EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000021449 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2988 bases
Position: chrCCOE01001127.1:15634-18621
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000027677	MMR_HSR1	PF01926.23	3.2e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000028407	-	1623	-	ENSACIP00000027677	540 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000021449	-	93	68.849	ENSACIG00000001022	-	94	68.849
ENSACIG00000021449	-	96	62.453	ENSACIG00000010569	-	97	62.453
ENSACIG00000021449	-	95	67.311	ENSACIG00000008256	-	96	67.311
ENSACIG00000021449	-	84	35.745	ENSACIG00000022228	-	78	35.745
ENSACIG00000021449	-	72	69.309	ENSACIG00000023712	-	97	69.309
ENSACIG00000021449	-	97	67.477	ENSACIG00000003168	-	99	67.477
ENSACIG00000021449	-	94	67.456	ENSACIG00000014982	-	96	67.456
ENSACIG00000021449	-	94	67.061	ENSACIG00000002240	-	95	67.061
ENSACIG00000021449	-	93	66.534	ENSACIG00000008585	-	98	66.534
ENSACIG00000021449	-	96	64.797	ENSACIG00000014961	-	94	64.797
ENSACIG00000021449	-	94	66.602	ENSACIG00000021889	-	92	66.602
ENSACIG00000021449	-	92	63.855	ENSACIG00000021882	-	93	63.727
ENSACIG00000021449	-	94	64.971	ENSACIG00000012148	-	94	65.558
ENSACIG00000021449	-	94	69.709	ENSACIG00000023726	-	96	69.709
ENSACIG00000021449	-	93	63.564	ENSACIG00000014898	-	93	63.601
ENSACIG00000021449	-	92	31.507	ENSACIG00000022269	-	85	31.507
ENSACIG00000021449	-	93	61.341	ENSACIG00000008246	-	91	61.341
ENSACIG00000021449	-	83	37.339	ENSACIG00000009923	-	74	37.554
ENSACIG00000021449	-	88	36.798	ENSACIG00000009814	-	87	36.798
ENSACIG00000021449	-	94	63.439	ENSACIG00000014973	-	96	63.439
ENSACIG00000021449	-	95	63.495	ENSACIG00000003888	-	96	63.495

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000021449	-	97	60.417	ENSAPOG00000005749	-	96	60.417	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000021449	-	83	35.332	ENSAPOG00000016636	-	91	35.560	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000021449	-	95	63.743	ENSAPOG00000021040	-	85	63.743	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000021449	-	98	60.377	ENSAPOG00000005726	-	95	60.377	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000021449	-	93	62.823	ENSAPEG00000000062	-	93	62.823	Amphiprion_percula
ENSACIG00000021449	-	92	67.735	ENSATEG00000012558	-	92	67.735	Anabas_testudineus
ENSACIG00000021449	-	92	68.273	ENSATEG00000019965	-	92	68.273	Anabas_testudineus
ENSACIG00000021449	-	92	67.265	ENSATEG00000023346	-	92	67.265	Anabas_testudineus
ENSACIG00000021449	-	96	56.731	ENSATEG00000017635	-	95	56.731	Anabas_testudineus
ENSACIG00000021449	-	72	68.167	ENSACLG00000009330	-	79	68.167	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021449	-	66	38.874	ENSACLG00000023033	-	92	38.874	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021449	-	71	63.333	ENSACLG00000015361	-	95	63.333	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021449	-	88	35.060	ENSACLG00000023468	-	83	35.141	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021449	-	84	68.354	ENSACLG00000006285	-	98	68.354	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021449	-	92	58.116	ENSACLG00000018599	-	95	58.116	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021449	-	90	59.754	ENSACLG00000006543	-	89	60.081	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021449	-	92	60.400	ENSACLG00000010007	-	75	60.400	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021449	-	89	64.959	ENSACLG00000021761	-	90	64.959	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021449	-	94	62.997	ENSACLG00000017259	-	96	62.997	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021449	-	92	68.354	ENSACLG00000006538	-	96	68.354	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021449	-	94	58.317	ENSACLG00000018271	-	94	58.317	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021449	-	95	68.431	ENSACLG00000009261	-	98	68.431	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021449	-	92	35.421	ENSACLG00000023126	-	95	35.421	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021449	-	95	39.884	ENSAMXG00000033407	-	97	39.962	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000021449	-	92	43.836	ENSAMXG00000029346	-	95	45.155	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000021449	-	88	40.496	ENSAMXG00000039672	-	92	40.326	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000021449	-	94	37.187	ENSAMXG00000041770	-	95	37.187	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000021449	-	96	42.230	ENSAMXG00000034407	-	97	42.413	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000021449	-	97	31.646	ENSAMXG00000036353	-	95	31.646	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000021449	-	94	40.769	ENSAMXG00000037920	-	96	42.430	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000021449	-	92	33.524	ENSAMXG00000035937	-	92	33.524	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000021449	-	92	51.131	ENSAMXG00000030535	-	94	51.131	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000021449	-	93	39.015	ENSAMXG00000032695	-	96	39.015	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000021449	-	94	61.840	ENSCVAG00000009446	-	98	61.840	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000021449	-	91	32.812	ENSCVAG00000011261	-	93	32.812	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000021449	-	94	56.436	ENSCVAG00000008134	-	96	56.436	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000021449	-	92	61.935	ENSCVAG00000007794	-	96	61.935	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000021449	-	85	63.931	ENSCVAG00000005819	-	99	63.931	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000021449	-	90	53.644	ENSCVAG00000013384	-	99	53.644	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000021449	-	96	61.346	ENSCVAG00000007269	-	97	61.346	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000021449	-	89	34.325	ENSFHEG00000021963	-	92	34.325	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000021449	-	92	58.434	ENSFHEG00000016342	-	97	58.434	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000021449	-	85	33.983	ENSGMOG00000008232	-	98	33.983	Gadus_morhua
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ENSACIG00000021449	-	86	34.025	ENSGMOG00000019825	-	98	34.096	Gadus_morhua
ENSACIG00000021449	-	87	35.282	ENSGMOG00000019330	-	81	35.282	Gadus_morhua
ENSACIG00000021449	-	86	34.661	ENSGMOG00000017552	-	80	34.661	Gadus_morhua
ENSACIG00000021449	-	85	35.510	ENSGMOG00000005680	-	79	35.031	Gadus_morhua
ENSACIG00000021449	-	95	58.167	ENSGAFG00000005023	-	96	57.812	Gambusia_affinis
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ENSACIG00000021449	-	88	62.737	ENSGACG00000013484	-	95	62.737	Gasterosteus_aculeatus
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