EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000022027 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4277 bases
Position: chrCCOE01000208.1:169060-173336
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000028435	Endonuclease_NS	PF01223.23	7.7e-19	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000029187	-	885	-	ENSACIP00000028435	294 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000022027	-	87	36.538	ENSACIG00000012712	-	71	38.991
ENSACIG00000022027	-	67	32.367	ENSACIG00000007813	-	70	32.850
ENSACIG00000022027	-	81	34.510	ENSACIG00000009432	-	88	35.102
ENSACIG00000022027	-	84	36.546	ENSACIG00000006055	-	75	37.339
ENSACIG00000022027	-	83	33.065	ENSACIG00000016021	si:dkey-243k1.3	76	35.122
ENSACIG00000022027	-	85	33.588	ENSACIG00000008299	-	72	36.073
ENSACIG00000022027	-	78	32.365	ENSACIG00000008317	-	75	33.182
ENSACIG00000022027	-	77	34.483	ENSACIG00000022595	-	69	36.667
ENSACIG00000022027	-	88	53.462	ENSACIG00000014265	-	87	53.462
ENSACIG00000022027	-	85	33.591	ENSACIG00000015751	-	76	35.747
ENSACIG00000022027	-	90	60.000	ENSACIG00000001431	-	94	60.000
ENSACIG00000022027	-	91	44.755	ENSACIG00000022024	si:dkey-85k7.11	90	44.755

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000022027	-	95	81.720	ENSAPOG00000010299	-	95	81.720	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022027	-	86	36.719	ENSAPOG00000023293	-	78	37.447	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022027	-	96	50.352	ENSAPOG00000008291	-	95	50.352	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022027	-	67	33.019	ENSAPOG00000022953	-	66	33.019	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022027	-	87	48.897	ENSAPOG00000010331	si:dkey-85k7.11	90	49.259	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022027	-	60	53.672	ENSAPOG00000010286	si:dkey-85k7.10	73	62.595	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022027	-	83	37.449	ENSAPOG00000022205	-	75	38.197	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022027	-	96	58.156	ENSAPOG00000008666	-	94	58.156	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022027	-	87	50.570	ENSAOCG00000021316	si:dkey-85k7.11	87	51.163	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022027	-	86	37.891	ENSAOCG00000007227	-	78	38.723	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022027	-	69	33.816	ENSAOCG00000015199	-	73	33.816	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022027	-	89	31.579	ENSAOCG00000002456	si:dkey-243k1.3	73	34.300	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022027	-	87	58.755	ENSAOCG00000021283	si:dkey-85k7.10	86	58.755	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022027	-	67	30.769	ENSAOCG00000008016	si:ch211-133n4.4	69	30.769	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022027	-	88	54.615	ENSAOCG00000005015	-	87	54.615	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022027	-	95	58.781	ENSAOCG00000013137	-	94	58.781	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022027	-	84	37.349	ENSAOCG00000000850	-	74	37.768	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022027	-	95	82.500	ENSAOCG00000021294	-	93	82.500	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022027	-	88	54.615	ENSAPEG00000008708	-	87	54.615	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022027	-	74	30.000	ENSAPEG00000023828	-	85	30.000	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022027	-	89	31.579	ENSAPEG00000024409	si:dkey-243k1.3	74	34.314	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022027	-	89	31.579	ENSAPEG00000024402	-	73	33.816	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022027	-	57	31.361	ENSAPEG00000017445	-	68	36.066	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022027	-	95	82.437	ENSAPEG00000018878	-	95	82.437	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022027	-	84	36.948	ENSAPEG00000012445	-	74	37.339	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022027	-	85	50.391	ENSAPEG00000018889	si:dkey-85k7.11	93	50.996	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022027	-	95	58.781	ENSAPEG00000007291	-	94	58.781	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022027	-	87	58.755	ENSAPEG00000018856	si:dkey-85k7.10	86	58.755	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022027	-	84	37.349	ENSAPEG00000018986	-	74	37.768	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022027	-	86	37.500	ENSAPEG00000013928	-	78	38.298	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022027	-	78	30.612	ENSATEG00000014621	-	82	30.603	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	90	31.541	ENSATEG00000014514	-	77	31.541	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	83	32.946	ENSATEG00000014512	-	55	35.714	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	89	54.406	ENSATEG00000008791	-	85	54.615	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	86	30.827	ENSATEG00000014542	-	62	34.450	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	80	31.120	ENSATEG00000014672	-	72	31.556	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	94	47.842	ENSATEG00000017500	si:dkey-85k7.11	91	47.842	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	95	32.056	ENSATEG00000022068	si:dkey-243k1.3	79	33.921	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	82	33.858	ENSATEG00000014477	-	63	33.858	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	80	31.837	ENSATEG00000014652	-	91	31.837	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	79	33.607	ENSATEG00000014488	-	69	34.529	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	