EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000020915 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: zcchc17
Alias: ps1d|zgc:85656
Full Name: zinc finger%2C CCHC domain containing 17
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5479 bases
Position: chrCCOE01001626.1:846653-852131
Accession: ZDB-GENE-040325-2
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000027062	S1	PF00575.23	3.8e-12	1	1
ENSACIP00000027035	S1	PF00575.23	1.7e-11	1	1
ENSACIP00000027050	S1	PF00575.23	1.7e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000027759	-	705	-	ENSACIP00000027050	234 (aa)	-	-
ENSACIT00000027743	-	693	-	ENSACIP00000027035	230 (aa)	-	-
ENSACIT00000027771	-	450	-	ENSACIP00000027062	149 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000020915	zcchc17	98	60.959	ENSG00000121766	ZCCHC17	100	60.959	Homo_sapiens
ENSACIG00000020915	zcchc17	92	94.891	ENSAPOG00000021724	zcchc17	90	83.408	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	ENSAMEG00000017710	-	69	58.084	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000020915	zcchc17	93	94.203	ENSAOCG00000003880	zcchc17	90	83.710	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020915	zcchc17	93	94.203	ENSAPEG00000014460	zcchc17	90	85.648	Amphiprion_percula
ENSACIG00000020915	zcchc17	93	94.203	ENSATEG00000015942	zcchc17	95	81.385	Anabas_testudineus
ENSACIG00000020915	zcchc17	89	60.902	ENSACAG00000000389	ZCCHC17	96	48.707	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000020915	zcchc17	98	60.959	ENSANAG00000024208	ZCCHC17	100	60.959	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000020915	zcchc17	93	94.928	ENSACLG00000019174	zcchc17	90	85.650	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000020915	zcchc17	93	76.978	ENSAMXG00000020595	zcchc17	75	73.256	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	ENSBTAG00000016818	ZCCHC17	95	50.870	Bos_taurus
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	57.447	ENSBTAG00000001432	-	69	58.182	Bos_taurus
ENSACIG00000020915	zcchc17	98	60.274	ENSCJAG00000006259	ZCCHC17	100	60.274	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	58.865	ENSCJAG00000045207	-	68	59.394	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	58.865	ENSCAFG00000001857	-	70	56.886	Canis_familiaris
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	ENSCAFG00000011131	-	69	58.084	Canis_familiaris
ENSACIG00000020915	zcchc17	76	50.442	ENSCAFG00020016304	-	51	50.442	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000020915	zcchc17	93	56.115	ENSCAFG00020016032	-	91	55.862	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000020915	zcchc17	91	59.259	ENSCAFG00020024828	ZCCHC17	90	60.284	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	ENSCHIG00000015629	-	95	50.870	Capra_hircus
ENSACIG00000020915	zcchc17	98	60.959	ENSTSYG00000000490	-	100	60.959	Carlito_syrichta
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	ENSCAPG00000006774	ZCCHC17	78	56.805	Cavia_aperea
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	ENSCPOG00000022394	-	81	57.485	Cavia_porcellus
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.993	ENSCPOG00000000106	ZCCHC17	69	58.084	Cavia_porcellus
ENSACIG00000020915	zcchc17	98	60.959	ENSCCAG00000033666	ZCCHC17	100	60.959	Cebus_capucinus
ENSACIG00000020915	zcchc17	98	60.959	ENSCATG00000044586	ZCCHC17	100	60.959	Cercocebus_atys
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	ENSCLAG00000008794	ZCCHC17	69	58.683	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	ENSCSAG00000001032	ZCCHC17	69	58.084	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	46.099	ENSCHOG00000001581	ZCCHC17	70	46.108	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000020915	zcchc17	98	60.959	ENSCANG00000038509	ZCCHC17	100	60.959	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	ENSCGRG00001014387	Zcchc17	68	60.366	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	ENSCGRG00000013323	Zcchc17	68	60.366	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000020915	zcchc17	92	91.241	ENSCSEG00000016039	zcchc17	96	89.189	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000020915	zcchc17	93	86.232	ENSCVAG00000007112	zcchc17	90	75.785	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000020915	zcchc17	92	77.372	ENSDARG00000018936	zcchc17	70	78.049	Danio_rerio
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	ENSDNOG00000000509	-	69	58.084	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	59.859	ENSDORG00000004128	Zcchc17	93	59.859	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	ENSETEG00000007421	ZCCHC17	67	60.248	Echinops_telfairi
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	ENSEASG00005010819	ZCCHC17	70	57.396	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	ENSECAG00000025040	ZCCHC17	61	57.396	Equus_caballus
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	58.156	ENSEEUG00000014855	ZCCHC17	69	56.287	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000020915	zcchc17	94	76.429	ENSELUG00000002450	zcchc17	71	76.048	Esox_lucius
ENSACIG00000020915	zcchc17	99	61.224	ENSFCAG00000004196	ZCCHC17	100	61.224	Felis_catus
ENSACIG00000020915	zcchc17	93	60.145	ENSFALG00000001165	ZCCHC17	64	60.759	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	ENSFDAG00000016520	ZCCHC17	74	56.742	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000020915	zcchc17	92	89.781	ENSFHEG00000007848	zcchc17	91	79.186	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000020915	zcchc17	92	85.401	ENSGMOG00000010452	zcchc17	81	70.335	Gadus_morhua
ENSACIG00000020915	zcchc17	92	59.124	ENSGALG00000000618	ZCCHC17	97	48.276	Gallus_gallus
ENSACIG00000020915	zcchc17	92	94.161	ENSGAFG00000015591	zcchc17	91	80.090	Gambusia_affinis
