EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000022147 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: polr1a
Alias: fa26a03|sb:cb935|wu:fa26a03
Full Name: RNA polymerase I subunit A
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 20078 bases
Position: chrCCOE01001179.1:1008726-1028803
Accession: ZDB-GENE-030131-5286
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000028724	RNA_pol_Rpb1_5	PF04998.17	1.2e-99	1	1
ENSACIP00000028724	RNA_pol_Rpb1_4	PF05000.17	9.7e-21	1	1
ENSACIP00000028724	RNA_pol_Rpb1_2	PF00623.20	1.1e-67	1	1
ENSACIP00000028724	RNA_pol_Rpb1_3	PF04983.18	8.8e-37	1	1
ENSACIP00000028724	RNA_pol_Rpb1_1	PF04997.12	1.9e-21	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000029485	-	4767	-	ENSACIP00000028724	1588 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000022147's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000022147's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000022147	polr1a	100	64.066	ENSG00000068654	POLR1A	100	63.889	Homo_sapiens
ENSACIG00000022147	polr1a	69	82.468	ENSAPOG00000017945	polr1a	100	82.638	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.117	ENSAMEG00000005807	POLR1A	93	73.857	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000022147	polr1a	100	83.045	ENSAOCG00000017336	polr1a	100	83.601	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000022147	polr1a	100	83.292	ENSAPEG00000016105	polr1a	100	83.827	Amphiprion_percula
ENSACIG00000022147	polr1a	99	86.709	ENSATEG00000016773	polr1a	97	86.488	Anabas_testudineus
ENSACIG00000022147	polr1a	88	67.152	ENSAPLG00000013871	POLR1A	98	68.053	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000022147	polr1a	99	66.736	ENSACAG00000012141	POLR1A	96	66.158	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.999	ENSANAG00000033927	POLR1A	100	63.173	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000022147	polr1a	100	83.153	ENSACLG00000020541	polr1a	100	82.427	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.139	ENSBTAG00000006481	POLR1A	100	63.088	Bos_taurus
ENSACIG00000022147	polr1a	98	41.792	WBGene00012999	rpoa-1	77	60.870	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.890	ENSCJAG00000019547	POLR1A	100	63.021	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	66.327	ENSCAFG00000007613	POLR1A	100	63.103	Canis_familiaris
ENSACIG00000022147	polr1a	97	72.917	ENSCAFG00020014752	POLR1A	100	64.994	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000022147	polr1a	100	67.571	ENSCHIG00000018204	POLR1A	96	67.571	Capra_hircus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	67.034	ENSTSYG00000002761	POLR1A	96	67.034	Carlito_syrichta
ENSACIG00000022147	polr1a	97	60.584	ENSCAPG00000010132	POLR1A	99	60.768	Cavia_aperea
ENSACIG00000022147	polr1a	100	63.366	ENSCPOG00000012350	POLR1A	100	63.066	Cavia_porcellus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.963	ENSCCAG00000019839	POLR1A	100	63.310	Cebus_capucinus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.978	ENSCATG00000029786	POLR1A	100	63.246	Cercocebus_atys
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.674	ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	63.663	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.862	ENSCSAG00000016251	POLR1A	100	63.130	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000022147	polr1a	99	69.092	ENSCPBG00000001115	POLR1A	96	69.535	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000022147	polr1a	99	50.922	ENSCSAVG00000007184	-	95	49.719	Ciona_savignyi
ENSACIG00000022147	polr1a	100	63.798	ENSCANG00000031785	POLR1A	96	63.830	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000022147	polr1a	96	63.214	ENSCGRG00001006651	Polr1a	96	75.706	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000022147	polr1a	62	63.275	ENSCGRG00000010834	Polr1a	100	64.472	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000022147	polr1a	100	77.273	ENSCSEG00000020190	polr1a	100	77.074	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000022147	polr1a	100	76.036	ENSCVAG00000020941	polr1a	100	76.450	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	74.791	ENSDARG00000098375	polr1a	97	74.652	Danio_rerio
ENSACIG00000022147	polr1a	100	60.151	ENSDNOG00000010829	POLR1A	100	60.824	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	67.127	ENSDORG00000008298	Polr1a	96	67.472	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000022147	polr1a	79	44.065	FBgn0019938	RpI1	99	43.371	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000022147	polr1a	70	87.500	ENSETEG00000000412	-	68	87.500	Echinops_telfairi
ENSACIG00000022147	polr1a	89	46.438	ENSEBUG00000005667	-	99	46.103	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.623	ENSEASG00005001625	POLR1A	100	63.636	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	63.874	ENSECAG00000010092	POLR1A	99	65.696	Equus_caballus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	63.521	ENSECAG00000036306	-	99	65.696	Equus_caballus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	63.874	ENSECAG00000030510	-	99	65.696	Equus_caballus
ENSACIG00000022147	polr1a	82	76.744	ENSEEUG00000000676	POLR1A	79	76.744	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	71.723	ENSELUG00000012769	polr1a	99	72.049	Esox_lucius
