EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000020856 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3965 bases
Position: chrCCOE01000377.1:267337-271301
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000026922	RVT_1	PF00078.27	1.1e-41	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000027630	-	1386	-	ENSACIP00000026922	461 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000020856's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000020856's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000020856	-	75	32.033	ENSACIG00000010538	-	92	32.033
ENSACIG00000020856	-	84	83.763	ENSACIG00000020849	-	94	83.763

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000020856	-	62	32.542	ENSAPOG00000015742	-	93	32.542	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020856	-	70	31.212	ENSAOCG00000014605	-	65	31.212	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020856	-	62	35.889	ENSAOCG00000000894	-	86	37.153	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020856	-	75	52.586	ENSATEG00000019721	-	91	52.586	Anabas_testudineus
ENSACIG00000020856	-	64	37.049	ENSACAG00000010816	-	86	37.049	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000020856	-	69	31.481	ENSACLG00000012857	-	88	31.481	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000020856	-	78	32.329	ENSACLG00000011319	-	95	32.329	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000020856	-	57	30.943	ENSACLG00000010837	-	65	30.943	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000020856	-	85	32.609	ENSACLG00000015899	-	55	32.609	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000020856	-	75	30.726	ENSACLG00000013571	-	87	30.726	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000020856	-	68	45.205	ENSAMXG00000033384	-	56	47.368	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000020856	-	99	43.227	ENSAMXG00000032036	-	67	43.227	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000020856	-	82	45.000	ENSAMXG00000038901	-	80	45.000	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000020856	-	52	35.537	ENSAMXG00000041014	-	91	35.537	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000020856	-	81	49.202	ENSAMXG00000035718	-	72	49.202	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000020856	-	67	35.484	ENSELUG00000000386	-	68	35.484	Esox_lucius
ENSACIG00000020856	-	78	32.418	ENSGAGG00000013921	-	98	32.418	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000020856	-	61	34.859	ENSHBUG00000007736	-	68	34.859	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000020856	-	66	33.333	ENSHBUG00000011715	-	79	33.333	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000020856	-	93	52.103	ENSHBUG00000003796	-	94	52.093	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000020856	-	56	34.866	ENSIPUG00000010242	-	69	34.866	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000020856	-	78	30.601	ENSKMAG00000014393	-	85	30.601	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000020856	-	81	30.423	ENSLBEG00000020242	-	99	30.423	Labrus_bergylta
ENSACIG00000020856	-	57	35.472	ENSMZEG00005016362	-	93	35.472	Maylandia_zebra
ENSACIG00000020856	-	85	30.808	ENSMZEG00005025877	-	93	30.808	Maylandia_zebra
ENSACIG00000020856	-	54	31.746	ENSMZEG00005006211	-	62	31.746	Maylandia_zebra
ENSACIG00000020856	-	78	32.153	ENSMZEG00005011529	-	68	32.153	Maylandia_zebra
ENSACIG00000020856	-	85	30.808	ENSMZEG00005008304	-	93	30.808	Maylandia_zebra
ENSACIG00000020856	-	78	32.153	ENSMZEG00005017030	-	69	32.153	Maylandia_zebra
ENSACIG00000020856	-	85	64.450	ENSNBRG00000022130	-	94	64.450	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000020856	-	51	32.500	ENSNBRG00000013792	-	69	32.500	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000020856	-	77	55.337	ENSNBRG00000001934	-	76	55.337	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000020856	-	75	30.141	ENSNBRG00000012595	-	80	30.141	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000020856	-	87	32.029	ENSONIG00000021275	-	55	32.029	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000020856	-	55	33.977	ENSORLG00000028454	-	81	33.977	Oryzias_latipes
ENSACIG00000020856	-	52	32.780	ENSORLG00000028976	-	63	33.884	Oryzias_latipes
ENSACIG00000020856	-	64	31.457	ENSORLG00000028706	-	61	31.457	Oryzias_latipes
ENSACIG00000020856	-	64	32.890	ENSORLG00000023713	-	76	32.890	Oryzias_latipes
ENSACIG00000020856	-	64	30.233	ENSORLG00020007779	-	80	30.233	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000020856	-	64	31.650	ENSORLG00020018629	-	78	31.650	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000020856	-	83	31.000	ENSORLG00020014626	-	73	31.000	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000020856	-	52	31.020	ENSORLG00020007002	-	96	31.020	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000020856	-	52	33.471	ENSORLG00020014149	-	75	33.471	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000020856	-	54	32.031	ENSORLG00020022004	-	87	32.031	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000020856	-	55	30.739	ENSORLG00020016429	-	50	30.739	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000020856	-	64	30.233	ENSORLG00020010425	-	53	30.233	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000020856	-	64	31.650	ENSORLG00015007703	-	76	31.650	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000020856	-	68	32.602	ENSORLG00015020895	-	85	32.602	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000020856	-	77	31.025	ENSORLG00015021206	-	68	31.025	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000020856	-	51	30.672	ENSORLG00015007976	-	64	30.672	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000020856	-	50	33.475	ENSORLG00015008227	-	65	33.475	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000020856	-	63	32.558	ENSORLG00015000419	-	84	32.558	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000020856	-	64	31.650	ENSOMEG00000013211	-	67	31.650	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000020856	-	52	32.114	ENSPKIG00000013511	-	83	32.114	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000020856	-	50	39.301	ENSPMGG00000014421	-	56	39.301	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000020856	-	62	35.616	ENSPLAG00000015080	-	70	35.616	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000020856	-	57	35.338	ENSPMEG00000004673	-	65	35.338	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000020856	-	61	34.615	ENSPREG00000004933	-	72	34.615	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000020856	-	62	31.849	ENSPREG00000001352	-	81	31.849	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000020856	-	85	31.188	ENSPREG00000010319	-	97	31.188	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000020856	-	78	56.111	ENSPNYG00000002652	-	94	56.111	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000020856	-	60	34.276	ENSPNYG00000002466	-	93	34.276	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000020856	-	53	33.735	ENSPNYG00000023697	-	58	33.735	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000020856	-	64	34.868	ENSPNAG00000014375	-	74	34.868	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000020856	-	60	31.295	ENSPNAG00000010342	-	88	31.295	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000020856	-	85	31.340	ENSPNAG00000024749	-	96	31.340	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000020856	-	67	30.063	ENSSMAG00000014015	-	69	30.063	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000020856	-	55	39.844	ENSSDUG00000015364	-	55	39.844	Seriola_dumerili
ENSACIG00000020856	-	56	34.363	ENSSDUG00000021791	-	86	34.363	Seriola_dumerili
ENSACIG00000020856	-	62	30.769	ENSSLDG00000006955	-	67	30.769	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000020856	-	64	32.997	ENSSPAG00000000151	-	65	32.997	Stegastes_partitus
ENSACIG00000020856	-	56	34.363	ENSXCOG00000016894	-	77	34.363	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000020856	-	68	36.508	ENSXMAG00000023211	-	70	36.508	Xiphophorus_maculatus
ENSACIG00000020856	-	62	33.333	ENSXMAG00000026184	-	98	33.333	Xiphophorus_maculatus