EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000020982 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: znf710b
Alias: -
Full Name: zinc finger protein 710b
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8012 bases
Position: chrCCOE01000285.1:322240-330251
Accession: ZDB-GENE-120503-2
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000027120	zf-C2H2	PF00096.26	7.4e-45	1	8
ENSACIP00000027120	zf-C2H2	PF00096.26	7.4e-45	2	8
ENSACIP00000027120	zf-C2H2	PF00096.26	7.4e-45	3	8
ENSACIP00000027120	zf-C2H2	PF00096.26	7.4e-45	4	8
ENSACIP00000027120	zf-C2H2	PF00096.26	7.4e-45	5	8
ENSACIP00000027120	zf-C2H2	PF00096.26	7.4e-45	6	8
ENSACIP00000027120	zf-C2H2	PF00096.26	7.4e-45	7	8
ENSACIP00000027120	zf-C2H2	PF00096.26	7.4e-45	8	8
ENSACIP00000027112	zf-C2H2	PF00096.26	2.8e-44	1	8
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ENSACIP00000027112	zf-C2H2	PF00096.26	2.8e-44	3	8
ENSACIP00000027112	zf-C2H2	PF00096.26	2.8e-44	4	8
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ENSACIP00000027112	zf-C2H2	PF00096.26	2.8e-44	6	8
ENSACIP00000027112	zf-C2H2	PF00096.26	2.8e-44	7	8
ENSACIP00000027112	zf-C2H2	PF00096.26	2.8e-44	8	8
ENSACIP00000027100	zf-C2H2	PF00096.26	5.2e-44	1	8
ENSACIP00000027100	zf-C2H2	PF00096.26	5.2e-44	2	8
ENSACIP00000027100	zf-C2H2	PF00096.26	5.2e-44	3	8
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ENSACIP00000027100	zf-C2H2	PF00096.26	5.2e-44	8	8
ENSACIP00000027120	zf-met	PF12874.7	3.3e-05	1	2
ENSACIP00000027120	zf-met	PF12874.7	3.3e-05	2	2
ENSACIP00000027112	zf-met	PF12874.7	0.00012	1	2
ENSACIP00000027112	zf-met	PF12874.7	0.00012	2	2
ENSACIP00000027100	zf-met	PF12874.7	0.0002	1	2
ENSACIP00000027100	zf-met	PF12874.7	0.0002	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000027821	-	2064	-	ENSACIP00000027112	687 (aa)	-	-
ENSACIT00000027809	-	2169	-	ENSACIP00000027100	722 (aa)	-	-
ENSACIT00000027829	-	1968	-	ENSACIP00000027120	655 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000020982	znf710b	50	41.071	ENSACIG00000002190	gfi1b	61	41.071
ENSACIG00000020982	znf710b	51	36.145	ENSACIG00000022293	-	94	36.218
ENSACIG00000020982	znf710b	50	32.044	ENSACIG00000009128	-	81	33.333
ENSACIG00000020982	znf710b	64	41.322	ENSACIG00000014123	znf236	77	38.835
ENSACIG00000020982	znf710b	50	37.931	ENSACIG00000022625	-	82	37.931
ENSACIG00000020982	znf710b	56	35.165	ENSACIG00000007855	-	89	40.496
ENSACIG00000020982	znf710b	52	41.489	ENSACIG00000023313	-	97	41.489
ENSACIG00000020982	znf710b	51	33.621	ENSACIG00000016180	znf341	50	33.621
ENSACIG00000020982	znf710b	52	39.326	ENSACIG00000016182	-	85	39.326
ENSACIG00000020982	znf710b	53	35.955	ENSACIG00000004626	-	85	35.955
ENSACIG00000020982	znf710b	53	39.655	ENSACIG00000010637	-	56	39.655
ENSACIG00000020982	znf710b	54	36.585	ENSACIG00000012636	ZNF319	90	34.940
ENSACIG00000020982	znf710b	50	35.961	ENSACIG00000015835	-	97	40.698
ENSACIG00000020982	znf710b	50	32.245	ENSACIG00000020938	zbtb47b	83	37.838
ENSACIG00000020982	znf710b	50	34.921	ENSACIG00000019815	-	84	35.521
ENSACIG00000020982	znf710b	58	36.306	ENSACIG00000015429	-	88	35.821
ENSACIG00000020982	znf710b	54	44.828	ENSACIG00000004666	-	99	39.597
ENSACIG00000020982	znf710b	50	33.906	ENSACIG00000019102	-	52	34.591
ENSACIG00000020982	znf710b	59	35.556	ENSACIG00000013508	ZNF384	54	35.556
