EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000020985 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-37o8.1
Alias: fi12b10|wu:fi12b10
Full Name: si:dkey-37o8.1
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6072 bases
Position: chrCCOE01000190.1:188031-194102
Accession: ZDB-GENE-030131-5667
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000027091	GTP_EFTU	PF00009.27	1.5e-54	1	1
ENSACIP00000027091	MMR_HSR1	PF01926.23	8e-08	1	1
ENSACIP00000027091	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	3.5e-12	1	1
ENSACIP00000027091	GTP_EFTU_D3	PF03143.17	1.4e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000027800	-	1602	-	ENSACIP00000027091	533 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	70	71.046	ENSACIG00000011859	eef1a1b	90	71.046
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	73	69.152	ENSACIG00000001219	-	94	69.152
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	78	38.369	ENSACIG00000017087	hbs1l	70	38.369
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	78	34.368	ENSACIG00000006643	GSPT1	80	34.211
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	84	68.000	ENSACIG00000001197	-	97	68.000
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	70	69.973	ENSACIG00000005630	-	90	69.973
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	80	36.768	ENSACIG00000007028	-	84	36.830

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	83	89.213	ENSAPOG00000016459	si:dkey-37o8.1	98	89.213	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	83	90.112	ENSAOCG00000002663	si:dkey-37o8.1	97	90.112	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	83	90.112	ENSAPEG00000012670	si:dkey-37o8.1	97	90.112	Amphiprion_percula
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	79	94.062	ENSATEG00000002217	si:dkey-37o8.1	99	94.062	Anabas_testudineus
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	84	91.150	ENSACLG00000003519	si:dkey-37o8.1	99	91.150	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	81.922	ENSAMXG00000002728	si:dkey-37o8.1	95	81.922	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	81	71.363	ENSCPBG00000020570	-	85	71.363	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	83	83.408	ENSCSEG00000019807	si:dkey-37o8.1	97	82.705	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	87.643	ENSCVAG00000009828	si:dkey-37o8.1	96	87.643	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	86	77.074	ENSDARG00000071727	si:dkey-37o8.1	95	77.074	Danio_rerio
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	81.922	ENSELUG00000007495	si:dkey-37o8.1	95	81.922	Esox_lucius
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	87.643	ENSFHEG00000017452	si:dkey-37o8.1	96	87.643	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	78.261	ENSGMOG00000006122	si:dkey-37o8.1	96	78.261	Gadus_morhua
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	80.778	ENSGAFG00000000367	si:dkey-37o8.1	97	80.778	Gambusia_affinis
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	87.872	ENSGACG00000004505	si:dkey-37o8.1	96	87.872	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	81	71.363	ENSGAGG00000007724	-	91	75.000	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	84	90.929	ENSHBUG00000015515	si:dkey-37o8.1	99	90.929	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	83	77.978	ENSHCOG00000001215	si:dkey-37o8.1	99	77.978	Hippocampus_comes
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	80.778	ENSIPUG00000004067	si:dkey-37o8.1	95	80.778	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	88.330	ENSKMAG00000015910	si:dkey-37o8.1	96	88.330	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	90.909	ENSLBEG00000021334	si:dkey-37o8.1	87	90.909	Labrus_bergylta
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	73.684	ENSLACG00000003948	si:dkey-37o8.1	95	73.684	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	78.947	ENSLOCG00000011245	si:dkey-37o8.1	95	78.947	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	73.913	ENSMAMG00000009907	si:dkey-37o8.1	91	73.913	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	84	91.150	ENSMZEG00005018358	si:dkey-37o8.1	99	91.150	Maylandia_zebra
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	89.245	ENSMMOG00000004111	si:dkey-37o8.1	97	91.686	Mola_mola
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	81	79.908	ENSMALG00000017152	si:dkey-37o8.1	99	79.908	Monopterus_albus
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	84	91.150	ENSNBRG00000013552	si:dkey-37o8.1	99	91.150	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	83	91.892	ENSONIG00000006165	si:dkey-37o8.1	97	91.892	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	89.016	ENSORLG00000019066	si:dkey-37o8.1	96	89.016	Oryzias_latipes
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	89.016	ENSORLG00020008094	si:dkey-37o8.1	96	89.016	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	89.245	ENSORLG00015008410	si:dkey-37o8.1	96	89.245	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	89.245	ENSOMEG00000001868	si:dkey-37o8.1	96	89.245	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	80.778	ENSPKIG00000017246	si:dkey-37o8.1	95	80.778	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	85	86.534	ENSPFOG00000013173	si:dkey-37o8.1	98	86.534	Poecilia_formosa
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	85	85.430	ENSPLAG00000010405	si:dkey-37o8.1	98	85.430	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	85	86.976	ENSPMEG00000015233	si:dkey-37o8.1	98	86.976	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	84	86.637	ENSPREG00000006280	si:dkey-37o8.1	98	86.637	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	84	90.487	ENSPNYG00000002059	si:dkey-37o8.1	99	90.487	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	81.465	ENSPNAG00000009990	si:dkey-37o8.1	96	81.465	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	78.947	ENSSFOG00015019070	si:dkey-37o8.1	96	78.947	Scleropages_formosus
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	92.220	ENSSMAG00000016143	si:dkey-37o8.1	96	92.220	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	91.304	ENSSDUG00000009163	si:dkey-37o8.1	96	91.304	Seriola_dumerili
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	91.076	ENSSLDG00000023761	si:dkey-37o8.1	96	91.076	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	81	69.977	ENSSPUG00000007467	-	96	69.476	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	83	89.888	ENSSPAG00000013856	si:dkey-37o8.1	97	89.888	Stegastes_partitus
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	81	90.531	ENSTRUG00000009006	si:dkey-37o8.1	96	90.531	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	82	90.389	ENSTNIG00000017138	si:dkey-37o8.1	94	90.389	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	81	73.272	ENSXETG00000017744	42Sp50	98	70.742	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	84	87.082	ENSXCOG00000012296	si:dkey-37o8.1	98	87.082	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	85	86.755	ENSXMAG00000001998	si:dkey-37o8.1	98	86.755	Xiphophorus_maculatus