EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000021885 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpl21
Alias: wu:fb13h07|wu:fc74e02|zgc:86669
Full Name: ribosomal protein L21
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2385 bases
Position: chrCCOE01000449.1:2302448-2304832
Accession: ZDB-GENE-030131-8512
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000028242	Ribosomal_L21e	PF01157.18	1.9e-51	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000028987	-	483	-	ENSACIP00000028242	160 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000021885	rpl21	100	88.125	ENSG00000122026	RPL21	100	90.164	Homo_sapiens
ENSACIG00000021885	rpl21	100	95.625	ENSAPOG00000024402	rpl21	100	95.625	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000021885	rpl21	100	85.000	ENSAMEG00000018663	RPL21	98	85.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000021885	rpl21	51	85.185	ENSAMEG00000016455	-	96	85.882	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000021885	rpl21	100	54.375	ENSAMEG00000004632	-	100	54.375	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000021885	rpl21	100	68.944	ENSAMEG00000004710	-	100	68.944	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000021885	rpl21	100	95.625	ENSAOCG00000017829	rpl21	100	95.625	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000021885	rpl21	100	95.625	ENSAPEG00000019936	rpl21	100	95.625	Amphiprion_percula
ENSACIG00000021885	rpl21	100	97.500	ENSATEG00000010524	rpl21	100	97.500	Anabas_testudineus
ENSACIG00000021885	rpl21	100	86.875	ENSAPLG00000005641	RPL21	98	86.875	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000021885	rpl21	100	88.750	ENSACAG00000003169	RPL21	100	88.750	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000021885	rpl21	100	88.125	ENSANAG00000023031	-	100	88.125	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000021885	rpl21	100	85.625	ENSANAG00000020005	-	100	85.625	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000021885	rpl21	100	86.250	ENSANAG00000031230	-	100	86.250	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000021885	rpl21	100	86.250	ENSANAG00000006331	-	100	86.250	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000021885	rpl21	100	86.250	ENSANAG00000031513	-	100	86.250	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000021885	rpl21	97	87.097	ENSANAG00000012283	-	100	87.097	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000021885	rpl21	100	83.125	ENSANAG00000019962	-	100	83.125	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000021885	rpl21	100	98.125	ENSACLG00000026444	rpl21	100	98.125	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021885	rpl21	100	93.125	ENSAMXG00000041892	rpl21	100	93.125	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000021885	rpl21	100	88.125	ENSBTAG00000001648	RPL21	100	88.125	Bos_taurus
ENSACIG00000021885	rpl21	100	86.250	ENSBTAG00000038379	-	100	86.250	Bos_taurus
ENSACIG00000021885	rpl21	51	88.889	ENSBTAG00000048537	-	84	88.889	Bos_taurus
ENSACIG00000021885	rpl21	100	61.491	WBGene00004433	rpl-21	100	61.491	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000021885	rpl21	100	86.875	ENSCJAG00000038205	-	100	86.875	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000021885	rpl21	100	63.125	ENSCJAG00000044477	-	100	63.125	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000021885	rpl21	100	72.500	ENSCJAG00000044730	-	100	72.500	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000021885	rpl21	82	90.076	ENSCJAG00000044684	-	92	90.076	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000021885	rpl21	67	78.505	ENSCJAG00000041707	-	98	78.505	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000021885	rpl21	100	80.625	ENSCJAG00000019734	-	100	80.625	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000021885	rpl21	100	87.500	ENSCJAG00000043116	-	100	87.500	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000021885	rpl21	92	87.075	ENSCJAG00000039102	-	100	87.075	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000021885	rpl21	100	87.500	ENSCAFG00000028744	-	100	87.500	Canis_familiaris
ENSACIG00000021885	rpl21	100	88.125	ENSCAFG00000032537	-	100	88.125	Canis_familiaris
ENSACIG00000021885	rpl21	99	78.616	ENSCAFG00000001564	-	99	78.616	Canis_familiaris
ENSACIG00000021885	rpl21	100	84.375	ENSCAFG00000015987	-	100	84.375	Canis_familiaris
ENSACIG00000021885	rpl21	100	87.037	ENSCAFG00000006810	RPL21	100	87.037	Canis_familiaris
ENSACIG00000021885	rpl21	76	83.607	ENSCAFG00000015533	-	88	83.607	Canis_familiaris
ENSACIG00000021885	rpl21	96	58.710	ENSCAFG00000018881	-	97	58.710	Canis_familiaris
ENSACIG00000021885	rpl21	99	60.759	ENSCAFG00000024055	-	99	60.759	Canis_familiaris
ENSACIG00000021885	rpl21	100	87.500	ENSCAFG00000008805	-	100	87.500	Canis_familiaris
ENSACIG00000021885	rpl21	73	85.470	ENSCAFG00000029659	-	99	85.470	Canis_familiaris
ENSACIG00000021885	rpl21	100	85.625	ENSCAFG00020020914	-	100	85.625	Canis_lupus_dingo
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ENSACIG00000021885	rpl21	100	88.125	ENSCAFG00020012834	-	100	88.125	Canis_lupus_dingo
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ENSACIG00000021885	rpl21	100	85.000	ENSCAFG00020026205	-	100	85.000	Canis_lupus_dingo
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ENSACIG00000021885	rpl21	100	78.750	ENSCCAG00000033290	-	100	78.750	Cebus_capucinus
ENSACIG00000021885	rpl21	99	88.050	ENSCCAG00000009412	-	96	88.050	Cebus_capucinus
ENSACIG00000021885	rpl21	100	88.125	ENSCCAG00000000258	-	100	88.125	Cebus_capucinus
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