ENSACIG00000022147	polr1a	100	63.051	ENSFCAG00000008966	POLR1A	100	63.573	Felis_catus
ENSACIG00000022147	polr1a	99	63.540	ENSFALG00000010082	POLR1A	99	64.071	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.892	ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	63.605	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000022147	polr1a	100	76.485	ENSFHEG00000005996	polr1a	100	77.026	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	69.779	ENSGMOG00000002230	polr1a	100	69.945	Gadus_morhua
ENSACIG00000022147	polr1a	89	61.183	ENSGALG00000038160	-	99	61.573	Gallus_gallus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	79.217	ENSGAFG00000015266	polr1a	100	79.157	Gambusia_affinis
ENSACIG00000022147	polr1a	99	82.214	ENSGACG00000018791	polr1a	96	81.185	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000022147	polr1a	88	69.784	ENSGAGG00000004984	-	94	69.258	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000022147	polr1a	100	63.179	ENSGGOG00000001788	POLR1A	100	63.447	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000022147	polr1a	89	87.169	ENSHBUG00000020021	polr1a	99	87.169	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000022147	polr1a	100	63.188	ENSHGLG00000006334	POLR1A	100	63.774	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000022147	polr1a	100	63.006	ENSHGLG00100006614	POLR1A	100	63.589	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000022147	polr1a	100	78.611	ENSHCOG00000003345	polr1a	100	78.454	Hippocampus_comes
ENSACIG00000022147	polr1a	100	69.000	ENSIPUG00000013174	polr1a	100	69.163	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000022147	polr1a	99	62.762	ENSSTOG00000012580	POLR1A	100	62.536	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	67.562	ENSJJAG00000013113	Polr1a	96	67.378	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	81.049	ENSKMAG00000007399	polr1a	100	80.751	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	82.204	ENSLBEG00000015401	polr1a	100	82.882	Labrus_bergylta
ENSACIG00000022147	polr1a	52	66.196	ENSLACG00000003218	polr1a	100	66.196	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000022147	polr1a	100	73.352	ENSLOCG00000010881	polr1a	96	73.458	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	67.566	ENSLAFG00000014948	POLR1A	96	67.633	Loxodonta_africana
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.841	ENSMFAG00000046097	POLR1A	100	63.594	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.841	ENSMMUG00000015815	POLR1A	100	63.594	Macaca_mulatta
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.841	ENSMNEG00000043313	POLR1A	100	63.594	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.920	ENSMLEG00000042428	POLR1A	100	62.899	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	81.105	ENSMAMG00000016565	polr1a	100	81.748	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	85.038	ENSMZEG00005004915	polr1a	100	84.970	Maylandia_zebra
ENSACIG00000022147	polr1a	99	64.143	ENSMGAG00000013111	POLR1A	95	64.710	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000022147	polr1a	88	67.012	ENSMAUG00000008497	Polr1a	91	68.188	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	66.758	ENSMICG00000000757	POLR1A	96	67.010	Microcebus_murinus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	66.805	ENSMOCG00000000122	Polr1a	96	67.405	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000022147	polr1a	100	77.394	ENSMMOG00000010216	polr1a	100	77.156	Mola_mola
ENSACIG00000022147	polr1a	100	63.236	ENSMODG00000009335	POLR1A	83	83.465	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000022147	polr1a	100	82.468	ENSMALG00000013363	polr1a	100	82.457	Monopterus_albus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	66.528	MGP_CAROLIEiJ_G0028494	Polr1a	96	67.082	Mus_caroli
ENSACIG00000022147	polr1a	100	66.736	ENSMUSG00000049553	Polr1a	96	67.289	Mus_musculus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	66.874	MGP_PahariEiJ_G0022230	Polr1a	96	67.358	Mus_pahari
ENSACIG00000022147	polr1a	100	65.877	MGP_SPRETEiJ_G0029499	Polr1a	96	65.944	Mus_spretus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.464	ENSMPUG00000009135	POLR1A	100	63.283	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000022147	polr1a	100	67.263	ENSMLUG00000015723	POLR1A	96	67.744	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	67.766	ENSNGAG00000017907	Polr1a	96	68.279	Nannospalax_galili
ENSACIG00000022147	polr1a	100	84.675	ENSNBRG00000000519	polr1a	100	84.852	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000022147	polr1a	100	61.534	ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	61.800	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000022147	polr1a	75	81.890	ENSMEUG00000011665	-	75	81.890	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000022147	polr1a	92	71.277	ENSOPRG00000008269	POLR1A	89	71.277	Ochotona_princeps
ENSACIG00000022147	polr1a	100	63.779	ENSODEG00000003542	POLR1A	100	63.933	Octodon_degus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	89.316	ENSONIG00000015895	polr1a	97	89.797	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	63.441	ENSOCUG00000010138	POLR1A	100	63.837	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	78.271	ENSORLG00000008753	polr1a	99	78.258	Oryzias_latipes