87	33.835	ENSATEG00000014484	-	63	36.667	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	82	39.419	ENSATEG00000011941	-	76	39.224	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	96	59.011	ENSATEG00000019243	-	95	59.011	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	81	40.167	ENSATEG00000009957	-	71	41.284	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	90	32.404	ENSATEG00000014589	-	73	32.883	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	93	31.818	ENSATEG00000014635	-	76	32.328	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	89	33.333	ENSATEG00000014502	-	50	36.744	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	76	34.322	ENSATEG00000014430	-	54	35.648	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	77	30.131	ENSATEG00000021350	-	58	31.122	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	86	33.460	ENSATEG00000014579	-	64	35.266	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	91	31.915	ENSATEG00000014573	-	64	35.160	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	97	77.113	ENSATEG00000017521	-	96	76.761	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	87	31.343	ENSATEG00000014526	-	72	31.343	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	89	31.522	ENSATEG00000014520	-	76	31.522	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022027	-	72	35.780	ENSACAG00000005411	-	77	35.780	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000022027	-	67	35.354	ENSACAG00000005752	-	71	35.354	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000022027	-	89	87.072	ENSACLG00000018928	-	92	87.072	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022027	-	87	59.144	ENSACLG00000018914	si:dkey-85k7.10	85	59.144	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022027	-	75	32.051	ENSACLG00000017744	-	81	32.051	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022027	-	67	34.615	ENSACLG00000017798	-	65	33.654	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022027	-	83	37.295	ENSACLG00000013353	-	77	36.134	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022027	-	88	33.835	ENSACLG00000011404	si:dkey-243k1.3	73	35.784	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022027	-	95	58.993	ENSACLG00000026586	-	94	58.993	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022027	-	69	35.648	ENSACLG00000017733	-	56	35.648	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022027	-	96	45.614	ENSACLG00000018957	si:dkey-85k7.11	94	45.614	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022027	-	87	30.325	ENSACLG00000016915	-	70	32.870	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022027	-	86	30.597	ENSACLG00000015425	-	65	32.203	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022027	-	90	33.333	ENSACLG00000001104	-	83	34.156	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022027	-	88	53.462	ENSACLG00000008439	-	86	53.462	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022027	-	78	38.158	ENSACLG00000021771	-	67	38.991	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022027	-	72	31.489	ENSAMXG00000035215	-	82	31.224	Astyanax_mexicanus
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ENSACIG00000022027	-	87	31.698	ENSAMXG00000040929	-	90	31.698	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022027	-	87	53.307	ENSAMXG00000040926	-	89	53.307	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022027	-	97	48.958	ENSAMXG00000019998	-	96	48.958	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022027	-	93	62.868	ENSAMXG00000019995	zgc:172339	95	61.210	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022027	-	77	33.772	ENSAMXG00000030013	-	85	33.772	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022027	-	70	32.367	ENSAMXG00000038214	-	55	34.503	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022027	-	83	38.462	ENSAMXG00000037172	-	71	39.556	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022027	-	95	53.873	ENSAMXG00000037726	si:dkey-85k7.10	97	53.873	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022027	-	70	32.609	ENSAMXG00000036403	-	75	32.609	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022027	-	84	31.273	ENSAMXG00000043661	-	70	33.178	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022027	-	94	68.478	ENSAMXG00000003411	-	95	67.500	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022027	-	60	31.795	ENSAMXG00000019466	-	60	31.959	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022027	-	83	32.800	ENSAMXG00000007611	si:dkey-243k1.3	72	34.300	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022027	-	87	54.297	ENSAMXG00000032585	-	89	54.297	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022027	-	72	32.301	ENSAMXG00000029128	-	77	32.301	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000022027	-	67	33.168	ENSCHOG00000013059	ENDOD1	57	33.168	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000022027	-	75	31.250	ENSCPBG00000019841	-	82	33.051	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000022027	-	93	31.834	ENSCSEG00000006632	-	73	34.483	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000022027	-	87	36.719	ENSCSEG00000002613	-	77	36.626	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000022027	-	92	44.444	ENSCVAG00000016704	si:dkey-85k7.11	92	44.444	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022027	-	70	35.648	ENSCVAG00000006246	si:dkey-243k1.3	73	35.377	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022027	-	96	75.175	ENSCVAG00000016710	-	97	75.175	Cyprinodon_variegatus
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