EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSACIG00000020589 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rps28
Alias: fb07a10|wu:fb07a10|wu:fb94f01|zgc:73367
Full Name: ribosomal protein S28
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1730 bases
Position: chrCCOE01000292.1:880757-882486
Accession: ZDB-GENE-030131-2022
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000026586	Ribosomal_S28e	PF01200.18	1.3e-34	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000027279	-	210	-	ENSACIP00000026586	69 (aa)	-	UPI0000134ED6

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Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSG00000233927	RPS28	100	95.652	Homo_sapiens
ENSACIG00000020589	rps28	100	100.000	ENSAPOG00000015173	rps28	100	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSAMEG00000004917	RPS28	100	95.652	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000020589	rps28	100	100.000	ENSAOCG00000019080	rps28	100	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020589	rps28	100	100.000	ENSAPEG00000015829	rps28	100	100.000	Amphiprion_percula
ENSACIG00000020589	rps28	100	100.000	ENSATEG00000018266	rps28	100	100.000	Anabas_testudineus
ENSACIG00000020589	rps28	59	95.122	ENSAPLG00000000915	RPS28	100	95.122	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000020589	rps28	100	91.304	ENSANAG00000003228	-	100	91.304	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000020589	rps28	100	92.754	ENSANAG00000019522	-	100	92.754	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000020589	rps28	100	78.261	ENSANAG00000034851	-	100	78.261	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSANAG00000036427	-	100	95.652	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000020589	rps28	100	100.000	ENSACLG00000008061	rps28	100	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000020589	rps28	100	100.000	ENSAMXG00000042497	rps28	100	100.000	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSBTAG00000002468	RPS28	100	95.652	Bos_taurus
ENSACIG00000020589	rps28	88	87.097	WBGene00004497	rps-28	95	87.097	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000020589	rps28	91	93.651	ENSCJAG00000022371	-	62	93.651	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSCJAG00000010726	RPS28	100	95.652	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSCHIG00000017787	RPS28	100	95.652	Capra_hircus
ENSACIG00000020589	rps28	100	84.058	ENSCHIG00000007447	-	100	84.058	Capra_hircus
ENSACIG00000020589	rps28	90	79.032	ENSCHIG00000009632	-	100	79.032	Capra_hircus
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSTSYG00000031396	-	100	95.652	Carlito_syrichta
ENSACIG00000020589	rps28	99	72.464	ENSTSYG00000027428	-	98	72.464	Carlito_syrichta
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSCPOG00000022876	RPS28	100	95.652	Cavia_porcellus
ENSACIG00000020589	rps28	100	78.261	ENSCCAG00000029502	-	100	78.261	Cebus_capucinus
ENSACIG00000020589	rps28	100	84.058	ENSCCAG00000016358	-	100	84.058	Cebus_capucinus
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSCCAG00000030298	-	100	95.652	Cebus_capucinus
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSCATG00000014458	RPS28	100	95.652	Cercocebus_atys
ENSACIG00000020589	rps28	96	82.353	ENSCLAG00000017469	-	97	82.353	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSCLAG00000002218	RPS28	100	95.652	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000020589	rps28	99	95.588	ENSCSAG00000000174	-	100	95.588	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSCPBG00000017064	RPS28	100	95.652	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000020589	rps28	87	90.000	ENSCING00000013272	-	88	90.000	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSCANG00000020391	RPS28	100	95.652	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000020589	rps28	100	79.710	ENSCGRG00001004003	-	100	79.710	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSCGRG00001022084	Rps28	100	95.652	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSCGRG00000004955	Rps28	100	95.652	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000020589	rps28	99	73.239	ENSCGRG00000010737	-	99	73.239	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000020589	rps28	100	100.000	ENSCSEG00000011735	rps28	100	100.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000020589	rps28	100	100.000	ENSCVAG00000012656	rps28	100	100.000	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000020589	rps28	100	100.000	ENSDARG00000035860	rps28	100	100.000	Danio_rerio
ENSACIG00000020589	rps28	100	79.710	ENSDNOG00000036089	-	100	79.710	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000020589	rps28	99	79.412	ENSDNOG00000043999	-	99	79.412	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000020589	rps28	93	75.000	ENSDNOG00000044899	-	93	75.000	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSDNOG00000038487	-	100	95.652	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000020589	rps28	91	82.540	ENSDNOG00000043010	-	91	82.540	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000020589	rps28	91	65.079	ENSDNOG00000041203	-	97	65.079	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSDORG00000027636	Rps28	100	95.652	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000020589	rps28	87	76.667	FBgn0039739	RpS28a	94	76.667	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000020589	rps28	91	80.952	FBgn0030136	RpS28b	97	80.952	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000020589	rps28	86	91.525	ENSEBUG00000006971	rps28	86	91.525	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSEASG00005003719	RPS28	100	95.652	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSECAG00000017256	RPS28	100	95.652	Equus_caballus
ENSACIG00000020589	rps28	100	76.812	ENSEEUG00000006685	-	100	76.812	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000020589	rps28	100	100.000	ENSELUG00000020168	RS28	100	100.000	Esox_lucius
ENSACIG00000020589	rps28	99	75.000	ENSFCAG00000040752	-	99	75.000	Felis_catus
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSFCAG00000024931	-	100	95.652	Felis_catus
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSFDAG00000009062	RPS28	100	95.652	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000020589	rps28	100	100.000	ENSFHEG00000005855	rps28	100	100.000	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000020589	rps28	100	100.000	ENSGMOG00000010283	rps28	100	100.000	Gadus_morhua
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSGALG00000049538	RPS28	100	95.652	Gallus_gallus
