59.413	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000020459	htatsf1	82	62.933	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	63.613	Nannospalax_galili
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	88.938	ENSNBRG00000003818	htatsf1	100	88.938	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	59.594	ENSNLEG00000002746	HTATSF1	53	61.176	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000020459	htatsf1	92	62.708	ENSMEUG00000004133	-	94	63.990	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	89.159	ENSONIG00000008638	htatsf1	100	89.159	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000020459	htatsf1	91	60.570	ENSOANG00000011674	-	99	60.095	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	59.410	ENSOCUG00000012570	HTATSF1	51	61.446	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	78.509	ENSORLG00000002356	htatsf1	100	76.754	Oryzias_latipes
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	78.166	ENSORLG00020017818	htatsf1	97	76.638	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	78.855	ENSORLG00015002268	htatsf1	100	77.313	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	80.220	ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	77.143	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	59.502	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	53	61.085	Pan_paniscus
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	59.453	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	50	63.797	Panthera_pardus
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	59.502	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	53	61.085	Pan_troglodytes
ENSACIG00000020459	htatsf1	99	68.341	ENSPKIG00000024852	htatsf1	99	67.396	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000020459	htatsf1	73	68.750	ENSPSIG00000010192	HTATSF1	98	67.143	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000020459	htatsf1	99	73.799	ENSPMGG00000006172	htatsf1	100	72.078	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000020459	htatsf1	99	57.269	ENSPCIG00000018896	-	98	56.954	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000020459	htatsf1	93	60.930	ENSPCIG00000030173	-	93	61.702	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	82.159	ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	79.694	Poecilia_formosa
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	81.938	ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	79.476	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	82.522	ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	80.131	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	82.379	ENSPREG00000007811	htatsf1	100	80.131	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	59.685	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	53	61.268	Pongo_abelii
ENSACIG00000020459	htatsf1	84	57.662	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	51	57.662	Procavia_capensis
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	59.453	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	53	61.045	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	58.352	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	57	59.905	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	88.717	ENSPNYG00000016693	htatsf1	100	88.717	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000020459	htatsf1	99	69.665	ENSPNAG00000006166	htatsf1	100	70.726	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	59.955	ENSRROG00000021939	HTATSF1	53	61.557	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000020459	htatsf1	98	59.477	ENSSHAG00000018908	-	89	62.322	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000020459	htatsf1	86	65.985	ENSSHAG00000006440	-	94	66.842	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000020459	htatsf1	99	61.392	ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	62.447	Scleropages_formosus
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	77.106	ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	75.325	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	79.646	ENSSDUG00000020002	htatsf1	99	76.805	Seriola_dumerili
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	82.599	ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	80.617	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000020459	htatsf1	92	57.506	ENSSARG00000005193	HTATSF1	51	61.499	Sorex_araneus
ENSACIG00000020459	htatsf1	99	60.341	ENSSPUG00000014767	HTATSF1	98	60.043	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000020459	htatsf1	99	85.339	ENSSPAG00000000732	htatsf1	99	85.339	Stegastes_partitus
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	55.694	ENSSSCG00000023062	HTATSF1	67	55.487	Sus_scrofa
ENSACIG00000020459	htatsf1	99	59.149	ENSTGUG00000002099	HTATSF1	99	59.524	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	77.042	ENSTRUG00000013383	htatsf1	100	76.770	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000020459	htatsf1	100	77.212	ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	76.549	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000020459	htatsf1	78	62.604	ENSTTRG00000002269	HTATSF1	58	61.389	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000020459	htatsf1	95	58.998	ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	63.317	Ursus_americanus
ENSACIG00000020459	htatsf1	99	57.987	ENSXETG00000019749	htatsf1	85	57.582	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000020459	htatsf1	97	80.090	ENSXCOG00000006912	htatsf1	94	81.340	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000020459	htatsf1	99	81.556	ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	79.075	Xiphophorus_maculatus