EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000021588 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srpra
Alias: id:ibd1064|srpr|wu:fd12f02
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6488 bases
Position: chrCCOE01000492.1:667626-674113
Accession: ZDB-GENE-030219-11
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000027927	SRP54	PF00448.22	6e-41	1	1
ENSACIP00000027927	SRP54_N	PF02881.19	6.3e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000028664	-	1911	-	ENSACIP00000027927	636 (aa)	-	-
ENSACIT00000028634	-	951	-	ENSACIP00000027897	316 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000021588's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000021588's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.514	ENSG00000182934	SRPRA	100	66.362	Homo_sapiens
ENSACIG00000021588	srpra	100	88.769	ENSAPOG00000017588	srpra	100	87.538	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.718	ENSAMEG00000000117	SRPRA	100	66.564	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000021588	srpra	100	88.923	ENSAOCG00000018884	srpra	100	87.692	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000021588	srpra	100	88.923	ENSAPEG00000022286	srpra	92	87.692	Amphiprion_percula
ENSACIG00000021588	srpra	100	84.969	ENSATEG00000023578	srpra	95	91.793	Anabas_testudineus
ENSACIG00000021588	srpra	94	67.891	ENSAPLG00000016079	SRPRA	99	69.082	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.269	ENSACAG00000000108	SRPRA	100	68.278	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.058	ENSANAG00000020346	SRPRA	100	65.906	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000021588	srpra	100	90.108	ENSACLG00000000518	srpra	100	88.717	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021588	srpra	100	71.894	ENSAMXG00000009975	srpra	100	71.783	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000021588	srpra	100	64.857	ENSBTAG00000014105	SRPRA	100	66.616	Bos_taurus
ENSACIG00000021588	srpra	99	47.713	WBGene00009521	F38A1.8	99	46.942	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.362	ENSCJAG00000008752	SRPRA	100	66.210	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000021588	srpra	100	65.297	ENSCAFG00000010474	SRPRA	100	64.787	Canis_familiaris
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.971	ENSCAFG00020010608	SRPRA	100	66.311	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000021588	srpra	100	67.228	ENSCHIG00000012423	SRPRA	100	66.514	Capra_hircus
ENSACIG00000021588	srpra	81	76.294	ENSTSYG00000005187	SRPRA	93	81.138	Carlito_syrichta
ENSACIG00000021588	srpra	95	63.681	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	88.722	Cavia_aperea
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.159	ENSCPOG00000014976	SRPRA	91	88.722	Cavia_porcellus
ENSACIG00000021588	srpra	100	65.954	ENSCCAG00000025602	SRPRA	100	65.805	Cebus_capucinus
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.718	ENSCATG00000039354	SRPRA	100	66.514	Cercocebus_atys
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.463	ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	66.311	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.514	ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	66.362	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000021588	srpra	54	86.735	ENSCHOG00000010015	-	73	86.735	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000021588	srpra	100	65.533	ENSCPBG00000011128	SRPRA	100	68.769	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000021588	srpra	99	57.604	ENSCING00000008954	-	100	58.065	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000021588	srpra	99	58.615	ENSCSAVG00000005602	-	100	58.333	Ciona_savignyi
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.411	ENSCANG00000032337	SRPRA	100	66.210	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.974	ENSCGRG00001017670	Srpr	100	66.463	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.974	ENSCGRG00000009892	Srpr	89	87.970	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000021588	srpra	100	83.461	ENSCSEG00000002374	srpra	100	82.083	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000021588	srpra	100	82.848	ENSCVAG00000019881	srpra	100	82.236	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000021588	srpra	100	77.454	ENSDARG00000061124	srpra	100	77.454	Danio_rerio
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.365	ENSDNOG00000010821	SRPRA	100	65.512	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.513	ENSDORG00000016719	Srpr	100	66.311	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000021588	srpra	99	50.850	FBgn0010391	Gtp-bp	100	51.543	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.210	ENSETEG00000013956	SRPRA	100	65.455	Echinops_telfairi
ENSACIG00000021588	srpra	50	79.385	ENSEBUG00000002602	srpra	92	65.258	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.921	ENSEASG00005022980	SRPRA	100	66.362	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.921	ENSECAG00000014692	SRPRA	100	66.362	Equus_caballus
ENSACIG00000021588	srpra	100	61.905	ENSEEUG00000007920	SRPRA	100	61.196	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000021588	srpra	100	81.413	ENSELUG00000017643	srpra	100	81.567	Esox_lucius
ENSACIG00000021588	srpra	81	63.498	ENSFCAG00000030894	-	99	62.429	Felis_catus
