EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000021986 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6248 bases
Position: chrCCOE01001301.1:14710-20957
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000028373	zf-C2H2	PF00096.26	8e-42	1	8
ENSACIP00000028373	zf-C2H2	PF00096.26	8e-42	2	8
ENSACIP00000028373	zf-C2H2	PF00096.26	8e-42	3	8
ENSACIP00000028373	zf-C2H2	PF00096.26	8e-42	4	8
ENSACIP00000028373	zf-C2H2	PF00096.26	8e-42	5	8
ENSACIP00000028373	zf-C2H2	PF00096.26	8e-42	6	8
ENSACIP00000028373	zf-C2H2	PF00096.26	8e-42	7	8
ENSACIP00000028373	zf-C2H2	PF00096.26	8e-42	8	8
ENSACIP00000028373	zf-met	PF12874.7	1.1e-08	1	2
ENSACIP00000028373	zf-met	PF12874.7	1.1e-08	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000029123	-	1002	-	ENSACIP00000028373	333 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000021986	-	89	39.394	ENSACIG00000007464	-	52	39.344
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ENSACIG00000021986	-	91	45.745	ENSACIG00000009780	-	73	45.745
ENSACIG00000021986	-	96	34.800	ENSACIG00000009128	-	86	34.800
ENSACIG00000021986	-	91	45.374	ENSACIG00000010637	-	55	45.833
ENSACIG00000021986	-	92	50.847	ENSACIG00000009755	-	85	50.847
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ENSACIG00000021986	-	97	42.500	ENSACIG00000009717	-	86	40.705
ENSACIG00000021986	-	95	41.667	ENSACIG00000018022	-	53	43.750
ENSACIG00000021986	-	96	44.512	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	89	44.512
ENSACIG00000021986	-	93	34.643	ENSACIG00000001767	zbtb41	63	34.643
ENSACIG00000021986	-	93	40.000	ENSACIG00000019804	-	83	40.000
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ENSACIG00000021986	-	98	49.153	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	85	45.312
ENSACIG00000021986	-	93	36.111	ENSACIG00000000406	prdm5	75	36.404
ENSACIG00000021986	-	95	45.122	ENSACIG00000017050	-	100	41.315
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ENSACIG00000021986	-	91	44.131	ENSACIG00000024444	-	60	44.131
ENSACIG00000021986	-	95	43.939	ENSACIG00000013604	-	98	41.611
ENSACIG00000021986	-	92	45.455	ENSACIG00000011541	-	67	42.756
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ENSACIG00000021986	-	87	45.783	ENSACIG00000007034	-	89	44.776
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ENSACIG00000021986	-	92	43.721	ENSACIG00000019791	-	88	43.333
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ENSACIG00000021986	-	98	42.617	ENSACIG00000017647	-	87	44.485
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ENSACIG00000021986	-	91	41.441	ENSACIG00000004641	-	59	41.441
ENSACIG00000021986	-	91	44.248	ENSACIG00000018952	-	52	44.248
ENSACIG00000021986	-	93	41.949	ENSACIG00000003556	-	73	41.949
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ENSACIG00000021986	-	92	39.695	ENSACIG00000006377	-	69	39.695
ENSACIG00000021986	-	95	46.429	ENSACIG00000012084	-	94	46.429
ENSACIG00000021986	-	93	40.594	ENSACIG00000004745	-	91	41.538
ENSACIG00000021986	-	92	67.857	ENSACIG00000008886	znf1164	81	67.857
ENSACIG00000021986	-	92	39.655	ENSACIG00000019815	-	82	39.655
ENSACIG00000021986	-	93	36.364	ENSACIG00000012604	scrt2	53	42.466
ENSACIG00000021986	-	96	38.824	ENSACIG00000017683	-	80	37.281
ENSACIG00000021986	-	90	38.235	ENSACIG00000017892	-	92	38.235
ENSACIG00000021986	-	91	43.684	ENSACIG00000003754	-	84	43.684
ENSACIG00000021986	-	92	37.131	ENSACIG00000013163	-	93	37.131

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000021986	-	96	46.465	ENSG00000267041	ZNF850	93	46.465	Homo_sapiens
ENSACIG00000021986	-	94	48.797	ENSAPOG00000007596	-	95	48.797	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000021986	-	92	44.978	ENSAPOG00000004628	-	99	43.290	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000021986	-	95	43.846	ENSAPOG00000007629	-	90	44.242	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000021986	-	99	43.885	ENSAPOG00000004417	-	96	41.846	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000021986	-	95	40.964	ENSAPOG00000022113	-	84	40.461	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000021986	-	92	42.244	ENSAPOG00000003666	-	97	42.244	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000021986	-	95	44.025	ENSAPOG00000008386	-	91	45.024	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000021986	-	99	39.419	ENSAMEG00000007611	-	100	43.377	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000021986	-	96	42.692	ENSAOCG00000001327	-	89	40.203	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000021986	-	95	40.950	ENSAOCG00000001615	-	86	42.435	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000021986	-	93	44.406	ENSAOCG00000004564	-	83	43.846	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000021986	-	97	43.098	ENSAOCG00000022675	-	97	43.974	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000021986	-	92	41.824	ENSAOCG00000022079	-	77	41.824	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000021986	-	94	39.634	ENSAOCG00000012653	-	82	38.889	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000021986	-	95	46.885	ENSAOCG00000001341	-	96	46.885	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000021986	-	92	47.883	ENSAOCG00000022283	-	90	47.883	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000021986	-	92	45.928	ENSAOCG00000004559	-	91	45.928	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000021986	-	93	45.000	ENSAPEG00000002558	-	86	45.000	Amphiprion_percula
ENSACIG00000021986	-	92	39.175	ENSAPEG00000012926	-	76	39.175	Amphiprion_percula
ENSACIG00000021986	-	97	43.098	ENSAPEG00000004486	-	97	42.951	Amphiprion_percula
ENSACIG00000021986	-	92	45.029	ENSAPEG00000016118	-	98	41.912	Amphiprion_percula
ENSACIG00000021986	-	94	47.557	ENSAPEG00000002585	-	95	47.557	Amphiprion_percula
ENSACIG00000021986	-	92	45.238	ENSAPEG00000002888	-	92	45.238	Amphiprion_percula
ENSACIG00000021986	-	95	47.594	ENSAPEG00000012599	-	96	47.594	Amphiprion_percula
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