EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000021049 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpsa
Alias: laminin receptor 1 (ribosomal protein SA)|lamr1|zgc:55831|zgc:77824
Full Name: ribosomal protein SA
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1877 bases
Position: chrCCOE01000097.1:508857-510733
Accession: ZDB-GENE-040426-811
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000027170	Ribosomal_S2	PF00318.20	1.1e-25	1	2
ENSACIP00000027170	Ribosomal_S2	PF00318.20	1.1e-25	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000027882	-	888	-	ENSACIP00000027170	295 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000021049	rpsa	100	90.236	ENSG00000168028	RPSA	100	92.424	Homo_sapiens
ENSACIG00000021049	rpsa	100	94.983	ENSAPOG00000009630	rpsa	100	94.983	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000021049	rpsa	100	72.391	ENSAMEG00000005990	-	100	72.391	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000021049	rpsa	100	88.079	ENSAMEG00000008962	RPSA	100	88.079	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000021049	rpsa	100	95.318	ENSAOCG00000007195	rpsa	100	95.318	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000021049	rpsa	100	95.318	ENSAPEG00000016294	rpsa	100	95.318	Amphiprion_percula
ENSACIG00000021049	rpsa	100	96.610	ENSATEG00000011829	rpsa	100	96.610	Anabas_testudineus
ENSACIG00000021049	rpsa	100	82.866	ENSAPLG00000015724	RPSA	100	82.866	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000021049	rpsa	89	92.105	ENSACAG00000004183	RPSA	93	92.105	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000021049	rpsa	100	84.848	ENSANAG00000024778	-	100	84.848	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000021049	rpsa	78	82.251	ENSANAG00000002363	-	96	82.251	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000021049	rpsa	100	81.818	ENSANAG00000035115	-	100	81.818	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000021049	rpsa	94	85.357	ENSANAG00000035549	-	100	85.357	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000021049	rpsa	99	84.068	ENSANAG00000018328	-	99	84.068	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000021049	rpsa	58	87.356	ENSANAG00000027734	-	100	87.356	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000021049	rpsa	97	82.007	ENSANAG00000029062	-	97	82.007	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000021049	rpsa	100	99.322	ENSACLG00000000951	rpsa	100	99.322	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021049	rpsa	100	86.262	ENSAMXG00000033451	RPSA	100	86.262	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000021049	rpsa	100	89.562	ENSBTAG00000009757	RPSA	100	89.562	Bos_taurus
ENSACIG00000021049	rpsa	97	53.667	WBGene00004469	rps-0	100	53.667	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000021049	rpsa	97	86.806	ENSCJAG00000039742	-	100	86.806	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000021049	rpsa	100	79.798	ENSCJAG00000040201	-	100	79.798	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000021049	rpsa	97	88.927	ENSCJAG00000038557	-	98	88.927	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000021049	rpsa	86	82.812	ENSCJAG00000038869	-	89	82.812	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000021049	rpsa	96	89.860	ENSCJAG00000038983	-	97	89.860	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000021049	rpsa	98	84.483	ENSCJAG00000044506	-	88	84.483	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000021049	rpsa	100	88.552	ENSCJAG00000020127	-	98	88.552	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000021049	rpsa	100	88.411	ENSCJAG00000009675	-	100	88.411	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000021049	rpsa	100	84.512	ENSCJAG00000039894	-	100	84.512	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000021049	rpsa	97	83.737	ENSCJAG00000013993	-	97	83.737	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000021049	rpsa	100	89.562	ENSCAFG00000005101	RPSA	100	89.562	Canis_familiaris
ENSACIG00000021049	rpsa	72	80.660	ENSCAFG00020000225	-	88	80.660	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000021049	rpsa	90	91.418	ENSCAFG00020025526	-	80	91.418	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000021049	rpsa	100	87.879	ENSCAFG00020006753	-	100	87.879	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000021049	rpsa	95	88.298	ENSCAFG00020015440	-	90	88.298	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000021049	rpsa	94	83.871	ENSCAFG00020011537	-	100	83.871	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000021049	rpsa	64	84.043	ENSCHIG00000017327	-	82	84.043	Capra_hircus
ENSACIG00000021049	rpsa	72	94.340	ENSCHIG00000009985	-	86	94.340	Capra_hircus
ENSACIG00000021049	rpsa	100	73.064	ENSCHIG00000021680	-	100	73.064	Capra_hircus
ENSACIG00000021049	rpsa	100	89.226	ENSCHIG00000011924	RPSA	100	89.226	Capra_hircus
ENSACIG00000021049	rpsa	100	84.512	ENSTSYG00000035318	-	100	84.512	Carlito_syrichta
ENSACIG00000021049	rpsa	71	78.571	ENSTSYG00000025673	-	97	78.571	Carlito_syrichta
ENSACIG00000021049	rpsa	98	64.483	ENSTSYG00000030034	-	100	64.483	Carlito_syrichta
ENSACIG00000021049	rpsa	96	89.510	ENSTSYG00000011791	-	99	89.510	Carlito_syrichta
ENSACIG00000021049	rpsa	96	88.112	ENSTSYG00000036747	-	96	88.112	Carlito_syrichta