ENSACIG00000021588	srpra	100	67.431	ENSFCAG00000011274	-	100	66.565	Felis_catus
ENSACIG00000021588	srpra	99	66.409	ENSFALG00000005048	SRPRA	99	66.564	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.159	ENSFDAG00000016229	SRPRA	85	88.636	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000021588	srpra	100	85.714	ENSFHEG00000016959	srpra	100	84.793	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000021588	srpra	100	78.528	ENSGMOG00000013244	srpra	100	77.301	Gadus_morhua
ENSACIG00000021588	srpra	100	69.832	ENSGALG00000030759	SRPRA	100	69.184	Gallus_gallus
ENSACIG00000021588	srpra	100	86.090	ENSGAFG00000000453	srpra	100	84.699	Gambusia_affinis
ENSACIG00000021588	srpra	100	80.835	ENSGACG00000006550	srpra	100	79.507	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000021588	srpra	100	67.117	ENSGAGG00000021157	SRPRA	100	68.619	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.514	ENSGGOG00000012962	SRPRA	100	66.362	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000021588	srpra	100	89.954	ENSHBUG00000000119	srpra	100	88.563	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.359	ENSHGLG00000001597	SRPR	94	88.636	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.359	ENSHGLG00100006449	SRPR	94	88.636	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000021588	srpra	100	83.155	ENSHCOG00000010749	srpra	100	83.461	Hippocampus_comes
ENSACIG00000021588	srpra	94	74.510	ENSIPUG00000000867	srpra	99	74.673	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.258	ENSSTOG00000009897	SRPRA	100	66.462	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.206	ENSJJAG00000020272	Srpr	100	65.701	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000021588	srpra	100	84.509	ENSKMAG00000002280	srpra	100	84.356	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000021588	srpra	100	87.097	ENSLBEG00000009608	srpra	100	86.329	Labrus_bergylta
ENSACIG00000021588	srpra	100	69.149	ENSLACG00000017781	SRPRA	100	69.909	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000021588	srpra	100	74.046	ENSLOCG00000002733	srpra	100	73.893	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.972	ENSLAFG00000010252	SRPRA	100	67.071	Loxodonta_africana
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.667	ENSMFAG00000032606	SRPRA	100	66.514	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.667	ENSMMUG00000007938	SRPRA	100	66.514	Macaca_mulatta
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.717	ENSMNEG00000030709	SRPRA	100	66.565	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.718	ENSMLEG00000043404	SRPRA	100	66.514	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000021588	srpra	100	85.208	ENSMAMG00000000473	srpra	100	84.438	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000021588	srpra	100	90.108	ENSMZEG00005013432	srpra	100	88.717	Maylandia_zebra
ENSACIG00000021588	srpra	94	68.123	ENSMGAG00000000732	SRPRA	100	68.710	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.820	ENSMAUG00000015648	Srpr	100	66.313	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.769	ENSMICG00000015981	SRPRA	100	66.616	Microcebus_murinus
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.667	ENSMOCG00000008311	Srpr	100	66.159	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000021588	srpra	100	77.950	ENSMMOG00000005019	srpra	100	75.338	Mola_mola
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.870	ENSMODG00000004576	-	100	65.861	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000021588	srpra	100	86.308	ENSMALG00000011343	srpra	100	86.308	Monopterus_albus
ENSACIG00000021588	srpra	100	65.658	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	88	88.148	Mus_caroli
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.667	ENSMUSG00000032042	Srpr	88	87.407	Mus_musculus
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.820	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	88	88.148	Mus_pahari
ENSACIG00000021588	srpra	100	63.543	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	100	63.081	Mus_spretus
ENSACIG00000021588	srpra	100	67.275	ENSMPUG00000006626	SRPRA	100	66.971	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000021588	srpra	100	67.334	ENSMLUG00000017334	SRPRA	100	67.334	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.513	ENSNGAG00000015686	Srpr	100	65.854	Nannospalax_galili
ENSACIG00000021588	srpra	100	89.645	ENSNBRG00000017311	srpra	100	88.253	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000021588	srpra	99	63.190	ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	65.760	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000021588	srpra	94	65.691	ENSMEUG00000004956	SRPRA	100	64.895	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000021588	srpra	100	62.519	ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	62.519	Ochotona_princeps
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.154	ENSODEG00000004730	SRPRA	100	66.006	Octodon_degus
ENSACIG00000021588	srpra	100	89.799	ENSONIG00000005324	srpra	100	88.408	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.311	ENSOCUG00000017057	SRPRA	100	66.159	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000021588	srpra	100	81.538	ENSORLG00000014676	srpra	95	90.909	Oryzias_latipes
