EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000021889 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2462 bases
Position: chrCCOE01001296.1:76637-79098
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000028248	MMR_HSR1	PF01926.23	4.8e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000028993	-	1644	-	ENSACIP00000028248	547 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000021889	-	92	66.602	ENSACIG00000021449	-	94	66.602
ENSACIG00000021889	-	91	72.102	ENSACIG00000023726	-	95	72.102
ENSACIG00000021889	-	93	64.854	ENSACIG00000014961	-	94	64.854
ENSACIG00000021889	-	90	36.084	ENSACIG00000009923	-	83	36.852
ENSACIG00000021889	-	91	65.941	ENSACIG00000014898	-	93	66.142
ENSACIG00000021889	-	92	69.141	ENSACIG00000012148	-	94	69.141
ENSACIG00000021889	-	90	32.500	ENSACIG00000022269	-	86	32.745
ENSACIG00000021889	-	93	69.598	ENSACIG00000010569	-	97	69.598
ENSACIG00000021889	-	93	70.656	ENSACIG00000008256	-	96	70.656
ENSACIG00000021889	-	91	77.000	ENSACIG00000014973	-	95	77.000
ENSACIG00000021889	-	91	69.141	ENSACIG00000003168	-	95	69.141
ENSACIG00000021889	-	93	65.953	ENSACIG00000002240	-	97	65.953
ENSACIG00000021889	-	90	68.410	ENSACIG00000021882	-	93	68.273
ENSACIG00000021889	-	92	68.442	ENSACIG00000003888	-	95	68.442
ENSACIG00000021889	-	91	68.191	ENSACIG00000001022	-	94	68.191
ENSACIG00000021889	-	69	70.130	ENSACIG00000023712	-	96	70.130
ENSACIG00000021889	-	80	36.797	ENSACIG00000022228	-	77	36.797
ENSACIG00000021889	-	91	65.079	ENSACIG00000008585	-	99	65.079
ENSACIG00000021889	-	92	68.182	ENSACIG00000014982	-	96	68.182
ENSACIG00000021889	-	83	37.931	ENSACIG00000009814	-	84	37.931
ENSACIG00000021889	-	92	64.648	ENSACIG00000008246	-	92	64.648

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000021889	-	91	61.111	ENSAPOG00000005749	-	92	61.111	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000021889	-	93	63.209	ENSAPOG00000005726	-	95	63.209	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000021889	-	93	62.891	ENSAPOG00000021040	-	85	62.891	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000021889	-	80	35.590	ENSAPOG00000016636	-	91	35.590	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000021889	-	92	60.588	ENSAPEG00000000062	-	95	60.588	Amphiprion_percula
ENSACIG00000021889	-	92	59.608	ENSATEG00000017635	-	94	59.608	Anabas_testudineus
ENSACIG00000021889	-	93	64.410	ENSATEG00000012558	-	96	64.410	Anabas_testudineus
ENSACIG00000021889	-	93	64.466	ENSATEG00000019965	-	96	64.466	Anabas_testudineus
ENSACIG00000021889	-	93	67.961	ENSATEG00000023346	-	95	67.961	Anabas_testudineus
ENSACIG00000021889	-	90	61.224	ENSACLG00000018599	-	95	61.224	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021889	-	93	61.122	ENSACLG00000010007	-	78	61.122	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021889	-	82	66.771	ENSACLG00000006285	-	98	67.857	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021889	-	86	34.921	ENSACLG00000023468	-	87	35.192	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021889	-	76	69.255	ENSACLG00000009330	-	82	72.241	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021889	-	86	65.806	ENSACLG00000017259	-	94	65.909	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021889	-	89	62.272	ENSACLG00000006543	-	90	62.749	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021889	-	91	69.841	ENSACLG00000006538	-	97	70.779	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021889	-	93	59.608	ENSACLG00000018271	-	94	59.608	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021889	-	90	37.182	ENSACLG00000023126	-	96	37.182	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021889	-	64	38.919	ENSACLG00000023033	-	92	38.919	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021889	-	93	70.217	ENSACLG00000009261	-	98	70.217	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021889	-	69	64.156	ENSACLG00000015361	-	95	64.156	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021889	-	92	61.359	ENSACLG00000021761	-	95	61.359	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000021889	-	89	37.149	ENSAMXG00000041770	-	91	37.149	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000021889	-	87	43.878	ENSAMXG00000033407	-	93	44.603	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000021889	-	93	38.632	ENSAMXG00000034407	-	96	38.745	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000021889	-	92	43.021	ENSAMXG00000029346	-	93	44.732	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000021889	-	93	39.499	ENSAMXG00000037920	-	99	39.883	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000021889	-	93	32.642	ENSAMXG00000036353	-	92	32.642	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000021889	-	91	51.786	ENSAMXG00000030535	-	95	51.786	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000021889	-	92	34.091	ENSAMXG00000035937	-	94	34.091	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000021889	-	86	42.650	ENSAMXG00000039672	-	92	42.769	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000021889	-	90	39.619	ENSAMXG00000032695	-	96	39.619	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000021889	-	93	59.375	ENSCVAG00000008127	-	96	59.375	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000021889	-	84	34.091	ENSCVAG00000008633	-	88	34.375	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000021889	-	92	63.580	ENSCVAG00000007794	-	97	62.805	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000021889	-	50	60.714	ENSCVAG00000022669	-	98	60.714	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000021889	-	93	54.297	ENSCVAG00000006308	-	93	54.297	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000021889	-	88	34.252	ENSCVAG00000015205	-	89	34.252	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000021889	-	93	62.157	ENSCVAG00000009446	-	98	62.157	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000021889	-	89	33.399	ENSCVAG00000011261	-	93	33.399	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000021889	-	93	57.957	ENSCVAG00000008134	-	97	57.957	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000021889	-	92	65.217	ENSCVAG00000004690	-	93	65.476	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000021889	-	90	61.723	ENSFHEG00000006385	-	92	61.723	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000021889	-	90	59.000	ENSFHEG00000006425	-	97	59.000	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000021889	-	90	56.942	ENSFHEG00000023034	-	96	56.942	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000021889	-	82	34.573	ENSGMOG00000008232	-	98	33.917	Gadus_morhua
ENSACIG00000021889	-	95	34.004	ENSGMOG00000019330	-	91	34.004	Gadus_morhua
ENSACIG00000021889	-	85	34.244	ENSGMOG00000011319	-	92	34.244	Gadus_morhua
ENSACIG00000021889	-	84	32.990	ENSGMOG00000019825	-	99	33.745	Gadus_morhua
ENSACIG00000021889	-	91	33.902	ENSGMOG00000017552	-	87	33.902	Gadus_morhua
ENSACIG00000021889	-	90	34.659	ENSGMOG00000005680	-	87	34.594	Gadus_morhua
ENSACIG00000021889	-	94	57.143	ENSGAFG00000005023	-	98	57.255	Gambusia_affinis
ENSACIG00000021889	-	93	60.234	ENSGAFG00000005032	-	95	60.234	Gambusia_affinis
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