ENSACIG00000021049	rpsa	100	81.695	ENSTSYG00000030190	-	100	81.695	Carlito_syrichta
ENSACIG00000021049	rpsa	96	81.818	ENSTSYG00000029538	-	99	81.221	Carlito_syrichta
ENSACIG00000021049	rpsa	100	89.562	ENSTSYG00000004458	-	100	89.562	Carlito_syrichta
ENSACIG00000021049	rpsa	97	89.199	ENSTSYG00000036281	-	98	89.199	Carlito_syrichta
ENSACIG00000021049	rpsa	92	91.971	ENSCAPG00000015766	RPSA	100	91.971	Cavia_aperea
ENSACIG00000021049	rpsa	100	89.899	ENSCPOG00000008715	-	100	89.899	Cavia_porcellus
ENSACIG00000021049	rpsa	100	89.899	ENSCCAG00000036860	-	100	89.899	Cebus_capucinus
ENSACIG00000021049	rpsa	68	88.119	ENSCCAG00000036590	-	87	88.119	Cebus_capucinus
ENSACIG00000021049	rpsa	68	87.129	ENSCCAG00000033067	-	97	87.129	Cebus_capucinus
ENSACIG00000021049	rpsa	100	86.532	ENSCCAG00000005344	-	100	86.532	Cebus_capucinus
ENSACIG00000021049	rpsa	100	86.869	ENSCCAG00000000334	-	100	86.869	Cebus_capucinus
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ENSACIG00000021049	rpsa	100	85.906	ENSCSAG00000018772	-	100	85.906	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000021049	rpsa	100	85.859	ENSCSAG00000000286	-	100	85.859	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000021049	rpsa	100	74.247	ENSCSAG00000004919	-	100	74.247	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000021049	rpsa	78	90.517	ENSCHOG00000001021	-	100	90.517	Choloepus_hoffmanni
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ENSACIG00000021049	rpsa	62	81.967	ENSCPBG00000010175	-	68	81.967	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000021049	rpsa	99	66.780	ENSCING00000022358	-	95	66.780	Ciona_intestinalis
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ENSACIG00000021049	rpsa	98	65.781	ENSCSAVG00000006847	-	99	65.781	Ciona_savignyi
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ENSACIG00000021049	rpsa	70	86.538	ENSCANG00000029197	-	99	86.538	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000021049	rpsa	100	88.411	ENSCANG00000041822	-	100	88.411	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000021049	rpsa	100	86.195	ENSCANG00000014311	-	100	86.195	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000021049	rpsa	71	80.660	ENSCANG00000014001	-	87	80.660	Colobus_angolensis_palliatus
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ENSACIG00000021049	rpsa	100	69.492	ENSCGRG00001022478	-	100	69.492	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000021049	rpsa	100	76.094	ENSCGRG00001023065	-	100	76.094	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000021049	rpsa	100	90.236	ENSCGRG00001006680	-	100	90.236	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000021049	rpsa	100	64.646	ENSCGRG00001014762	-	100	64.646	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000021049	rpsa	100	64.646	ENSCGRG00000007138	-	100	64.646	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000021049	rpsa	100	69.153	ENSCGRG00000012657	-	100	69.153	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000021049	rpsa	53	93.631	ENSCGRG00000016882	Rpsa	88	93.631	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000021049	rpsa	99	74.830	ENSCGRG00000000708	-	100	74.830	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000021049	rpsa	100	85.284	ENSCGRG00000010343	-	100	85.284	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000021049	rpsa	100	93.939	ENSCSEG00000015086	rpsa	100	93.939	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000021049	rpsa	100	94.631	ENSCVAG00000007308	rpsa	100	94.631	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000021049	rpsa	100	90.291	ENSDARG00000019181	rpsa	100	98.889	Danio_rerio
ENSACIG00000021049	rpsa	98	60.900	ENSDNOG00000035877	-	99	60.900	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000021049	rpsa	87	64.479	ENSDNOG00000040697	-	95	62.238	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000021049	rpsa	100	89.899	ENSDNOG00000004048	-	100	89.899	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000021049	rpsa	99	71.331	ENSDNOG00000039101	-	99	71.331	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000021049	rpsa	99	64.784	ENSDNOG00000044874	-	99	64.784	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000021049	rpsa	96	62.105	ENSDNOG00000042322	-	98	63.509	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000021049	rpsa	91	66.667	ENSDNOG00000035845	-	91	66.667	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000021049	rpsa	99	67.347	ENSDNOG00000044795	-	100	68.707	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000021049	rpsa	97	77.431	ENSDNOG00000038753	-	95	77.431	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000021049	rpsa	100	88.889	ENSDORG00000008267	-	100	88.889	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000021049	rpsa	70	72.947	FBgn0003517	sta	99	61.871	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000021049	rpsa	100	88.889	ENSETEG00000018160	-	100	88.889	Echinops_telfairi
ENSACIG00000021049	rpsa	99	77.365	ENSEBUG00000008837	-	99	77.365	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000021049	rpsa	92	82.117	ENSEASG00005006870	-	97	82.117	Equus_asinus_asinus
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ENSACIG00000021049	rpsa	68	76.733	ENSEASG00005021699	-	78	76.733	Equus_asinus_asinus
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