ENSACIG00000020915	zcchc17	92	86.861	ENSGACG00000005616	zcchc17	90	70.996	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000020915	zcchc17	97	57.931	ENSGAGG00000019515	ZCCHC17	65	60.377	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000020915	zcchc17	98	60.959	ENSGGOG00000009126	ZCCHC17	100	60.959	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000020915	zcchc17	93	94.928	ENSHBUG00000018638	zcchc17	90	85.650	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000020915	zcchc17	94	56.429	ENSHGLG00000005931	-	74	53.293	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	ENSHGLG00000019323	ZCCHC17	69	58.084	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	51.064	ENSHGLG00000014866	-	71	50.311	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	56.028	ENSHGLG00100019907	-	69	53.293	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	51.064	ENSHGLG00100000976	-	71	50.311	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000020915	zcchc17	91	59.259	ENSHGLG00100014521	ZCCHC17	92	60.284	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000020915	zcchc17	94	56.429	ENSHGLG00100009772	-	75	53.293	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000020915	zcchc17	92	89.051	ENSHCOG00000005075	zcchc17	67	89.571	Hippocampus_comes
ENSACIG00000020915	zcchc17	92	73.188	ENSIPUG00000020511	zcchc17	75	69.714	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	ENSSTOG00000003825	ZCCHC17	95	50.435	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000020915	zcchc17	91	93.382	ENSKMAG00000003662	zcchc17	93	77.974	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000020915	zcchc17	93	89.855	ENSLBEG00000002644	zcchc17	90	81.778	Labrus_bergylta
ENSACIG00000020915	zcchc17	89	65.909	ENSLACG00000016945	ZCCHC17	56	65.909	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000020915	zcchc17	89	69.173	ENSLOCG00000005280	zcchc17	61	70.701	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	ENSLAFG00000015364	ZCCHC17	68	58.084	Loxodonta_africana
ENSACIG00000020915	zcchc17	98	60.959	ENSMFAG00000039045	ZCCHC17	100	60.959	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000020915	zcchc17	98	60.959	ENSMMUG00000012156	ZCCHC17	100	60.959	Macaca_mulatta
ENSACIG00000020915	zcchc17	98	60.959	ENSMNEG00000032021	ZCCHC17	100	60.959	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000020915	zcchc17	98	60.959	ENSMLEG00000040817	ZCCHC17	100	60.959	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	85.816	ENSMAMG00000011701	zcchc17	93	75.652	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000020915	zcchc17	93	94.928	ENSMZEG00005005784	zcchc17	90	85.650	Maylandia_zebra
ENSACIG00000020915	zcchc17	92	60.584	ENSMGAG00000000777	ZCCHC17	94	49.569	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000020915	zcchc17	80	63.025	ENSMAUG00000005269	Zcchc17	64	62.238	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	53.191	ENSMICG00000028289	-	69	52.071	Microcebus_murinus
ENSACIG00000020915	zcchc17	72	51.852	ENSMICG00000035778	-	57	51.852	Microcebus_murinus
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	47.518	ENSMICG00000027526	-	80	44.828	Microcebus_murinus
ENSACIG00000020915	zcchc17	98	60.959	ENSMICG00000009354	-	100	60.959	Microcebus_murinus
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	ENSMOCG00000014937	Zcchc17	68	60.123	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000020915	zcchc17	93	90.647	ENSMMOG00000019813	zcchc17	93	70.755	Mola_mola
ENSACIG00000020915	zcchc17	88	57.252	ENSMODG00000025345	-	82	52.632	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	55.319	ENSMODG00000020372	-	94	53.143	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.993	ENSMODG00000017082	-	69	59.763	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000020915	zcchc17	92	90.511	ENSMALG00000016295	zcchc17	95	76.682	Monopterus_albus
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	MGP_CAROLIEiJ_G0026546	Zcchc17	68	60.123	Mus_caroli
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	ENSMUSG00000028772	Zcchc17	68	60.123	Mus_musculus
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	MGP_PahariEiJ_G0028878	Zcchc17	68	60.123	Mus_pahari
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	MGP_SPRETEiJ_G0027526	Zcchc17	68	60.123	Mus_spretus
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	54.610	ENSMPUG00000015442	ZCCHC17	70	53.293	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	ENSMLUG00000000594	ZCCHC17	95	52.838	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	59.574	ENSNGAG00000022689	Zcchc17	67	58.896	Nannospalax_galili
ENSACIG00000020915	zcchc17	64	76.042	ENSNBRG00000010797	zcchc17	63	76.842	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000020915	zcchc17	98	60.959	ENSNLEG00000001493	ZCCHC17	100	60.959	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000020915	zcchc17	80	64.706	ENSOPRG00000014449	ZCCHC17	76	61.074	Ochotona_princeps
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.284	ENSODEG00000003683	ZCCHC17	69	58.084	Octodon_degus
ENSACIG00000020915	zcchc17	93	95.652	ENSONIG00000002308	zcchc17	90	85.068	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	56.738	ENSOCUG00000027238	-	67	57.143	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000020915	zcchc17	92	91.971	ENSORLG00000011563	zcchc17	88	82.075	Oryzias_latipes
ENSACIG00000020915	zcchc17	92	91.971	ENSORLG00020019636	zcchc17	83	90.286	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000020915	zcchc17	92	91.971	ENSORLG00015011437	zcchc17	72	89.714	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000020915	zcchc17	92	91.241	ENSOMEG00000009464	zcchc17	87	81.221	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000020915	zcchc17	95	60.993	ENSOGAG00000013749	ZCCHC17	69	59.281	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000020915	zcchc17	94	60.000	ENSOARG00000001618	-	95	50.649	Ovis_aries
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