ENSACIG00000020982	znf710b	50	34.251	ENSACIG00000017683	-	85	33.206
ENSACIG00000020982	znf710b	57	37.695	ENSACIG00000003515	-	94	37.812
ENSACIG00000020982	znf710b	50	38.462	ENSACIG00000004745	-	89	38.462
ENSACIG00000020982	znf710b	51	41.250	ENSACIG00000007192	zbtb7b	62	41.250
ENSACIG00000020982	znf710b	50	40.714	ENSACIG00000022330	-	83	40.714
ENSACIG00000020982	znf710b	56	34.286	ENSACIG00000013604	-	97	36.364
ENSACIG00000020982	znf710b	53	35.780	ENSACIG00000006586	-	62	35.780
ENSACIG00000020982	znf710b	55	33.449	ENSACIG00000016117	-	86	34.164
ENSACIG00000020982	znf710b	53	37.671	ENSACIG00000003754	-	93	37.671
ENSACIG00000020982	znf710b	57	36.364	ENSACIG00000013163	-	91	41.667
ENSACIG00000020982	znf710b	58	40.171	ENSACIG00000007464	-	78	40.171
ENSACIG00000020982	znf710b	53	31.646	ENSACIG00000002944	-	89	30.714
ENSACIG00000020982	znf710b	58	32.105	ENSACIG00000016779	patz1	52	36.842
ENSACIG00000020982	znf710b	59	36.667	ENSACIG00000004041	-	99	36.667
ENSACIG00000020982	znf710b	53	33.929	ENSACIG00000017166	-	93	41.772
ENSACIG00000020982	znf710b	50	34.711	ENSACIG00000017653	-	94	37.069
ENSACIG00000020982	znf710b	50	41.111	ENSACIG00000018440	-	95	41.111
ENSACIG00000020982	znf710b	54	35.398	ENSACIG00000012604	scrt2	69	35.398
ENSACIG00000020982	znf710b	55	30.450	ENSACIG00000011516	-	82	31.034
ENSACIG00000020982	znf710b	56	38.636	ENSACIG00000011515	-	75	38.636
ENSACIG00000020982	znf710b	53	33.333	ENSACIG00000023049	znf646	90	35.922
ENSACIG00000020982	znf710b	50	38.824	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	95	38.824
ENSACIG00000020982	znf710b	56	37.209	ENSACIG00000010739	-	87	37.209
ENSACIG00000020982	znf710b	50	37.273	ENSACIG00000018022	-	58	37.273
ENSACIG00000020982	znf710b	64	40.000	ENSACIG00000014282	znf526	81	33.333
ENSACIG00000020982	znf710b	52	43.333	ENSACIG00000023162	-	66	42.391
ENSACIG00000020982	znf710b	55	33.607	ENSACIG00000019447	-	73	33.607
ENSACIG00000020982	znf710b	50	35.398	ENSACIG00000002180	-	100	35.714
ENSACIG00000020982	znf710b	58	35.938	ENSACIG00000009755	-	88	37.013
ENSACIG00000020982	znf710b	50	40.206	ENSACIG00000006172	-	87	37.037
ENSACIG00000020982	znf710b	53	36.875	ENSACIG00000023212	-	79	36.364
ENSACIG00000020982	znf710b	55	34.146	ENSACIG00000019710	-	79	34.826
ENSACIG00000020982	znf710b	57	35.032	ENSACIG00000019791	-	95	35.032
ENSACIG00000020982	znf710b	65	35.443	ENSACIG00000017647	-	96	34.146
ENSACIG00000020982	znf710b	51	36.410	ENSACIG00000012084	-	98	36.410
ENSACIG00000020982	znf710b	60	40.411	ENSACIG00000017050	-	96	39.241
ENSACIG00000020982	znf710b	50	44.048	ENSACIG00000009717	-	95	33.333
ENSACIG00000020982	znf710b	50	35.907	ENSACIG00000013470	-	65	37.069
ENSACIG00000020982	znf710b	50	36.538	ENSACIG00000013149	-	79	36.538
ENSACIG00000020982	znf710b	55	39.252	ENSACIG00000013750	-	78	39.252
ENSACIG00000020982	znf710b	56	39.474	ENSACIG00000018641	snai2	71	39.474
ENSACIG00000020982	znf710b	50	44.828	ENSACIG00000011153	-	77	34.437
ENSACIG00000020982	znf710b	56	41.818	ENSACIG00000022738	-	90	41.818
ENSACIG00000020982	znf710b	60	37.838	ENSACIG00000000311	-	78	37.838
ENSACIG00000020982	znf710b	57	35.673	ENSACIG00000010647	-	99	39.316
ENSACIG00000020982	znf710b	51	32.390	ENSACIG00000000406	prdm5	74	35.458
ENSACIG00000020982	znf710b	51	41.573	ENSACIG00000022658	-	96	41.573