ENSACIG00000020589	rps28	100	97.101	ENSGAFG00000012933	rps28	100	97.101	Gambusia_affinis
ENSACIG00000020589	rps28	100	100.000	ENSGACG00000015568	rps28	100	100.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000020589	rps28	86	93.220	ENSGAGG00000016191	-	88	93.220	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000020589	rps28	77	84.906	ENSGAGG00000003977	-	80	84.906	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000020589	rps28	100	89.855	ENSGAGG00000004683	-	70	89.855	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSGGOG00000024725	RPS28	100	95.652	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000020589	rps28	100	100.000	ENSHBUG00000011321	rps28	100	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSHGLG00000015344	RPS28	100	95.652	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSHGLG00100003314	RPS28	100	95.652	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000020589	rps28	100	79.710	ENSHGLG00100019526	-	100	79.710	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000020589	rps28	100	84.058	ENSHGLG00100020381	-	100	84.058	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000020589	rps28	100	97.101	ENSHCOG00000005849	rps28	100	97.101	Hippocampus_comes
ENSACIG00000020589	rps28	100	100.000	ENSIPUG00000008759	rps28	58	100.000	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSSTOG00000022842	RPS28	100	95.652	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSJJAG00000017384	-	100	95.652	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000020589	rps28	100	78.261	ENSJJAG00000021064	-	100	78.261	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000020589	rps28	100	85.507	ENSJJAG00000009096	-	100	85.507	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000020589	rps28	97	76.119	ENSJJAG00000012669	-	100	76.119	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000020589	rps28	99	89.706	ENSJJAG00000010478	-	72	89.706	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000020589	rps28	94	80.000	ENSJJAG00000020121	-	100	80.000	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000020589	rps28	100	100.000	ENSKMAG00000015763	rps28	100	100.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000020589	rps28	100	76.812	ENSLBEG00000013549	rps28	100	76.812	Labrus_bergylta
ENSACIG00000020589	rps28	100	100.000	ENSLOCG00000002654	rps28	84	100.000	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSLAFG00000029923	RPS28	100	95.652	Loxodonta_africana
ENSACIG00000020589	rps28	100	92.754	ENSMFAG00000029879	-	100	92.754	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSMFAG00000042430	-	100	95.652	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000020589	rps28	100	92.754	ENSMFAG00000024228	-	100	92.754	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSMMUG00000028895	RPS28	100	95.652	Macaca_mulatta
ENSACIG00000020589	rps28	100	91.304	ENSMMUG00000030827	-	100	91.304	Macaca_mulatta
ENSACIG00000020589	rps28	100	92.754	ENSMMUG00000030258	-	100	92.754	Macaca_mulatta
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSMNEG00000036447	RPS28	100	95.652	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000020589	rps28	100	82.609	ENSMNEG00000034123	-	100	82.609	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSMLEG00000036014	RPS28	100	95.652	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000020589	rps28	100	98.551	ENSMAMG00000005811	rps28	100	98.551	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000020589	rps28	100	100.000	ENSMZEG00005003997	rps28	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSMAUG00000014417	Rps28	100	95.652	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSMICG00000026849	RPS28	100	95.652	Microcebus_murinus
ENSACIG00000020589	rps28	100	79.710	ENSMOCG00000007029	-	100	79.710	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSMOCG00000010653	-	100	95.652	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSMOCG00000008235	-	100	95.652	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000020589	rps28	100	94.203	ENSMOCG00000001023	-	100	94.203	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000020589	rps28	100	91.304	ENSMOCG00000002602	-	90	91.304	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000020589	rps28	100	94.203	ENSMOCG00000018789	-	100	94.203	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSMOCG00000010096	-	100	95.652	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSMOCG00000007820	-	100	95.652	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000020589	rps28	100	91.304	ENSMOCG00000006129	-	100	91.304	Microtus_ochrogaster
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ENSACIG00000020589	rps28	100	94.203	ENSMODG00000003890	RPS28	100	94.203	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000020589	rps28	99	86.765	ENSMODG00000025356	-	100	86.765	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000020589	rps28	100	98.551	ENSMALG00000000781	rps28	100	98.551	Monopterus_albus
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	MGP_CAROLIEiJ_G0021418	-	100	96.429	Mus_caroli
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ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	MGP_PahariEiJ_G0020423	Rps28	100	96.429	Mus_pahari
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ENSACIG00000020589	rps28	100	88.406	MGP_SPRETEiJ_G0027470	-	100	88.406	Mus_spretus
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSMLUG00000023621	RPS28	100	95.652	Myotis_lucifugus
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ENSACIG00000020589	rps28	97	77.612	ENSOGAG00000002534	-	100	77.612	Otolemur_garnettii
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ENSACIG00000020589	rps28	100	82.609	ENSOARG00000004121	-	100	82.609	Ovis_aries
ENSACIG00000020589	rps28	99	82.353	ENSOARG00000013830	-	99	82.353	Ovis_aries
ENSACIG00000020589	rps28	100	95.652	ENSPPAG00000028825	RPS28	100	95.652	Pan_paniscus
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ENSACIG00000020589	rps28	88	77.049	ENSPTIG00000005894	-	91	77.049	Panthera_tigris_altaica
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ENSACIG00000020589	rps28	100	100.000	ENSPFOG00000002637	rps28	53	100.000	Poecilia_formosa
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ENSACIG00000020589	rps28	100	92.754	ENSSBOG00000008426	-	100	92.754	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSACIG00000020589	rps28	100	76.812	ENSXCOG00000007160	rps28	100	76.812	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000020589	rps28	100	76.812	ENSXMAG00000013950	rps28	100	76.812	Xiphophorus_maculatus