EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000020910 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: sf3b1
Alias: tst|wu:fb99f09
Full Name: splicing factor 3b%2C subunit 1
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14549 bases
Position: chrCCOE01000189.1:818132-832680
Accession: ZDB-GENE-040827-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000027025	SF3b1	PF08920.10	2.3e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000027733	-	4059	-	ENSACIP00000027025	1352 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSG00000115524	SF3B1	100	93.216	Homo_sapiens
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	97.795	ENSAPOG00000011894	sf3b1	100	97.795	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020910	sf3b1	96	92.945	ENSAMEG00000013809	SF3B1	99	93.098	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	97.795	ENSAOCG00000004478	sf3b1	100	97.795	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	97.795	ENSAPEG00000012937	sf3b1	100	97.795	Amphiprion_percula
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	97.641	ENSATEG00000020435	sf3b1	100	97.641	Anabas_testudineus
ENSACIG00000020910	sf3b1	96	93.236	ENSAPLG00000003993	SF3B1	99	93.236	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	92.982	ENSACAG00000009612	SF3B1	100	92.982	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSANAG00000021577	SF3B1	100	94.416	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	99.085	ENSACLG00000023470	sf3b1	100	99.085	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	95.821	ENSAMXG00000002219	sf3b1	100	95.821	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSBTAG00000008915	SF3B1	100	93.216	Bos_taurus
ENSACIG00000020910	sf3b1	95	64.540	WBGene00011605	sftb-1	99	64.614	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSCJAG00000003902	SF3B1	100	93.216	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSCAFG00000010826	SF3B1	100	93.216	Canis_familiaris
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSCAFG00020004750	SF3B1	100	93.216	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSCHIG00000015226	SF3B1	100	93.216	Capra_hircus
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	92.988	ENSTSYG00000009214	SF3B1	100	93.140	Carlito_syrichta
ENSACIG00000020910	sf3b1	96	92.890	ENSCAPG00000006547	SF3B1	99	93.043	Cavia_aperea
ENSACIG00000020910	sf3b1	96	93.011	ENSCPOG00000009353	SF3B1	100	93.164	Cavia_porcellus
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSCCAG00000020506	SF3B1	100	93.216	Cebus_capucinus
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSCATG00000035735	SF3B1	100	93.216	Cercocebus_atys
ENSACIG00000020910	sf3b1	96	93.016	ENSCLAG00000014767	SF3B1	99	93.170	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSCSAG00000011505	SF3B1	100	93.216	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000020910	sf3b1	73	91.676	ENSCHOG00000009860	SF3B1	76	91.676	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.206	ENSCPBG00000021902	SF3B1	99	94.341	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000020910	sf3b1	66	77.875	ENSCING00000002558	-	99	78.295	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	80.302	ENSCSAVG00000002559	-	99	80.302	Ciona_savignyi
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSCANG00000029415	SF3B1	100	93.216	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSCGRG00001016990	Sf3b1	100	93.216	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSCGRG00000005301	Sf3b1	100	93.216	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.664	ENSCSEG00000003860	sf3b1	100	93.664	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000020910	sf3b1	93	97.387	ENSCVAG00000003680	sf3b1	99	97.387	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	94.677	ENSDARG00000056138	sf3b1	100	94.677	Danio_rerio
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	92.993	ENSDNOG00000011754	SF3B1	100	93.145	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000020910	sf3b1	96	91.091	ENSDORG00000002399	Sf3b1	100	91.091	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	76.250	FBgn0031266	Sf3b1	100	76.250	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000020910	sf3b1	80	91.713	ENSETEG00000009188	SF3B1	100	91.897	Echinops_telfairi
ENSACIG00000020910	sf3b1	96	85.780	ENSEBUG00000004325	sf3b1	100	88.601	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSEASG00005020159	SF3B1	98	93.216	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSECAG00000021657	SF3B1	98	93.216	Equus_caballus
ENSACIG00000020910	sf3b1	79	100.000	ENSEEUG00000000836	SF3B1	81	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	95.166	ENSELUG00000005977	sf3b1	98	95.166	Esox_lucius
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSFCAG00000005038	SF3B1	100	93.216	Felis_catus
ENSACIG00000020910	sf3b1	96	93.313	ENSFALG00000004281	SF3B1	99	93.313	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSFDAG00000017510	SF3B1	100	93.216	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	96.502	ENSFHEG00000014333	sf3b1	100	96.502	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	95.506	ENSGMOG00000006773	sf3b1	100	95.506	Gadus_morhua
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.282	ENSGALG00000008038	SF3B1	100	93.282	Gallus_gallus
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	95.957	ENSGAFG00000000704	sf3b1	100	97.529	Gambusia_affinis
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	96.494	ENSGACG00000008839	sf3b1	100	96.494	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	92.570	ENSGAGG00000017478	SF3B1	100	92.570	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000020910	sf3b1	96	88.095	ENSGGOG00000009264	SF3B1	99	88.095	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	99.084	ENSHBUG00000007705	sf3b1	100	99.084	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000020910	sf3b1	96	93.016	ENSHGLG00000008285	-	99	93.170	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000020910	sf3b1	96	91.021	ENSHGLG00100005535	-	99	91.174	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	96.067	ENSHCOG00000016775	sf3b1	100	96.067	Hippocampus_comes
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ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSSTOG00000011034	SF3B1	100	93.216	Ictidomys_tridecemlineatus
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ENSACIG00000020910	sf3b1	97	96.813	ENSKMAG00000004009	sf3b1	100	96.813	Kryptolebias_marmoratus
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ENSACIG00000020910	sf3b1	96	92.621	ENSMGAG00000007017	SF3B1	99	92.621	Meleagris_gallopavo
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ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSMICG00000013879	SF3B1	100	93.216	Microcebus_murinus
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ENSACIG00000020910	sf3b1	97	97.641	ENSMALG00000017211	sf3b1	100	97.641	Monopterus_albus
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ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSMUSG00000025982	Sf3b1	100	93.216	Mus_musculus
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	MGP_SPRETEiJ_G0014947	Sf3b1	100	93.216	Mus_spretus
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSMPUG00000007799	SF3B1	100	93.216	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	91.921	ENSMLUG00000000840	SF3B1	100	92.073	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000020910	sf3b1	96	93.011	ENSNGAG00000021884	-	100	92.890	Nannospalax_galili
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	94.351	ENSNBRG00000015816	sf3b1	100	94.419	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSNLEG00000006861	SF3B1	100	93.216	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000020910	sf3b1	61	99.717	ENSMEUG00000015848	-	66	99.717	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	80.611	ENSOPRG00000008596	SF3B1	100	80.686	Ochotona_princeps
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSODEG00000011153	-	100	93.216	Octodon_degus
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	99.085	ENSONIG00000013758	sf3b1	100	99.085	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000020910	sf3b1	80	94.858	ENSOCUG00000012722	-	96	95.295	Oryctolagus_cuniculus
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ENSACIG00000020910	sf3b1	97	96.880	ENSORLG00020001746	sf3b1	100	96.880	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000020910	sf3b1	62	95.471	ENSORLG00015001759	sf3b1	98	95.471	Oryzias_latipes_hsok
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ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSOARG00000015374	SF3B1	100	93.216	Ovis_aries
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSPPAG00000035007	SF3B1	100	93.216	Pan_paniscus
ENSACIG00000020910	sf3b1	97	93.064	ENSPPRG00000009090	SF3B1	100	93.216	Panthera_pardus
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