ENSACIG00000021588	srpra	100	81.692	ENSORLG00020009240	srpra	100	82.000	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000021588	srpra	100	81.385	ENSORLG00015015405	srpra	100	80.923	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000021588	srpra	100	82.308	ENSOMEG00000005872	srpra	100	82.071	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.667	ENSOGAG00000008926	SRPRA	100	66.210	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000021588	srpra	100	64.482	ENSOARG00000012397	SRPRA	100	64.165	Ovis_aries
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.514	ENSPPAG00000030813	SRPRA	100	66.362	Pan_paniscus
ENSACIG00000021588	srpra	100	67.431	ENSPPRG00000001542	SRPRA	100	66.565	Panthera_pardus
ENSACIG00000021588	srpra	100	67.278	ENSPTIG00000006989	SRPRA	100	66.412	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.514	ENSPTRG00000028360	SRPRA	100	66.362	Pan_troglodytes
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.667	ENSPANG00000010858	SRPRA	100	66.514	Papio_anubis
ENSACIG00000021588	srpra	100	75.267	ENSPKIG00000016106	srpra	100	74.355	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000021588	srpra	94	67.851	ENSPSIG00000012009	SRPRA	100	68.167	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000021588	srpra	100	82.663	ENSPMGG00000001393	srpra	100	82.689	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.820	ENSPEMG00000018279	Srpr	100	66.311	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000021588	srpra	99	60.182	ENSPMAG00000009559	srpra	99	59.877	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.820	ENSPCIG00000010207	SRPRA	100	66.163	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000021588	srpra	100	86.308	ENSPFOG00000003114	srpra	100	85.077	Poecilia_formosa
ENSACIG00000021588	srpra	100	86.308	ENSPLAG00000007323	srpra	100	85.077	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000021588	srpra	100	86.308	ENSPMEG00000015658	srpra	100	85.077	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000021588	srpra	100	86.000	ENSPREG00000004937	srpra	100	84.923	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000021588	srpra	89	72.368	ENSPPYG00000004045	SRPRA	100	72.368	Pongo_abelii
ENSACIG00000021588	srpra	61	82.171	ENSPCAG00000003801	-	63	82.171	Procavia_capensis
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.616	ENSPCOG00000025726	SRPRA	100	66.413	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000021588	srpra	100	67.176	ENSPVAG00000000993	SRPRA	100	67.023	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000021588	srpra	100	90.108	ENSPNYG00000012371	srpra	100	88.717	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000021588	srpra	100	78.428	ENSPNAG00000013476	srpra	100	78.274	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.667	ENSRNOG00000010543	Srpra	100	66.311	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.667	ENSRBIG00000008702	SRPRA	100	66.514	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.514	ENSRROG00000029494	SRPRA	100	66.058	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.058	ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	65.906	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000021588	srpra	94	66.558	ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	65.422	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000021588	srpra	100	71.894	ENSSFOG00015008837	srpra	100	72.291	Scleropages_formosus
ENSACIG00000021588	srpra	100	75.387	ENSSMAG00000002783	srpra	100	75.193	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000021588	srpra	100	86.790	ENSSDUG00000013920	srpra	100	78.241	Seriola_dumerili
ENSACIG00000021588	srpra	100	86.482	ENSSLDG00000008601	srpra	93	85.561	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000021588	srpra	82	80.488	ENSSARG00000012434	SRPRA	86	80.488	Sorex_araneus
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.819	ENSSPUG00000018221	SRPRA	100	67.071	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000021588	srpra	100	88.804	ENSSPAG00000005103	srpra	100	87.883	Stegastes_partitus
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.871	ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	66.564	Sus_scrofa
ENSACIG00000021588	srpra	94	66.721	ENSTGUG00000000815	SRPRA	100	66.883	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000021588	srpra	100	82.535	ENSTRUG00000006856	srpra	100	82.689	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000021588	srpra	100	77.376	ENSTNIG00000010316	srpra	100	77.074	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000021588	srpra	100	65.517	ENSTTRG00000001558	SRPRA	100	66.667	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000021588	srpra	100	67.075	ENSUAMG00000005510	SRPRA	100	66.364	Ursus_americanus
ENSACIG00000021588	srpra	96	60.876	ENSUMAG00000002269	SRPRA	100	60.345	Ursus_maritimus
ENSACIG00000021588	srpra	69	82.171	ENSVPAG00000001077	SRPRA	75	82.171	Vicugna_pacos
ENSACIG00000021588	srpra	100	66.616	ENSVVUG00000020094	SRPRA	100	66.311	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000021588	srpra	100	57.418	ENSXETG00000003920	srpra	100	59.248	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000021588	srpra	92	83.469	ENSXCOG00000001286	srpra	100	90.691	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000021588	srpra	100	85.162	ENSXMAG00000028401	srpra	100	83.771	Xiphophorus_maculatus