ENSACIG00000022147	polr1a	100	78.006	ENSORLG00020020726	polr1a	99	77.825	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000022147	polr1a	100	76.467	ENSORLG00015016071	polr1a	98	89.362	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000022147	polr1a	100	66.781	ENSOGAG00000004031	POLR1A	96	66.644	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.927	ENSOARG00000020601	POLR1A	100	63.426	Ovis_aries
ENSACIG00000022147	polr1a	100	63.006	ENSPPAG00000042450	POLR1A	100	63.274	Pan_paniscus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.993	ENSPPRG00000006702	POLR1A	100	63.515	Panthera_pardus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.601	ENSPTIG00000018783	POLR1A	100	63.121	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.558	ENSPTRG00000012147	POLR1A	100	62.869	Pan_troglodytes
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.804	ENSPANG00000025908	POLR1A	100	63.072	Papio_anubis
ENSACIG00000022147	polr1a	100	71.070	ENSPKIG00000005468	polr1a	100	71.131	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000022147	polr1a	65	65.677	ENSPSIG00000009321	-	99	66.264	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000022147	polr1a	54	79.106	ENSPMGG00000009718	polr1a	95	79.106	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	66.943	ENSPEMG00000022224	Polr1a	96	67.196	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000022147	polr1a	95	65.784	ENSPCIG00000004222	POLR1A	95	66.372	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	77.673	ENSPFOG00000005025	polr1a	100	78.066	Poecilia_formosa
ENSACIG00000022147	polr1a	100	77.798	ENSPLAG00000021389	polr1a	100	78.356	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000022147	polr1a	100	77.591	ENSPMEG00000006463	polr1a	100	78.336	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000022147	polr1a	100	77.758	ENSPREG00000002389	polr1a	100	77.902	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.587	ENSPPYG00000012217	POLR1A	100	63.362	Pongo_abelii
ENSACIG00000022147	polr1a	90	74.145	ENSPCAG00000011582	POLR1A	91	57.360	Procavia_capensis
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.011	ENSPCOG00000026987	POLR1A	100	63.021	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000022147	polr1a	94	64.901	ENSPVAG00000012674	POLR1A	91	64.159	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	84.861	ENSPNYG00000000026	polr1a	100	84.793	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000022147	polr1a	100	71.367	ENSPNAG00000019223	polr1a	100	71.665	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000022147	polr1a	100	67.220	ENSRNOG00000009545	Polr1a	96	67.911	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	66.302	ENSRBIG00000028335	POLR1A	96	67.102	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000022147	polr1a	100	66.302	ENSRROG00000031473	POLR1A	96	67.102	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000022147	polr1a	94	46.923	YOR341W	RPA190	86	46.923	Saccharomyces_cerevisiae
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.811	ENSSBOG00000030262	POLR1A	100	62.999	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.105	ENSSHAG00000014739	POLR1A	96	62.311	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000022147	polr1a	100	73.128	ENSSFOG00015019716	polr1a	96	72.835	Scleropages_formosus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	82.574	ENSSMAG00000014342	polr1a	100	82.736	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	81.813	ENSSDUG00000014631	polr1a	100	83.097	Seriola_dumerili
ENSACIG00000022147	polr1a	100	86.796	ENSSLDG00000024095	polr1a	100	86.525	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000022147	polr1a	70	95.122	ENSSARG00000003136	-	71	95.122	Sorex_araneus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	66.387	ENSSPUG00000004215	POLR1A	100	63.267	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000022147	polr1a	70	84.773	ENSSPAG00000016341	polr1a	100	84.973	Stegastes_partitus
ENSACIG00000022147	polr1a	84	64.271	ENSSSCG00000008226	POLR1A	99	64.101	Sus_scrofa
ENSACIG00000022147	polr1a	98	63.361	ENSTGUG00000010704	POLR1A	100	63.302	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000022147	polr1a	100	75.030	ENSTRUG00000002210	polr1a	99	75.355	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000022147	polr1a	100	69.038	ENSTNIG00000010116	polr1a	100	68.921	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000022147	polr1a	71	82.301	ENSTBEG00000008646	POLR1A	69	82.301	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000022147	polr1a	100	61.153	ENSTTRG00000008597	POLR1A	100	61.386	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000022147	polr1a	71	65.993	ENSUAMG00000012158	-	94	66.807	Ursus_americanus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	65.820	ENSUMAG00000006700	POLR1A	100	64.826	Ursus_maritimus
ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.326	ENSVVUG00000001245	POLR1A	100	62.929	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000022147	polr1a	100	63.889	ENSXETG00000001952	polr1a	97	65.593	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000022147	polr1a	100	77.412	ENSXMAG00000004032	polr1a	100	77.529	Xiphophorus_maculatus