ENSACIG00000020982	znf710b	50	34.872	ENSACIG00000018404	-	76	35.319
ENSACIG00000020982	znf710b	66	42.045	ENSACIG00000006806	-	70	42.045
ENSACIG00000020982	znf710b	59	34.821	ENSACIG00000013613	scrt1b	77	34.821
ENSACIG00000020982	znf710b	59	37.903	ENSACIG00000004641	-	73	37.903
ENSACIG00000020982	znf710b	53	33.564	ENSACIG00000001369	-	93	35.922
ENSACIG00000020982	znf710b	51	34.914	ENSACIG00000023794	-	58	35.841
ENSACIG00000020982	znf710b	50	33.858	ENSACIG00000024444	-	65	34.802
ENSACIG00000020982	znf710b	50	36.628	ENSACIG00000016133	-	58	36.628

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000020982	znf710b	100	96.957	ENSAPOG00000021512	znf710b	100	96.957	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020982	znf710b	100	97.925	ENSACLG00000013604	znf710b	100	97.925	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000020982	znf710b	98	90.832	ENSCSEG00000012005	znf710b	100	90.504	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000020982	znf710b	100	77.025	ENSELUG00000017700	znf710b	100	77.527	Esox_lucius
ENSACIG00000020982	znf710b	99	93.566	ENSFHEG00000014039	znf710b	100	93.957	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000020982	znf710b	62	94.840	ENSGMOG00000017555	znf710b	100	95.086	Gadus_morhua
ENSACIG00000020982	znf710b	98	93.706	ENSGACG00000016481	znf710b	99	93.706	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000020982	znf710b	100	97.649	ENSHBUG00000023268	znf710b	100	97.649	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000020982	znf710b	91	80.078	ENSHBUG00000005895	-	98	82.975	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000020982	znf710b	100	89.714	ENSHCOG00000018972	znf710b	100	91.198	Hippocampus_comes
ENSACIG00000020982	znf710b	100	90.346	ENSKMAG00000017329	znf710b	100	90.346	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000020982	znf710b	100	93.133	ENSMAMG00000001213	znf710b	100	95.821	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000020982	znf710b	100	97.925	ENSMZEG00005008625	znf710b	100	97.925	Maylandia_zebra
ENSACIG00000020982	znf710b	100	88.906	ENSMMOG00000000136	znf710b	100	88.906	Mola_mola
ENSACIG00000020982	znf710b	100	95.422	ENSNBRG00000000292	znf710b	100	97.983	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000020982	znf710b	100	96.081	ENSONIG00000002589	znf710b	99	95.105	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000020982	znf710b	100	86.888	ENSORLG00000012610	znf710b	99	86.269	Oryzias_latipes
ENSACIG00000020982	znf710b	100	91.582	ENSORLG00020000009	znf710b	99	90.909	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000020982	znf710b	100	87.536	ENSPMGG00000008771	znf710b	98	86.798	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000020982	znf710b	100	92.120	ENSPFOG00000017353	znf710b	100	93.822	Poecilia_formosa
ENSACIG00000020982	znf710b	100	92.011	ENSPLAG00000001306	znf710b	100	93.966	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000020982	znf710b	100	91.869	ENSPMEG00000012507	znf710b	100	93.966	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000020982	znf710b	100	93.931	ENSPREG00000005030	znf710b	100	93.931	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000020982	znf710b	100	97.925	ENSPNYG00000019563	znf710b	100	97.925	Pundamilia_nyererei
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